Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14586
• Subject: NM_198415.2
• Aligned Length: 1257
• Identities: 1117
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCCAGTATCTTTTCTAAGTTGCTAACTGGCCGCAATGCTTCTCTGCTGTTTGCTACCATGGGCACCAGTGT  74
            |||||||||..|||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||.||||..||||.|||||||.
Sbjct    1  ATGGCCAGTGCCTTCTCAAAGTTGCTAACTGGCCGAAATGCATCTCTGCTGTTTACTACACTGGGAACCAGTGC  74

Query   75  CCTGACCACCGGGTACCTGCTGAACCGGCAGAAAGTGTGTGCCGAGGTCCGGGAGCAGCCTAGGCTATTTCCTC  148
            |||||||||.||.|||||||||||..|||||||.||.|.|||.||.|.||||||.||||..|.|||.|||||.|
Sbjct   75  CCTGACCACTGGTTACCTGCTGAATAGGCAGAAGGTATCTGCTGATGCCCGGGAACAGCACAAGCTCTTTCCCC  148

Query  149  CAAGCGCAGACTACCCAGACCTGCGCAAGCACAACAACTGCATGGCCGAGTGCCTCACCCCCGCCATTTATGCC  222
            ||||.||.||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||||.||||||
Sbjct  149  CAAGTGCGGACTACCCTGACCTTCGAAAACATAACAACTGCATGGCTGAGTGCCTCACCCCCACCATCTATGCC  222

Query  223  AAGCTTCGCAACAAGGTGACACCCAACGGCTACACGCTGGACCAGTGCATCCAGACTGGAGTGGACAACCCTGG  296
            ||.||.||.||||||.|||||||||..|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  223  AAACTCCGAAACAAGATGACACCCAGTGGCTATACCCTGGACCAGTGCATCCAAACTGGAGTGGACAACCCCGG  296

Query  297  CCACCCCTTCATAAAGACTGTGGGCATGGTGGCTGGTGACGAGGAGTCCTATGAGGTGTTTGCTGACCTTTTTG  370
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  CCACCCCTTCATTAAGACTGTGGGCATGGTGGCTGGTGATGAGGAGTCGTATGAGGTATTTGCTGACCTTTTTG  370

Query  371  ACCCCGTCATCAAACTAAGACACAACGGCTATGACCCCAGGGTGATGAAGCACACAACGGATCTGGATGCATCA  444
            |.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||..|.|||||.|||||||||||.
Sbjct  371  ATCCTGTCATCAAACTAAGGCACAATGGCTATGACCCTAGGGTGATGAAGCATCCTACGGACCTGGATGCATCC  444

Query  445  AAGATCACCCAAGGGCAGTTCGACGAGCATTACGTGCTGTCTTCTCGGGTGCGCACTGGCCGCAGCATCCGTGG  518
            |||||.||.||.||||||||.||.||||..||.|||.||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct  445  AAGATTACTCACGGGCAGTTTGATGAGCGCTATGTGTTGTCCTCTCGGGTACGCACTGGCCGAAGCATCCGCGG  518

Query  519  GCTGAGCCTGCCTCCAGCCTGCACCCGGGCCGAGCGAAGGGAGGTAGAGAACGTGGCCATCACTGCCCTGGAGG  592
            ||||||||||||||||||||||.||||.||.|||.||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  GCTGAGCCTGCCTCCAGCCTGCTCCCGAGCAGAGAGAAGGGAGGTGGAGAATGTGGCCATTACTGCCCTGGAGG  592

Query  593  GCCTCAAGGGGGACCTGGCTGGCCGCTACTACAAGCTGTCCGAGATGACGGAGCAGGACCAGCAGCGGCTCATC  666
            ||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct  593  GCCTGAAGGGCGATCTGGCTGGCCGCTACTACAAGCTGTCTGAGATGACGGAGCAGGATCAGCAACGTCTCATC  666

Query  667  GATGACCACTTTCTGTTTGATAAGCCAGTGTCCCCTTTATTAACATGTGCTGGGATGGCCCGTGACTGGCCAGA  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  667  GATGACCACTTTCTGTTTGATAAGCCAGTGTCCCCTTTACTAACATGTGCTGGAATGGCCCGTGACTGGCCTGA  740

Query  741  TGCCAGGGGAATCTGGCATAATTATGATAAGACATTTCTCATCTGGATAAATGAGGAGGATCACACCAGGGTAA  814
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct  741  TGCCAGGGGAATCTGGCATAATTATGACAAGACATTTCTCATCTGGATAAATGAGGAAGACCACACCAGGGTGA  814

Query  815  TCTCAATGGAAAAAGGAGGCAATATGAAACGAGTATTTGAGCGATTCTGTCGTGGACTAAAAGAAGTAGAACGG  888
            |||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct  815  TCTCAATGGAAAAGGGAGGCAATATGAAACGCGTATTTGAGAGATTCTGTCGTGGACTAAAGGAAGTGGAACGA  888

Query  889  TTAATCCAAGAACGAGGCTGGGAGTTCATGTGGAATGAGCGCCTAGGATACATTTTGACCTGTCCTTCGAACCT  962
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct  889  TTAATCCAGGAACGAGGCTGGGAGTTCATGTGGAATGAGCGTCTGGGATACATTTTGACTTGCCCCTCGAACCT  962

Query  963  TGGAACAGGACTACGAGCTGGTGTCCACGTTAGGATCCCAAAGCTCAGCAAGGACCCACGCTTTTCTAAGATCC  1036
            .|||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.
Sbjct  963  CGGAACTGGATTGCGAGCTGGTGTCCACGTTAGGATCCCGAAGCTCAGCAAGGATCCACGCTTTTCTAAGATCT  1036

Query 1037  TGGAAAACCTAAGACTCCAGAAGCGTGGCACAGGTGGTGTGGACACTGCCGCGGTCGCAGATGTGTACGACATT  1110
            ||||.|||||..|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1037  TGGAGAACCTGCGGCTCCAAAAGCGTGGCACAGGTGGTGTGGACACTGCTGCAGTGGCAGATGTGTACGATATT  1110

Query 1111  TCCAACATAGATAGAATTGGTCGATCAGAGGTTGAGCTTGTTCAGATAGTCATCGATGGAGTCAATTACCTGGT  1184
            ||||||||||||.|.||.||..|||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 1111  TCCAACATAGATCGGATCGGCAGATCAGAGGTTGAGCTTGTTCAGATTGTTATTGACGGAGTCAACTACCTGGT  1184

Query 1185  GGATTGTGAAAAGAAGTTGGAGAGAGGCCAAGATATTAAGGTGCCACCCCCTCTGCCTCAGTTTGGCAAAAAG  1257
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||..|||
Sbjct 1185  GGATTGTGAAAAGAAGCTGGAGAGAGGCCAAGACATCAAGGTGCCCCCTCCTCTGCCTCAGTTTGGCAGGAAG  1257