Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14566
• Subject: XM_017016722.1
• Aligned Length: 1856
• Identities: 1394
• Gaps: 411

Alignment

Query    1  ATGGCCACCACCGCCACCTGCACCCGTTTCACCGACGACTACCAGCTCTTCGAGGAGCTTGGCAA---------  65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct    1  ATGGCCACCACCGCCACCTGCACCCGTTTCACCGACGACTACCAGCTCTTCGAGGAGCTTGGCAAGGGTGCTTT  74

Query   66  ---------------GTGTGTGAAGAAAACCTCCACGCAGGAGTACGCAGCAAAAATCATCAATACCAAGAAAT  124
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  CTCTGTGGTCCGCAGGTGTGTGAAGAAAACCTCCACGCAGGAGTACGCAGCAAAAATCATCAATACCAAGAAGT  148

Query  125  TGTCTGCCCGGGATCACCAGAAACTAGAACGTGAGGCTCGGATATGTCGACTTCTGAAACATCCAAACATCGTG  198
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGTCTGCCCGGGATCACCAGAAACTAGAACGTGAGGCTCGGATATGTCGACTTCTGAAACATCCAAACATCGTG  222

Query  199  CGCCTCCATGACAGTATTTCTGAAGAAGGGTTTCACTACCTCGTGTTTGACCTTGTTACCGGCGGGGAGCTGTT  272
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGCCTCCATGACAGTATTTCTGAAGAAGGGTTTCACTACCTCGTGTTTGACCTTGTTACCGGCGGGGAGCTGTT  296

Query  273  TGAAGACATTGTGGCCAGAGAGTACTACAGTGAAGCAGATGCCAGCCACTGTATACATCAGATTCTGGAGAGTG  346
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAAGACATTGTGGCCAGAGAGTACTACAGTGAAGCAGATGCCAGCCACTGTATACATCAGATTCTGGAGAGTG  370

Query  347  TTAACCACATCCACCAGCATGACATCGTCCACAGGGACCTGAAGCCTGAGAACCTGCTGCTGGCGAGTAAATGC  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTAACCACATCCACCAGCATGACATCGTCCACAGGGACCTGAAGCCTGAGAACCTGCTGCTGGCGAGTAAATGC  444

Query  421  AAGGGTGCCGCCGTCAAGCTGGCTGATTTTGGCCTAGCCATCGAAGTACAGGGAGAGCAGCAGGCTTGGTTTGG  494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGGGTGCCGCCGTCAAGCTGGCTGATTTTGGCCTAGCCATCGAAGTACAGGGAGAGCAGCAGGCTTGGTTTGG  518

Query  495  TTTTGCTGGCACCCCAGGTTACTTGTCCCCTGAGGTCTTGAGGAAAGATCCCTATGGAAAACCTGTGGATATCT  568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTTTGCTGGCACCCCAGGTTACTTGTCCCCTGAGGTCTTGAGGAAAGATCCCTATGGAAAACCTGTGGATATCT  592

Query  569  GGGCCTGCGGGGTCATCCTGTATATCCTCCTGGTGGGCTATCCTCCCTTCTGGGATGAGGATCAGCACAAGCTG  642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGCCTGCGGGGTCATCCTGTATATCCTCCTGGTGGGCTATCCTCCCTTCTGGGATGAGGATCAGCACAAGCTG  666

Query  643  TATCAGCAGATCAAGGCTGGAGCCTATGATTTCCCATCACCAGAATGGGACACGGTAACTCCTGAAGCCAAGAA  716
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TATCAGCAGATCAAGGCTGGAGCCTATGATTTCCCATCACCAGAATGGGACACGGTAACTCCTGAAGCCAAGAA  740

Query  717  CTTGATCAACCAGATGCTGACCATAANCCCAGCCAAAGCGCATCACGGCTGACCAGGCTCTCAAGCACCCGTGG  790
            ||||||||||||||||||||||||||.||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTGATCAACCAGATGCTGACCATAAACCCAG-CAAAGCGCATCACGGCTGACCAGGCTCTCAAGCACCCGTGG  813

Query  791  GTCTGTCAACGATCCACGGTGGCATCCATGATGCATCGTCAGGAGACTGTGGAGTGTTTGCGCAAGTTCAATGC  864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  GTCTGTCAACGATCCACGGTGGCATCCATGATGCATCGTCAGGAGACTGTGGAGTGTTTGCGCAAGTTCAATGC  887

Query  865  CCGGAGAAAACTGAAGGGTGCCATCCTCACGACCATGCTTGTCTCCAGGAACTTCTC-----------------  921
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
Sbjct  888  CCGGAGAAAACTGAAGGGTGCCATCCTCACGACCATGCTTGTCTCCAGGAACTTCTCAGTTGGCAGGCAGAGCT  961

Query  922  ----------------------------------------------AGCTGCCAAAAGCATATTGAACAAGAAG  949
                                                          |||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  962  CCGCCCCCGCCTCGCCTGCCGCGAGCGCCGCCGGCCTGGCCGGGCAAGCTGCCAAAAGCCTATTGAACAAGAAG  1035

Query  950  TCGGATGGCGGTGTCAAGCCACAGAGCAACAACAAAAACAGTCTCGTAAGCCCAGCCCAAGAGCCCGCGCCCTT  1023
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                             
Sbjct 1036  TCGGATGGCGGTGTCAAGCCACAGAGCAACAACAAAAACAGTCTC-----------------------------  1080

Query 1024  GCAGACGGCCATGGAGCCACAAACCACTGTGGTACACAACGCTACAGATGGGATCAAGGGCTCCACAGAGAGCT  1097
                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081  -------------GAGCCACAAACCACTGTGGTACACAACGCTACAGATGGGATCAAGGGCTCCACAGAGAGCT  1141

Query 1098  GCAACACCACCACAGAAGATGAGGACCTCAAAG-----------------------------------------  1130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||                                         
Sbjct 1142  GCAACACCACCACAGAAGATGAGGACCTCAAAGCTGCCCCGCTCCGCACTGGGAATGGCAGCTCGGTGCCTGAA  1215

Query 1131  -------------------------------------------------------------------------T  1131
                                                                                     |
Sbjct 1216  GGACGGAGCTCCCGGGACAGAACAGCCCCCTCTGCAGGCATGCAGCCCCAGCCTTCTCTCTGCTCCTCAGCCAT  1289

Query 1132  GCGAAAACAGGAGATCATTAAGATTACAGAACAGCTGATTGAAGCCATCAACAATGGGGACTTTGAGGCCTACA  1205
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1290  GCGAAAACAGGAGATCATTAAGATTACAGAACAGCTGATTGAAGCCATCAACAATGGGGACTTTGAGGCCTACA  1363

Query 1206  CGAAGATTTGTGATCCAGGCCTCACTTCCTTTGAGCCTGAGGCCCTTGGTAACCTCGTGGAGGGGATGGATTTC  1279
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1364  CGAAGATTTGTGATCCAGGCCTCACTTCCTTTGAGCCTGAGGCCCTTGGTAACCTCGTGGAGGGGATGGATTTC  1437

Query 1280  CATAAGTTTTACTTTGAGAATC----------TCCTG------------TCCAAGAACAGCAAGCCTATCC--A  1329
            ||||||||||||||||||||||          ||.||            |||          .||||..||  .
Sbjct 1438  CATAAGTTTTACTTTGAGAATCGTGAGTGGGTTCGTGCTGCTGATATACTCC----------TGCCTGCCCCTT  1501

Query 1330  TAC----------------------CACCATCCTAAACCCA------CACGTCCACGTGATTGGGGAGGACGCA  1375
            |||                      |||| |.||.|.||||      |||.|...|.|.|||     .||| |.
Sbjct 1502  TACCCCTTTGTCTCTGTCTCCTGCTCACC-TTCTCATCCCAGTTGCCCACTTTTCCCTTATT-----TGAC-CT  1568

Query 1376  GCGTGCAT---CGCCTAC-----ATCCGCCTCACCCAGTACATCGACG------GGCAGG-------GTCGGC-  1427
            .||||| |   |.|||||     ||.|...||.||..||.|..|||.|      |.||||       |..||| 
Sbjct 1569  TCGTGC-TGCACTCCTACTCTGTATGCTTGTCCCCTTGTGCCCCGATGGTTGTAGACAGGCACCTTTGAAGGCC  1641

Query 1428  ---CTC----GCACCA---GCCAGTCAGAAGAGACCCGGGTCTG--GCACCGTCGGGATGGCAAGTGGC--TCA  1487
               |||    ||.|||   ||||.|||            .||||  ||..|.|.|   |||| ||||.|  |||
Sbjct 1642  CTGCTCCTGAGCTCCAAGTGCCATTCA------------TTCTGCAGCTGCTTTG---TGGC-AGTGCCAGTCA  1699

Query 1488  ATGTCCACTATCACTGCTCA------------GGGGCCC-----CCTCCGCACCGCTGCAG-------------  1531
                ||||.|||| .|||||            .||||.|     |.|.|||    |||.|.             
Sbjct 1700  ----CCACAATCA-AGCTCACTTATTTCTTGCCGGGCGCGGTGGCTTACGC----CTGTAATCCCAACACTTTG  1764

Query 1532  ------  1531
                  
Sbjct 1765  GGAGGC  1770