Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14299
- Subject:
- XM_017312502.1
- Aligned Length:
- 2070
- Identities:
- 1425
- Gaps:
- 414
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCTGCTCAGGCAGTTGGAGTACAGAGAGCAGATGAGTGAGCATCACAAGCGAGCCTACACGTACGCGCCTTC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CTACGAGGACTTTATCAAGCTCATCAACAGCAACTCTGATGTGGACTTCCTGAAGCAGCTCAGGTATCAAATTG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TAGTGGAGATAATCCAAGCAACTACAATCAGCAGCTTTCCCCAGCTGAAGAGACACAAGGGTAAGGAATCAGCT 222
Query 1 ---ATGAAAGCTGATCTCCTGAGGGCCAGGAACATGAAGAGGTACATCAACCAACTGACTGTGGCAAAGAAGCA 71
||||||.||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCCATGAAAACTGATCTCTTGAGGGCCAGGAACATGAAAAGGTACATTAACCAGCTGACTGTGGCAAAGAAGCA 296
Query 72 GTGTGAGAAGAGAATCCGAATCCTGGGAGGCCCTGCCTATGACCAGCAAGAGGATGGGGCCCTGGATGAGGGGG 145
||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||..||||||.||||
Sbjct 297 GTGTGAGAAGAGAATCCGAATCCTGGGAGGTCCTGCCTATGACCAGCAAGAGGATGGAGCCTCGGATGAAGGGG 370
Query 146 AAGGGCCTCAAAGCCAGAAGATTCTTCAGTTTGAAGATATCTTGGCCAATACGTTCTACCGAGAGCACTTTGGA 219
||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||..||.|||||.|.|||||||||||||.|||||||
Sbjct 371 AAGGGCCTCAGAGCCAAAAGATTCTTCAGTTTGAAGATATTATGACCAATCCTTTCTACCGAGAGCGCTTTGGA 444
Query 220 ATGTACATGGAAAGGATGGACAAAAGAGCTCTGATTAGTTTTTGGGAATCTGTGGAACATTTAAAGAATGCTAA 293
|..|||||||||.||||.|||||..|.|||||..||.|.||||||||.||||..|||||..|.|||||||||||
Sbjct 445 ACATACATGGAACGGATAGACAAGCGGGCTCTAGTTGGCTTTTGGGAGTCTGCCGAACACCTGAAGAATGCTAA 518
Query 294 CAAGAATGAAATTCCACAATTAGTTGGTGAAATTTATCAGAATTTCTTTGTGGAGAGCAAAGAAATATCTGTGG 367
|||||.|||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||
Sbjct 519 CAAGAGTGAAATTCCACAATTAGTTAGTGAAATGTATCAGAATTTCTTCGTGGAAAGCAAGGAAATCTCCGTGG 592
Query 368 AAAAATCACTTTACAAAGAAATTCAGCAGTGTCTTGTAGGAAATAAAGGTATTGAAGTATTCTACAAAATCCAG 441
||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|.|||.||.||.||.|||..|||||||||.
Sbjct 593 AAAAGTCACTTTACAAAGAAATCCAGCAGTGTCTTGTGGGAAACAGAGGCATCGAGGTGTTCAGCAAAATCCAA 666
Query 442 GAAGATGTTTATGAGACCCTAAAGGACAGGTATTACCCTTCATTTATTGTCAGTGACCTGTATGAGAA----AT 511
|..|||||.|..|||...||.|.|||..||||||||||.||.||..|.|||||.|||||||||||||| ||
Sbjct 667 GCCGATGTGTCCGAGGTGCTGAGGGAGCGGTATTACCCCTCCTTCCTCGTCAGCGACCTGTATGAGAAGCTCAT 740
Query 512 ---TGTTGATAAAAGAGGAAGAAAAACATGCCT----CACAGATGATTTCCAACAAGGATGAGATGGGCCCAAG 578
||..|| |.|||||||.|| |||| |.|||.||...||..|.|||||||||.||||..||.|
Sbjct 741 GCGTGAGGA-AGAAGAGGAGGA-------GCCTGACGCTCAGCTGGCCTCTGAGAAGGATGAGCTGGGTTCAGG 806
Query 579 AGATGAGGCTGGTGAGGAAGCCGTGGATGATGGTACCAATCAGATCAATGAACAAGCCAGTTTTGCTGTAAACA 652
||.|||||||||||||||.||.|| .||.||.||||.|..|.|||.|||.|.||||||.||||||||||.||
Sbjct 807 AGGTGAGGCTGGTGAGGAGGCTGT---AGAAGGCACCAGTGGGGTCAGTGATCCAGCCAGCTTTGCTGTAATCA 877
Query 653 AACTGCGAGAACTAAATGAGAAACTTGAATATAAAAGGCAAGCTCTAAATTCTATTCAAAATGCACCAAAACCT 726
||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 878 AACTCCGAGAGCTAAATGAGAAACTTGAATACAAAAGGCAAGCTCTAAGTTCTATTCAGAATGCACCAAAACCT 951
Query 727 GACAAGAAGATTGTTTCCAAGTTGAAGGATGAAATAATCCTAATAGAGAAAGAACGCACAGACCTTCAGCTGCA 800
||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||||||.||||.|..|||||||||||
Sbjct 952 GATAAGAAGATTATTTCCAAGTTGAAGGATGAAATACTTCTGATAGAGAAAGAATGCACGGCTCTTCAGCTGCA 1025
Query 801 CATAGCAAGAACGGATTGGTGGTGTGAAAACCTTGGCATGTGGAAAGCCTCCATCACCAGTGGAGAGGTTACAG 874
|||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||.||||||.|||.|||||||||||.|.||||||.||||
Sbjct 1026 CATGGCGAGAACAGATTGGTGGTGTGAGAACCTGGGCCTGTGGAGAGCATCCATCACCAGCGCAGAGGTGACAG 1099
Query 875 AAGAGAATGGTGAGCAATTGCCATGTTACTTTGTCATGGTAAGCCTACAAGAAGTTGGAGGAGTTGAAACTAAG 948
||||||||||.||||||.||||.|||||||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1100 AAGAGAATGGCGAGCAAATGCCTTGTTACTTTGTCAGGGTAAATCTACAAGAAGTTGGAGGAGTTGAAACTAAG 1173
Query 949 AACTGGACGGTCCCCAGAAGGCTCAGCGAGTTTCAGAATTTACACCGGAAACTCAGTGAGTGCGTCCCTTCTTT 1022
||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1174 AACTGGACCGTCCCAAGAAGGCTCAGTGAGTTTCAGAATTTACATCGGAAACTTAGTGAGTGTGTCCCTTCTTT 1247
Query 1023 AAAAAAAGTCCAGTTGCCTTCTCTTAGCAAGCTGCCTTTCAAATCTATAGATCAAAAGTTTATGGAAAAGTCGA 1096
||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||.|||||| |
Sbjct 1248 AAAAAAAGTCCAGTTGCCTTCTCTCAGTAAGCTGCCTTTCAAATCTATAGATCACAAGTTCCTGGGAAAGTC-A 1320
Query 1097 AG-AATCAATTAAAT-----------------------------AAG--------------------------- 1113
|| |||||.|||||| |||
Sbjct 1321 AGAAATCAGTTAAATGCATTTCTACAGAACCTGCTTTCAGATGAAAGACTGTTCCAGAGCGAAGCACTTTATGC 1394
Query 1114 -TTTTT--------------AC---------------------------------------------------- 1120
||||| ||
Sbjct 1395 CTTTTTGAGCCCTTCTCCTGACTACCTCAAGGTCATTGATGTACAGGGGAAAAAGACCTCCTTCTCATTGTCTT 1468
Query 1121 ------------------------------------------AGGAGGAGACAGAGGAGGACAGTGACCTGTCA 1152
|||||||||.|||.||||||||.||||||||.
Sbjct 1469 CATTTCTGGAAAAACTTCCTCGTGACTTCTTCTCCCATCAGGAGGAGGAGATAGAAGAGGACAGCGACCTGTCC 1542
Query 1153 GATTATGGTGATGATGTGGATGGGAGGAAAGACGCCTTGGCTGAACCATGTTTCATGTTGATTGGGGAGATTTT 1226
|||||.||.|||||||||||.||||.|||.||..|||||||||||||.|||||||||.||||.|||||||||||
Sbjct 1543 GATTACGGGGATGATGTGGACGGGAAGAAGGATTCCTTGGCTGAACCGTGTTTCATGCTGATCGGGGAGATTTT 1616
Query 1227 TGAACTTCGAGGAATGTTTAAATGGGTGAGAAGAACATTAATTGCCCTCGTTCAGGTCACTTTTGGAAGAACCA 1300
.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1617 CGAACTTCGAGGAATGTTTAAATGGGTGCGAAGAACATTAATCGCTCTTGTTCAGGTCACGTTTGGAAGAACCA 1690
Query 1301 TCAACAAACAAATCCGGGACACAGTCAGCTGGATTTTCAGTGAGCAAATGTTGGTTTACTACATCAATATTTTC 1374
|||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|.|||.|||||.|||.||||.||||||||||.|..||||
Sbjct 1691 TCAACAAGCAAATCCGCGACACGGTGAGCTGGATCTCCAGCGAGCAGATGCTGGTCTACTACATCAGTGCTTTC 1764
Query 1375 CGGGATGCTTTTTGGCCAAATGGGAAGTTGGCACCACCGACCACAATCAGAAGCAAAGAGCAAAGTCAGGAAAC 1448
||||||||.|||||||||||.|||||..|||||||.||.||.|.||||.|||||...|..||.||||||||.||
Sbjct 1765 CGGGATGCCTTTTGGCCAAACGGGAAACTGGCACCTCCAACAAGAATCCGAAGCGTGGCACAGAGTCAGGAGAC 1838
Query 1449 AAAACAGAGAGCACAGCAAAAGCTGCTTGAAAACATTCCAGATATGCTTCAGAGCCTTGTTGGACAGCAAAATG 1522
.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1839 GAAGCAGAGAGCACAGCAGAAGCTGCTCGAGAACATTCCAGATACACTTCAGAGCCTTGTTGGACAGCAAAATG 1912
Query 1523 CCCGCCACGGTATAATAAAAATATTCAATGCACTGCAAGAAACAAGAGCCAACAAGCATCTGTTATATGCGCTG 1596
|||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||..||||||||.||.|||.|.||||.||||
Sbjct 1913 CCCGCCATGGTATAATAAAAATATTCAAGGCGCTGCAAGAGACAAAGGCCAACAAACACCTGCTCTATGTGCTG 1986
Query 1597 ATGGAACTGCTGCTAATTGAACTGTGTCCTGAGCTGAGAGTTCATTTAGATCAACTTAAAGCTGGCCAAGTT 1668
|||||.||||||||.|..||.||.||.|||||||||||.|.|||..|.|||||..|.||||||||||||||.
Sbjct 1987 ATGGAGCTGCTGCTGACAGAGCTCTGCCCTGAGCTGAGGGCTCACCTGGATCAGTTCAAAGCTGGCCAAGTC 2058