Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14337
• Subject: XM_017026074.1
• Aligned Length: 1761
• Identities: 1520
• Gaps: 198

Alignment

Query    1  ATGAAACAGCCCAACAGGAAAAGGAAGCTTAATATGGATTCCAAAGAGCGTTTGGATCAGGACGGACGCTTGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAACAGCCCAACAGGAAAAGGAAGCTTAATATGGATTCCAAAGAGCGTTTGGATCAGGACGGACGCTTGGA  74

Query   75  GCAAGCTGAAGAGGAAAAGAAGCCCAAGGATAGCACAACCCCTTTGAGTCACGTCCCTTCAGCGGCTGCACAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAAGCTGAAGAGGAAAAGAAGCCCAAGGATAGCACAACCCCTTTGAGTCACGTCCCTTCAGCGGCTGCACAGG  148

Query  149  GAGCATGGTCTTGGGAGTGGTACTTGAAAGAACAGAAGGCTGTCGCAGCACCTGTTGAGCTGTTTTCCAAGGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAGCATGGTCTTGGGAGTGGTACTTGAAAGAACAGAAGGCTGTCGCAGCACCTGTTGAGCTGTTTTCCAAGGAT  222

Query  223  CAGTCCTTTCCAGAGCATGAAAATGGTTTTCAGATTGGAATGAGATTAGAAGGCATTGATCCCCGACATCCATC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGTCCTTTCCAGAGCATGAAAATGGTTTTCAGATTGGAATGAGATTAGAAGGCATTGATCCCCGACATCCATC  296

Query  297  GGTATTCTGTGTGCTTTCTGTAGCGGAGGTTTGTGGTTACCGTCTAAGACTTCATTTTGATGGTTATTTAAGTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTATTCTGTGTGCTTTCTGTAGCGGAGGTTTGTGGTTACCGTCTAAGACTTCATTTTGATGGTTATTTAAGTT  370

Query  371  GCTATGATTTTTGGACCAATGCTGGTTCCCCTGACATTCATCCAGTAGGATGGTGTGAAAAGACCAAACATGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCTATGATTTTTGGACCAATGCTGGTTCCCCTGACATTCATCCAGTAGGATGGTGTGAAAAGACCAAACATGAA  444

Query  445  CTGCACATCCCTAAGGGTTATAGAAAAGATAAATTTGTTTGGATGGATTACTTGAAGGCCTGCAAATTGCAAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGCACATCCCTAAGGGTTATAGAAAAGATAAATTTGTTTGGATGGATTACTTGAAGGCCTGCAAATTGCAAAA  518

Query  519  TGCTCCAAAGAAATTATTCAGAAACAGAAGTCCTAATGGGCCAATGTCTAAAGAATTTCAGGTTGGAATGAAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCTCCAAAGAAATTATTCAGAAACAGAAGTCCTAATGGGCCAATGTCTAAAGAATTTCAGGTTGGAATGAAGC  592

Query  593  TGGAGGCCGTGGACAGGAAGAACCCTTCCTTGGTGTGTGTGGCGACCATAGCAGATATTGTTGAAGATCGCTTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGAGGCCGTGGACAGGAAGAACCCTTCCTTGGTGTGTGTGGCGACCATAGCAGATATTGTTGAAGATCGCTTA  666

Query  667  CTAGTGCATTTTGACAACTGGGATGATAGTTACGATTACTGGTGCGATGTTAATAGCCCTTATGTCCAGCCAGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTAGTGCATTTTGACAACTGGGATGATAGTTACGATTACTGGTGCGATGTTAATAGCCCTTATGTCCAGCCAGT  740

Query  741  TGGTTGGTGTCAGGAGAATGGAAGAACTCTGATAGCACCCCAAGGTTATCCCAATCCAGAAAATTTTTCCTGGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGTTGGTGTCAGGAGAATGGAAGAACTCTGATAGCACCCCAAGGTTATCCCAATCCAGAAAATTTTTCCTGGA  814

Query  815  CAGAATACCTGGAAGCTACTCAAACCAATGCAGTTCCTGCCAAAGTTTTTAAAATGAGGTTGCCTCATGGTTTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGAATACCTGGAAGCTACTCAAACCAATGCAGTTCCTGCCAAAGTTTTTAAAATGAGGTTGCCTCATGGTTTT  888

Query  889  CTGCCAAATATGAAACTTGAAGTTGTGGATAAACGGAACCCCAGGTTAATTCGTGTTGCTACGATTGTAGATGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGCCAAATATGAAACTTGAAGTTGTGGATAAACGGAACCCCAGGTTAATTCGTGTTGCTACGATTGTAGATGT  962

Query  963  TGATGACCAAAGAGTAAAGGTTCATTTTGATGGTTGGGACCATAAGTATGACTACTGGGTGGAGGCAGACAGCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGATGACCAAAGAGTAAAGGTTCATTTTGATGGTTGGGACCATAAGTATGACTACTGGGTGGAGGCAGACAGCC  1036

Query 1037  CTGATATCCACCCGATCGGATGGTGTGATGTCACAGGGCATCCACTGGAAGTGCCACAGCGAACGAATGACCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGATATCCACCCGATCGGATGGTGTGATGTCACAGGGCATCCACTGGAAGTGCCACAGCGAACGAATGACCTG  1110

Query 1111  AAGATCCTTCCAGGTCAAGCTGTCTGTCCTACTCCCGGGTGCCGAGGAATAGGCCATATCCGTGGTCCACGTTA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGATCCTTCCAGGTCAAGCTGTCTGTCCTACTCCCGGGTGCCGAGGAATAGGCCATATCCGTGGTCCACGTTA  1184

Query 1185  TTCGGGACATCACAGTGCTTTTGGCTGCCCGTATTCAGACATGAACTTGAAAAAGGAGGCAACACTTCACGATC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTCGGGACATCACAGTGCTTTTGGCTGCCCGTATTCAGACATGAACTTGAAAAAGGAGGCAACACTTCACGATC  1258

Query 1259  GTTTGAGAGAACAAACACAGGCAAATTTGGAATCAGACTCTTCACATTCAAAATCAAAAAGCCTCTGTAGTTTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTTTGAGAGAACAAACACAGGCAAATTTGGAATCAGACTCTTCACATTCAAAATCAAAAAGCCTCTGTAGTTTG  1332

Query 1333  AACTTCAATGGAAAACATGAAAAGGTGAACAGTCAGCCCAG--------ACTTGTAC-----------------  1381
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ..||||||                 
Sbjct 1333  AACTTCAATGGAAAACATGAAAAGGTGAACAGTCAGCCCAGGTGGCTGAGTTTGTACAGTCTCTTCTGGGCTGT  1406

Query 1382  ----AGCAGGCAAAGTG-TTTGAAAATCAAAGGAAAAGAAGATATTGACTTGGATAATCTCTTCAGAGGCCGAG  1450
                ||||.||.||||| |||        |||  |||||.||           ||.||||     |||.|.|  
Sbjct 1407  GAAGAGCATGCCAAGTGCTTT--------AAG--AAAGAGGA-----------ATCATCT-----GAGCCAG--  1452

Query 1451  TGCGGTGGC--TCA-------TGCCTGTAATCCCAGCACTT-------------TGG--------GAGGCCGAG  1494
             ||.|||.|  |||       || |.|||.||||.|.|.||             |||        ||.||.|.|
Sbjct 1453  -GCTGTGTCAATCAGAGACGCTG-CAGTAGTCCCTGGAGTTGTGCTGAGGTCACTGGGGCATCCAGAAGCTGGG  1524

Query 1495  GCAGGCAG---ATCACG------------------AGATC----------------------------------  1513
            |.|.||||   | ||||                  |||||                                  
Sbjct 1525  GAAAGCAGCCTA-CACGGTGGCCACTGCCATCCTCAGATCGATGGCAAAGCCTTCCTGCTTCTGACACAGACGG  1597

Query 1514  ---------AGGAGATCAAGACCATCCTGG--CCAACGCAGTGA--------AACCCCGTC-------TC----  1557
                     |.|.|||.||||.||..||||  |||  |||.|||        |||.|..||       ||    
Sbjct 1598  ACATTGTCAAAGTGATGAAGATCAAACTGGGCCCA--GCACTGAAGATTTACAACTCTATCCTGATGTTCAGGC  1669

Query 1558  --TACCAAAAA-------TACAAAAAATTAGC--CAGGC---GTGGTGGCGGGCGCCTA  1602
              |.|||..||       .|.||.|.||| ||  |||||   |..||...|||.     
Sbjct 1670  ATTCCCAGGAACTCCCTGAAGAAGATATT-GCCTCAGGCCAAGAAGTCAGGGGA-----  1722