Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14592
- Subject:
- XM_017027666.1
- Aligned Length:
- 2064
- Identities:
- 1431
- Gaps:
- 618
Alignment
Query 1 ATGGCCGGGCCAAGCGCGTGCGCCCCGCTCCTGCTCCTGCTCCTGCTCGGGGAGCTTCTGGCGGCCGCCGGGGC 74
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Sbjct 1 ATGGCCGGGCCGCGCGCGTGCGCCCCGCTCCTGCTCCTGCTCCTGCTCGGGGAGCTTCTGGCGGCCGCCGGGGC 74
Query 75 GCAGAGAGTGGGACTCCCCGGCCCCCCCGGCCCCCCAGGGCCGCCCGGGAAGCCCGGCCAGGACGGCATTGACG 148
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Sbjct 75 GCAGAGAGTGGGACTCCCCGGCCCCCCCGGCCCCCCAGGGCCGCCCGGGAAGCCCGGCCAGGACGGCATTGACG 148
Query 149 GAGAAGCTGGTCCTCCAGGTCTGCCTGGGCCCCCGGGACCAAAGGGGGCCCCAGGAAAGCCGGGGAAACCAGGA 222
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Sbjct 149 GAGAAGCTGGTCCTCCAGGTCTGCCTGGGCCCCCGGGACCAAAGGGGGCCCCAGGAAAGCCGGGGAAACCAGGA 222
Query 223 GAGGCTGGGCTGCCGGGACTGCCGGGTGTGGATGGTCTGACTGGACGAGATGGACCCCCTGGACCCAAGGGTGC 296
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Sbjct 223 GAGGCTGGGCTGCCGGGACTGCCGGGTGTGGATGGTCTGACTGGACGAGATGGACCCCCTGGACCCAAGGGTGC 296
Query 297 CCCTGGGGAACGGGGAAGTCTGGGACCCCCGGGGCCGCCCGGGCTGGGGGGCAAAGGCCTCCCTGGACCCCCCG 370
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Sbjct 297 CCCTGGGGAACGGGGAAGTCTGGGACCCCCGGGGCCGCCCGGGCTGGGGGGCAAAGGCCTCCCTGGACCCCCCG 370
Query 371 GAGAGGCAGGAGTGAGCGGCCCCCCAGGTGGGATCGGCCTCCGCGGCCCCCCGGGACCTTCTGGACTCCCCGGC 444
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Sbjct 371 GAGAGGCAGGAGTGAGCGGCCCCCCAGGTGGGATCGGCCTCCGCGGCCCCCCGGGACCTTCTGGACTCCCCGGC 444
Query 445 CTCCCTGGTCCCCCAGGACCTCCCGGACCCCCTGGACACCCAGGAGTCCTCCCTGAAGGCGCTACTGACCTTCA 518
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Sbjct 445 CTCCCTGGTCCCCCAGGACCTCCCGGACCCCCTGGACACCCAGGAGTCCTCCCTGAAGGCGCTACTGACCTTCA 518
Query 519 GTGCCCAAGTATCTGCCCGCCAGGTCCCCCAGGGCCCCCTGGAATGCCAGGGTTCAAGGGACCCACTGGCTACA 592
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Sbjct 519 GTGCCCAAGTATCTGCCCGCCAGGTCCCCCAGGGCCCCCTGGAATGCCAGGGTTCAAGGGACCCACTGGCTACA 592
Query 593 AAGGCGAGCAGGGGGAAGTCGGCAAGGACGGCGAGAAGGGTGACCCTGGCCCCCCTGGGCCCGCCGGCCTCCCG 666
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Sbjct 593 AAGGCGAGCAGGGGGAAGTCGGCAAGGACGGCGAGAAGGGTGACCCTGGCCCCCCTGGGCCCGCCGGCCTCCCG 666
Query 667 GGCAGCGTGGGGCTGCAGGGCCCCCGGGGATTACGAGGACTGCCAGGGCCACTCGGGCCCCCTGGGGACCGGGG 740
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Sbjct 667 GGCAGCGTGGGGCTGCAGGGCCCCCGGGGATTACGAGGACTGCCAGGGCCACTCGGGCCCCCTGGGGACCGGGG 740
Query 741 TCCCATTGGGTTCCGAGGGCCGCCTGGGATCCCAGGAGCGCCTGGGAAAGCGGGTGACCGAGGCGAGAGGGGCC 814
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Sbjct 741 TCCCATTGGGTTCCGAGGGCCGCCTGGGATCCCAGGAGCGCCTGGGAAAGCGGGTGACCGAGGCGAGAGGGGCC 814
Query 815 CAGAAGGGTTCCGCGGCCCCAAGGGTGACCTCGGCAGACCTGGTCCCAAGGGAACCCCTGGCATGGCCGGGCCA 888
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Sbjct 815 CAGAAGGGTTCCGCGGCCCCAAGGGTGACCTCGGCAGACCTGGTCCCAAGGGAACCCCCGGAGTGGCCGGGCCA 888
Query 889 AGCGGAGAGCCGGGCATGCCGGGCAAGGACGGCCAGAATGGCGTGCCAGGACTCGATGGCCAGAAGGGAGAGGC 962
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Sbjct 889 AGCGGAGAGCCGGGCATGCCGGGCAAGGACGGCCAGAATGGCGTGCCAGGACTCGATGGCCAGAAGGGAGAGGC 962
Query 963 TGGTCGCAACGGTGCTCCGGGAGAGAAGGGCCCCAACGGGCTGCCGGGCCTCCCTGGACGAGCGGGGTCCAAAG 1036
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Sbjct 963 TGGTCGCAACGGTGCTCCGGGAGAGAAGGGCCCCAACGGGCTGCCGGGCCTCCCTGGACGAGCGGGGTCCAAAG 1036
Query 1037 GCGAGAAGGGAGAACGGGGCAGAGCTGGGGAGCTGGGTGAGGCCGGCCCCTCTGGAGAGCCAGGCGTCCCTGGA 1110
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Sbjct 1037 GCGAGAAGGGAGAACGGGGCAGAGCTGGGGAGCTGGGTGAGGCCGGCCCCTCTGGAGAGCCAGGCGTCCCTGGA 1110
Query 1111 GATGCTGGCATGCCTGGGGAGCGCGGTGAGGCTGGCCACCGGGGCTCAGCGGGGGCCCTCGGCCCACAAGGCCC 1184
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Sbjct 1111 GATGCTGGCATGCCTGGGGAGCGCGGTGAGGCTGGCCACCGGGGCTCAGCGGGGGCCCTCGGCCCACAAGGCCC 1184
Query 1185 TCCCGGAGCCCCTGGTGTCCGAGGCTTCCAGGGCCAGAAGGGCAGCATGGGAGACCCCGGCCTTCCAGGCCCCC 1258
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Sbjct 1185 TCCCGGAGCCCCTGGTGTCCGAGGCTTCCAGGGCCAGAAGGGCAGCATGGGAGACCCCGGCCTTCCAGGCCCCC 1258
Query 1259 AGGGCCTCCGAGGTGACGTGGGCGACCGGGGTCCGGGAGGTGCCGCAGGCCCTAAGGGAGACCAGGGTATTGCA 1332
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Sbjct 1259 AGGGCCTCCGAGGTGACGTGGGCGACCGGGGTCCGGGAGGTGCCGCAGGCCCTAAGGGAGACCAGGGTATTGCA 1332
Query 1333 GGTTCCGACGGTCTTCCTGGGGATAAAGGAGAACTGGGTCCCAGCGGCCTGGTCGGACCCAAAGGAGAGTCTGG 1406
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Sbjct 1333 GGTTCCGACGGTCTTCCTGGGGATAAAGGAGAACTGGGTCCCAGCGGCCTGGTCGGACCCAAAGGAGA----GG 1402
Query 1407 CAGT-------CGAGGGGA-GCTGGGCCCCAAAGG---CACCCAGGGTCCCAACGGCACCA-GCGGTGTTCAGG 1468
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Sbjct 1403 AAGTTACTTTGCGGGGTGACGGTGGG-----AATGCCTCACCGAGGCTGC---CGCCCCCATGC---------- 1458
Query 1469 GTGTCCCCGGGCCCCCCGGTCCTCTGGGCCTGCAGGGCGTCCCGGGTGTTCCTGGCATCACGGGGAAGCCGGGA 1542
Sbjct 1459 -------------------------------------------------------------------------- 1458
Query 1543 GTTCCGGGGAAGGAGGCCAGCGAGCAGCGCATCAGGGAGCTGTGTGGGGGGATGATCAGCGAACAAATTGCACA 1616
Sbjct 1459 -------------------------------------------------------------------------- 1458
Query 1617 GTTAGCCGCGCACCTAAGGAAGCCTTTGGCACCCGGGTCCATTGGTCGGCCCGGTCCAGCTGGCCCCCCTGGGC 1690
Sbjct 1459 -------------------------------------------------------------------------- 1458
Query 1691 CCCCAGGACCCCCAGGCTCCATTGGTCACCCTGGCGCTCGAGGACCCCCCGGATACCGCGGTCCCACTGGGGAG 1764
Sbjct 1459 -------------------------------------------------------------------------- 1458
Query 1765 CTGGGAGACCCCGGGCCCAGAGGAAACCAGGGTGACAGAGGAGACAAAGGCGCGGCAGGAGCAGGGCTGGACGG 1838
Sbjct 1459 -------------------------------------------------------------------------- 1458
Query 1839 GCCTGAAGGAGACCAGGGGCCCCAAGGACCCCAAGGCGTGCCCGGCACCAGCAAGGACGGCCAGGACGGTGCTC 1912
Sbjct 1459 -------------------------------------------------------------------------- 1458
Query 1913 CCGGCGAGCCTGGGCCTCCCGGAGATCCTGGGCTTCCAGGTGCCATTGGGGCCCAGGGGACACCGGGGATCTGC 1986
Sbjct 1459 -------------------------------------------------------------------------- 1458
Query 1987 GACACCTCAGTCTGCCAAGGAGCCGTGTTAGGAGGGGTCGGGGAGAAATCAGGCTCTCGAAGCTCA 2052
Sbjct 1459 ------------------------------------------------------------------ 1458
