Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14392
- Subject:
- NM_001178003.2
- Aligned Length:
- 3468
- Identities:
- 2802
- Gaps:
- 651
Alignment
Query 1 ATGTCAGATGCAGCAGAAGCTCCCCGAGAAGCAACAGGAGAAAATGGAGAAACAGAAATGAAAGAAGAGGAGGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCAGATGCAGCAGAAGCTCCCCGAGAAGCAACAGGAGAAAATGGAGAAACAGAAATGAAAGAAGAGGAGGA 74
Query 75 ACCTAATCCAAATTATAAAGAAGTAGAAGATCCACAACAGGAATCAAAAGATGACACAATAGCATGGAGAGAGT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACCTAATCCAAATTATAAAGAAGTAGAAGATCCACAACAGGAATCAAAAGATGACACAATAGCATGGAGAGAGT 148
Query 149 CTCAGGAGGAGGAGAGGAAAACGGGCGAGGAGGAAGGGGAGGAGGAGGAGAAAGAGGAGGAGGGGAAGGAGGAC 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTCAGGAGGAGGAGAGGAAAACGGGCGAGGAGGAAGGG---------------GAGGAGGAGGGGAAGGAGGAC 207
Query 223 AAAAAGATTGTCATGGAAGAAACTGAGGAAAAGGCTGGAGAAGTCCAAGAGAAGGAGGCTTCAGGAATACAGGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 208 AAAAAGATTGTCATGGAAGAAACTGAGGAAAAGGCTGGAGAAGTCCAAGAGAAGGAGGCTTCAGGAATACAGGA 281
Query 297 AGAAACCACAGTAGAGCCCCAAGAAGTCACAGCGTCCATGATCCGTTTGGAGACACAGATTACTGATTCCCAGT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 282 AGAAACCACAGTAGAGCCCCAAGAAGTCACAGCGTCCATGATCCGTTTGGAGACACAGATTACTGATTCCCAGT 355
Query 371 CAATCACATCAGGAATTTTCCCAAAAACCCAAAGAGGTAGCAAGTCAAAGCTTTCCTTACAATTGGAGGATGCA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 356 CAATCACATCAGGAATTTTCCCAAAAACCCAAAGAGGTAGCAAGTCAAAGCTTTCCTTACAATTGGAGGATGCA 429
Query 445 GAAACAGATGAGCTTTTAAGAGACCTGAGCACACAAATTGAATTTCTTGATTTGGATCAAATCAGTCCTGAGGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 430 GAAACAGATGAGCTTTTAAGAGACCTGAGCACACAAATTGAATTTCTTGATTTGGATCAAATCAGTCCTGAGGA 503
Query 519 ACAACAGATTAGTTCCCCTGAAAGGCAGCCCTCAGGAGAGCTTGAGGAGAAAACCGACCGGATGCCCCAAGATG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 504 ACAACAGATTAGTTCCCCTGAAAGGCAGCCCTCAGGAGAGCTTGAGGAGAAAACCGACCGGATGCCCCAAGATG 577
Query 593 AACTGGGACAAGAAAGAAGGGACTTGGAGCCAGAAAACAGAGAGGAGGGACAAGAAAGGAGAGTATCCGACATC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 578 AACTGGGACAAGAAAGAAGGGACTTGGAGCCAGAAAACAGAGAGGAGGGACAAGAAAGGAGAGTATCCGACATC 651
Query 667 CAGTCCAAAGCAGGGATCTCCCGGGAGTCACTGGTGTCCAGCACCACAGAGGACATTCTGTTTCAAAAGGATAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 652 CAGTCCAAAGCAGGGATCTCCCGGGAGTCACTGGTGTCCAGCACCACAGAGGACATTCTGTTTCAAAAGGATAA 725
Query 741 AAGCACCCCGGTGTATCCCTTGACCATGACCTGGTCGTTTGGATGGAACAGTTCTCTTCCTGTTTACTATATTC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 726 AAGCACCCCGGTGTATCCCTTGACCATGACCTGGTCGTTTGGATGGAACAGTTCTCTTCCTGTTTACTATATTC 799
Query 815 GAGAGGAAAGGCAGAGAGTTCTTCTGTATGTTTGTGCTCACACTGCGATCATCTACAATGTGTTCAGGAACAAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 800 GAGAGGAAAGGCAGAGAGTTCTTCTGTATGTTTGTGCTCACACTGCGATCATCTACAACGTGTTCAGGAACAAT 873
Query 889 CAATACCACCTTCAGGGCCACGCCAATATTATCTCCTGCCTCTGCGTCAGTGAAGACAGGCGGTGGATCGCCAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 874 CAATACCACCTTCAGGGCCACGCCAATATTATCTCCTGCCTCTGCGTCAGTGAAGACAGGCGGTGGATCGCCAC 947
Query 963 AGCAGACAAAGGGCCAGACTGCCTGGTGATTATATGGGACTCCTTCACAGGTATTCCTGTGCACACAATATTTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 948 AGCAGACAAAGGGCCAGACTGCCTGGTGATTATATGGGACTCCTTCACAGGTATTCCTGTGCACACAATATTTG 1021
Query 1037 ACAGCTGCCCTGAAGGGAATGGCATCATGGCCATGGCCATGACCCACGACGCCAAGTATCTGGCAACCATCTCA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1022 ACAGCTGCCCTGAAGGGAATGGCATCATGGCCATGGCCATGACCCACGACGCCAAGTATCTGGCAACCATCTCA 1095
Query 1111 GATGCTGAAGTCCAGAAGGTATGCATCTGGAAGTGGACTTTGGCAGTGGAAACGCCAGCATGCACTCTCGAACT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1096 GATGCTGAAGTCCAGAAGGTATGCATCTGGAAGTGGACTTTGGCAGTGGAAACGCCAGCATGCACTCTCGAACT 1169
Query 1185 CCCCACAGAGTACGGTGTTCAGAACTACGTTACTTTTAACCCAACAAATAATAAAGAATTGGTGAGCAATAGTA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1170 CCCCACAGAGTACGGTGTTCAGAACTACGTTACTTTTAACCCAACAAATAATAAAGAATTGGTGAGCAATAGTA 1243
Query 1259 AAACACGGGCAATATATTATGCATGGTATGAAGAGAGGGATACACTGGCTCACAGTGCCCCACTTTTAACTGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1244 AAACACGGGCAATATATTATGCATGGTATGAAGAGAGGGATACACTGGCTCACAGTGCCCCACTTTTAACTGAA 1317
Query 1333 AAAACCTTCAACAAGCTTGTGGGAAAGTTTAGCCAGTCCATCTTTCACTTGAATTTAACACAAATACTCTCAGC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318 AAAACCTTCAACAAGCTTGTGGGAAAGTTTAGCCAGTCCATCTTTCACTTGAATTTAACACAAATACTCTCAGC 1391
Query 1407 CACAATGGAAGGGAAGCTGGTTGTCTGGGACATACACCGCCCACCCTCATCTGCCTCCACCTTTTTGGGCTTTC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1392 CACAATGGAAGGGAAGCTGGTTGTCTGGGACATACACCGCCCACCCTCATCTGCCTCCACCTTTTTGGGCTTTC 1465
Query 1481 CCTATATCAAGCCTTGTAAATTGGTTCATTTGCAGAAAGAGGGTATCACGGTACTTACCACAATTGATAGCTAC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1466 CCTATATCAAGCCTTGTAAATTGGTTCATTTGCAGAAAGAGGGTATCACGGTACTTACCACAATTGATAGCTAC 1539
Query 1555 ATTGTCACAGGTGACATTAAGGGGAACATTAAGTTCTATGATCACACCCTGTCTATTGTTAACTGGTACAGTCA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1540 ATTGTCACAGGTGACATTAAGGGGAACATTAAGTTCTATGATCACACCCTGTCTATTGTTAACTGGTACAGTCA 1613
Query 1629 CTTGAAACTGGGCGCCATAAGAACTCTGTCCTTTTCAAAGACCCCAGCAACTCCTCCTACTGAAAAATCAAACT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1614 CTTGAAACTGGGCGCCATAAGAACTCTGTCCTTTTCAAAGACCCCAGCAACTCCTCCTACTGAAAAATCAAACT 1687
Query 1703 ATCCTCCTGACTGCACTTTAAAAGGTGACCTTTTTGTCTTAAGGAATTTTATCATTGGAACATCTGATGCCGCG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1688 ATCCTCCTGACTGCACTTTAAAAGGTGACCTTTTTGTCTTAAGGAATTTTATCATTGGAACATCTGATGCCGCG 1761
Query 1777 GTGTACCACTTAACAACAGATGGGACCAAACTTGAGAAGTTATTTGTAGAGCCCAAGGATGCCATTTGTGCCAT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1762 GTGTACCACTTAACAACAGATGGGACCAAACTTGAGAAGTTATTTGTAGAGCCCAAGGATGCCATTTGTGCCAT 1835
Query 1851 CTCCTGCCACCCATATCAACCCCTCATTGCCATCGGGAGCATCTGTGGGATGATCAAAGTGTGGAATTATGAAA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1836 CTCCTGCCACCCATATCAACCCCTCATTGCCATCGGGAGCATCTGTGGGATGATCAAAGTGTGGAATTATGAAA 1909
Query 1925 ACAAACAATATCTTTTCAGCAGGGTTTTTGAGAAGGGGTTTGGAGTCCAGAGTCTGACCTACAACCCCGAAGGA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1910 ACAAACAATATCTTTTCAGCAGGGTTTTTGAGAAGGGGCTTGGAGTCCAGAGTCTGACCTACAACCCCGAAGGA 1983
Query 1999 GCCCTTCTTGGAGCTGGCTTTACAGAGGGGACAGTTTACATTCTTGATGCAATGTCTTTAGAAAATGAAAGCCC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1984 GCCCTTCTTGGAGCTGGCTTTACAGAGGGGACAGTTTACATTCTTGATGCAATGTCTTTAGAAAATGAAAGCCC 2057
Query 2073 AGAGCCTTTCAAATATTCCAGAACCAGTGTGACTCATATAAGCTTTTCCCATGACTCCCAGTATATGGCAACTG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2058 AGAGCCTTTCAAATATTCCAGAACCAGTGTGACTCATATAAGCTTTTCCCATGACTCCCAGTATATGGCAACTG 2131
Query 2147 CTGATAGAAGTTTTACTGTGGCTGTTTACATGCTGGTGGTCAGAAATGGACAGAGGGTCTGGGAGTACTTAGCA 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2132 CTGATAGAAGTTTTACTGTGGCTGTTTACATGCTGGTGGTCAGAAATGGACAGAGGGTCTGGGAGTACTTAGCA 2205
Query 2221 AGACTTCGCTCTCATCGCAAAAGCATTCGAAGTCTCCTGTTTGGGGTTTACCTGGACAGCAATGAGCCTAGACT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2206 AGACTTCGCTCTCATCGCAAAAGCATTCGAAGTCTCCTGTTTGGGGTTTACCTGGACAGCAATGAGCCTAGACT 2279
Query 2295 GCTGAGCCTTGGGACAGACAGGCTCTTGATAGAGTATGATCTTCTCAGGAGCTACAAAGACCACCTGGAAGTCC 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280 GCTGAGCCTTGGGACAGACAGGCTCTTGATAGAGTATGATCTTCTCAGGAGCTACAAAGACCACCTGGAAGTCC 2353
Query 2369 TGGACATTCACCACACCGACCAGGGCTGCTATCCCACCTGCATGGTCTGGTACCCACCACTCACCAGGGAACTC 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2354 TGGACATTCACCACACCGACCAGGGCTGCTATCCCACCTGCATGGTCTGGTACCCACCACTCACCAGGGAACTC 2427
Query 2443 TTCCTGCTTATTTGCAACAGTGGCTACAAAGTGAAGCTTTTTAATGCTACTACCAAAATGTGCAGAAAGACGCT 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2428 TTCCTGCTTATTTGCAACAGTGGCTACAAAGTGAAGCTTTTTAATGCTACTACCAAAATGTGCAGAAAGACGCT 2501
Query 2517 TCTGGGGCCAGCTTATGGTTCCCCTATTGAGCAGACACAAGTCCTCCCAGTGAGAAGCATGGCGGAGCTACAGA 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2502 TCTGGGGCCAGCTTATGGTTCCCCTATTGAGCAGACACAAGTCCTCCCAGTGAGAAGCATGGCGGAGCTACAGA 2575
Query 2591 AACGCTACTTGGTGTTTATTAACAGAGACAAGTTGGGACTTCAGATCTTACCAGTTGACGGCAATCCACATAAG 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2576 AACGCTACTTGGTGTTTATTAACAGAGACAAGGTGGGACTTCAGATCTTACCAGTTGACGGCAATCCACATAAG 2649
Query 2665 ACATCTGCTATTGTTTGCCACCCGAACGGGGTGGCCGGCATGGCCGTTTCCTATGATGGCTGCTACGCCTTCAC 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2650 ACATCTGCTATTGTTTGCCACCCGAACGGGGTGGCCGGCATGGCCGTTTCCTATGATGGCTGCTACGCCTTCAC 2723
Query 2739 TGCGGGAGGGCACGATCGCTCGGTGGTGCAGTGGAAAATCACCTTAAG-TGTCCTGG-----AGGCAGCGGTTT 2806
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ..|||||| |||||.|
Sbjct 2724 TGCGGGAGGGCACGATCGCTCGGTGGTGCAGTGGAAAATCACCTTAAGCCATCCTGGGAGCCAGGCACC----- 2792
Query 2807 CTCTTGGGGGTGAAGACTTGACCCCATTCTATGGTCTGCTGTCTGGTGGCCGGGAAGGAAAATTCTACAGGGAG 2880
||.| ||..|||||| .||..|.|| ||.|.||
Sbjct 2793 ------------AATA-TTATCCCCAT---------------------------CAGACACAT----CAAGAAG 2822
Query 2881 CTAGAAGACTACTTCTACTATTCTCAGCTCCGCAGTCAAGGCATCGACACAATGGAGACCAGAAAGGTGTCAGA 2954
|
Sbjct 2823 C------------------------------------------------------------------------- 2823
Query 2955 ACACATTTGCCTGTCAGAGCTTCCTTTTGTCATGAGAGCAATTGGCTTTTACCCATCTGAAGAGAAGATTGATG 3028
Sbjct 2824 -------------------------------------------------------------------------- 2823
Query 3029 ATATATTTAACGAAATCAAATTTGGTGAATATGTGGACACTGGAAAGCTAATCGACAAGATCAACTTACCAGAT 3102
Sbjct 2824 -------------------------------------------------------------------------- 2823
Query 3103 TTCCTAAAAGTGTACCTTAACCACAAGCCACCTTTTGGTAACACCATGAGTGGCATCCACAAGAGCTTTGAGGT 3176
Sbjct 2824 -------------------------------------------------------------------------- 2823
Query 3177 GCTCGGTTATACCAACTCCAAAGGGAAAAAGGCCATTCGAAGAGAGGACTTCCTGAGACTGCTCGTTACTAAAG 3250
Sbjct 2824 -------------------------------------------------------------------------- 2823
Query 3251 GTGAGCATATGACGGAGGAGGAGATGTTGGATTGCTTTGCTTCACTGTTTGGCCTGAATCCCGAGGGATGGAAA 3324
Sbjct 2824 -------------------------------------------------------------------------- 2823
Query 3325 TCCGAGCCTGCAACCTGCTCCGTCAAAGGTTCAGAAATTTGCCTTGAAGAAGAACTTCCAGACGAAATCACTGC 3398
Sbjct 2824 -------------------------------------------------------------------------- 2823
Query 3399 AGAAATATTCGCGACTGAAATTCTTGGCTTAACCATTTCAGAAGATTCCGCCCAGGATTGTCAG 3462
Sbjct 2824 ---------------------------------------------------------------- 2823