Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14356
- Subject:
- NM_052885.4
- Aligned Length:
- 1944
- Identities:
- 1887
- Gaps:
- 57
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------------ATGGGCGAGCGGCGCAG 17
|||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCCCGCAAGGCAAGCGAGAATGTGGAGTACACGCTGCGGAGCCTGAGCAGCCTGATGGGCGAGCGGCGCAG 74
Query 18 GAAGCAGCCGGAGCCGGACGCGGCGAGCGCGGCCGGGGAGTGCAGCCTCCTGGCTGCCGCCGAATCGAGCACCA 91
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAAGCAGCCGGAGCCGGACGCGGCGAGCGCGGCCGGGGAGTGCAGCCTCCTGGCTGCCGCCGAATCGAGCACCA 148
Query 92 GCCTGCAGAGCGCGGGCGCGGGCGGCGGCGGCGTCGGGGACCTGGAGCGCGCGGCGCGGCGGCAGTTCCAGCAG 165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCCTGCAGAGCGCGGGCGCGGGCGGCGGCGGCGTCGGGGACCTGGAGCGCGCGGCGCGGCGGCAGTTCCAGCAG 222
Query 166 GACGAGACCCCCGCCTTCGTGTACGTGGTGGCCGTCTTCTCCGCGCTGGGCGGCTTCCTGTTTGGCTATGACAC 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GACGAGACCCCCGCCTTCGTGTACGTGGTGGCCGTCTTCTCCGCGCTGGGCGGCTTCCTGTTTGGCTATGACAC 296
Query 240 CGGGGTGGTGTCAGGGGCCATGCTGCTGCTCAAGCGGCAGCTCAGTCTGGACGCGCTGTGGCAGGAGCTGCTGG 313
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CGGGGTGGTGTCAGGGGCCATGCTGCTGCTCAAGCGGCAGCTCAGTCTGGACGCGCTGTGGCAGGAGCTGCTGG 370
Query 314 TGTCCAGCACGGTGGGGGCGGCTGCCGTCTCGGCGCTGGCCGGAGGCGCCCTCAACGGCGTCTTCGGCCGCCGC 387
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGTCCAGCACGGTGGGGGCGGCTGCCGTCTCGGCGCTGGCCGGAGGCGCCCTCAACGGCGTCTTCGGCCGCCGC 444
Query 388 GCTGCCATCCTCCTGGCCAGTGCCCTCTTCACCGCCGGCTCCGCGGTGCTGGCTGCGGCCAACAACAAGGAGAC 461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCTGCCATCCTCCTGGCCAGTGCCCTCTTCACCGCCGGCTCCGCGGTGCTGGCTGCGGCCAACAACAAGGAGAC 518
Query 462 ACTGCTCGCCGGCCGCCTGGTCGTGGGACTCGGCATCGGCATTGCTTCTATGACAGTGCCAGTGTACATTGCGG 535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ACTGCTCGCCGGCCGCCTGGTCGTGGGACTCGGCATCGGCATTGCTTCTATGACAGTGCCAGTGTACATTGCGG 592
Query 536 AGGTCTCACCACCCAATTTAAGAGGCCGATTAGTCACCATTAATACCCTCTTCATCACAGGAGGGCAGTTCTTT 609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGGTCTCACCACCCAATTTAAGAGGCCGATTAGTCACCATTAATACCCTCTTCATCACAGGAGGGCAGTTCTTT 666
Query 610 GCAAGTGTTGTTGATGGAGCCTTCAGTTATCTCCAGAAGGATGGATGGAGGTACATGTTGGGACTTGCAGCAGT 683
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCAAGTGTTGTTGATGGAGCCTTCAGTTATCTCCAGAAGGATGGATGGAGGTACATGTTGGGACTTGCAGCAGT 740
Query 684 TCCGGCGGTTATACAGTTTTTTGGCTTTCTCTTTTTGCCTGAAAGCCCTCGATGGCTTATTCAGAAAGGACAGA 757
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCCGGCGGTTATACAGTTTTTTGGCTTTCTCTTTTTGCCTGAAAGCCCTCGATGGCTTATTCAGAAAGGACAGA 814
Query 758 CTCAGAAGGCCCGTAGAATTTTATCTCAGATGCGTGGTAACCAGACCATTGATGAGGAATATGATAGCATCAAA 831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTCAGAAGGCCCGTAGAATTTTATCTCAGATGCGTGGTAACCAGACCATTGATGAGGAATATGATAGCATCAAA 888
Query 832 AACAACATTGAAGAGGAGGAAAAAGAGGTTGGCTCAGCTGGACCTGTGATCTGCAGAATGCTGAGTTATCCCCC 905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AACAACATTGAAGAGGAGGAAAAAGAGGTTGGCTCAGCTGGACCTGTGATCTGCAGAATGCTGAGTTATCCCCC 962
Query 906 AACTCGCCGAGCTTTAATTGTGGGTTGTGGCCTACAAATGTTCCAGCAGCTCTCAGGCATTAACACCATCATGT 979
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AACTCGCCGAGCTTTAATTGTGGGTTGTGGCCTACAAATGTTCCAGCAGCTCTCAGGCATTAACACCATCATGT 1036
Query 980 ACTACAGTGCAACCATTCTGCAGATGTCTGGTGTTGAAGATGATAGACTTGCAATATGGCTGGCTTCAGTTACA 1053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ACTACAGTGCAACCATTCTGCAGATGTCTGGTGTTGAAGATGATAGACTTGCAATATGGCTGGCTTCAGTTACA 1110
Query 1054 GCCTTCACAAATTTCATTTTCACACTTGTGGGAGTCTGGCTTGTTGAGAAGGTGGGCCGCAGAAAGCTTACCTT 1127
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCCTTCACAAATTTCATTTTCACACTTGTGGGAGTCTGGCTTGTTGAGAAGGTGGGCCGCAGAAAGCTTACCTT 1184
Query 1128 TGGTAGTTTAGCAGGTACCACCGTAGCACTCATTATTCTTGCCTTGGGATTTGTGCTATCAGCCCAAGTTTCCC 1201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGGTAGTTTAGCAGGTACCACCGTAGCACTCATTATTCTTGCCTTGGGATTTGTGCTATCAGCCCAAGTTTCCC 1258
Query 1202 CACGCATCACTTTTAAGCCAATAGCTCCGTCAGGTCAGAACGCCACTTGCACAAGATACAGTTACTGTAATGAA 1275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CACGCATCACTTTTAAGCCAATAGCTCCGTCAGGTCAGAACGCCACTTGCACAAGATACAGTTACTGTAATGAA 1332
Query 1276 TGTATGTTGGATCCAGACTGCGGTTTCTGCTACAAGATGAACAAATCAACTGTCATTGACTCCTCCTGTGTTCC 1349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TGTATGTTGGATCCAGACTGCGGTTTCTGCTACAAGATGAACAAATCAACTGTCATTGACTCCTCCTGTGTTCC 1406
Query 1350 AGTTAATAAAGCATCTACAAATGAGGCAGCCTGGGGCAGGTGTGAAAATGAAACCAAGTTCAAAACAGAAGATA 1423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGTTAATAAAGCATCTACAAATGAGGCAGCCTGGGGCAGGTGTGAAAATGAAACCAAGTTCAAAACAGAAGATA 1480
Query 1424 TATTTTGGGCTTACAATTTCTGCCCTACTCCATACTCCTGGACTGCACTTCTGGGCCTTATTTTATATCTTGTC 1497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TATTTTGGGCTTACAATTTCTGCCCTACTCCATACTCCTGGACTGCACTTCTGGGCCTTATTTTATATCTTGTC 1554
Query 1498 TTCTTTGCACCTGGAATGGGACCAATGCCTTGGACTGTGAATTCTGAAATATATCCCCTTTGGGCAAGAAGTAC 1571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TTCTTTGCACCTGGAATGGGACCAATGCCTTGGACTGTGAATTCTGAAATATATCCCCTTTGGGCAAGAAGTAC 1628
Query 1572 AGGAAATGCATGTTCATCTGGAATAAACTGGATTTTCAATGTCCTGGTTTCACTAACATTTTTACACACAGCAG 1645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGGAAATGCATGTTCATCTGGAATAAACTGGATTTTCAATGTCCTGGTTTCACTAACATTTTTACACACAGCAG 1702
Query 1646 AGTATCTTACATACTATGGAGCTTTCTTCCTCTATGCTGGATTTGCTGCTGTGGGACTCCTTTTCATCTATGGC 1719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGTATCTTACATACTATGGAGCTTTCTTCCTCTATGCTGGATTTGCTGCTGTGGGACTCCTTTTCATCTATGGC 1776
Query 1720 TGTCTTCCTGAGACCAAAGGCAAAAAATTAGAGGAAATTGAATCACTCTTTGACAACAGGCTATGTACATGTGG 1793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TGTCTTCCTGAGACCAAAGGCAAAAAATTAGAGGAAATTGAATCACTCTTTGACAACAGGCTATGTACATGTGG 1850
Query 1794 CACTTCAGATTCTGATGAAGGGAGATATATTGAATATATTCGGGTAAAGGGAAGTAACTATCATCTTTCTGACA 1867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CACTTCAGATTCTGATGAAGGGAGATATATTGAATATATTCGGGTAAAGGGAAGTAACTATCATCTTTCTGACA 1924
Query 1868 ATGATGCTTCTGATGTGGAA 1887
||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ATGATGCTTCTGATGTGGAA 1944