Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14563
• Subject: XM_017314239.1
• Aligned Length: 1629
• Identities: 1391
• Gaps: 120

Alignment

Query    1  ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGCTTCACCGACGAGTACCAGCTCTACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGTTTCACCGACGAGTACCAGCTATACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT  74

Query   75  CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGCACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATCAACACCAAGAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct   75  CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGTACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATTAATACCAAGAAGC  148

Query  149  TGTCAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGAGAGAGGCTCGGATCTGCCGCCTTCTGAAGCATTCCAACATCGTG  222
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct  149  TGTCGGCCAGAGATCACCAGAAACTGGAGAGAGAAGCTCGGATCTGCCGCCTGCTGAAGCATTCCAACATTGTA  222

Query  223  CGTCTCCACGACAGCATCTCCGAGGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT  296
            ||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGCCTCCATGACAGCATCTCTGAAGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT  296

Query  297  TGAAGACATTGTGGCGAGAGAGTACTACAGCGAGGCTGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCCG  370
            |||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct  297  TGAAGACATCGTGGCAAGAGAGTACTACAGTGAAGCTGATGCCAGTCACTGCATCCAGCAGATCCTGGAAGCTG  370

Query  371  TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCGGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAGTGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCTGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAATGC  444

Query  445  AAAGGGGCTGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTAGCTATCGAGGTGCAGGGGGACCAGCAGGCATGGTTTGG  518
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAGGCGCCGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTGGCCATCGAGGTTCAGGGAGACCAGCAGGCATGGTTTGG  518

Query  519  TTTCGCTGGCACACCAGGCTACCTGTCCCCTGAGGTCCTTCGCAAAGAGGCGTATGGCAAGCCTGTGGACATCT  592
            .||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  519  ATTTGCGGGAACGCCAGGCTACCTGTCTCCCGAGGTCCTTCGGAAGGAGGCCTACGGCAAACCTGTGGACATCT  592

Query  593  GGGCATGTGGGGTGATCCTGTACATCCTGCTCGTGGGCTACCCACCCTTCTGGGACGAGGACCAGCACAAGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  593  GGGCATGTGGGGTGATCCTGTATATCCTGCTGGTGGGCTACCCACCTTTCTGGGATGAGGACCAACACAAGCTG  666

Query  667  TACCAGCAGATCAAGGCTGGTGCCTATGACTTCCCGTCCCCTGAGTGGGACACCGTCACTCCTGAAGCCAAAAA  740
            ||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  TACCAGCAGATCAAGGCTGGGGCGTATGATTTCCCATCCCCTGAGTGGGACACCGTTACTCCTGAAGCCAAAAA  740

Query  741  CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACAGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCGTGGG  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACGGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCATGGG  814

Query  815  TCTGCCAACGCTCCACGGTAGCATCCATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAGTGTCTGAAAAAGTTCAATGCC  888
            ||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct  815  TCTGCCAACGTTCCACCGTGGCCTCTATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAATGTCTGAAGAAGTTCAATGCA  888

Query  889  AGGAGAAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACCATGCTGGCCACACGGAATTTCTC------------------  944
            |||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||                  
Sbjct  889  AGGAGGAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACTATGCTGGCCACACGGAATTTCTCAGTGGGCAGACAGACCAC  962

Query  945  ---------------------------------------------------------AGCAGCCAAGAGTTTAC  961
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct  963  CGCTCCGGCCACAATGTCCACCGCGGCCTCCGGCACCACCATGGGGCTGGTGGAACAAGCAGCCAAGAGTTTAC  1036

Query  962  TCAACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACGAATAGCACCAAAAACAGTGCAGCCGCCACCAGCCCCAAA  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..|.|||..|||||||||||||
Sbjct 1037  TCAACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACAAACAGCACCAAAAACAGCTCGGCCATCACCAGCCCCAAA  1110

Query 1036  GGGACGCTTCCTCCTGCCGCCCTGGAG---------------------------------------------TC  1064
            ||..|.||.||||||||.|||||||||                                             ||
Sbjct 1111  GGATCTCTCCCTCCTGCTGCCCTGGAGCCTCAAACCACCGTTATCCATAACCCAGTGGACGGGATTAAGGAATC  1184

Query 1065  TTCTGACAGTGCCAATACCACCATAGAGGATGAAGACGCTAAAGCCCGGAAGCAGGAGATCATTAAGACCACGG  1138
            |||.|||||..||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1185  TTCCGACAGCACCAACACAACCATAGAGGATGAAGATGCCAAAGCCCGGAAGCAGGAAATCATCAAGACCACAG  1258

Query 1139  AGCAGCTCATCGAGGCCGTCAACAACGGTGACTTTGAGGCCTACGCGAAAATCTGTGACCCAGGGCTGACCTCG  1212
            ||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1259  AGCAGCTCATTGAGGCCGTCAACAATGGGGACTTTGAGGCCTATGCGAAAATCTGTGACCCAGGCCTGACCTCA  1332

Query 1213  TTTGAGCCTGAAGCACTGGGCAACCTGGTTGAAGGGATGGACTTCCACAGATTCTACTTCGAGAACCTGCTGGC  1286
            ||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1333  TTTGAGCCTGAAGCTCTGGGCAACCTGGTCGAAGGGATGGATTTCCACAGATTCTACTTTGAGAACCTGCTGGC  1406

Query 1287  CAAGAACAGCAAGCCGATCCACACGACCATCCTGAACCCACACGTGCACGTCATTGGAGAGGATGCCGCCTGCA  1360
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 1407  CAAGAACAGCAAGCCGATCCACACCACCATCCTGAACCCGCACGTGCACGTCATTGGCGAGGATGCGGCATGCA  1480

Query 1361  TCGCTTACATCCGGCTCACGCAGTACATTGACGGGCAGGGCCGGCCCCGCACCAGCCAGTCTGAGGAGACCCGC  1434
            ||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||.|.|||||.|||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 1481  TCGCCTACATCCGCCTCACACAGTACATCGATGGCCAGGGCAGACCCCGTACCAGCCAGTCCGAAGAGACCCGT  1554

Query 1435  GTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAACGTGCACTTCCACTGCTCGGGCGCGCCTGTGGCCCCGCTGCA  1508
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1555  GTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAATGTACATTTCCACTGCTCGGGCGCTCCAGTGGCCCCGCTGCA  1628

Query 1509  G  1509
            |
Sbjct 1629  G  1629