Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14564
• Subject: XM_017314237.1
• Aligned Length: 1956
• Identities: 1390
• Gaps: 447

Alignment

Query    1  ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGCTTCACCGACGAGTACCAGCTCTACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGTTTCACCGACGAGTACCAGCTATACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT  74

Query   75  CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGCACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATCAACACCAAGAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct   75  CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGTACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATTAATACCAAGAAGC  148

Query  149  TGTCAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGAGAGAGGCTCGGATCTGCCGCCTTCTGAAGCATTCCAACATCGTG  222
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct  149  TGTCGGCCAGAGATCACCAGAAACTGGAGAGAGAAGCTCGGATCTGCCGCCTGCTGAAGCATTCCAACATTGTA  222

Query  223  CGTCTCCACGACAGCATCTCCGAGGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT  296
            ||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGCCTCCATGACAGCATCTCTGAAGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT  296

Query  297  TGAAGACATTGTGGCGAGAGAGTACTACAGCGAGGCTGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCCG  370
            |||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct  297  TGAAGACATCGTGGCAAGAGAGTACTACAGTGAAGCTGATGCCAGTCACTGCATCCAGCAGATCCTGGAAGCTG  370

Query  371  TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCGGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAGTGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCTGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAATGC  444

Query  445  AAAGGGGCTGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTAGCTATCGAGGTGCAGGGGGACCAGCAGGCATGGTTTGG  518
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAGGCGCCGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTGGCCATCGAGGTTCAGGGAGACCAGCAGGCATGGTTTGG  518

Query  519  TTTCGCTGGCACACCAGGCTACCTGTCCCCTGAGGTCCTTCGCAAAGAGGCGTATGGCAAGCCTGTGGACATCT  592
            .||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  519  ATTTGCGGGAACGCCAGGCTACCTGTCTCCCGAGGTCCTTCGGAAGGAGGCCTACGGCAAACCTGTGGACATCT  592

Query  593  GGGCATGTGGGGTGATCCTGTACATCCTGCTCGTGGGCTACCCACCCTTCTGGGACGAGGACCAGCACAAGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  593  GGGCATGTGGGGTGATCCTGTATATCCTGCTGGTGGGCTACCCACCTTTCTGGGATGAGGACCAACACAAGCTG  666

Query  667  TACCAGCAGATCAAGGCTGGTGCCTATGACTTCCCGTCCCCTGAGTGGGACACCGTCACTCCTGAAGCCAAAAA  740
            ||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  TACCAGCAGATCAAGGCTGGGGCGTATGATTTCCCATCCCCTGAGTGGGACACCGTTACTCCTGAAGCCAAAAA  740

Query  741  CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACAGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCGTGGG  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACGGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCATGGG  814

Query  815  TCTGCCAACGCTCCACGGTAGCATCCATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAGTGTCTGAAAAAGTTCAATGCC  888
            ||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct  815  TCTGCCAACGTTCCACCGTGGCCTCTATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAATGTCTGAAGAAGTTCAATGCA  888

Query  889  AGGAGAAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACCATGCTGGCCACACGGAATTTCTC------------------  944
            |||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||                  
Sbjct  889  AGGAGGAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACTATGCTGGCCACACGGAATTTCTCAGTGGGCAGACAGACCAC  962

Query  945  ---------------------------------------------------------AGCAGCCAAGAGTTTAC  961
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct  963  CGCTCCGGCCACAATGTCCACCGCGGCCTCCGGCACCACCATGGGGCTGGTGGAACAAGCAGCCAAGAGTTTAC  1036

Query  962  TCAACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACGAATAGCACCAAAAACAGTGCAGCCGCCACCAGCCCCAAA  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..|.|||..|||||||||||||
Sbjct 1037  TCAACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACAAACAGCACCAAAAACAGCTCGGCCATCACCAGCCCCAAA  1110

Query 1036  GGGACGCTTCCTCCTGCCGCCCTGGAGTCTTCTGACAGTGCCAATACCACCATAGAGGATGAAGACGCTAAAG-  1108
            ||..|.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||..||||.||.|||||||||||||||||.||.|||| 
Sbjct 1111  GGATCTCTCCCTCCTGCTGCCCTGGAATCTTCCGACAGCACCAACACAACCATAGAGGATGAAGATGCCAAAGC  1184

Query 1109  --------------------------------------------------------------------------  1108
                                                                                      
Sbjct 1185  CCCCAGGGTCCCTGATGTCCTGAGCTTGGTGAGGAGGGCCTCAGGAGCCCCCGAAGCCGAGGGCCCCCTCTCCT  1258

Query 1109  --------------------------------------------------------------------------  1108
                                                                                      
Sbjct 1259  GCCAATCTCCAGTTCCCATTAGCCCCCTTCCAACCCCGTCCCCCAGGATCTCTGACATCCTGAACTCAGTGAGA  1332

Query 1109  --------------------------------------------------------------------------  1108
                                                                                      
Sbjct 1333  AGGGGCTGTGGAACCCCAGAAGCCGAGGGACCCCTATCAGTGGGGCCCCCACCCTGCTTGTCTCCGGGTCTCCT  1406

Query 1109  --------------------------------------------------------------------------  1108
                                                                                      
Sbjct 1407  AGGCCCCCTGCCCACCCCGTCCCCCAGGATCTCTGACATCCTCAACTCAGTGAGGCGGGGCTCAGGGACCCCAG  1480

Query 1109  --------------------------------------------------------------------------  1108
                                                                                      
Sbjct 1481  AAGCTGAGGGCCTCCCACCAGTGGGCCCCCCACCCTGCCCATCTCCGACTCTCCCTGGCCCCTTGCCCACCCCA  1554

Query 1109  -CCCGGAAGCAGGAGATCATTAAGACCACGGAGCAGCTCATCGAGGCCGTCAACAACGGTGACTTTGAGGCCTA  1181
             |||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1555  TCCCGGAAGCAGGAAATCATCAAGACCACAGAGCAGCTCATTGAGGCCGTCAACAATGGGGACTTTGAGGCCTA  1628

Query 1182  CGCGAAAATCTGTGACCCAGGGCTGACCTCGTTTGAGCCTGAAGCACTGGGCAACCTGGTTGAAGGGATGGACT  1255
            .||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1629  TGCGAAAATCTGTGACCCAGGCCTGACCTCATTTGAGCCTGAAGCTCTGGGCAACCTGGTCGAAGGGATGGATT  1702

Query 1256  TCCACAGATTCTACTTCGAGAACCTGCTGGCCAAGAACAGCAAGCCGATCCACACGACCATCCTGAACCCACAC  1329
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1703  TCCACAGATTCTACTTTGAGAACCTGCTGGCCAAGAACAGCAAGCCGATCCACACCACCATCCTGAACCCGCAC  1776

Query 1330  GTGCACGTCATTGGAGAGGATGCCGCCTGCATCGCTTACATCCGGCTCACGCAGTACATTGACGGGCAGGGCCG  1403
            ||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||.|
Sbjct 1777  GTGCACGTCATTGGCGAGGATGCGGCATGCATCGCCTACATCCGCCTCACACAGTACATCGATGGCCAGGGCAG  1850

Query 1404  GCCCCGCACCAGCCAGTCTGAGGAGACCCGCGTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAACGTGCACTTCC  1477
            .|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct 1851  ACCCCGTACCAGCCAGTCCGAAGAGACCCGTGTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAATGTACATTTCC  1924

Query 1478  ACTGCTCGGGCGCGCCTGTGGCCCCGCTGCAG  1509
            |||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1925  ACTGCTCGGGCGCTCCAGTGGCCCCGCTGCAG  1956