Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14378
- Subject:
- XM_017003397.1
- Aligned Length:
- 1335
- Identities:
- 1313
- Gaps:
- 18
Alignment
Query 1 ------------------ATGAATGTCTTTGTGACCTTACAAATTTTGGTTGACTTTGTGAAGAAACAATTGAA 56
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGAGAACATTGGAAATGAATGTCTTTGTGACCTTACAAATTTTGGTTGACTTTGTGAAGAAACAATTGAA 74
Query 57 AACTGTCTTTGAAAGACTTAGGCTGGAGCAACAGAGAATAGAAAATGATCTTTCAGACTGGAGTATAAAGATTC 130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AACTGTCTTTGAAAGACTTAGGCTGGAGCAACAGAGAATAGAAAATGATCTTTCAGACTGGAGTATAAAGATTC 148
Query 131 TAGATCATTCTTTGGAAGAAAAGACTAACCCGCTTAGTGAACTGCCCATTGAATTAGAAAGTTTGGAATGCCCA 204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TAGATCATTCTTTGGAAGAAAAGACTAACCCGCTTAGTGAACTGCCCATTGAATTAGAAAGTTTGGAATGCCCA 222
Query 205 TACCCTGATTTGAAATCTTCAATTCTCAGTGAGTTCTATAAGTTTACACAGAAATATCAGAAGAAGCTTCAAGA 278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TACCCTGATTTGAAATCTTCAATTCTCAGTGAGTTCTATAAGTTTACACAGAAATATCAGAAGAAGCTTCAAGA 296
Query 279 CTTTAATCTGCAGTTGGAAGACATATACAGAAACTGTCAACTAAGTGAAGAAGACCACTGGATTTACCAGGCTA 352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTTTAATCTGCAGTTGGAAGACATATACAGAAACTGTCAACTAAGTGAAGAAGACCACTGGATTTACCAGGCTA 370
Query 353 TTTTGGATCAGTACCCTGGAGATCTCTTTGGAAGAAGGACTCTGTATCTGGACATGTTACAAAGATATTTTCCT 426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TTTTGGATCAGTACCCTGGAGATCTCTTTGGAAGAAGGACTCTGTATCTGGACATGTTACAAAGATATTTTCCT 444
Query 427 CACAAATCTAGGCATGATTTGGTTGAACACGAGAAATATTGTGACCAATATCGCTTTGCTATAGAGCAGCAAAA 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CACAAATCTAGGCATGATTTGGTTGAACACGAGAAATATTGTGACCAATATCGCTTTGCTATAGAGCAGCAAAA 518
Query 501 TATCCTGATATCAAATTGGAATAAAAATAGGAAAGACTTTATACAGAAGGCTGTGCTGACACTCACTGAGGCTT 574
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TATCCTGATATCAAATTGGAATAAAAATAAGAAAGACTTTATACAGAAGGCTGTGCTGACACTCACTGAGGCTT 592
Query 575 GTGCAACACATGAAATGGAGAGCATGTTGGCTAAGGACAAGAAAAAGCAACAGGAATTGTGTGCTGATCTGAAA 648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTGCAACACATGAAATGGAGAGCATGTTGGCTAAGGACAAGAAAAAGCAACAGGAATTGTGTGCTGATCTGAAA 666
Query 649 GCCAAGGTTCGTCAATGGCGAGCCCACCAAGAAGAGGTAGCAAGACTGGAAATGGAAATTTCTGCCAGAAGAAG 722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCCAAGGTTCGTCAATGGCGAGCCCACCAAGAAGAGGTAGCAAGACTGGAAATGGAAATTTCTGCCAGAAGAAG 740
Query 723 AGAAAAGGAAGAGGAGAAAGAGAAACTGTGGAAGAAGAAGGAATTGTTGCAAAGAGCAGAGAAGAAAAAAAGCA 796
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|
Sbjct 741 AGAAAAGGAAGAGGAGAAAGAGAAACTGTGGAAGAAGAAGGAATTGTTGCAAAGAGCAGAGAAGAAAAAAAAAA 814
Query 797 TAAAAAAATACTGGGCCAAGAAAAAACAGAAGTGGCAAGAAATGGAAATGAGAGATCTTCAGCGTCTAGAAGAA 870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TAAAAAAATACTGGGCCAAGAAAAAACAGAAGTGGCAAGAAATGGAAATGAGAGATCTTCAGCGTCTAGAAGAA 888
Query 871 CTGAAGAAATTAATCGCTGAACAGTCACTAAAAGACAGAGAAAGGGTTAAATATAGACAAGAATTATTGGAAAG 944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGAAGAAATTAATCGCTGAACAGTCACTAAAAGACAGAGAAAGGGTTAAATATAGACAAGAATTATTGGAAAG 962
Query 945 GCGTTTGATGGAGAAAAAGGAAGTGGCCCTTCAAGAAGCTCATGAAGACAAAGAGAGAGCACGGCGGCTAGAAG 1018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCGTTTGATGGAGAAAAAGGAAGTGGCCCTTCAAGAAGCTCATGAAGACAAAGAGAGAGCACGGCGGCTAGAAG 1036
Query 1019 CCCTTAGGAAACAGGTTGCTGTTGTTGCTCAATTTGATCCTGTTAGAATGATGTCAGATACAATGGCATCAAAA 1092
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCCTTAGGAAACAGGTTGCTGTTGTTGCTCAATTTGATCCTGTTAGAATGATGTCAGATACAATGGCATCAAAA 1110
Query 1093 GCTAGAATGGGCATTGAAATTGAAGAAGAATTTATTCTTCAAAAGCCACTCTTCACATTGAATACATACAATGA 1166
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCTAGAATGGGCATTGAAATTGAAGAAGAATTTATTCTTCAAAAGCCACTCTTCACATTGAATACATACAATGA 1184
Query 1167 ACAGCAGATAATTTCTGACCCTAGACTTCGCTTCGAGTTAGCACTTCGAGAAGCTGGACTTCATAGAACACTTT 1240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ACAGCAGATAATTTCTGACCCTAGACTTCGCTTCGAGTTAGCACTTCGAGAAGCTGGACTTCATAGAACACTTT 1258
Query 1241 ATGCTAAAGAGATATTACCAAAAATTAGTCCTCAAAAACCTCCAAGAAAGGACATGGAGTCTACTGTATTGAAA 1314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1259 ATGCTAAAGAGATATTACCAAAAATTAGTCCTCAAAAACCTCCAAGAAAGGACATGGAGTCTACTGTATTTAAA 1332
Query 1315 ATA 1317
|||
Sbjct 1333 ATA 1335