Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14378
- Subject:
- XM_017003398.1
- Aligned Length:
- 1366
- Identities:
- 1066
- Gaps:
- 281
Alignment
Query 1 ATGAATGTCTTTGTGACCTTACAAATTTTGGTTGACTTTGTGAAGAAACAATTGAAAACTGTCTTTGAAAGACT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TAGGCTGGAGCAACAGAGAATAGAAAATGATCTTTCAGACTGGAGTATAAAGATTCTAGATCATTCTTTGGAAG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AAAAGACTAACCCGCTTAGTGAACTGCCCATTGAATTAGAAAG----TTTGGAATGCCCATACCCTGATTTGAA 218
.||| |||| |||.|.|.|.||| .|||| |||||
Sbjct 1 ------------------ATGA--TGCC--TTGGAGTTGTAAGGAGAGTTGG--------------GATTT--- 35
Query 219 ATCTTCAATTCTCAGTGAGTTCTATAAGTTTACACAGAAATATCAG--AAGAAGCTTCAAGACTTTAATCTGCA 290
|||.| |.|||| ..||.|||| || .|||.|.||| ||||||
Sbjct 36 -----------------AGTAC-ACAAGT----GGAGGAATA--AGCACAGATGGTTC---------ATCTGC- 75
Query 291 GTTGGAAGACATA----TACAGAAACTGTCAACTAAGTGAAGAAGACCACTGGATTTACCAGGCTATTTTGGAT 360
|| .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 76 -----------TACTCTAACAGAAACTGTCAACTAAGTGAAGAAGACCACTGGATTTACCAGGCTATTTTGGAT 138
Query 361 CAGTACCCTGGAGATCTCTTTGGAAGAAGGACTCTGTATCTGGACATGTTACAAAGATATTTTCCTCACAAATC 434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 139 CAGTACCCTGGAGATCTCTTTGGAAGAAGGACTCTGTATCTGGACATGTTACAAAGATATTTTCCTCACAAATC 212
Query 435 TAGGCATGATTTGGTTGAACACGAGAAATATTGTGACCAATATCGCTTTGCTATAGAGCAGCAAAATATCCTGA 508
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 213 TAGGCATGATTTGGTTGAACACGAGAAATATTGTGACCAATATCGCTTTGCTATAGAGCAGCAAAATATCCTGA 286
Query 509 TATCAAATTGGAATAAAAATAGGAAAGACTTTATACAGAAGGCTGTGCTGACACTCACTGAGGCTTGTGCAACA 582
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 287 TATCAAATTGGAATAAAAATAAGAAAGACTTTATACAGAAGGCTGTGCTGACACTCACTGAGGCTTGTGCAACA 360
Query 583 CATGAAATGGAGAGCATGTTGGCTAAGGACAAGAAAAAGCAACAGGAATTGTGTGCTGATCTGAAAGCCAA--- 653
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CATGAAATGGAGAGCATGTTGGCTAAGGACAAGAAAAAGCAACAGGAATTGTGTGCTGATCTGAAAGCCAAGGA 434
Query 654 ------------------------------------GGTTCGTCAATGGCGAGCCCACCAAGAAGAGGTAGCAA 691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 435 AGTGATTCTATTCAGAGATAACCAATATCATTATTTGGTTCGTCAATGGCGAGCCCACCAAGAAGAGGTAGCAA 508
Query 692 GACTGGAAATGGAAATTTCTGCCAGAAGAAGAGAAAAGGAAGAGGAGAAAGAGAAACTGTGGAAGAAGAAGGAA 765
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 509 GACTGGAAATGGAAATTTCTGCCAGAAGAAGAGAAAAGGAAGAGGAGAAAGAGAAACTGTGGAAGAAGAAGGAA 582
Query 766 TTGTTGCAAAGAGCAGAGAAGAAAAAAAGCATAAAAAAATACTGGGCCAAGAAAAAACAGAAGTGGCAAGAAAT 839
||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 583 TTGTTGCAAAGAGCAGAGAAGAAAAAAAAAATAAAAAAATACTGGGCCAAGAAAAAACAGAAGTGGCAAGAAAT 656
Query 840 GGAAATGAGAGATCTTCAGCGTCTAGAAGAACTGAAGAAATTAATCGCTGAACAGTCACTAAAAGACAGAGAAA 913
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 GGAAATGAGAGATCTTCAGCGTCTAGAAGAACTGAAGAAATTAATCGCTGAACAGTCACTAAAAGACAGAGAAA 730
Query 914 GGGTTAAATATAGACAAGAATTATTGGAAAGGCGTTTGATGGAGAAAAAGGAAGTGGCCCTTCAAGAAGCTCAT 987
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 731 GGGTTAAATATAGACAAGAATTATTGGAAAGGCGTTTGATGGAGAAAAAGGAAGTGGCCCTTCAAGAAGCTCAT 804
Query 988 GAAGACAAAGAGAGAGCACGGCGGCTAGAAGCCCTTAGGAAACAGGTTGCTGTTGTTGCTCAATTTGATCCTGT 1061
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 805 GAAGACAAAGAGAGAGCACGGCGGCTAGAAGCCCTTAGGAAACAGGTTGCTGTTGTTGCTCAATTTGATCCTGT 878
Query 1062 TAGAATGATGTCAGATACAATGGCATCAAAAGCTAGAATGGGCATTGAAATTGAAGAAGAATTTATTCTTCAAA 1135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 879 TAGAATGATGTCAGATACAATGGCATCAAAAGCTAGAATGGGCATTGAAATTGAAGAAGAATTTATTCTTCAAA 952
Query 1136 AGCCACTCTTCACATTGAATACATACAATGAACAGCAGATAATTTCTGACCCTAGACTTCGCTTCGAGTTAGCA 1209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 953 AGCCACTCTTCACATTGAATACATACAATGAACAGCAGATAATTTCTGACCCTAGACTTCGCTTCGAGTTAGCA 1026
Query 1210 CTTCGAGAAGCTGGACTTCATAGAACACTTTATGCTAAAGAGATATTACCAAAAATTAGTCCTCAAAAACCTCC 1283
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027 CTTCGAGAAGCTGGACTTCATAGAACACTTTATGCTAAAGAGATATTACCAAAAATTAGTCCTCAAAAACCTCC 1100
Query 1284 AAGAAAGGACATGGAGTCTACTGTATTGAAAATA 1317
|||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1101 AAGAAAGGACATGGAGTCTACTGTATTTAAAATA 1134