Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14615
- Subject:
- XM_006521764.3
- Aligned Length:
- 2827
- Identities:
- 2368
- Gaps:
- 201
Alignment
Query 1 ATGCCGGTCCGGAAGCAAGATACCCAGAGAGCATTGCACCTTTTGGAGGAATATCGTTCAAAACTAAGCCAAAC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCGGTCCGGAAGCAAGATACCCAGAGAGCATTGCATCTGTTGGAAGAATATCGATCGAAACTAAGCCAAAC 74
Query 75 TGAAGACAGACAGCTCAGAAGTTCCATAGAACGGGTTATTAACATATTTCAGAGCAACCTCTTTCAGGCTTTAA 148
||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGAAGACAGACAACTCAGAAGTTCCATAGAGCGGGTTATTAACATATTTCAGAGCAACCTCTTTCAGGCTTTAA 148
Query 149 TAGATATTCAAGAATTTTATGAAGTGACCTTACTGGATAATCCAAAATGTATAGATCGTTCAAAGCCGTCTGAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||.||||||||.||.||||
Sbjct 149 TAGATATTCAAGAATTTTATGAAGTGACCTTACTTGATAATCCAAAATGTGTGGATCATTCAAAGCAGTGTGAA 222
Query 223 CCAATTCAACCTGTGAATACTTGGGAGATTTCCAGCCTTCCAAGCTCTACTGTGACTTCAGAGACACTGCCAAG 296
|||.||||.|||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||.|.|||||.|||||.||.|||||..|
Sbjct 223 CCAGTTCAGCCTGTGACTACTTGGGAGATTGCCAGCCTTCCAAGCACTGCCGTGACGTCAGAAACCCTGCCCGG 296
Query 297 CAGCCTTAGCCCTAGTGTAGAGAAATACAGGTATCAGGATGAAGATACACCTCCTCAAGAGCATATTTCCCCAC 370
|||||||||||||...||||||||||||.||||||||||||||||...||.|||||..|||||||||||.||||
Sbjct 297 CAGCCTTAGCCCTCCAGTAGAGAAATACCGGTATCAGGATGAAGAGGTACTTCCTCCTGAGCATATTTCTCCAC 370
Query 371 AAATCACAAATGAAGTGATAGGTCCAGAATTGGTTCATGTCTCAGAGAAGAACTTATCAGAGATTGAGAATGTC 444
||.||||||||||.|||.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGTCACAAATGAGGTGCTAGGTCCAGAACTGGTCCATGTCTCAGAGAAGAACCTGTCAGAGATTGAGAATGTC 444
Query 445 CATGGATTTGTTTCTCATTCTCATATTTCACCAATAA------------------------------------- 481
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 445 CATGGATTTGTTTCTCATTCTCATATCTCACCAATAAAGCCCACAGAAGCTGTTCCTCCCTCCTCTCCCATTGT 518
Query 482 --------------------------------------------------------------AGGCAAATCCTC 493
||||||||||||
Sbjct 519 CCCTGTGACCCCTGCCCTGCCAGTCCCTGCTGAGAGTACTGTCGTCCTGCCCTCCGCACCACAGGCAAATCCTC 592
Query 494 CCCCAGTACTGGTCAACACAGATAGCTTGAAAACACCAACTTACGTTAATGGCACAGATGCAGATTATGAATAT 567
|.|||||.||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTCCAGTGCTGGTCAACACAGACAGCTTAGAGACACCAACTTATGTTAATGGCACTGATGCAGATTATGAATAT 666
Query 568 GAAGAAATCACACTTGAAAGGGGAAATTCAGGGCTTGGTTTCAGCATTGCAG--AGTACGGACAACCCACACAT 639
||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||| .||||.||||||||||||||
Sbjct 667 GAGGAAATCACACTTGAAAGGGGAAATTCGGGTCTTGGTTTCAGCATTGCAGGAGGTACAGACAACCCACACAT 740
Query 640 TGGAGATGACTCAAGTATTTTCATTACCAAAATTATCACAGG-GGAGCAGCCGCCCAAGATGGGAAGATTGCGG 712
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||| |||||.||.|||||.||| ||||||||||||
Sbjct 741 TGGAGATGACTCAAGTATTTTCATCACCAAAATTATCACAGGCGGAGCGGCTGCCCAGGAT-GGAAGATTGCGG 813
Query 713 GTCAATGACTGTATATTACAAGTAAATGAAGTAGATGTTCGTGATGTAACACATAGCAAAGCAGTTGAAGCGTT 786
||.||||||||||||.|...|||||||||||.|||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 814 GTAAATGACTGTATACTGAGAGTAAATGAAGCAGACGTTCGTGATGTAACCCACAGCAAAGCAGTGGAGGCATT 887
Query 787 GAAAGAAGCAGGGTCTATTGTACGCTTGTATGTAAAAAGAAGGAAACCAGTGTCAGAAAAAATAATGGAAATAA 860
.||||||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||..||||.||||..|||||||||||.||||||||||
Sbjct 888 AAAAGAAGCTGGATCTATTGTGCGATTGTATGTGAAAAGGCGGAAGCCAGCATCAGAAAAAATCATGGAAATAA 961
Query 861 AGCTCATTAAAGGTCCTAAAGGTCTTGGGTTTAGCATTGCTGGAGGTGTTGGAAATCAGCATATTCCTGGGGAT 934
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 962 AGCTCATTAAAGGTCCTAAAGGTCTTGGGTTCAGCATTGCTGGAGGTGTTGGAAATCAGCACATTCCTGGTGAT 1035
Query 935 AATAGCATCTATGTAACCAAAATAATTGAAGGAGGTGCAGCACATAAGGATGGCAAACTTCAGATTGGAGATAA 1008
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1036 AACAGCATCTATGTAACCAAAATAATTGAAGGAGGTGCAGCACACAAGGATGGCAAGCTTCAGATTGGAGATAA 1109
Query 1009 ACTTTTAGCAGTGAATAACGTATGTTTAGAAGAAGTTACTCATGAAGAAGCAGTAACTGCCTTAAAGAACACAT 1082
.|||.||||||||||.|..||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1110 GCTTCTAGCAGTGAACAGTGTGTGTTTAGAAGAAGTTACTCATGAAGAAGCAGTGACTGCCTTAAAGAATACAT 1183
Query 1083 CTGATTTTGTTTATTTGAAAGTGGCAAAACCCACAAGTATGTATATGAATGATGGCTATGCACCACCTGATATC 1156
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1184 CTGATTTTGTTTATTTGAAAGTGGCAAAACCAACAA-------------------------------------- 1219
Query 1157 ACCAACTCTTCTTCTCAGCCTGTTGATAACCATGTTAGCCCATCTTCCTTCTTGGGCCAGACACCAGCATCTCC 1230
||||||||||..|||||||.||||||||.|||||.||.||||.||||||||||||.|||.|.||.||
Sbjct 1220 -------CTTCTTCTCAATCTGTTGACAACCATGTCAGCCCGTCCTCCTGCTTGGGCCAGACGCCAACGTCACC 1286
Query 1231 AGCCAGATACTC-CCCAGTTTCTAAAGCAGTACTTGGAGATGATGAAATTACAAGGGAACCTAGAAAAGTTGTT 1303
||||||.||||| |||| ||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1287 AGCCAGGTACTCACCCA-TTTCTAAAGCTGTGCTCGGAGATGACGAGATCACTAGGGAACCTAGAAAAGTTGTT 1359
Query 1304 CTTCATCGTGGCTCAACGGGCCTTGGTTTCAACATTGTAGGAGGAGAAGATGGAGAAGGAATATTTATTTCCTT 1377
|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1360 CTTCATCGTGGCTCAACAGGACTTGGTTTTAACATTGTGGGAGGTGAAGATGGAGAAGGGATTTTTATCTCCTT 1433
Query 1378 TATCTTAGCCGGAGGACCTGCTGATCTAAGTGGAGAGCTCAGAAAAGGAGATCGTATTATATCGGTAAACAGTG 1451
.|||.|.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 1434 CATCCTTGCTGGCGGACCTGCTGATCTAAGTGGAGAGCTCAGAAAAGGAGATCGCATCATATCGGTGAACAGTG 1507
Query 1452 TTGACCTCAGAGCTGCTAGTCATGAGCAGGCAGCAGCTGCATTGAAAAATGCTGGCCAGGCTGTCACAATTGTT 1525
||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||.|.||.||.||.|||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 1508 TTGACCTCAGAGCTGCAAGTCACGAACAAGCAGCAGCTGCACTAAAGAACGCAGGCCAAGCCGTCACCATCGTT 1581
Query 1526 GCACAATATCGACCTGAAGAATACAGTCGTTTTGAAGCTAAAATACATGATTTACGGGAGCAGATGATGAATAG 1599
||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1582 GCGCAATATCGACCCGAAGAGTACAGTCGTTTTGAAGCTAAAATCCATGACTTACGGGAGCAGATGATGAATAG 1655
Query 1600 TAGTATTAGTTCAGGGTCAGGTTCTCTTCGAACTAGCCAGAAGCGATCCCTCTATGTCAGAGCCCTTTTTGATT 1673
.|||.|.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1656 CAGTGTCAGTTCAGGGTCAGGGTCTCTTCGAACCAGCCAGAAGCGCTCCCTCTATGTCAGAGCCCTCTTTGATT 1729
Query 1674 ATGACAAGACTAAAGACAGTGGGCTTCCCAGTCAGGGACTGAACTTCAAATTTGGAGATATCCTCCATGTTATT 1747
|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||...||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1730 ATGACAAGACTAAGGACAGCGGGCTTCCCAGTCAAGGACTGAACTTCCGCTTTGGAGACATCCTCCATGTCATC 1803
Query 1748 AATGCTTCTGATGATGAATGGTGGCAAGCCAGGCAGGTTACACCAGATGGTGAGAGCGATGAGGTCGGAGTGAT 1821
|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1804 AATGCTTCTGACGACGAGTGGTGGCAAGCCAGGCAGGTCACCCCAGACGGGGAGAGTGACGAAGTCGGAGTGAT 1877
Query 1822 TCCCAGTAAACGCAGAGTTGAGAAGAAAGAACGAGCCCGATTAAAAACAGTGAAATTCAATTCTAAAACGA--- 1892
|||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1878 TCCTAGTAAACGAAGAGTTGAGAAGAAGGAACGAGCCCGATTAAAAACGGTCAAATTCAATTCTAAAACAAGAG 1951
Query 1893 GAGATAAAGGGCAGTCATTCAATGACAAGCGTAAAAAGAACCTCTTTTCCCGAAAATTCCCCTTCTACAAGAAC 1966
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1952 GAGATAAAGGGCAGTCATTCAATGACAAGCGTAAAAAGAACCTCTTTTCCCGAAAATTTCCCTTCTACAAGAAC 2025
Query 1967 AAGGACCAGAGTGAGCAGGAAACAAGTGATGCTCACAAGTATGTA-----TA-------------TGAA----- 2017
||||||||||||||.||||||||.|||||||||.||.||.|.||| || ||||
Sbjct 2026 AAGGACCAGAGTGAACAGGAAACGAGTGATGCTGACCAGCACGTAACTTCTAATGCCAGCGATAGTGAAAGTAG 2099
Query 2018 -----------TGATGGCTATGCACCACCTG-ATAT-----CACCAACTGTGGTCAAGAAGAATACGTCTTATC 2074
|||| || ||..|| |||| |.|.||..||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 2100 TTACCTAATCTTGAT---TA-----CAGATGAATATGGCTGCTCAAAAGGTGGTCAAGAAGAATATGTTTTATC 2165
Query 2075 TTATGAACCAGTGAATCAACAAGAAGTTAATTATACTCGACCAGTGATCATATTGGGACCTATGAAAGACAGGA 2148
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||..
Sbjct 2166 TTATGAGCCAGTGAATCAACAAGAAGTTAATTATACCCGACCAGTCATCATATTAGGACCTATGAAAGACAGAG 2239
Query 2149 TAAATGATGACTTGATCTCAGAATTTCCTGACAAATTTGGATCCTGTGTTCCTCATACAACTAGACCAAAACGA 2222
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 2240 TAAATGATGACTTAATCTCAGAATTTCCTGACAAATTTGGATCCTGTGTCCCTCATACAACTAGACCGAAGCGT 2313
Query 2223 GATTATGAGGTAGATGGAAGAGATTATCATTTTGTGACTTCAAGAGAGCAGATGGAAAAAGATATCCAGGAACA 2296
||.||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 2314 GACTATGAGGTGGATGGACGAGATTATCATTTTGTGACTTCAAGGGAACAGATGGAAAAGGATATTCAGGAGCA 2387
Query 2297 TAAATTCATTGAAGCTGGCCAGTATAACAATCATCTATATGGAACAAGTGTTCAGTCTGTACGAGAAGTAGCAG 2370
|||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||.|||||.||.||||.|||.||||
Sbjct 2388 TAAGTTCATTGAAGCCGGCCAGTATAACAACCATCTGTATGGGACGAGCGTGCAGTCCGTGCGAGCAGTGGCAG 2461
Query 2371 AAAAGGGCAAACACTGTATCCTTGATGTGTCTGGAAATGCCATAAAGAGATTACAGATTGCACAGCTTTACCCT 2444
|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 2462 AGAAGGGCAAACATTGTATCCTTGATGTGTCTGGAAATGCCATAAAGAGGTTGCAGATTGCACAGCTTTATCCA 2535
Query 2445 ATCTCCATTTTTATTAAACCCAAATCCATGGAAAATATCATGGAAATGAATAAGCGTCTAACAGAAGAACAAGC 2518
||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 2536 ATATCTATTTTTATTAAACCCAAATCCATGGAAAATATCATGGAAATGAACAAGCGCCTAACAGAAGAGCAGGC 2609
Query 2519 CAGAAAAACATTTGAGAGAGCCATGAAACTGGAACAGGAGTTTACTGAACATTTCACAGCTATTGTACAGGGGG 2592
|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 2610 CAGAAAAACATTTGAGAGAGCCATGAAGCTGGAGCAGGAGTTCACTGAGCATTTCACAGCTATTGTCCAGGGAG 2683
Query 2593 ATACGCTGGAAGACATTTACAACCAAGTGAAACAGATCATAGAAGAACAATCTGGTTCTTACATCTGGGTTCCG 2666
|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||..|||||||||||||.||.
Sbjct 2684 ACACGCTGGAGGACATTTACAACCAAGTGAAACAGATCATCGAAGAACAGTCTGGGCCTTACATCTGGGTCCCA 2757
Query 2667 GCAAAAGAAAAGCTA 2681
||.||||||||||||
Sbjct 2758 GCGAAAGAAAAGCTA 2772