Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14462
• Subject: XM_011526805.2
• Aligned Length: 1971
• Identities: 1827
• Gaps: 142

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGACATCCTGACAGAGGATGACGTCTACTGCAGCTGCCTGGCCAAGACACTCTGCCACGTGCCGGTCCCTGT  74

Query    1  -------------------------------------------------------------------ATGCAGC  7
                                                                               |||||||
Sbjct   75  GACCGTGGGTTTCTATGCCCCTTTCGGCTGCCGCCTGCACATGATGCTGGACAAGATCACGGCGCTGATGCAGC  148

Query    8  AGGAGGCCGCGCAGCGCGAGAGCGAGGAGCTGCAGCACGTGCAGTGGCGGCCGCGTGCCGTGAGCGGCTGGGGC  81
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGAGGCCGCGCAGCGCGAGAGCGAGGAGCTGCAGCACGTGCAGTGGCGGCCGCGTGCCGTGAGCGGCTGGGGC  222

Query   82  GTCCCGCAGCTACTGTGGTACCTGGTGTTCCTGCAGCCCATCATCACCGAGGTGCACCTGCGGCGCAGGAACGT  155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCCCGCAGCTACTGTGGTACCTGGTGTTCCTGCAGCCCATCATCACCGAGGTGCACCTGCGGCGCAGGAACGT  296

Query  156  GCAGTTCCTTTTCATCCGCTTTAGCGCCTGGCAGTACGCGGGCACCGACAAGCTGTGGGCCGGCCTGGTGACCA  229
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAGTTCCTTTTCATCCGCTTTAGCGCCTGGCAGTACGCGGGCACCGACAAGCTGTGGGCCGGCCTGGTGACCA  370

Query  230  CGTTGTGCGAGGGCATCCGCCGCCACTATGGCGCACTGCCCTTCAGCGTGTACTCGGTGCTGGGCAACAAGCCG  303
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGTTGTGCGAGGGCATCCGCCGCCACTATGGCGCACTGCCCTTCAGCGTGTACTCGGTGCTGGGCAACAAGCCG  444

Query  304  GCCACCAGGCAGGACTGCTGCCAGAGCGAGTGGCATTGTCGGCGCCGCGTGTGCCTGGGGCTGCTGGCGCTGCT  377
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCACCAGGCAGGACTGCTGCCAGAGCGAGTGGCATTGTCGGCGCCGCGTGTGCCTGGGGCTGCTGGCGCTGCT  518

Query  378  GGCGGCGCTGGGCCTGGGTGTGGGGCTGCTCTACTTGTCACTGGGCGGCCACGCGCTGGGCCACGGCAGCCCGA  451
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCGGCGCTGGGCCTGGGTGTGGGGCTGCTCTACTTGTCACTGGGCGGCCACGCGCTGGGCCACGGCAGCCCGA  592

Query  452  GCGGCAGCCTGCTCAAGGTGTTTGGCGGCGCGGCCACCACACTGTCGGGCTCGGGGCTGCTCATGGCCGTGTAC  525
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCGGCAGCCTGCTCAAGGTGTTTGGCGGCGCGGCCACCACACTGTCGGGCTCGGGGCTGCTCATGGCCGTGTAC  666

Query  526  TCGGTGGGCAAGCACCTGTTCGTAAGCCAGCGCAAGAAGATCGAGCGGCTGGTGTCGCGTGAAAAGTTCGGCAG  599
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCGGTGGGCAAGCACCTGTTCGTAAGCCAGCGCAAGAAGATCGAGCGGCTGGTGTCGCGTGAAAAGTTCGGCAG  740

Query  600  CCAGCTGGGTTTCATGTGCGAGGTGAAGAAGGAGGTGGAGCTGCTCACCGACTTCCTGTGCTTCCTGGAGATCT  673
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCAGCTGGGTTTCATGTGCGAGGTGAAGAAGGAGGTGGAGCTGCTCACCGACTTCCTGTGCTTCCTGGAGATCT  814

Query  674  ACCAGCGGCGCAGGCTGCGCGTGGTGCTGGAGGTCACCGGGCTGGACACGTGCTACCCGGAGCGCGTGGTGGGC  747
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCAGCGGCGCAGGCTGCGCGTGGTGCTGGAGGTCACCGGGCTGGACACGTGCTACCCGGAGCGCGTGGTGGGC  888

Query  748  GTGCTCAACGCCATCAACACGCTGCTGTCCGACAGCCACGCGCCCTTCATCTTCATCCTGGTCGTGGACCCCAG  821
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGCTCAACGCCATCAACACGCTGCTGTCCGACAGCCACGCGCCCTTCATCTTCATCCTGGTCGTGGACCCCAG  962

Query  822  CATCCTGGCCGCGTGCCTAGAGAGCGCGGGCAACATGAAGGGCACGGCCGATAACGGCTACCTCTTCCTCAACC  895
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATCCTGGCCGCGTGCCTAGAGAGCGCGGGCAACATGAAGGGCACGGCCGATAACGGCTACCTCTTCCTCAACC  1036

Query  896  GCACTGTCACGCTGCCCTTCTCTGTGCCCATTATGGGCCGCCGCACCAAGCTGCAGTTCCTGCACGATGCGGTG  969
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCACTGTCACGCTGCCCTTCTCTGTGCCCATTATGGGCCGCCGCACCAAGCTGCAGTTCCTGCACGATGCGGTG  1110

Query  970  CAGAGCCGCGACGACCTGTTGTACCGCGAGATGACGCGCAAGCCGTGGCTGCCGGGGGACGCCGGGGGCGAGAG  1043
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGAGCCGCGACGACCTGTTGTACCGCGAGATGACGCGCAAGCCGTGGCTGCCGGGGGACGCCGGGGGCGAGAG  1184

Query 1044  CGCGCAGCTGCTGGCGGTGCAGGCGCAGGCGGGGACGGAGCGCGGGCAGGGCCGCATCGACGACGAGGCGGCGC  1117
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGCGCAGCTGCTGGCGGTGCAGGCGCAGGCGGGGACGGAGCGCGGGCAGGGCCGCATCGACGACGAGGCGGCGC  1258

Query 1118  GGCGAATCCAGGAGGCGCTCTTCTGCCTTCACGACGAGCGCGACTGCCTCTACGAGTACGTGCCCGACAACGTG  1191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGCGAATCCAGGAGGCGCTCTTCTGCCTTCACGACGAGCGCGACTGCCTCTACGAGTACGTGCCCGACAACGTG  1332

Query 1192  GTGTCCATGCGGCGCATCGTCAACACCGTGCCCATCACCGTGCGCCTGCT-NNGCAGCAGCAGCAGCAGGGGGA  1264
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ..|||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGTCCATGCGGCGCATCGTCAACACCGTGCCCATCACCGTGCGCCTGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGGGGA  1406

Query 1265  CTTTGGGGGCCCCACGCCGCGCCAGGCGGTGGCGTGGGTGGTGCTCGCCAACCAGTGGCCGTGCCGCCTGAGCT  1338
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTTTGGGGGCCCCACGCCGCGCCAGGCGGTGGCGTGGGTGGTGCTCGCCAACCAGTGGCCGTGCCGCCTGAGCT  1480

Query 1339  GGGCGCTGCAGTGCCTGGAGGACCGGCAGCAGACCGGGGGCGCGCCCGAGGGCCGCGCGCGCCTCTGGGACGTT  1412
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGGCGCTGCAGTGCCTGGAGGACCGGCAGCAGACCGGGGGCGCGCCCGAGGGCCGCGCGCGCCTCTGGGACGTT  1554

Query 1413  TTCCGCGACAACAGCCGCGAGCTGCACACCATGACCAAGGCGTTGCAGAACGTGCTCGACCTGGACGGCGACCC  1486
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTCCGCGACAACAGCCGCGAGCTGCACACCATGACCAAGGCGTTGCAGAACGTGCTCGACCTGGACGGCGACCC  1628

Query 1487  CGAGCTCTTCGAGCGCTTCCTGGGCGCCGACTTCCCCTTCACCGTGGCCGAGGCGCAGAGCCTGCTGCGCTGCA  1560
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CGAGCTCTTCGAGCGCTTCCTGGGCGCCGACTTCCCCTTCACCGTGGCCGAGGCGCAGAGCCTGCTGCGCTGCA  1702

Query 1561  CGGTCAACCTGGACCACTCCATCCGCCGGCGCATGGGTCTCATCCGAGCCGTCAGCGCGCTCAAGCCGCCCAGC  1634
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CGGTCAACCTGGACCACTCCATCCGCCGGCGCATGGGTCTCATCCGAGCCGTCAGCGCGCTCAAGCCGCCCAGC  1776

Query 1635  CCGCCCAAGTCCCCTACCCGCGATACCCCCCACGCTGCCCACCGGGCCAACAGCGCCTCCAGGGCGCCCCCGTC  1708
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCGCCCAAGTCCCCTACCCGCGATACCCCCCACGCTGCCCACCGGGCCAACAGCGCCTCCAGGGCGCCCCCGTC  1850

Query 1709  GGGCCGTGCCTCAGGGCAAGCCGGCGAAGGCCACCACACTGGGGACTTGGCCCACAGGGGCAAGCTATGGCCGG  1782
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGGCCGTGCCTCAGGGCAAGCCGGCGAAGGCCACCACACTGGGGACTTGGCCCACAGGGGCAAGCTATGGCCGG  1924

Query 1783  TGGCCTGTGCGCTCTTCCGTCCAGGGCAATCCAGCCCAGGTGGGCCT  1829
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGGCCTGTGCGCTCTTCCGTCCAGGGCAATCCAGCCCAGGTGGGCCT  1971