Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14460
• Subject: XM_011523545.3
• Aligned Length: 3594
• Identities: 2242
• Gaps: 1347

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCTGTGGCTACTCTTCGGCAGTCAGTGGAGGAAGTGAAAAAAAACACGGGGTCACAGGTATTTCTGGAAAA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTCAAACTGTTTTTCCTCTACTCTGATACCACAAGAATCATCAGCACAGAGGAAGACTTCTGTGATCAAATGTG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GTGGGAGAGGGAGGTTTTCACCAGCACATGAGCAGTCAGTTCTGCCGCAGACTCGGCGGGTGTCCTTCGGTTCA  222

Query    1  ------------------------------------------------ATGCTGCCACTGGGCTCAGAGCCCGC  26
                                                            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTTCCAACACCGCCTGCCTGGAGAGAGGTCAGACCACAGGCGGCCACCATGCTGCCACTGGGCTCAGAGCCCGC  296

Query   27  CCTGAATGAGCTGCTGCTTCGCAAGGAGGAGGAGTGGAGGGCGCTGCAGGCACACCGCACCCAGCTGCAGGAGG  100
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTGAATGAGCTGCTGCTTCGCAAGGAGGAGGAGTGGAGGGCGCTGCAGGCACACCGCACCCAGCTGCAGGAGG  370

Query  101  CGGCTCTGCAGGACACACGGAGCCAGCTGGAGGAGGCGCAGGGGAAACTGCGGTGCCTGCAGGAGGACTTTGTC  174
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGGCTCTGCAGGACACACGGAGCCAGCTGGAGGAGGCGCAGGGGAAACTGCGGTGCCTGCAGGAGGACTTTGTC  444

Query  175  TACAACCTTCAGGTGCTGGAGGAGCGGGACCTCGAGCTGGAGCGCTATGACGCCGCCTTCGCCCAGGCCAGGGA  248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TACAACCTTCAGGTGCTGGAGGAGCGGGACCTCGAGCTGGAGCGCTATGACGCCGCCTTCGCCCAGGCCAGGGA  518

Query  249  GTGGGAGGAGGCCAGGCGGGCAGAGGTGAGCGAGCTCAAGATAGAGGCAGCTAAGCTGAGGCAGGCGCTAGCCA  322
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTGGGAAGAGGCCAGGCGGGCAGAGGTGAGCGAGCTCAAGATAGAGGCAGCTAAGCTGAGGCAGGCGCTAGCCA  592

Query  323  GAGAGGCCAGGAAGGTGGAGGAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCTGGCATTCCAGGAGCATCGCCTGGAGCTGGAG  396
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAGAGGCCAGGAAGGTGGAGGAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCTGGCATTCCAGGAGCATCGCCTGGAGCTGGAG  666

Query  397  CGCGTCCACAGTGACAAGAATGGTGAGATTGACCACCACCGGGAACAGTATGAAAATCTAAAATGGACACTGGA  470
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGCGTCCACAGTGACAAGAATGGTGAGATTGACCACCACCGGGAACAGTATGAAAATCTAAAATGGACACTGGA  740

Query  471  GAGAAAACTTGAGGAGCTCGACGGTGAGCTTGCTCTGCAGAGACAGGAACTGCTGCTGGAGTTTGAATCGAAAA  544
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAGAAAACTTGAGGAGCTCGACGGTGAGCTTGCTCTGCAGAGACAGGAACTGCTGCTGGAGTTTGAATCGAAAA  814

Query  545  TGCGGAAGAGGGAGCACGAATTCCGTCTGCAGGCTGACAACATGAGCAACACAGCCTTGTCCCGGGAGCTTAAG  618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCGGAAGAGGGAGCACGAATTCCGTCTGCAGGCTGACAACATGAGCAACACAGCCTTGTCCCGGGAGCTTAAG  888

Query  619  GTTAAACTACTGCACAAAGAGCTGGAGGCTCTGAAGGAAGCCGGGGCAAAGGCTGCAGAGAGTCTGCAGAGGGC  692
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTTAAACTACTGCACAAAGAGCTGGAGGCTCTGAAGGAAGCCGGGGCAAAGGCTGCAGAGAGTCTGCAGAGGGC  962

Query  693  AGAGGCCACCAACGCCGAGCTGGAGAGGAAGCTCCAGAGCCGAGCCGGGGAGCTCCAGGATCTGGAGGCCATGA  766
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  963  AGAGGCCACCAACGCCGAGCTGGAGAGGAAGCTCCAGAGCCGAGCCGGGGAGCTCCAGGACCTGGAGGCCATGA  1036

Query  767  GCCGCGCCCGGGTAAAGGATTTAGAGGATAAACTTCACTCTGTGCAGCTAACCAGGAAGAAGGAAGAGGAAACA  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCCGCGCCCGGGTAAAGGATTTAGAGGATAAACTTCACTCTGTGCAGCTAACCAGGAAGAAGGAAGAGGAAACA  1110

Query  841  TTTAAGAGGAAGCATGAGGAGCTCGACCGTCTGGCCAGGGAGAAGGATGCAGTGCTGGTGGCGGTGAAGGGAGC  914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTTAAGAGGAAGCATGAGGAGCTCGACCGTCTGGCCAGGGAGAAGGATGCAGTGCTGGTGGCGGTGAAGGGAGC  1184

Query  915  CCACGTGGAGCAGCTGCAGGAGCTGCAGACCAGGGTTCTGGAGCTGCAGGCCCACTGCGAGACCCTCGAGGCGC  988
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCACGTGGAGCAGCTGCAGGAGCTGCAGACCAGGGTTCTGGAGCTGCAGGCCCACTGCGAGACCCTCGAGGCGC  1258

Query  989  AGCTCCGCAGGGCAGAGTGGAGACAGGCTGACACCGCCAAGGAGAAGGACGCTGCCATTGACCAACTTCGTGAA  1062
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGCTCCGCAGGGCAGAGTGGAGACAGGCTGACACCGCCAAGGAGAAGGACGCTGCCATTGACCAACTTCGTGAA  1332

Query 1063  GATGCATCAACTGTAAAATCTGCCTGGGATGCTCAAATTGCTCAACTATCTAAGGAGATGGTCTCCAGAGACCT  1136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GATGCATCAACTGTAAAATCTGCCTGGGATGCTCAAATTGCTCAACTATCTAAGGAGATGGTCTCCAGAGACCT  1406

Query 1137  TCAGATTCAGACGCTGCAGGAAGAAGAGGTGAAGCTCAAGGCACAGGTGGCCCGATCCCAGCAGGACATTGAAA  1210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCAGATTCAGACGCTGCAGGAAGAAGAGGTGAAGCTCAAGGCACAGGTGGCCCGATCCCAGCAGGACATTGAAA  1480

Query 1211  GGTACAAGCAACAGCTGTCCCTGGCAGTGGAAAGGGAGCGGAGCCTGGAGCGTGATCAGGTGCAGCTGGGCCTG  1284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGTACAAGCAACAGCTGTCCCTGGCAGTGGAAAGGGAGCGGAGCCTGGAGCGTGATCAGGTGCAGCTGGGCCTG  1554

Query 1285  GACTGGCAGCGCCGCTGTGATGACATTGAAAGGGACCAGATCCAAAAGTCAGAGGCCCTGATTCAGGGTCTGAG  1358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GACTGGCAGCGCCGCTGTGATGACATTGAAAGGGACCAGATCCAAAAGTCAGAGGCCCTGATTCAGGGTCTGAG  1628

Query 1359  CATGGCAAAAAGTCAGGTTGCTGCCAAGCTGCAGGAGACAGAGCAGGCGCTACAGGAGCAGGAGGTGGTGCTGA  1432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CATGGCAAAAAGTCAGGTTGCTGCCAAGCTGCAGGAGACAGAGCAGGCGCTACAGGAGCAGGAGGTGGTGCTGA  1702

Query 1433  AGGCCATGACCCTGGAACGAGACCAGGCCGTGCAGGCCCTGAGGATGCATGGGCTCCCCAGACCAGGGGCACAG  1506
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGGCCGTGACCCTGGAACGAGACCAGGCCGTGCAGGCCCTGAGGATGCATGGGCTCCCCAGACCAGGGGCACAG  1776

Query 1507  ATGCTTCTCAGGCAGCATGAAGAAGAAATAAGTAAAGACTTTCCATCCAGTGAGATCCAGCGGCTCCGAGAGCA  1580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATGCTTCTCAGGCAGCATGAAGAAGAAATAAGTAAAGACTTTCCATCCAGTGAGATCCAGCGGCTCCGAGAGCA  1850

Query 1581  GAACACGAGCTTGCGAAACGCGATTGCCCAGATGAGGAAAGAAATGGAGGCTCTAAGCCATCAGATTCCTCCTC  1654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GAACACGAGCTTGCGAAACGCGATTGCCCAGATGAGGAAAGAAATGGAGGCTCTAAGCCATCAGATTCCTCCTC  1924

Query 1655  CCATCCAGACAGCGGCAGAGAGCACAGATGCAAACCAGCCTGACCCAGAGGCTGGGGGAGATGCCGCCACTCCT  1728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCATCCAGACAGCGGCAGAGAGCACAGATGCAAACCAGCCTGACCCAGAGGCTGGGGGAGATGCCGCCACTCCT  1998

Query 1729  GATTATGTTCTGGCCCTTGAAGCAGAAATACGAACTCTAAAGCATAAGTTTAAAACTCTGGAAAAGCATCTAGA  1802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GATTATGTTCTGGCCCTTGAAGCAGAAATACGAACTCTAAAGCATAAGTTTAAAACTCTGGAAAAGCATCTAGA  2072

Query 1803  AGATGTGTTGGATCCTTTAAAGATGTCCTCACCTCATGCTGAGTCTCAGCCCAGCGTCCGCACCTCGACAGAGA  1876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AGATGTGTTGGATCCTTTAAAGATGTCCTCACCTCATGCTGAGTCTCAGCCCAGCGTCCGCACCTCGACAGAGA  2146

Query 1877  CGACTGGAGGGTCTGCCCAAGCTGGTCAAGCCGGAGGGTCTGTCCAAGCTGGTCAAGCAGGAGGATCTGTCCAA  1950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CGACTGGAGGGTCTGCCCAAGCTGGTCAAGCCGGAGGGTCTGTCCAAGCTGGTCAAGCAGGAGGATCTGTCCAA  2220

Query 1951  GCTGGCCCAGTATCCTCTGGACTGGCACTCAGGAAGCTCGGGGACAGAGTGCAGCTCCTAAACCTGCTGGTGAC  2024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GCTGGCCCAGTATCCTCTGGACTGGCACTCAGGAAGCTCGGGGACAGAGTGCAGCTCCTAAACCTGCTGGTGAC  2294

Query 2025  ACGACTCAGACAGAAGGTGCTGCGGGAACCCCTGGAGCCGGCCGCTCTCCAGCGTGAGCTTCCCCGTGAGGTGG  2098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  ACGACTCAGACAGAAGGTGCTGCGGGAACCCCTGGAGCCGGCCGCTCTCCAGCGTGAGCTTCCCCGTGAGGTGG  2368

Query 2099  ACCAGGTACACCTGGAGGTTTTGGAGCTGCGGAAGCAGGTGGCTGAGCTGGGGAAGCATCTCAGGATAGCCCAG  2172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  ACCAGGTACACCTGGAGGTTTTGGAGCTGCGGAAGCAGGTGGCTGAGCTGGGGAAGCATCTCAGGATAGCCCAG  2442

Query 2173  CACGGGGGAGCGGAGCCTTCAGGCAGGAAGCAGCCCCCAGCCTCGGACGCCGTGGCCCTTGGGAGAGAGGTGGG  2246
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct 2443  CACGGGGGAGCGGAGCCTTCAGGCAGGAAGCAGCCCCCAGCCTCGGACGCCGTGGCCCTTGGGAGAGAG-----  2511

Query 2247  TGNCCGC-------------------------------------------------------------------  2253
             |.||.|                                                                   
Sbjct 2512  -GGCCTCACCAAGAGAGGGCCTATGGAGGCCGAGGACCAGGGGGAGCTTTTCCTGCACCTCCGGTCAGTGGCAC  2584

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 2585  GTGCCCCCCAGACCTTATCTATGCACCGACTCCAGAGAAAGCTGAAGGAGGCAGCCAGAAAAATCATCAGCCTC  2658

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 2659  CGCCTGGAGAAAGAGCAGCTCATCGAGATGGGGAACAGGCTCCGTGCAGAGCTGGGCCGACCCGAAAGGTGGCT  2732

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 2733  GTTGCACCACGCCCTCCCTCCTGCCCCTGAGGCCCGGAAGCCAGGCGAGGAGCCCAGGAGGCCTTTGGATCGCA  2806

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 2807  GCCCACCTTTGGGACAGGTGCAGCCCCATTTTACATCTCAGGACGCCAAGAGTGCCGAGGATGAGGCTCCTTCC  2880

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 2881  AGACACTTGGGAAAGCACCAGCCCCGCTCAGCACAGGTGGGCAGCAGACTTGACGCCCTGCAAGGCCCGAAGAC  2954

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 2955  ACAACACAGCATCCACACGGTGACCTGTAAATCACCTCGGCAGAAAGAAGACAGGTCCCCAAAGCCACCCCAGG  3028

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 3029  CTCCCCAGCACCCTGAGGAGCATGGTCGCCAATCCCACAGCTCCTCCTCCTTTGCCAGTGGCACCCTCCAGGAC  3102

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 3103  ATGTGGAGGTTGCTAGACCTGGGATCCAGCCCTTCTGGTGTCACCTCCCAGGGTGACTCAACTCCAGAAATGGG  3176

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 3177  GTCTCACTATGTCACCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGGCTCAAGCAGTCCTGCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTG  3250

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 3251  CTGAGATGACAGGTGTGGGCCCCACGCCCAGCCTGGCGTGGAGTGGAGCCCTTCACCCAAACATGAACCAGGAG  3324

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 3325  GCGAGCTTGGTAAGGAGCACGTGGGCTCCAGGAATGCGAGGGGGAATGAATGGAGGCAGCTCCTCAGTGTGCAA  3398

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 3399  AAACATGCAGCGCGGGCCTCACTGGTCACCATCACAGCAGCCTTGCAGTGGGATCAGGACAGTCCTGCTGTCCA  3472

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 3473  GGAAGGAGAGGACCCTGCTCTCTTGTTTCTCACTACCTGCTCCTGTCGTTCTAGTCCCATTGCTGCTCTCAGGA  3546

Query 2254  ------------------------------------------  2253
                                                      
Sbjct 3547  CAAGCTGTGACTGAGAGAGCAGGTCACGCTGGTGACATTTTA  3588