Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14563
• Subject: XM_006715781.2
• Aligned Length: 1881
• Identities: 1506
• Gaps: 375

Alignment

Query    1  ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGCTTCACCGACGAGTACCAGCTCTACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT  74
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Sbjct    1  ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGCTTCACCGACGAGTACCAGCTCTACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT  74

Query   75  CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGCACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATCAACACCAAGAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGCACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATCAACACCAAGAAGC  148

Query  149  TGTCAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGAGAGAGGCTCGGATCTGCCGCCTTCTGAAGCATTCCAACATCGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGTCAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGAGAGAGGCTCGGATCTGCCGCCTTCTGAAGCATTCCAACATCGTG  222

Query  223  CGTCTCCACGACAGCATCTCCGAGGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGTCTCCACGACAGCATCTCCGAGGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT  296

Query  297  TGAAGACATTGTGGCGAGAGAGTACTACAGCGAGGCTGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCCG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAAGACATTGTGGCGAGAGAGTACTACAGCGAGGCTGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCCG  370

Query  371  TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCGGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAGTGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCGGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAGTGC  444

Query  445  AAAGGGGCTGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTAGCTATCGAGGTGCAGGGGGACCAGCAGGCATGGTTTGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAGGGGCTGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTAGCTATCGAGGTGCAGGGGGACCAGCAGGCATGGTTTGG  518

Query  519  TTTCGCTGGCACACCAGGCTACCTGTCCCCTGAGGTCCTTCGCAAAGAGGCGTATGGCAAGCCTGTGGACATCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTTCGCTGGCACACCAGGCTACCTGTCCCCTGAGGTCCTTCGCAAAGAGGCGTATGGCAAGCCTGTGGACATCT  592

Query  593  GGGCATGTGGGGTGATCCTGTACATCCTGCTCGTGGGCTACCCACCCTTCTGGGACGAGGACCAGCACAAGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGCATGTGGGGTGATCCTGTACATCCTGCTCGTGGGCTACCCACCCTTCTGGGACGAGGACCAGCACAAGCTG  666

Query  667  TACCAGCAGATCAAGGCTGGTGCCTATGACTTCCCGTCCCCTGAGTGGGACACCGTCACTCCTGAAGCCAAAAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TACCAGCAGATCAAGGCTGGTGCCTATGACTTCCCGTCCCCTGAGTGGGACACCGTCACTCCTGAAGCCAAAAA  740

Query  741  CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACAGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCGTGGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACAGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCGTGGG  814

Query  815  TCTGCCAACGCTCCACGGTAGCATCCATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAGTGTCTGAAAAAGTTCAATGCC  888
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Sbjct  815  TCTGCCAACGCTCCACGGTAGCATCCATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAGTGTCTGAAAAAGTTCAATGCC  888

Query  889  AGGAGAAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACCATGCTGGCCACACGGAATTTCTCAGCAGCCAAGAGTTTACT  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||
Sbjct  889  AGGAGAAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACCATGCTGGCCACACGGAATTTCT---CAGCCAAGAGTTTACT  959

Query  963  CAACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACGAATAGCACCAAAAACAGTGCAGCCGCCACCAGCCCCAAAG  1036
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Sbjct  960  CAACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACGAATAGCACCAAAAACAGTGCAGCCGCCACCAGCCCCAAAG  1033

Query 1037  GGACGCTTCCTCCTGCCGCCCTGGAGTCTTCTGACAGTGCCAATACCACCATAGAGGATGAAGACGCTAAAG--  1108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct 1034  GGACGCTTCCTCCTGCCGCCCTGGAGTCTTCTGACAGTGCCAATACCACCATAGAGGATGAAGACGCTAAAGCC  1107

Query 1109  --------------------------------------------------------------------------  1108
                                                                                      
Sbjct 1108  CCCAGGGTCCCCGACATCCTGAGCTCAGTGAGGAGGGGCTCGGGAGCCCCAGAAGCCGAGGGGCCCCTGCCCTG  1181

Query 1109  --------------------------------------------------------------------------  1108
                                                                                      
Sbjct 1182  CCCATCTCCGGCTCCCTTTAGCCCCCTGCCAGCCCCATCCCCCAGGATCTCTGACATCCTGAACTCTGTGAGAA  1255

Query 1109  --------------------------------------------------------------------------  1108
                                                                                      
Sbjct 1256  GGGGTTCAGGAACCCCAGAAGCCGAGGGCCCCCTCTCAGCGGGGCCCCCGCCCTGCCTGTCTCCGGCTCTCCTA  1329

Query 1109  --------------------------------------------------------------------------  1108
                                                                                      
Sbjct 1330  GGCCCCCTGTCCTCCCCGTCCCCCAGGATCTCTGACATCCTGAACTCTGTGAGGAGGGGCTCAGGGACCCCAGA  1403

Query 1109  --------------------------------------------------------------------------  1108
                                                                                      
Sbjct 1404  AGCCGAGGGCCCCTCGCCAGTGGGGCCCCCGCCCTGCCCATCTCCGACTATCCCTGGCCCCCTGCCCACCCCAT  1477

Query 1109  CCCGGAAGCAGGAGATCATTAAGACCACGGAGCAGCTCATCGAGGCCGTCAACAACGGTGACTTTGAGGCCTAC  1182
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Sbjct 1478  CCCGGAAGCAGGAGATCATTAAGACCACGGAGCAGCTCATCGAGGCCGTCAACAACGGTGACTTTGAGGCCTAC  1551

Query 1183  GCGAAAATCTGTGACCCAGGGCTGACCTCGTTTGAGCCTGAAGCACTGGGCAACCTGGTTGAAGGGATGGACTT  1256
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Sbjct 1552  GCGAAAATCTGTGACCCAGGGCTGACCTCGTTTGAGCCTGAAGCACTGGGCAACCTGGTTGAAGGGATGGACTT  1625

Query 1257  CCACAGATTCTACTTCGAGAACCTGCTGGCCAAGAACAGCAAGCCGATCCACACGACCATCCTGAACCCACACG  1330
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Sbjct 1626  CCACAGATTCTACTTCGAGAACCTGCTGGCCAAGAACAGCAAGCCGATCCACACGACCATCCTGAACCCACACG  1699

Query 1331  TGCACGTCATTGGAGAGGATGCCGCCTGCATCGCTTACATCCGGCTCACGCAGTACATTGACGGGCAGGGCCGG  1404
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Sbjct 1700  TGCACGTCATTGGAGAGGATGCCGCCTGCATCGCTTACATCCGGCTCACGCAGTACATTGACGGGCAGGGCCGG  1773

Query 1405  CCCCGCACCAGCCAGTCTGAGGAGACCCGCGTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAACGTGCACTTCCA  1478
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Sbjct 1774  CCCCGCACCAGCCAGTCTGAGGAGACCCGCGTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAACGTGCACTTCCA  1847

Query 1479  CTGCTCGGGCGCGCCTGTGGCCCCGCTGCAG  1509
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Sbjct 1848  CTGCTCGGGCGCGCCTGTGGCCCCGCTGCAG  1878