Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14562
• Subject: XM_006525541.4
• Aligned Length: 1468
• Identities: 1333
• Gaps: 34

Alignment

Query    1  ATGGCCACCATCACCTGCACCCGCTTCACGGAAGAGTACCAGCTCTTCGAGGAATTGGGCAAGGGAGCCTTCTC  74
            |||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTACCATCACCTGCACCCGATTCACAGAAGAGTACCAGCTCTTTGAGGAACTGGGAAAGGGAGCCTTCTC  74

Query   75  GGTGGTGCGAAGGTGTGTGAAGGTGCTGGCTGGCCAGGAGTATGCTGCCAAGATCATCAACACAAAGAAGCTGT  148
            .||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct   75  TGTGGTGCGCAGGTGTGTGAAGGTGCTGGCTGGTCAGGAGTATGCTGCCAAGATTATCAACACCAAGAAGCTTT  148

Query  149  CAGCCAGAGACCATCAGAAGCTGGAGCGTGAAGCCCGCATCTGCCGCCTGCTGAAGCACCCCAACATCGTCCGA  222
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.||.|||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  CAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGCGTGAGGCCCGCATCTGCCGCTTGTTGAAGCACCCCAATATCGTCCGA  222

Query  223  CTACATGACAGCATCTCAGAGGAGGGACACCACTACCTGATCTTCGACCTGGTCACTGGTGGGGAACTGTTTGA  296
            ||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTCCATGACAGCATCTCCGAGGAGGGGCACCACTACCTTATCTTCGATCTGGTTACTGGTGGGGAACTGTTTGA  296

Query  297  AGATATCGTGGCCCGGGAGTATTACAGTGAGGCGGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCTGTGC  370
            |||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  297  AGACATTGTGGCCCGGGAGTATTACAGTGAAGCTGATGCCAGCCACTGTATCCAGCAGATCTTGGAGGCTGTGC  370

Query  371  TGCACTGCCACCAGATGGGGGTGGTGCACCGGGACCTGAAGCCTGAGAATCTGTTGCTGGCCTCCAAGCTCAAG  444
            |.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  371  TACACTGTCACCAGATGGGGGTGGTGCATCGTGACCTGAAGCCTGAGAATCTGTTGCTGGCCTCGAAGCTCAAG  444

Query  445  GGTGCCGCAGTGAAGCTGGCAGACTTTGGCCTGGCCATAGAGGTGGAGGGGGAGCAGCAGGCATGGTTTGGGTT  518
            ||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCGCTGCTGTGAAGCTGGCAGACTTTGGCCTGGCCATAGAGGTGGAGGGGGAGCAGCAGGCATGGTTTGGGTT  518

Query  519  TGCAGGGACTCCTGGATATCTCTCCCCAGAAGTGCTGCGGAAGGACCCGTACGGGAAGCCTGTGGACCTGTGGG  592
            .||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  CGCAGGGACACCTGGATACCTCTCCCCAGAAGTGCTGAGGAAGGACCCGTACGGGAAGCCCGTGGACCTGTGGG  592

Query  593  CTTGTGGGGTCATCCTGTACATCCTGCTGGTTGGGTACCCCCCGTTCTGGGATGAGGACCAGCACCGCCTGTAC  666
            |.|||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  593  CCTGTGGCGTCATCCTGTATATCTTGCTGGTTGGGTATCCCCCGTTCTGGGATGAAGACCAGCATCGCCTGTAC  666

Query  667  CAGCAGATCAAAGCCGGCGCCTTATGATTTCCCATCGCCGGAATGGGACACTGTCACCCCGGAAGCCAAGGATC  740
            ||||||||||||||.||.||| ||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  667  CAGCAGATCAAAGCTGGTGCC-TATGATTTCCCATCACCAGAATGGGACACCGTCACCCCAGAAGCCAAGGATC  739

Query  741  TGATCAATAAGATGCTGACCATTAACCCATCCAAACGCATCACAGCTGCCGAAGCCATTAAGCACCCCTGGATC  814
            ||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.||..|.||||||||.||||||
Sbjct  740  TGATCAATAAGATGCTGACCATCAACCCGTCCAAACGCATCACGGCCGCTGAGGCTCTCAAGCACCCATGGATC  813

Query  815  TCGCACCGCTCCACCGTGGCATCGTGCATGCACAGACAGGAGACCGTGGACTGCCTGAAGAAGTTCAATGCCAG  888
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  TCGCACCGCTCCACCGTGGCCTCCTGCATGCACAGACAGGAGACCGTGGACTGCCTGAAGAAGTTCAATGCCAG  887

Query  889  GAGGAAACTGAAGGGAGCCATTCTCACCACGATGCTGGCCACCAGGAACTTCTCCGGAGGGAAGAGTGGGGGAA  962
            |||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  888  GAGGAAACTGAAGGGAGCCATCCTCACCACTATGCTGGCCACCAGGAACTTCTCCGGAGGGAAGAGCGGAGGAA  961

Query  963  ACAAGAAGAGCGATGGTGTGAA---------------------------------GGAATCCTCAGAGAGCACC  1003
            |||||||||.||||||||||||                                 ||||||.||.|||||||||
Sbjct  962  ACAAGAAGAACGATGGTGTGAAGAAAAGAAAGTCCAGTTCCAGCGTTCAGTTAATGGAATCTTCTGAGAGCACC  1035

Query 1004  AACACCACCATCGAGGATGAAGACACCAAAGTGCGGAAACAGGAAATTATAAAAGTGACAGAGCAGCTGATTGA  1077
            |||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1036  AACACCACCATTGAGGACGAAGACACCAAAGTGCGCAAACAGGAAATTATCAAAGTGACAGAGCAGCTGATCGA  1109

Query 1078  AGCCATAAGCAATGGAGATTTTGAGTCCTACACGAAGATGTGCGACCCTGGCATGACAGCCTTCGAACCTGAGG  1151
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1110  AGCCATAAGCAATGGAGACTTTGAGTCCTACACGAAGATGTGCGACCCTGGAATGACAGCCTTTGAACCAGAGG  1183

Query 1152  CCCTGGGGAACCTGGTTGAGGGCCTGGACTTCCATCGATTCTATTTTGAAAACCTGTGGTCCCGGAACAGCAAG  1225
            ||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  CCCTGGGGAACCTGGTGGAGGGCCTGGACTTTCATCGATTCTATTTTGAAAACCTGTGGTCCCGGAACAGCAAG  1257

Query 1226  CCCGTGCACACCACCATCCTGAATCCCCACATCCACCTGATGGGCGACGAGTCAGCCTGCATCGCCTACATCCG  1299
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1258  CCCGTGCACACCACCATCCTGAACCCTCACATCCACCTGATGGGTGACGAGTCAGCCTGCATCGCCTATATCCG  1331

Query 1300  CATCACGCAGTACCTGGACGCTGGCGGCATCCCACGCACCGCCCAGTCGGAGGAGACCCGTGTCTGGCACCGCC  1373
            ||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||.
Sbjct 1332  CATCACTCAGTACCTGGATGCAGGCGGCATACCCCGCACGGCCCAGTCAGAGGAGACCCGCGTCTGGCACCGCA  1405

Query 1374  GGGACGGCAAATGGCAGATCGTCCACTTCCACAGATCTGGGGCGCCCTCCGTCCTGCCCCAC  1435
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1406  GGGACGGCAAATGGCAGATCGTCCACTTCCACAGATCTGGGGCGCCCTCCGTCCTGCCGCAT  1467