Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14378
• Subject: NM_138803.4
• Aligned Length: 1773
• Identities: 1313
• Gaps: 456

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTGTGCAGCTTCTGCTTCTCCAGATAATCTGGTATTCCATATGAAAAATGAGATGAGAAACATCAAGTACAA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  ACCAGTAGACTATCAACAATTGCGTGCATTAACTGAAGCAAAGAAATTGGCTTCTGCCTCTGCAAAGCTAAAGA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TCAGAAAAGCAATGTTGACTTCAAAGTTATCCAAAGAACAAACACTAATAAAACAACACAAGCAAGTGTGGTGG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CAGGAATACCAGAGGCTGAATGAAGTCAGATGTAAAATGGAATCTGAAATAAAATCCCTTCTCAATGAAGAGAA  296

Query    1  --------ATGAATGTCTTTGTGACCTTACAAATTTT-------------------------------------  29
                    |||||||||||||||||||||||||||||                                     
Sbjct  297  CATTGGAAATGAATGTCTTTGTGACCTTACAAATTTTGAGCAAGAGCTATCAGAACAACAGTGCACATATCTTA  370

Query   30  --------------------------------------------------------------------------  29
                                                                                      
Sbjct  371  AAAATGTAATAAATCCTATTCAGCAGCTGAGAGCAGATCTAAAATACAGACAGCATCACACTTTGCAGCATTCA  444

Query   30  -----------------------------------------GGTTGACTTTGTGAAGAAACAATTGAAAACTGT  62
                                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACCCACATATTGAGTTTAACTCCATGAAAGTATTGGAAGAGGTTGACTTTGTGAAGAAACAATTGAAAACTGT  518

Query   63  CTTTGAAAGACTTAGGCTGGAGCAACAGAGAATAGAAAATGATCTTTCAGACTGGAGTATAAAGATTCTAGATC  136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTTGAAAGACTTAGGCTGGAGCAACAGAGAATAGAAAATGATCTTTCAGACTGGAGTATAAAGATTCTAGATC  592

Query  137  ATTCTTTGGAAGAAAAGACTAACCCGCTTAGTGAACTGCCCATTGAATTAGAAAGTTTGGAATGCCCATACCCT  210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATTCTTTGGAAGAAAAGACTAACCCGCTTAGTGAACTGCCCATTGAATTAGAAAGTTTGGAATGCCCATACCCT  666

Query  211  GATTTGAAATCTTCAATTCTCAGTGAGTTCTATAAGTTTACACAGAAATATCAGAAGAAGCTTCAAGACTTTAA  284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATTTGAAATCTTCAATTCTCAGTGAGTTCTATAAGTTTACACAGAAATATCAGAAGAAGCTTCAAGACTTTAA  740

Query  285  TCTGCAGTTGGAAGACATATACAGAAACTGTCAACTAAGTGAAGAAGACCACTGGATTTACCAGGCTATTTTGG  358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCTGCAGTTGGAAGACATATACAGAAACTGTCAACTAAGTGAAGAAGACCACTGGATTTACCAGGCTATTTTGG  814

Query  359  ATCAGTACCCTGGAGATCTCTTTGGAAGAAGGACTCTGTATCTGGACATGTTACAAAGATATTTTCCTCACAAA  432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATCAGTACCCTGGAGATCTCTTTGGAAGAAGGACTCTGTATCTGGACATGTTACAAAGATATTTTCCTCACAAA  888

Query  433  TCTAGGCATGATTTGGTTGAACACGAGAAATATTGTGACCAATATCGCTTTGCTATAGAGCAGCAAAATATCCT  506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCTAGGCATGATTTGGTTGAACACGAGAAATATTGTGACCAATATCGCTTTGCTATAGAGCAGCAAAATATCCT  962

Query  507  GATATCAAATTGGAATAAAAATAGGAAAGACTTTATACAGAAGGCTGTGCTGACACTCACTGAGGCTTGTGCAA  580
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GATATCAAATTGGAATAAAAATAAGAAAGACTTTATACAGAAGGCTGTGCTGACACTCACTGAGGCTTGTGCAA  1036

Query  581  CACATGAAATGGAGAGCATGTTGGCTAAGGACAAGAAAAAGCAACAGGAATTGTGTGCTGATCTGAAAGCCAAG  654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CACATGAAATGGAGAGCATGTTGGCTAAGGACAAGAAAAAGCAACAGGAATTGTGTGCTGATCTGAAAGCCAAG  1110

Query  655  GTTCGTCAATGGCGAGCCCACCAAGAAGAGGTAGCAAGACTGGAAATGGAAATTTCTGCCAGAAGAAGAGAAAA  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTTCGTCAATGGCGAGCCCACCAAGAAGAGGTAGCAAGACTGGAAATGGAAATTTCTGCCAGAAGAAGAGAAAA  1184

Query  729  GGAAGAGGAGAAAGAGAAACTGTGGAAGAAGAAGGAATTGTTGCAAAGAGCAGAGAAGAAAAAAAGCATAAAAA  802
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||
Sbjct 1185  GGAAGAGGAGAAAGAGAAACTGTGGAAGAAGAAGGAATTGTTGCAAAGAGCAGAGAAGAAAAAAAAAATAAAAA  1258

Query  803  AATACTGGGCCAAGAAAAAACAGAAGTGGCAAGAAATGGAAATGAGAGATCTTCAGCGTCTAGAAGAACTGAAG  876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AATACTGGGCCAAGAAAAAACAGAAGTGGCAAGAAATGGAAATGAGAGATCTTCAGCGTCTAGAAGAACTGAAG  1332

Query  877  AAATTAATCGCTGAACAGTCACTAAAAGACAGAGAAAGGGTTAAATATAGACAAGAATTATTGGAAAGGCGTTT  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAATTAATCGCTGAACAGTCACTAAAAGACAGAGAAAGGGTTAAATATAGACAAGAATTATTGGAAAGGCGTTT  1406

Query  951  GATGGAGAAAAAGGAAGTGGCCCTTCAAGAAGCTCATGAAGACAAAGAGAGAGCACGGCGGCTAGAAGCCCTTA  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GATGGAGAAAAAGGAAGTGGCCCTTCAAGAAGCTCATGAAGACAAAGAGAGAGCACGGCGGCTAGAAGCCCTTA  1480

Query 1025  GGAAACAGGTTGCTGTTGTTGCTCAATTTGATCCTGTTAGAATGATGTCAGATACAATGGCATCAAAAGCTAGA  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGAAACAGGTTGCTGTTGTTGCTCAATTTGATCCTGTTAGAATGATGTCAGATACAATGGCATCAAAAGCTAGA  1554

Query 1099  ATGGGCATTGAAATTGAAGAAGAATTTATTCTTCAAAAGCCACTCTTCACATTGAATACATACAATGAACAGCA  1172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATGGGCATTGAAATTGAAGAAGAATTTATTCTTCAAAAGCCACTCTTCACATTGAATACATACAATGAACAGCA  1628

Query 1173  GATAATTTCTGACCCTAGACTTCGCTTCGAGTTAGCACTTCGAGAAGCTGGACTTCATAGAACACTTTATGCTA  1246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GATAATTTCTGACCCTAGACTTCGCTTCGAGTTAGCACTTCGAGAAGCTGGACTTCATAGAACACTTTATGCTA  1702

Query 1247  AAGAGATATTACCAAAAATTAGTCCTCAAAAACCTCCAAGAAAGGACATGGAGTCTACTGTATTGAAAATA  1317
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1703  AAGAGATATTACCAAAAATTAGTCCTCAAAAACCTCCAAGAAAGGACATGGAGTCTACTGTATTTAAAATA  1773