Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14482
• Subject: XM_017001196.1
• Aligned Length: 1797
• Identities: 1603
• Gaps: 192

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTCAGTCCCTGGTATGATGAGTTTCTAGATGAAGAGGACTACTGGTTTCTCCTTTTTACGACACAGAACAG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GTTCATCAGCTCCAGACAGCATAAAAGAGAATTTATAGGCAAAGAAGAGAACATTCTTCTTTATAAGAGGATTC  148

Query    1  --------------------------------------------ATGGACTATAGGCAGTGGCGAAAGATAGCT  30
                                                        ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCAGTCTCTAGAGTTAAGCCAGGCTTTGGCTGACATGAAGGAAATGGACTATAGGCAGTGGCGAAAGATAGCT  222

Query   31  ACTGAGGACCTGAAGCAAGGAGGCTCTCTCCAGGTAGAGCTGACATCTCCAGTGTTTCTAACAGACATAACTAA  104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACTGAGGACCTGAAGCAAGGAGGCTCTCTCCAGGTAGAGCTGACATCTCCAGTGTTTCTAACAGACATAACTAA  296

Query  105  AATGTCCTTTGAGGAGCTTTGCTACAAGAACCCAAAGATGGCCATACAGAAGATCAGTGATGACTACAAAATAT  178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AATGTCCTTTGAGGAGCTTTGCTACAAGAACCCAAAGATGGCCATACAGAAGATCAGTGATGACTACAAAATAT  370

Query  179  ACTGTGAGAAAGCACCTAAAATAGATTTTAAAATGGAAATTATCAAGGAAACAAAGACAGTTTCACGCTCAAAT  252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACTGTGAGAAAGCACCTAAAATAGATTTTAAAATGGAAATTATCAAGGAAACAAAGACAGTTTCACGCTCAAAT  444

Query  253  AGGAAAATGTCCTTGCTCAAAAGAACTCTTGTAAGGAAGCCATCAATGAGACCCAGAAACTTGACAGAAGTCCT  326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGGAAAATGTCCTTGCTCAAAAGAACTCTTGTAAGGAAGCCATCAATGAGACCCAGAAACTTGACAGAAGTCCT  518

Query  327  CTTAAATACACAGCACTTGGAGTTCTTCATGGAGTTCCTCAAGGAACGGAAGGCTAAAATCCCATTGCAATTTC  400
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTAAATACACAGCACTTGGAGTTCTTCAGGGAGTTCCTCAAGGAACGGAAGGCTAAAATCCCATTGCAATTTC  592

Query  401  TCACAGCTGTACAGAAGATCAGTGTAGAGACCAATGAAAAGATTTGCAAGTCTCTCATAGAAAATGTAATCAAG  474
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCACAGCTGTACAGAAGATCAGTATAGAGACCAATGAAAAGATTTGCAAGTCTCTCATAGAAAATGTAATCAAG  666

Query  475  ACTTTCTTCCAAGGCCAACTCTCTCCTGAAGAAATGCTGCAGTGTGATGCCCCTATTATCAAAGAAATCGCTTC  548
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACTTTCTTCCAAGGCCAACTCTCTCCTGAAGAAATGCTGCAGTGTGATGCCCCTATTATCAAAGAAATCGCTTC  740

Query  549  CATGCGTCATGTCACCACAAGCACACTGTTAACGCTCCAGGGACATGTTATGAAATCTATAGAAGAAAAGTGGT  622
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATGCGTCATGTCACCACAAGCACACTGTTAACGCTCCAGGGACATGTTATGAAATCTATAGAAGAAAAGTGGT  814

Query  623  TTAAAGATTATCAAGACCTGTTCCCACCTCACCATCAGGAGGTGGAAGTGCAAAGTGAAGTACAAATTTCGTCT  696
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTAAAGATTATCAAGACCTGTTCCCACCTCACCATCAGGAGGTGGAAGTGCAAAGTGAAGTACAAATTTCGTCT  888

Query  697  AGGAAGCCCTCAAAGATAGTGTCAACTTACCTACAGGAATCCCAGAAGAAAGGCTGGATGAGAATGATCAGCTT  770
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGGAAGCCCTCAAAGATAGTGTCAACTTACCTACAGGAATCCCAGAAGAAAGGCTGGATGAGAATGATCAGCTT  962

Query  771  TATCAGGAGTTTTTGCAAGTACCGCAGATTTATGTTGAATCCTAGTAAGCGCCAGGAATTTGAAGACTATCTTC  844
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TATCAGGAGTTTTTGCAAGTACCGCAGATTTATGTTGAATCCTAGTAAGCGCCAGGAATTTGAAGACTATCTTC  1036

Query  845  ACCAGGAAATGCAAAATAGCAAGGAAAATTTCACCACAGCACACAACACATCGGGACGTTCAGCTCCACCCTCC  918
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACCAGGAAATGCAAAATAGCAAGGAAAATTTCACCACAGCACACAACACATCGGGACGTTCAGCTCCACCCTCC  1110

Query  919  ACAAATGTCCGGAGTGCAGACCAAGAGAATGGAGAAATAACCCTTGTAAAGCGTCGTATATTTGGCCACAGGAT  992
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACAAATGTCCGGAGTGCAGACCAAGAGAATGGAGAAATAACCCTTGTAAAGCGTCGTATATTTGGCCACAGGAT  1184

Query  993  TATCACTGTCAACTTTGCGATCAATGATCTATATTTCTTTTCTGAAATGGAGAAATTTAATGATCTGGTCAGTT  1066
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TATCACTGTCAACTTTGCGATCAATGATCTATATTTCTTTTCTGAAATGGAGAAATTTAATGATCTGGTCAGTT  1258

Query 1067  CAGCCCACATGCTGCAGGTCAACCGGGCATATAATGAGAATGATGTGATCCTAATGCGGTCCAAAATGAACATT  1140
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGCCCACATGCTGCAGGTCAACCGGGCATATAATGAGAATGATGTGATCCTAATGCGGTCCAAAATGAACATT  1332

Query 1141  ATCCAAAAACTCTTCCTGAATTCTGACATCCCTCCAAAGCTGAGGGTGAATGTCCCTGAGTTCCAGAAGGATGC  1214
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATCCAAAAACTCTTCCTGAATTCTGACATCCCTCCAAAGCTGAGGGTGAATGTCCCTGAGTTCCAGAAGGATGC  1406

Query 1215  CATCCTTGCTGCCATCACAGAGGGCTACCTAGATCGGAGCGTCTTCCATGGGGCTATCATGTCTGTCTTCCCCG  1288
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CATCCTTGCTGCCATCACAGAGGGCTACCTAGATCGGAGCGTCTTCCATGGGGCTATCATGTCTGTCTTCCCCG  1480

Query 1289  TTGTTATGTACTTCTGGAAAAGGTTTTGTTTCTGGAAGGCAACCCGCTCTTACTTACAGTATAGGGGGAAGAAG  1362
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTGTTATGTACTTCTGGAAAAGGTTTTGTTTCTGGAAGGCAACCCGCTCTTACTTACAGTATAGGGGGAAGAAG  1554

Query 1363  TTCAAGGACAGAAAAAGCCCTCCTAAATCTACGGACAAGTATCCTTTCTCGAGTGGAGGAGACAATGCCATCTT  1436
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTCAAGGACAGAAAAAGCCCTCCTAAATCTACGGACAAGTATCCTTTCTCGAGTGGAGGAGACAATGCCATCTT  1628

Query 1437  AAGGTTCACCTTGCTCAGAGGTATTGAGTGGTTGCAGCCTCAACGGGAAGCAATAAGTTCAGTTCAAAATTCTT  1510
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AAGGTTCACCTTGCTCAGAGGTATTGAGTGGTTGCAGCCTCAACGGGAAGCAATAAGTTCAGTTCAAAATTCTT  1702

Query 1511  CATCAAGCAAACTTACTCAGCCAAGACTCGTGGTATCTGCCATGCAGCTGCATCCCGTCCAGGGACAAAAATTA  1584
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CATCAAGCAAACTTACTCAGCCAAGACTCGTGGTATCTGCCATGCAGCTGCATCCCGTCCAGGGACAAAAATTA  1776

Query 1585  TCCTACATCAAAAAAGAGAAG  1605
            |||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCCTACATCAAAAAAGAGAAG  1797