Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_14356
Subject:
NM_052885.4
Aligned Length:
648
Identities:
629
Gaps:
19

Alignment

Query   1  -------------------MGERRRKQPEPDAASAAGECSLLAAAESSTSLQSAGAGGGGVGDLERAARRQFQQ  55
                              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MSRKASENVEYTLRSLSSLMGERRRKQPEPDAASAAGECSLLAAAESSTSLQSAGAGGGGVGDLERAARRQFQQ  74

Query  56  DETPAFVYVVAVFSALGGFLFGYDTGVVSGAMLLLKRQLSLDALWQELLVSSTVGAAAVSALAGGALNGVFGRR  129
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  DETPAFVYVVAVFSALGGFLFGYDTGVVSGAMLLLKRQLSLDALWQELLVSSTVGAAAVSALAGGALNGVFGRR  148

Query 130  AAILLASALFTAGSAVLAAANNKETLLAGRLVVGLGIGIASMTVPVYIAEVSPPNLRGRLVTINTLFITGGQFF  203
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  AAILLASALFTAGSAVLAAANNKETLLAGRLVVGLGIGIASMTVPVYIAEVSPPNLRGRLVTINTLFITGGQFF  222

Query 204  ASVVDGAFSYLQKDGWRYMLGLAAVPAVIQFFGFLFLPESPRWLIQKGQTQKARRILSQMRGNQTIDEEYDSIK  277
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  ASVVDGAFSYLQKDGWRYMLGLAAVPAVIQFFGFLFLPESPRWLIQKGQTQKARRILSQMRGNQTIDEEYDSIK  296

Query 278  NNIEEEEKEVGSAGPVICRMLSYPPTRRALIVGCGLQMFQQLSGINTIMYYSATILQMSGVEDDRLAIWLASVT  351
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  NNIEEEEKEVGSAGPVICRMLSYPPTRRALIVGCGLQMFQQLSGINTIMYYSATILQMSGVEDDRLAIWLASVT  370

Query 352  AFTNFIFTLVGVWLVEKVGRRKLTFGSLAGTTVALIILALGFVLSAQVSPRITFKPIAPSGQNATCTRYSYCNE  425
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  AFTNFIFTLVGVWLVEKVGRRKLTFGSLAGTTVALIILALGFVLSAQVSPRITFKPIAPSGQNATCTRYSYCNE  444

Query 426  CMLDPDCGFCYKMNKSTVIDSSCVPVNKASTNEAAWGRCENETKFKTEDIFWAYNFCPTPYSWTALLGLILYLV  499
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  CMLDPDCGFCYKMNKSTVIDSSCVPVNKASTNEAAWGRCENETKFKTEDIFWAYNFCPTPYSWTALLGLILYLV  518

Query 500  FFAPGMGPMPWTVNSEIYPLWARSTGNACSSGINWIFNVLVSLTFLHTAEYLTYYGAFFLYAGFAAVGLLFIYG  573
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  FFAPGMGPMPWTVNSEIYPLWARSTGNACSSGINWIFNVLVSLTFLHTAEYLTYYGAFFLYAGFAAVGLLFIYG  592

Query 574  CLPETKGKKLEEIESLFDNRLCTCGTSDSDEGRYIEYIRVKGSNYHLSDNDASDVE  629
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  CLPETKGKKLEEIESLFDNRLCTCGTSDSDEGRYIEYIRVKGSNYHLSDNDASDVE  648