Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14299
- Subject:
- XM_017008684.2
- Aligned Length:
- 2094
- Identities:
- 1666
- Gaps:
- 426
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCTGCTTGCCCAGCTGGCGTACAGAGAGCAAATGAATGAGCATCACAAGAGAGCCTACACCTATGCCCCCTC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TTACGAGGACTTCATCAAGCTCATTAACAGCAACTCTGATGTGGAGTTCTTGAAGCAACTAAGGTATCAAATTG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TAGTGGAAATAATCCAGGCGACTACAATTAGCAGCTTTCCCCAACTGAAGAGGCACAAAGGTAAAGAAACTGCG 222
Query 1 ---ATGAAAGCTGATCTCCTGAGGGCCAGGAACATGAAGAGGTACATCAACCAACTGACTGTGGCAAAGAAGCA 71
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCAATGAAAGCTGATCTCCTGAGGGCCAGGAACATGAAGAGGTACATCAACCAACTGACTGTGGCAAAGAAGCA 296
Query 72 GTGTGAGAAGAGAATCCGAATCCTGGGAGGCCCTGCCTATGACCAGCAAGAGGATGGGGCCCTGGATGAGGGGG 145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GTGTGAGAAGAGAATCCGAATCCTGGGAGGCCCTGCCTATGACCAGCAAGAGGATGGGGCCCTGGATGAGGGGG 370
Query 146 AAGGGCCTCAAAGCCAGA------------------------------------AGATTCTTCAGTTTGAAGAT 183
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGGGCCTCAAAGCCAGAAGCAGAAGCTACAGATAGAAGGTTCAATATCTCCACAGATTCTTCAGTTTGAAGAT 444
Query 184 ATCTTGGCCAATACGTTCTACCGAGAGCACTTTGGAATGTACATGGAAAGGATGGACAAAAGAGCTCTGATTAG 257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATCTTGGCCAATACGTTCTACCGAGAGCACTTTGGAATGTACATGGAAAGGATGGACAAAAGAGCTCTGATTAG 518
Query 258 TTTTTGGGAATCTGTGGAACATTTAAAGAATGCTAACAAGAATGAAATTCCACAATTAGTTGGTGAAATTTATC 331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TTTTTGGGAATCTGTGGAACATTTAAAGAATGCTAACAAGAATGAAATTCCACAATTAGTTGGTGAAATTTATC 592
Query 332 AGAATTTCTTTGTGGAGAGCAAAGAAATATCTGTGGAAAAATCACTTTACAAAGAAATTCAGCAGTGTCTTGTA 405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGAATTTCTTTGTGGAGAGCAAAGAAATATCTGTGGAAAAATCACTTTACAAAGAAATTCAGCAGTGTCTTGTA 666
Query 406 GGAAATAAAGGTATTGAAGTATTCTACAAAATCCAGGAAGATGTTTATGAGACCCTAAAGGACAGGTATTACCC 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 667 GGAAATAAAGGTATTGAAGTATTCTACAAAATCCAGGAAGATGTTTATGAGACCCTAAAGGATAGGTATTACCC 740
Query 480 TTCATTTATTGTCAGTGACCTGTATGAGAAATTGTTGATAAAAGAGGAAGAAAAACATGCCTCACAGATGATTT 553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTCATTTATTGTCAGTGACCTGTATGAGAAATTGTTGATAAAAGAGGAAGAAAAACATGCCTCACAGATGATTT 814
Query 554 CCAACAAGGATGAGATGGGCCCAAGAGATGAGGCTGGTGAGGAAGCCGTGGATGATGGTACCAATCAGATCAAT 627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCAACAAGGATGAGATGGGCCCAAGAGATGAGGCTGGTGAGGAAGCCGTGGATGATGGTACCAATCAGATCAAT 888
Query 628 GAACAAGCCAGTTTTGCTGTAAACAAACTGCGAGAACTAAATGAGAAACTTGAATATAAAAGGCAAGCTCTAAA 701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAACAAGCCAGTTTTGCTGTAAACAAACTGCGAGAACTAAATGAGAAACTTGAATATAAAAGGCAAGCTCTAAA 962
Query 702 TTCTATTCAAAATGCACCAAAACCTGACAAGAAGATTGTTTCCAAGTTGAAGGATGAAATAATCCTAATAGAGA 775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TTCTATTCAAAATGCACCAAAACCTGACAAGAAGATTGTTTCCAAGTTGAAGGATGAAATAATCCTAATAGAGA 1036
Query 776 AAGAACGCACAGACCTTCAGCTGCACATAGCAAGAACGGATTGGTGGTGTGAAAACCTTGGCATGTGGAAAGCC 849
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AAGAACGCACAGACCTTCAGCTGCACATGGCAAGAACGGATTGGTGGTGTGAAAACCTTGGCATGTGGAAAGCC 1110
Query 850 TCCATCACCAGTGGAGAGGTTACAGAAGAGAATGGTGAGCAATTGCCATGTTACTTTGTCATGGTAAGCCTACA 923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCCATCACCAGTGGAGAGGTTACAGAAGAGAATGGTGAGCAATTGCCATGTTACTTTGTCATGGTAAGCCTACA 1184
Query 924 AGAAGTTGGAGGAGTTGAAACTAAGAACTGGACGGTCCCCAGAAGGCTCAGCGAGTTTCAGAATTTACACCGGA 997
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGAAGTTGGAGGAGTTGAAACTAAGAACTGGACGGTCCCCAGAAGGCTCAGCGAGTTTCAGAATTTACACCGGA 1258
Query 998 AACTCAGTGAGTGCGTCCCTTCTTTAAAAAAAGTCCAGTTGCCTTCTCTTAGCAAGCTGCCTTTCAAATCTATA 1071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AACTCAGTGAGTGCGTCCCTTCTTTAAAAAAAGTCCAGTTGCCTTCTCTTAGCAAGCTGCCTTTCAAATCTATA 1332
Query 1072 GATCAAAAGTTTATGGAAAAGTCGAAGAATCAATTAAATAAGTTTTTAC------------------------- 1120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GATCAAAAGTTTATGGAAAAGTCGAAGAATCAATTAAATAAGTTTTTACAGAATCTGCTTTCAGATGAAAGACT 1406
Query 1121 -------------------------------------------------------------------------- 1120
Sbjct 1407 GTGTCAGAGTGAAGCACTTTATGCCTTCTTGAGCCCTTCTCCTGACTACCTCAAGGTTATCGACGTGCAGGGGA 1480
Query 1121 ------------------------------------------------------------------AGGAGGAG 1128
||||||||
Sbjct 1481 AAAAAAATTCTTTTTCATTATCCTCATTTTTGGAAAGACTTCCTCGCGACTTCTTCTCCCACCAGGAGGAGGAG 1554
Query 1129 ACAGAGGAGGACAGTGACCTGTCAGATTATGGTGATGATGTGGATGGGAGGAAAGACGCCTTGGCTGAACCATG 1202
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ACAGAGGAGGACAGTGACCTGTCAGATTATGGTGATGATGTGGATGGGAGGAAAGACGCCTTGGCTGAACCATG 1628
Query 1203 TTTCATGTTGATTGGGGAGATTTTTGAACTTCGAGGAATGTTTAAATGGGTGAGAAGAACATTAATTGCCCTCG 1276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TTTCATGTTGATTGGGGAGATTTTTGAACTTCGAGGAATGTTTAAATGGGTGAGAAGAACATTAATTGCCCTCG 1702
Query 1277 TTCAGGTCACTTTTGGAAGAACCATCAACAAACAAATCCGGGACACAGTCAGCTGGATTTTCAGTGAGCAAATG 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TTCAGGTCACTTTTGGAAGAACCATCAACAAACAAATCCGGGACACAGTCAGCTGGATTTTCAGTGAGCAAATG 1776
Query 1351 TTGGTTTACTACATCAATATTTTCCGGGATGCTTTTTGGCCAAATGGGAAGTTGGCACCACCGACCACAATCAG 1424
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TTGGTTTACTACATCAATATTTTCCGGGATGCTTTTTGGCCAAATGGGAAGTTGGCACCACCGACCACAATCAG 1850
Query 1425 AAGCAAAGAGCAAAGTCAGGAAACAAAACAGAGAGCACAGCAAAAGCTGCTTGAAAACATTCCAGATATGCTTC 1498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AAGCAAAGAGCAAAGTCAGGAAACAAAACAGAGAGCACAGCAAAAGCTGCTTGAAAACATTCCAGATATGCTTC 1924
Query 1499 AGAGCCTTGTTGGACAGCAAAATGCCCGCCACGGTATAATAAAAATATTCAATGCACTGCAAGAAACAAGAGCC 1572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AGAGCCTTGTTGGACAGCAAAATGCCCGCCACGGTATAATAAAAATATTCAATGCACTGCAAGAAACAAGAGCC 1998
Query 1573 AACAAGCATCTGTTATATGCGCTGATGGAACTGCTGCTAATTGAACTGTGTCCTGAGCTGAGAGTTCATTTAGA 1646
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AACAAGCATCTGTTATATGCGCTGATGGAACTGCTGCTAATTGAACTGTGTCCTGAGCTGAGAGTTCATTTAGA 2072
Query 1647 TCAACTTAAAGCTGGCCAAGTT 1668
||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TCAACTTAAAGCTGGCCAAGTT 2094