Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14462
- Subject:
- XM_011526804.2
- Aligned Length:
- 2139
- Identities:
- 1827
- Gaps:
- 310
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCCCACAGAGGCTACGCCAAGCCTGTGTGCTCCCTCCTGCCTCAGGAGCAGGCCCCCAGCACCCAGCTGCCC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGCTGCCATGCACAAACATTACAAAGTCCACTTCGCCAAGGATGCCCAGAGCCCCAACGGGCACTACTTCTGGG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 ACCCAGAGTTGGGGCACCGAAAAGACATCCTGACAGAGGATGACGTCTACTGCAGCTGCCTGGCCAAGACACTC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TGCCACGTGCCGGTCCCTGTGACCGTGGGTTTCTATGCCCCTTTCGGCTGCCGCCTGCACATGATGCTGGACAA 296
Query 1 -------------ATGCAGCAGGAGGCCGCGCAGCGCGAGAGCGAGGAGCTGCAGCACGTGCAGTGGCGGCCGC 61
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Sbjct 297 GATCACGGCGCTGATGCAGCAGGAGGCCGCGCAGCGCGAGAGCGAGGAGCTGCAGCACGTGCAGTGGCGGCCGC 370
Query 62 GTGCCGTGAGCGGCTGGGGCGTCCCGCAGCTACTGTGGTACCTGGTGTTCCTGCAGCCCATCATCACCGAGGTG 135
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Sbjct 371 GTGCCGTGAGCGGCTGGGGCGTCCCGCAGCTACTGTGGTACCTGGTGTTCCTGCAGCCCATCATCACCGAGGTG 444
Query 136 CACCTGCGGCGCAGGAACGTGCAGTTCCTTTTCATCCGCTTTAGCGCCTGGCAGTACGCGGGCACCGACAAGCT 209
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Sbjct 445 CACCTGCGGCGCAGGAACGTGCAGTTCCTTTTCATCCGCTTTAGCGCCTGGCAGTACGCGGGCACCGACAAGCT 518
Query 210 GTGGGCCGGCCTGGTGACCACGTTGTGCGAGGGCATCCGCCGCCACTATGGCGCACTGCCCTTCAGCGTGTACT 283
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Sbjct 519 GTGGGCCGGCCTGGTGACCACGTTGTGCGAGGGCATCCGCCGCCACTATGGCGCACTGCCCTTCAGCGTGTACT 592
Query 284 CGGTGCTGGGCAACAAGCCGGCCACCAGGCAGGACTGCTGCCAGAGCGAGTGGCATTGTCGGCGCCGCGTGTGC 357
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Sbjct 593 CGGTGCTGGGCAACAAGCCGGCCACCAGGCAGGACTGCTGCCAGAGCGAGTGGCATTGTCGGCGCCGCGTGTGC 666
Query 358 CTGGGGCTGCTGGCGCTGCTGGCGGCGCTGGGCCTGGGTGTGGGGCTGCTCTACTTGTCACTGGGCGGCCACGC 431
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Sbjct 667 CTGGGGCTGCTGGCGCTGCTGGCGGCGCTGGGCCTGGGTGTGGGGCTGCTCTACTTGTCACTGGGCGGCCACGC 740
Query 432 GCTGGGCCACGGCAGCCCGAGCGGCAGCCTGCTCAAGGTGTTTGGCGGCGCGGCCACCACACTGTCGGGCTCGG 505
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Sbjct 741 GCTGGGCCACGGCAGCCCGAGCGGCAGCCTGCTCAAGGTGTTTGGCGGCGCGGCCACCACACTGTCGGGCTCGG 814
Query 506 GGCTGCTCATGGCCGTGTACTCGGTGGGCAAGCACCTGTTCGTAAGCCAGCGCAAGAAGATCGAGCGGCTGGTG 579
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Sbjct 815 GGCTGCTCATGGCCGTGTACTCGGTGGGCAAGCACCTGTTCGTAAGCCAGCGCAAGAAGATCGAGCGGCTGGTG 888
Query 580 TCGCGTGAAAAGTTCGGCAGCCAGCTGGGTTTCATGTGCGAGGTGAAGAAGGAGGTGGAGCTGCTCACCGACTT 653
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Sbjct 889 TCGCGTGAAAAGTTCGGCAGCCAGCTGGGTTTCATGTGCGAGGTGAAGAAGGAGGTGGAGCTGCTCACCGACTT 962
Query 654 CCTGTGCTTCCTGGAGATCTACCAGCGGCGCAGGCTGCGCGTGGTGCTGGAGGTCACCGGGCTGGACACGTGCT 727
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Sbjct 963 CCTGTGCTTCCTGGAGATCTACCAGCGGCGCAGGCTGCGCGTGGTGCTGGAGGTCACCGGGCTGGACACGTGCT 1036
Query 728 ACCCGGAGCGCGTGGTGGGCGTGCTCAACGCCATCAACACGCTGCTGTCCGACAGCCACGCGCCCTTCATCTTC 801
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Sbjct 1037 ACCCGGAGCGCGTGGTGGGCGTGCTCAACGCCATCAACACGCTGCTGTCCGACAGCCACGCGCCCTTCATCTTC 1110
Query 802 ATCCTGGTCGTGGACCCCAGCATCCTGGCCGCGTGCCTAGAGAGCGCGGGCAACATGAAGGGCACGGCCGATAA 875
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Sbjct 1111 ATCCTGGTCGTGGACCCCAGCATCCTGGCCGCGTGCCTAGAGAGCGCGGGCAACATGAAGGGCACGGCCGATAA 1184
Query 876 CGGCTACCTCTTCCTCAACCGCACTGTCACGCTGCCCTTCTCTGTGCCCATTATGGGCCGCCGCACCAAGCTGC 949
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Sbjct 1185 CGGCTACCTCTTCCTCAACCGCACTGTCACGCTGCCCTTCTCTGTGCCCATTATGGGCCGCCGCACCAAGCTGC 1258
Query 950 AGTTCCTGCACGATGCGGTGCAGAGCCGCGACGACCTGTTGTACCGCGAGATGACGCGCAAGCCGTGGCTGCCG 1023
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Sbjct 1259 AGTTCCTGCACGATGCGGTGCAGAGCCGCGACGACCTGTTGTACCGCGAGATGACGCGCAAGCCGTGGCTGCCG 1332
Query 1024 GGGGACGCCGGGGGCGAGAGCGCGCAGCTGCTGGCGGTGCAGGCGCAGGCGGGGACGGAGCGCGGGCAGGGCCG 1097
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Sbjct 1333 GGGGACGCCGGGGGCGAGAGCGCGCAGCTGCTGGCGGTGCAGGCGCAGGCGGGGACGGAGCGCGGGCAGGGCCG 1406
Query 1098 CATCGACGACGAGGCGGCGCGGCGAATCCAGGAGGCGCTCTTCTGCCTTCACGACGAGCGCGACTGCCTCTACG 1171
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Sbjct 1407 CATCGACGACGAGGCGGCGCGGCGAATCCAGGAGGCGCTCTTCTGCCTTCACGACGAGCGCGACTGCCTCTACG 1480
Query 1172 AGTACGTGCCCGACAACGTGGTGTCCATGCGGCGCATCGTCAACACCGTGCCCATCACCGTGCGCCTGCT-NNG 1244
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Sbjct 1481 AGTACGTGCCCGACAACGTGGTGTCCATGCGGCGCATCGTCAACACCGTGCCCATCACCGTGCGCCTGCTGCAG 1554
Query 1245 CAGCAGCAGCAGCAGGGGGACTTTGGGGGCCCCACGCCGCGCCAGGCGGTGGCGTGGGTGGTGCTCGCCAACCA 1318
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Sbjct 1555 CAGCAGCAGCAGCAGGGGGACTTTGGGGGCCCCACGCCGCGCCAGGCGGTGGCGTGGGTGGTGCTCGCCAACCA 1628
Query 1319 GTGGCCGTGCCGCCTGAGCTGGGCGCTGCAGTGCCTGGAGGACCGGCAGCAGACCGGGGGCGCGCCCGAGGGCC 1392
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Sbjct 1629 GTGGCCGTGCCGCCTGAGCTGGGCGCTGCAGTGCCTGGAGGACCGGCAGCAGACCGGGGGCGCGCCCGAGGGCC 1702
Query 1393 GCGCGCGCCTCTGGGACGTTTTCCGCGACAACAGCCGCGAGCTGCACACCATGACCAAGGCGTTGCAGAACGTG 1466
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Sbjct 1703 GCGCGCGCCTCTGGGACGTTTTCCGCGACAACAGCCGCGAGCTGCACACCATGACCAAGGCGTTGCAGAACGTG 1776
Query 1467 CTCGACCTGGACGGCGACCCCGAGCTCTTCGAGCGCTTCCTGGGCGCCGACTTCCCCTTCACCGTGGCCGAGGC 1540
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Sbjct 1777 CTCGACCTGGACGGCGACCCCGAGCTCTTCGAGCGCTTCCTGGGCGCCGACTTCCCCTTCACCGTGGCCGAGGC 1850
Query 1541 GCAGAGCCTGCTGCGCTGCACGGTCAACCTGGACCACTCCATCCGCCGGCGCATGGGTCTCATCCGAGCCGTCA 1614
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Sbjct 1851 GCAGAGCCTGCTGCGCTGCACGGTCAACCTGGACCACTCCATCCGCCGGCGCATGGGTCTCATCCGAGCCGTCA 1924
Query 1615 GCGCGCTCAAGCCGCCCAGCCCGCCCAAGTCCCCTACCCGCGATACCCCCCACGCTGCCCACCGGGCCAACAGC 1688
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Sbjct 1925 GCGCGCTCAAGCCGCCCAGCCCGCCCAAGTCCCCTACCCGCGATACCCCCCACGCTGCCCACCGGGCCAACAGC 1998
Query 1689 GCCTCCAGGGCGCCCCCGTCGGGCCGTGCCTCAGGGCAAGCCGGCGAAGGCCACCACACTGGGGACTTGGCCCA 1762
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Sbjct 1999 GCCTCCAGGGCGCCCCCGTCGGGCCGTGCCTCAGGGCAAGCCGGCGAAGGCCACCACACTGGGGACTTGGCCCA 2072
Query 1763 CAGGGGCAAGCTATGGCCGGTGGCCTGTGCGCTCTTCCGTCCAGGGCAATCCAGCCCAGGTGGGCCT 1829
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Sbjct 2073 CAGGGGCAAGCTATGGCCGGTGGCCTGTGCGCTCTTCCGTCCAGGGCAATCCAGCCCAGGTGGGCCT 2139