Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14378
• Subject: XM_017003395.1
• Aligned Length: 1554
• Identities: 1313
• Gaps: 237

Alignment

Query    1  ----------------------------------------------ATGAATGTCTTTGTGACCTTACAAATTT  28
                                                          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAATCTGAAATAAAATCCCTTCTCAATGAAGAGAACATTGGAAATGAATGTCTTTGTGACCTTACAAATTT  74

Query   29  T-------------------------------------------------------------------------  29
            |                                                                         
Sbjct   75  TGAGCAAGAGCTATCAGAACAACAGTGCACATATCTTAAAAATGTAATAAATCCTATTCAGCAGCTGAGAGCAG  148

Query   30  --------------------------------------------------------------------------  29
                                                                                      
Sbjct  149  ATCTAAAATACAGACAGCATCACACTTTGCAGCATTCACACCCACATATTGAGTTTAACTCCATGAAAGTATTG  222

Query   30  -----GGTTGACTTTGTGAAGAAACAATTGAAAACTGTCTTTGAAAGACTTAGGCTGGAGCAACAGAGAATAGA  98
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGAGGTTGACTTTGTGAAGAAACAATTGAAAACTGTCTTTGAAAGACTTAGGCTGGAGCAACAGAGAATAGA  296

Query   99  AAATGATCTTTCAGACTGGAGTATAAAGATTCTAGATCATTCTTTGGAAGAAAAGACTAACCCGCTTAGTGAAC  172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAATGATCTTTCAGACTGGAGTATAAAGATTCTAGATCATTCTTTGGAAGAAAAGACTAACCCGCTTAGTGAAC  370

Query  173  TGCCCATTGAATTAGAAAGTTTGGAATGCCCATACCCTGATTTGAAATCTTCAATTCTCAGTGAGTTCTATAAG  246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGCCCATTGAATTAGAAAGTTTGGAATGCCCATACCCTGATTTGAAATCTTCAATTCTCAGTGAGTTCTATAAG  444

Query  247  TTTACACAGAAATATCAGAAGAAGCTTCAAGACTTTAATCTGCAGTTGGAAGACATATACAGAAACTGTCAACT  320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTACACAGAAATATCAGAAGAAGCTTCAAGACTTTAATCTGCAGTTGGAAGACATATACAGAAACTGTCAACT  518

Query  321  AAGTGAAGAAGACCACTGGATTTACCAGGCTATTTTGGATCAGTACCCTGGAGATCTCTTTGGAAGAAGGACTC  394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGTGAAGAAGACCACTGGATTTACCAGGCTATTTTGGATCAGTACCCTGGAGATCTCTTTGGAAGAAGGACTC  592

Query  395  TGTATCTGGACATGTTACAAAGATATTTTCCTCACAAATCTAGGCATGATTTGGTTGAACACGAGAAATATTGT  468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGTATCTGGACATGTTACAAAGATATTTTCCTCACAAATCTAGGCATGATTTGGTTGAACACGAGAAATATTGT  666

Query  469  GACCAATATCGCTTTGCTATAGAGCAGCAAAATATCCTGATATCAAATTGGAATAAAAATAGGAAAGACTTTAT  542
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  667  GACCAATATCGCTTTGCTATAGAGCAGCAAAATATCCTGATATCAAATTGGAATAAAAATAAGAAAGACTTTAT  740

Query  543  ACAGAAGGCTGTGCTGACACTCACTGAGGCTTGTGCAACACATGAAATGGAGAGCATGTTGGCTAAGGACAAGA  616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACAGAAGGCTGTGCTGACACTCACTGAGGCTTGTGCAACACATGAAATGGAGAGCATGTTGGCTAAGGACAAGA  814

Query  617  AAAAGCAACAGGAATTGTGTGCTGATCTGAAAGCCAA-------------------------------------  653
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                     
Sbjct  815  AAAAGCAACAGGAATTGTGTGCTGATCTGAAAGCCAAGGAAGTGATTCTATTCAGAGATAACCAATATCATTAT  888

Query  654  --GGTTCGTCAATGGCGAGCCCACCAAGAAGAGGTAGCAAGACTGGAAATGGAAATTTCTGCCAGAAGAAGAGA  725
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTGGTTCGTCAATGGCGAGCCCACCAAGAAGAGGTAGCAAGACTGGAAATGGAAATTTCTGCCAGAAGAAGAGA  962

Query  726  AAAGGAAGAGGAGAAAGAGAAACTGTGGAAGAAGAAGGAATTGTTGCAAAGAGCAGAGAAGAAAAAAAGCATAA  799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||
Sbjct  963  AAAGGAAGAGGAGAAAGAGAAACTGTGGAAGAAGAAGGAATTGTTGCAAAGAGCAGAGAAGAAAAAAAAAATAA  1036

Query  800  AAAAATACTGGGCCAAGAAAAAACAGAAGTGGCAAGAAATGGAAATGAGAGATCTTCAGCGTCTAGAAGAACTG  873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAAAATACTGGGCCAAGAAAAAACAGAAGTGGCAAGAAATGGAAATGAGAGATCTTCAGCGTCTAGAAGAACTG  1110

Query  874  AAGAAATTAATCGCTGAACAGTCACTAAAAGACAGAGAAAGGGTTAAATATAGACAAGAATTATTGGAAAGGCG  947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGAAATTAATCGCTGAACAGTCACTAAAAGACAGAGAAAGGGTTAAATATAGACAAGAATTATTGGAAAGGCG  1184

Query  948  TTTGATGGAGAAAAAGGAAGTGGCCCTTCAAGAAGCTCATGAAGACAAAGAGAGAGCACGGCGGCTAGAAGCCC  1021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTTGATGGAGAAAAAGGAAGTGGCCCTTCAAGAAGCTCATGAAGACAAAGAGAGAGCACGGCGGCTAGAAGCCC  1258

Query 1022  TTAGGAAACAGGTTGCTGTTGTTGCTCAATTTGATCCTGTTAGAATGATGTCAGATACAATGGCATCAAAAGCT  1095
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTAGGAAACAGGTTGCTGTTGTTGCTCAATTTGATCCTGTTAGAATGATGTCAGATACAATGGCATCAAAAGCT  1332

Query 1096  AGAATGGGCATTGAAATTGAAGAAGAATTTATTCTTCAAAAGCCACTCTTCACATTGAATACATACAATGAACA  1169
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGAATGGGCATTGAAATTGAAGAAGAATTTATTCTTCAAAAGCCACTCTTCACATTGAATACATACAATGAACA  1406

Query 1170  GCAGATAATTTCTGACCCTAGACTTCGCTTCGAGTTAGCACTTCGAGAAGCTGGACTTCATAGAACACTTTATG  1243
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCAGATAATTTCTGACCCTAGACTTCGCTTCGAGTTAGCACTTCGAGAAGCTGGACTTCATAGAACACTTTATG  1480

Query 1244  CTAAAGAGATATTACCAAAAATTAGTCCTCAAAAACCTCCAAGAAAGGACATGGAGTCTACTGTATTGAAAATA  1317
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1481  CTAAAGAGATATTACCAAAAATTAGTCCTCAAAAACCTCCAAGAAAGGACATGGAGTCTACTGTATTTAAAATA  1554