Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14274
• Subject: NM_001321376.2
• Aligned Length: 1668
• Identities: 1371
• Gaps: 297

Alignment

Query    1  ATGTTGTCCCCAGTGTCCCGAGACGCGTCTGATGCTCTGCAGGGACGGAAGTGCCTGCGTCCCCGATCGAGACG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCTGCCGCTCCCGGCAGCTGTCCGCGCCCACGGTCCTATGGCGGAGCTAACGGACTCCGCGCGGGGCTGTGTGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCTTTGAGGATGTGTTTGTATACTTCTCTCGGGAAGAATGGGAGCTTCTTGATGATGCTCAGAGACTTTTGTAC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CATGATGTGATGCTGGAGAACTTTGCACTTTTAGCCTCACTGGGAATTGCATTTTCCAGATCACGTGCAGTCAT  296
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------ATGCTGGAGAACTTTGCACTTTTAGCCTCACTGGGAATTGCATTTTCCAGATCACGTGCAGTCAT  65

Query  297  GAAACTAGAGCGAGGAGAAGAGCCCTGGGTGTATGACCAGGTGGATATGACTTCAGCCACAGAAAGAGAGGCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   66  GAAACTAGAGCGAGGAGAAGAGCCCTGGGTGTATGACCAGGTGGATATGACTTCAGCCACAGAAAGAGAGGCCC  139

Query  371  AGAGGGGACTTAGACCTGGTTGTTGGCATGGAGTGGAGGATGAAGAGGTATCTTCTGAGCAGAGCATTTTTGTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  140  AGAGGGGACTTAGACCTGGTTGTTGGCATGGAGTGGAGGATGAAGAGGTATCTTCTGAGCAGAGCATTTTTGTA  213

Query  445  GCAGGAGTGTCAGAGGTCAGGACTCTCATGGCAGAGCTGGAGTCTCACCCATGTGACATATGTGGCCCAATATT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  214  GCAGGAGTGTCAGAGGTCAGGACTCTCATGGCAGAGCTGGAGTCTCACCCATGTGACATATGTGGCCCAATATT  287

Query  519  GAAAGATACCTTACACCTGGCTAAATACCATGGGGGAAAAGCCAGGCAGAAACCATACTTGTGTGGGGCATGTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  288  GAAAGATACCTTACACCTGGCTAAATACCATGGGGGAAAAGCCAGGCAGAAACCATACTTGTGTGGGGCATGTG  361

Query  593  GAAAGCAATTCTGGTTCAGTACAGACTTTGACCAGCACCAGAACCAGCCCAATGGAGGGAAACTTTTCCCAAGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  362  GAAAGCAATTCTGGTTCAGTACAGACTTTGACCAGCACCAGAACCAGCCCAATGGAGGGAAACTTTTCCCAAGG  435

Query  667  AAGGAGGGCAGAGACTCTGTGAAAAGCTGCAGAGTCCATGTGCCAGAGAAGACCCTCACATGTGGGAAAGGTAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  436  AAGGAGGGCAGAGACTCTGTGAAAAGCTGCAGAGTCCATGTGCCAGAGAAGACCCTCACATGTGGGAAAGGTAG  509

Query  741  GAGAGACTTTTCAGCCACATCTGGCCTTCTTCAGCATCAGGCCTCTCTCAGCAGCATGAAGCCCCACAAGAGCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  510  GAGAGACTTTTCAGCCACATCTGGCCTTCTTCAGCATCAGGCCTCTCTCAGCAGCATGAAGCCCCACAAGAGCA  583

Query  815  CTAAGCTTGTGAGTGGCTTTCTCATGGGACAGAGGTATCACAGGTGTGGTGAATGTGGGAAAGCCTTCACCCGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  584  CTAAGCTTGTGAGTGGCTTTCTCATGGGACAGAGGTATCACAGGTGTGGTGAATGTGGGAAAGCCTTCACCCGC  657

Query  889  AAAGACACACTTGCTCGGCATCAGAGAATCCACACTGGAGAAAGGCCTTATGAGTGTAACGAATGTGGGAAATT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  658  AAAGACACACTTGCTCGGCATCAGAGAATCCACACTGGAGAAAGGCCTTATGAGTGTAACGAATGTGGGAAATT  731

Query  963  CTTCAGCCAAAGCTATGACCTCTTTAAACACCAGACAGTTCACACTGGAGAAAGGCCATACGAGTGCAGCGAAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  732  CTTCAGCCAAAGCTATGACCTCTTTAAACACCAGACAGTTCACACTGGAGAAAGGCCATACGAGTGCAGCGAAT  805

Query 1037  GTGGGAAATTCTTTAGACAAATCTCCGGCCTGATTGAGCACAGGCGAGTTCACACGGGTGAAAGACTCTATCAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  806  GTGGGAAATTCTTTAGACAAATCTCCGGCCTGATTGAGCACAGGCGAGTTCACACGGGTGAAAGACTCTATCAG  879

Query 1111  TGTGGCAAATGTGGGAAATTTTTTAGCAGTAAGTCTAATCTCATTCGACACCAGGAAGTTCACACAGGAGCCAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  880  TGTGGCAAATGTGGGAAATTTTTTAGCAGTAAGTCTAATCTCATTCGACACCAGGAAGTTCACACAGGAGCCAG  953

Query 1185  GCCTTATGTATGCAGCGAATGTGGGAAAGAGTTCAGTCGGAAACACACACTTGTTCTGCACCAACGAACTCACA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  954  GCCTTATGTATGCAGCGAATGTGGGAAAGAGTTCAGTCGGAAACACACACTTGTTCTGCACCAACGAACTCACA  1027

Query 1259  CTGGAGAAAGGCCTTATGAGTGCAGTGAATGTGGGAAGGCCTTTAGCCAAAGCTCCCACCTTAATGTACACTGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028  CTGGAGAAAGGCCTTATGAGTGCAGTGAATGTGGGAAGGCCTTTAGCCAAAGCTCCCACCTTAATGTACACTGG  1101

Query 1333  AGAATTCACAGCAGTGATTATGAGTGTAGCAGATGTGGTAAAGCTTTCAGCTGCATCTCCAAACTCATTCAGCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102  AGAATTCACAGCAGTGATTATGAGTGTAGCAGATGTGGTAAAGCTTTCAGCTGCATCTCCAAACTCATTCAGCA  1175

Query 1407  CCAGAAAGTTCACTCTGGAGAAAAGCCTTATGAGTGCAGCAAGTGCGGGAAAGCCTTCACTCAAAGACCCAACC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176  CCAGAAAGTTCACTCTGGAGAAAAGCCTTATGAGTGCAGCAAGTGCGGGAAAGCCTTCACTCAAAGACCCAACC  1249

Query 1481  TCATCAGGCACTGGAAAGTCCACACTGGGGAAAGGCCTTATGTGTGTAGTGAGTGCGGGAGAGAATTCATCCGG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250  TCATCAGGCACTGGAAAGTCCACACTGGGGAAAGGCCTTATGTGTGTAGTGAGTGCGGGAGAGAATTCATCCGG  1323

Query 1555  AAACAGACACTTGTTCTGCACCAGAGGGTTCATGCTGGAGAAAAGCTTAAGAGTGTAGCAAATGTGGGGGAAAG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                          
Sbjct 1324  AAACAGACACTTGTTCTGCACCAGAGGGTTCATGCTGGAGAAAAGCTT--------------------------  1371

Query 1629  TCTTAGGCCAATGCCCCTGACTTACTATCTGGTGGGCAAC  1668
                                                    
Sbjct 1372  ----------------------------------------  1371