Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14460
- Subject:
- NM_198082.4
- Aligned Length:
- 2746
- Identities:
- 2246
- Gaps:
- 494
Alignment
Query 1 ATGCTGCCACTGGGCTCAGAGCCCGCCCTGAATGAGCTGCTGCTTCGCAAGGAGGAGGAGTGGAGGGCGCTGCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTGCCACTGGGCTCAGAGCCCGCCCTGAATGAGCTGCTGCTTCGCAAGGAGGAGGAGTGGAGGGCGCTGCA 74
Query 75 GGCACACCGCACCCAGCTGCAGGAGGCGGCTCTGCAGGACACACGGAGCCAGCTGGAGGAGGCGCAGGGGAAAC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGCACACCGCACCCAGCTGCAGGAGGCGGCTCTGCAGGACACACGGAGCCAGCTGGAGGAGGCGCAGGGGAAAC 148
Query 149 TGCGGTGCCTGCAGGAGGACTTTGTCTACAACCTTCAGGTGCTGGAGGAGCGGGACCTCGAGCTGGAGCGCTAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGCGGTGCCTGCAGGAGGACTTTGTCTACAACCTTCAGGTGCTGGAGGAGCGGGACCTCGAGCTGGAGCGCTAT 222
Query 223 GACGCCGCCTTCGCCCAGGCCAGGGAGTGGGAGGAGGCCAGGCGGGCAGAGGTGAGCGAGCTCAAGATAGAGGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GACGCCGCCTTCGCCCAGGCCAGGGAGTGGGAAGAGGCCAGGCGGGCAGAGGTGAGCGAGCTCAAGATAGAGGC 296
Query 297 AGCTAAGCTGAGGCAGGCGCTAGCCAGAGAGGCCAGGAAGGTGGAGGAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCTGGCAT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGCTAAGCTGAGGCAGGCGCTAGCCAGAGAGGCCAGGAAGGTGGAGGAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCTGGCAT 370
Query 371 TCCAGGAGCATCGCCTGGAGCTGGAGCGCGTCCACAGTGACAAGAATGGTGAGATTGACCACCACCGGGAACAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCCAGGAGCATCGCCTGGAGCTGGAGCGCGTCCACAGTGACAAGAATGGTGAGATTGACCACCACCGGGAACAG 444
Query 445 TATGAAAATCTAAAATGGACACTGGAGAGAAAACTTGAGGAGCTCGACGGTGAGCTTGCTCTGCAGAGACAGGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TATGAAAATCTAAAATGGACACTGGAGAGAAAACTTGAGGAGCTCGACGGTGAGCTTGCTCTGCAGAGACAGGA 518
Query 519 ACTGCTGCTGGAGTTTGAATCGAAAATGCGGAAGAGGGAGCACGAATTCCGTCTGCAGGCTGACAACATGAGCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ACTGCTGCTGGAGTTTGAATCGAAAATGCGGAAGAGGGAGCACGAATTCCGTCTGCAGGCTGACAACATGAGCA 592
Query 593 ACACAGCCTTGTCCCGGGAGCTTAAGGTTAAACTACTGCACAAAGAGCTGGAGGCTCTGAAGGAAGCCGGGGCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACACAGCCTTGTCCCGGGAGCTTAAGGTTAAACTACTGCACAAAGAGCTGGAGGCTCTGAAGGAAGCCGGGGCA 666
Query 667 AAGGCTGCAGAGAGTCTGCAGAGGGCAGAGGCCACCAACGCCGAGCTGGAGAGGAAGCTCCAGAGCCGAGCCGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGGCTGCAGAGAGTCTGCAGAGGGCAGAGGCCACCAACGCCGAGCTGGAGAGGAAGCTCCAGAGCCGAGCCGG 740
Query 741 GGAGCTCCAGGATCTGGAGGCCATGAGCCGCGCCCGGGTAAAGGATTTAGAGGATAAACTTCACTCTGTGCAGC 814
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGAGCTCCAGGACCTGGAGGCCATGAGCCGCGCCCGGGTAAAGGATTTAGAGGATAAACTTCACTCTGTGCAGC 814
Query 815 TAACCAGGAAGAAGGAAGAGGAAACATTTAAGAGGAAGCATGAGGAGCTCGACCGTCTGGCCAGGGAGAAGGAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TAACCAGGAAGAAGGAAGAGGAAACATTTAAGAGGAAGCATGAGGAGCTCGACCGTCTGGCCAGGGAGAAGGAT 888
Query 889 GCAGTGCTGGTGGCGGTGAAGGGAGCCCACGTGGAGCAGCTGCAGGAGCTGCAGACCAGGGTTCTGGAGCTGCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GCAGTGCTGGTGGCGGTGAAGGGAGCCCACGTGGAGCAGCTGCAGGAGCTGCAGACCAGGGTTCTGGAGCTGCA 962
Query 963 GGCCCACTGCGAGACCCTCGAGGCGCAGCTCCGCAGGGCAGAGTGGAGACAGGCTGACACCGCCAAGGAGAAGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGCCCACTGCGAGACCCTCGAGGCGCAGCTCCGCAGGGCAGAGTGGAGACAGGCTGACACCGCCAAGGAGAAGG 1036
Query 1037 ACGCTGCCATTGACCAACTTCGTGAAGATGCATCAACTGTAAAATCTGCCTGGGATGCTCAAATTGCTCAACTA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ACGCTGCCATTGACCAACTTCGTGAAGATGCATCAACTGTAAAATCTGCCTGGGATGCTCAAATTGCTCAACTA 1110
Query 1111 TCTAAGGAGATGGTCTCCAGAGACCTTCAGATTCAGACGCTGCAGGAAGAAGAGGTGAAGCTCAAGGCACAGGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCTAAGGAGATGGTCTCCAGAGACCTTCAGATTCAGACGCTGCAGGAAGAAGAGGTGAAGCTCAAGGCACAGGT 1184
Query 1185 GGCCCGATCCCAGCAGGACATTGAAAGGTACAAGCAACAGCTGTCCCTGGCAGTGGAAAGGGAGCGGAGCCTGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGCCCGATCCCAGCAGGACATTGAAAGGTACAAGCAACAGCTGTCCCTGGCAGTGGAAAGGGAGCGGAGCCTGG 1258
Query 1259 AGCGTGATCAGGTGCAGCTGGGCCTGGACTGGCAGCGCCGCTGTGATGACATTGAAAGGGACCAGATCCAAAAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGCGTGATCAGGTGCAGCTGGGCCTGGACTGGCAGCGCCGCTGTGATGACATTGAAAGGGACCAGATCCAAAAG 1332
Query 1333 TCAGAGGCCCTGATTCAGGGTCTGAGCATGGCAAAAAGTCAGGTTGCTGCCAAGCTGCAGGAGACAGAGCAGGC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TCAGAGGCCCTGATTCAGGGTCTGAGCATGGCAAAAAGTCAGGTTGCTGCCAAGCTGCAGGAGACAGAGCAGGC 1406
Query 1407 GCTACAGGAGCAGGAGGTGGTGCTGAAGGCCATGACCCTGGAACGAGACCAGGCCGTGCAGGCCCTGAGGATGC 1480
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GCTACAGGAGCAGGAGGTGGTGCTGAAGGCCGTGACCCTGGAACGAGACCAGGCCGTGCAGGCCCTGAGGATGC 1480
Query 1481 ATGGGCTCCCCAGACCAGGGGCACAGATGCTTCTCAGGCAGCATGAAGAAGAAATAAGTAAAGACTTTCCATCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ATGGGCTCCCCAGACCAGGGGCACAGATGCTTCTCAGGCAGCATGAAGAAGAAATAAGTAAAGACTTTCCATCC 1554
Query 1555 AGTGAGATCCAGCGGCTCCGAGAGCAGAACACGAGCTTGCGAAACGCGATTGCCCAGATGAGGAAAGAAATGGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGTGAGATCCAGCGGCTCCGAGAGCAGAACACGAGCTTGCGAAACGCGATTGCCCAGATGAGGAAAGAAATGGA 1628
Query 1629 GGCTCTAAGCCATCAGATTCCTCCTCCCATCCAGACAGCGGCAGAGAGCACAGATGCAAACCAGCCTGACCCAG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GGCTCTAAGCCATCAGATTCCTCCTCCCATCCAGACAGCGGCAGAGAGCACAGATGCAAACCAGCCTGACCCAG 1702
Query 1703 AGGCTGGGGGAGATGCCGCCACTCCTGATTATGTTCTGGCCCTTGAAGCAGAAATACGAACTCTAAAGCATAAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGGCTGGGGGAGATGCCGCCACTCCTGATTATGTTCTGGCCCTTGAAGCAGAAATACGAACTCTAAAGCATAAG 1776
Query 1777 TTTAAAACTCTGGAAAAGCATCTAGAAGATGTGTTGGATCCTTTAAAGATGTCCTCACCTCATGCTGAGTCTCA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TTTAAAACTCTGGAAAAGCATCTAGAAGATGTGTTGGATCCTTTAAAGATGTCCTCACCTCATGCTGAGTCTCA 1850
Query 1851 GCCCAGCGTCCGCACCTCGACAGAGACGACTGGAGGGTCTGCCCAAGCTGGTCAAGCCGGAGGGTCTGTCCAAG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GCCCAGCGTCCGCACCTCGACAGAGACGACTGGAGGGTCTGCCCAAGCTGGTCAAGCCGGAGGGTCTGTCCAAG 1924
Query 1925 CTGGTCAAGCAGGAGGATCTGTCCAAGCTGGCCCAGTATCCTCTGGACTGGCACTCAGGAAGCTCGGGGACAGA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CTGGTCAAGCAGGAGGATCTGTCCAAGCTGGCCCAGTATCCTCTGGACTGGCACTCAGGAAGCTCGGGGACAGA 1998
Query 1999 GTGCAGCTCCTAAACCTGCTGGTGACACGACTCAGACAGAAGGTGCTGCGGGAACCCCTGGAGCCGGCCGCTCT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GTGCAGCTCCTAAACCTGCTGGTGACACGACTCAGACAGAAGGTGCTGCGGGAACCCCTGGAGCCGGCCGCTCT 2072
Query 2073 CCAGCGTGAGCTTCCCCGTGAGGTGGACCAGGTACACCTGGAGGTTTTGGAGCTGCGGAAGCAGGTGGCTGAGC 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CCAGCGTGAGCTTCCCCGTGAGGTGGACCAGGTACACCTGGAGGTTTTGGAGCTGCGGAAGCAGGTGGCTGAGC 2146
Query 2147 TGGGGAAGCATCTCAGGATAGCCCAGCACGGGGGAGCGGAGCCTTCAGGCAGGAAGCAGCCCCCAGCCTCGGAC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TGGGGAAGCATCTCAGGATAGCCCAGCACGGGGGAGCGGAGCCTTCAGGCAGGAAGCAGCCCCCAGCCTCGGAC 2220
Query 2221 GCCGTGGCCCTTGGGAGAGAGG------TGGGTGNCCGC----------------------------------- 2253
|||||||||||||||||||||| .|.||| |||.
Sbjct 2221 GCCGTGGCCCTTGGGAGAGAGGACGCCAAGAGTG-CCGAGGATGAGGCTCCTTCCAGACACTTGGGAAAGCACC 2293
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 2294 AGCCCCGCTCAGCACAGGTGGGCAGCAGACTTGACGCCCTGCAAGGCCCGAAGACACAACACAGCATCCACACG 2367
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 2368 GTGACCTGTAAATCACCTCGGCAGAAAGAAGACAGGTCCCCAAAGCCACCCCAGGCTCCCCAGCACCCTGAGGA 2441
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 2442 GCATGGTCGCCAATCCCACAGCTCCTCCTCCTTTGCCAGTGGCACCCTCCAGGACATGTGGAGGTTGCTAGACC 2515
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 2516 TGGGATCCAGCCCTTCTGGTGTCACCTCCCAGGGTGACTCAACTCCAGAGCTCCCAGCTCCTCCAGCAGCCGAC 2589
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 2590 AGGAGGCCCGTCAAGATGCAGGCAGGCATTGCCACCCCAGGGATGAAGACAGCAGCCCAGGCAAAGGCCAAGAC 2663
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 2664 CACAGGAGCCTCCCGGTCTCATCCTGCAAAAGCTAAAGGCTGCCAGAGGCCCCCCAAGATCCGTAACTACAACA 2737
Query 2254 -------- 2253
Sbjct 2738 TTATGGAC 2745