Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14318
• Subject: XM_017020799.2
• Aligned Length: 1579
• Identities: 1168
• Gaps: 401

Alignment

Query    1  ATGCTGTGCAAAGANCAAGGGATCACTGTGCTGGGTTTAAATGCGGTATTTGACATCTTGGTGATAGGCAAATT  74
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGTGCAAAGAGCAAGGGATCACTGTGCTGGGTTTAAATGCGGTATTTGACATCTTGGTGATAGGCAAATT  74

Query   75  CAATGTTCTGGAAATTGTCCAGAAGGTACTACATAAGGACAAGTCATTAGAGAATCTCGGCATGCTCAGGAACG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAATGTTCTGGAAATTGTCCAGAAGGTACTACATAAGGACAAGTCATTAGAGAATCTCGGCATGCTCAGGAACG  148

Query  149  GGGGCCTCCTCTTCAGAATGACCCTGCTCACCTCTGGAGGGGCTGGGATGCTCTACGTGCGCTGGAGGATCATG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGGCCTCCTCTTCAGAATGACCCTGCTCACCTCTGGAGGGGCTGGGATGCTCTACGTGCGCTGGAGGATCATG  222

Query  223  GGCACGGGCCCGCCGGCCTTCACCGAGGTGGACAACCCGGCCTCCTTTGCTGACAGCATGCTGGTGAGGGCCGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGCACGGGCCCGCCGGCCTTCACCGAGGTGGACAACCCGGCCTCCTTTGCTGACAGCATGCTGGTGAGGGCCGT  296

Query  297  AAACTACAATTACTACTATTCATTGAATGCCTGGCTGCTGCTGTGTCCCTGGTGGCTGTGTTTTGATTGGTCAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAACTACAATTACTACTATTCATTGAATGCCTGGCTGCTGCTGTGTCCCTGGTGGCTGTGTTTTGATTGGTCAA  370

Query  371  TGGGCTGCATCCCCCTCATTAAGTCCATCAGCGACTGGAGGGTAATTGCACTTGCAGCACTCTGGTTCTGCCTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGGCTGCATCCCCCTCATTAAGTCCATCAGCGACTGGAGGGTAATTGCACTTGCAGCACTCTGGTTCTGCCTA  444

Query  445  ATTGGCCTGATATGCCAAGCCCTGTGCTCTGAAGACGGCCACAAGAGAAGGATCCTTACTCTGGGCCTGGGATT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTGGCCTGATATGCCAAGCCCTGTGCTCTGAAGACGGCCACAAGAGAAGGATCCTTACTCTGGGCCTGGGATT  518

Query  519  TCTCGTTATCCCATTTCTCCCCGCGAGTAACCTGTTCTTCCGAGTGGGCTTCGTGGTCGCGGAGCGTGTCCTCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  TCTCGTTATCCCATTTCTCCCCGCGAGTAACCTGTTCTTCCGAGTGGGCTTCGTGGTCGCAGAGCGTGTCCTCT  592

Query  593  ACCTCCCCAGCGTTGGGTACTGTGTGCTGCTGACTTTTGGATTCGGAGCCCTGAGCAAACATACCAAGAAAAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCTCCCCAGCGTTGGGTACTGTGTGCTGCTGACTTTTGGATTCGGAGCCCTGAGCAAACATACCAAGAAAAAG  666

Query  667  AAACTCATTGCCGCTGTCGTGCTGGGAATCTTATTCATCAACACGCTGAGATGTGTGCTGCGCAGCGGCGAGTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAACTCATTGCCGCTGTCGTGCTGGGAATCTTATTCATCAACACGCTGAGATGTGTGCTGCGCAGCGGCGAGTG  740

Query  741  GCGGAGTGAGGAACAGCTTTTCAGAAGTGCTCTGTCTGTGTGTCCCCTCAATGCTAAGGTTCACTACAACATTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCGGAGTGAGGAACAGCTTTTCAGAAGTGCTCTGTCTGTGTGTCCCCTCAATGCTAAGGTTCACTACAACATTG  814

Query  815  GCAAAAACCTGGCTGATAAAGGCAACCAGACAGCTGCCATCAGATACTACCGGGAAGCTGTAAGATTAAATCCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCAAAAACCTGGCTGATAAAGGCAACCAGACAGCTGCCATCAGATACTACCGGGAAGCTGTAAGATTAAATCCC  888

Query  889  AAGTATGTTCATGCCATGAATAATCTTGGAAATATCTTAAAAGAAAGGAATGAGCTACAGGAAGCTGAGGAGCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGTATGTTCATGCCATGAATAATCTTGGAAATATCTTAAAAGAAAGGAATGAGCTACAGGAAGCTGAGGAGCT  962

Query  963  GCTGTCTTTGGCTGTTCAAATACAGCCAGACTTTGCCGCTGCGTGGATGAATCTAGGCATAGTGCAGAATAGCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTGTCTTTGGCTGTTCAAATACAGCCAGACTTTGCCGCTGCGTGGATGAATCTAGGCATAGTGCAGAATAGCC  1036

Query 1037  TGAAACGGTTTGAAGCAGCAGAGCAAAGTTACCGGACAGCAATTAAACACAGAAGGAAATACCCAGACTGTTAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGAAACGGTTTGAAGCAGCAGAGCAAAGTTACCGGACAGCAATTAAACACAGAAGGAAATACCCAGACTGTTAC  1110

Query 1111  TACAACCTCGGGCGTCTGGTAAGC-------------------------------GCGGGG-----TGCC----  1144
            ||||||||||||||||| |||.||                               |||.||     ||||    
Sbjct 1111  TACAACCTCGGGCGTCT-GTATGCAGATCTCAATCGCCACGTGGATGCCTTGAATGCGTGGAGAAATGCCACCG  1183

Query 1145  --CTG------------TGCCTG---TGGAAGGAAAGATGGGTTATTTTTC----------------TTATTTA  1185
              |||            .|||||   |||||  .||.|||    |||.|.|                |.|||||
Sbjct 1184  TGCTGAAACCAGAGCACAGCCTGGCCTGGAA--CAACATG----ATTATACTCCTCGACAATACAGGTAATTTA  1251

Query 1186  --------------------------------------------------------------------------  1185
                                                                                      
Sbjct 1252  GCCCAAGCTGAAGCAGTTGGAAGAGAGGCACTGGAATTAATACCTAATGATCACTCTCTCATGTTCTCGTTGGC  1325

Query 1186  --------------------------------------------------------------------------  1185
                                                                                      
Sbjct 1326  AAACGTGCTGGGGAAATCCCAGAAATACAAGGAATCTGAAGCTTTATTCCTCAAGGCAATTAAAGCAAATCCAA  1399

Query 1186  --------------------------------------------------------------------------  1185
                                                                                      
Sbjct 1400  ATGCTGCAAGTTACCATGGTAATTTGGCTGTGCTTTATCATCGTTGGGGACATCTAGACTTGGCCAAGAAACAC  1473

Query 1186  --------------------------------------------------------------------------  1185
                                                                                      
Sbjct 1474  TATGAAATCTCCTTGCAGCTTGACCCCACGGCATCAGGAACTAAGGAGAATTACGGTCTGCTGAGAAGAAAGCT  1547

Query 1186  -------------------------  1185
                                     
Sbjct 1548  AGAACTAATGCAAAAGAAAGCTGTC  1572