Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14427
- Subject:
- XM_005270593.2
- Aligned Length:
- 1655
- Identities:
- 1579
- Gaps:
- 67
Alignment
Query 1 ATGAGGATTGGGAAGAGATTCGGTGCTGTCCTGGAGGCCCTGGAGAAGGGGCAGCCCGTGGATCTGAGTGCCAT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGGATTGGGAAGAGATTCGGTGCTGTCCTGGAGGCCCTGGAGAAGGGGCAGCCCGTGGATCTGAGTGCCAT 74
Query 75 GCCCCCGGCACCTGAGGATCTGAAGCCCCAGCAGGCTTCTCAGGCTCCCACAGCACCCTCAGTCATTCCCCCAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCCCCCGGCACCTGAGGATCTGAAGCCCCAGCAGGCTTCTCAGGCTCCCACAGCACCCTCAGTCATTCCCCCAG 148
Query 149 CCGTGGAGCGAGTGCAGCCAGTGATGGCCCCTGACGTCCCAGCAACCCCAGTGGCCCCTACAGAGTCACAGACA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCGTGGAGCGAGTGCAGCCAGTGATGGCCCCTGACGTCCCAGCAACCCCAGTGGCCCCTACAGAGTCACAGACA 222
Query 223 GTGCTGGATGCCCTGCAGCAGAGGCTGAACAAGTACCGCGAGGCGGGCATCCAGGCCCGGAGTGGTGGGGACGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTGCTGGATGCCCTGCAGCAGAGGCTGAACAAGTACCGCGAGGCGGGCATCCAGGCCCGGAGTGGTGGGGACGA 296
Query 297 GCGCAAGGCTCGGATGCATGAGCGCATTGCCAAGCAATATCAAGATGCTATTCGAGCACACCGAGCAGGACGGA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCGCAAGGCTCGGATGCATGAGCGCATTGCCAAGCAATATCAAGATGCTATTCGAGCACACCGAGCAGGACGGA 370
Query 371 AAGTCAACTTTGCTGAATTGCCTGTTCCTCCAGGATTTCCCCCCATCCCTGGCCTGGAGTCCACTATGGGTGTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGTCAACTTTGCTGAATTGCCTGTTCCTCCAGGATTTCCCCCCATCCCTGGCCTGGAGTCCACTATGGGTGTT 444
Query 445 GAGGAGGACGCAGTGGCAGCGACATTGGCAGCTGCAGAGAAACTGGCCTCTGCAGAGGATTCAGCCCCGGCTGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAGGAGGACGCAGTGGCAGCGACATTGGCAGCTGCAGAGAAACTGGCCTCTGCAGAGGATTCAGCCCCGGCTGA 518
Query 519 TAAAGACGAGGACG------------------AGGGTGAGCCCCCAGCACAGGCCCCAGTGGCCAAGAAACCTG 574
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TAAAGACGAGGACGAGCCTCCTGGGCACCTGCAGGGTGAGCCCCCAGCACAGGCCCCAGTGGCCAAGAAACCTG 592
Query 575 CACGGCCCACAGTCCCTTCATCCCAGCGCCTGCCTGAGCCCAGGGCCTCAAGTTCTAAGGAGTCACCGAGTCCA 648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CACGGCCCACAGTCCCTTCATCCCAGCGCCTGCCTGAGCCCAGGGCCTCAAGTTCTAAGGAGTCACCGAGTCCA 666
Query 649 TCTGTGCGGGAGCAGCTGGCACTGCTGGAGGCACGGAAACTGCAGTATCAGCGGGCAGCCCTGCAGGCCAAGCG 722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCTGTGCGGGAGCAGCTGGCACTGCTGGAGGCACGGAAACTGCAGTATCAGCGGGCAGCCCTGCAGGCCAAGCG 740
Query 723 CAGCCAGGACCTGGAGCAGGCCAAAGCCTATCTGCGGGTAGCCAAATGGCTTGAGGCTCAGATCATCCAGGCCC 796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAGCCAGGACCTGGAGCAGGCCAAAGCCTATCTGCGGGTAGCCAAATGGCTTGAGGCTCAGATCATCCAGGCCC 814
Query 797 GATCTGGCAGACCTGTTGATCTGTCCAAGGTGCCTTCGCCCTTGACGGATGAGGAGGGTGACTTCATCCTCATC 870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GATCTGGCAGACCTGTTGATCTGTCCAAGGTGCCTTCGCCCTTGACGGATGAGGAGGGTGACTTCATCCTCATC 888
Query 871 CACCATGAGGACCTGCGACTCTCCCAGAAGGCGGAGGAGGTGTATGCCCAGCTGCAAAAAATGCTTCTGGAGCA 944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CACCATGAGGACCTGCGACTCTCCCAGAAGGCGGAGGAGGTGTATGCCCAGCTGCAAAAAATGCTTCTGGAGCA 962
Query 945 ACAAGAGAAGTGCCTGCTGTTCTCCAAGCAGTTCATGCACCAGGGCAACGTGGCTGAGACCACCCGATTTGAGA 1018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACAAGAGAAGTGCCTGCTGTTCTCCAAGCAGTTCATGCACCAGGGCAACGTGGCTGAGACCACCCGATTTGAGA 1036
Query 1019 AGCTTGCTCAGGACCGCAAGAAACAGCTGGAGATCCTGCAGCTGGCCCAGGCTCAGGGCCTCGACCCTCCCACC 1092
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGCTTGCTCAGGACCGCAAGAAACAGCTGGAGATCCTGCAGCTGGCCCAGGCTCAGGGCCTCGACCCTCCCACC 1110
Query 1093 CACCACTTTGAGTTGAAGACATTCCAGACTGTGAGGATCTTCTCAGAACTCAACAGCACAGAAATGCATCTGAT 1166
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CACCACTTTGAGTTGAAGACATTCCAGACTGTGAGGATCTTCTCAGAACTCAACAGCACAGAAATGCATCTGAT 1184
Query 1167 CATTGTCCGGGGAATGAACCTCCCAGCCCCTCCAGGGGTGACTCCCGATGACCTGGATGCTTTTGTGCGGTTTG 1240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CATTGTCCGGGGAATGAACCTCCCAGCCCCTCCAGGGGTGACTCCCGATGACCTGGATGCTTTTGTGCGGTTTG 1258
Query 1241 AGTTTCACTACCCTAACTCGGACCAGGCTCAAAAAAGCAAAACAGCTGTGGTGAAGAACACAAACTCTCCAGAA 1314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGTTTCACTACCCTAACTCGGACCAGGCTCAAAAAAGCAAAACAGCTGTGGTGAAGAACACAAACTCTCCAGAA 1332
Query 1315 TTTGATCAACTCTTCAAACTAAACATCAACCGAAACCACCGGGGCTTCAAGAGGGTGATCCAGAGCAAAGGCAT 1388
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TTTGATCAACTCTTCAAACTAAACATCAACCGAAACCACCGGGGCTTCAAGAGGGTGATCCAGAGCAAAGGCAT 1406
Query 1389 CAAGTTTGAGATCTTCCACAAAGGGTCCTTCTTCAGAAGCGACAAGCTGGTTGGCACAGCACACCTGAAACTGG 1462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CAAGTTTGAGATCTTCCACAAAGGGTCCTTCTTCAGAAGCGACAAGCTGGTTGGCACAGCACACCTGAAACTGG 1480
Query 1463 AGCGGCTGGAGAATGAGTGTGAGATCAGAGAAATTGTGGAGGTCCTGGATGGAAGGAAGCCCACCGGGGGGAAG 1536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGCGGCTGGAGAATGAGTGTGAGATCAGAGAAATTGTGGAGGTCCTGGATGGAAGGAAGCCCACCGGGGGGAAG 1554
Query 1537 CTGGAGGTGAAGCCGATGGCCAGCACCAGGAG---ATGAGTCAGGCCGCGACTGTGCAG---------GAGA-- 1596
||||||||||||..|| .||..|.|||| .||||| ||||..|| ||||||| ||||
Sbjct 1555 CTGGAGGTGAAGGTGA-----GGCTGCGGGAGCCTCTGAGT--GGCCAGGA-TGTGCAGATGGTCACTGAGAAC 1620
Query 1597 --------------------------- 1596
Sbjct 1621 TGGCTGGTTCTGGAGCCCAGGGGCTTG 1647