Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14615
• Subject: XM_006521767.3
• Aligned Length: 2728
• Identities: 2409
• Gaps: 57

Alignment

Query    1  ATGCCGGTCCGGAAGCAAGATACCCAGAGAGCATTGCACCTTTTGGAGGAATATCGTTCAAAACTAAGCCAAAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCGGTCCGGAAGCAAGATACCCAGAGAGCATTGCATCTGTTGGAAGAATATCGATCGAAACTAAGCCAAAC  74

Query   75  TGAAGACAGACAGCTCAGAAGTTCCATAGAACGGGTTATTAACATATTTCAGAGCAACCTCTTTCAGGCTTTAA  148
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGAAGACAGACAACTCAGAAGTTCCATAGAGCGGGTTATTAACATATTTCAGAGCAACCTCTTTCAGGCTTTAA  148

Query  149  TAGATATTCAAGAATTTTATGAAGTGACCTTACTGGATAATCCAAAATGTATAGATCGTTCAAAGCCGTCTGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||.||||||||.||.||||
Sbjct  149  TAGATATTCAAGAATTTTATGAAGTGACCTTACTTGATAATCCAAAATGTGTGGATCATTCAAAGCAGTGTGAA  222

Query  223  CCAATTCAACCTGTGAATACTTGGGAGATTTCCAGCCTTCCAAGCTCTACTGTGACTTCAGAGACACTGCCAAG  296
            |||.||||.|||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||.|.|||||.|||||.||.|||||..|
Sbjct  223  CCAGTTCAGCCTGTGACTACTTGGGAGATTGCCAGCCTTCCAAGCACTGCCGTGACGTCAGAAACCCTGCCCGG  296

Query  297  CAGCCTTAGCCCTAGTGTAGAGAAATACAGGTATCAGGATGAAGATACACCTCCTCAAGAGCATATTTCCCCAC  370
            |||||||||||||...||||||||||||.||||||||||||||||...||.|||||..|||||||||||.||||
Sbjct  297  CAGCCTTAGCCCTCCAGTAGAGAAATACCGGTATCAGGATGAAGAGGTACTTCCTCCTGAGCATATTTCTCCAC  370

Query  371  AAATCACAAATGAAGTGATAGGTCCAGAATTGGTTCATGTCTCAGAGAAGAACTTATCAGAGATTGAGAATGTC  444
            ||.||||||||||.|||.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGTCACAAATGAGGTGCTAGGTCCAGAACTGGTCCATGTCTCAGAGAAGAACCTGTCAGAGATTGAGAATGTC  444

Query  445  CATGGATTTGTTTCTCATTCTCATATTTCACCAATAAAGGCAAATCCTCCCCCAGTACTGGTCAACACAGATAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct  445  CATGGATTTGTTTCTCATTCTCATATCTCACCAATAAAGGCAAATCCTCCTCCAGTGCTGGTCAACACAGACAG  518

Query  519  CTTGAAAACACCAACTTACGTTAATGGCACAGATGCAGATTATGAATATGAAGAAATCACACTTGAAAGGGGAA  592
            |||..|.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTAGAGACACCAACTTATGTTAATGGCACTGATGCAGATTATGAATATGAGGAAATCACACTTGAAAGGGGAA  592

Query  593  ATTCAGGGCTTGGTTTCAGCATTGCAG--AGTACGGACAACCCACACATTGGAGATGACTCAAGTATTTTCATT  664
            ||||.||.|||||||||||||||||||  .||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  593  ATTCGGGTCTTGGTTTCAGCATTGCAGGAGGTACAGACAACCCACACATTGGAGATGACTCAAGTATTTTCATC  666

Query  665  ACCAAAATTATCACAGG-GGAGCAGCCGCCCAAGATGGGAAGATTGCGGGTCAATGACTGTATATTACAAGTAA  737
            ||||||||||||||||| |||||.||.|||||.||| ||||||||||||||.||||||||||||.|...|||||
Sbjct  667  ACCAAAATTATCACAGGCGGAGCGGCTGCCCAGGAT-GGAAGATTGCGGGTAAATGACTGTATACTGAGAGTAA  739

Query  738  ATGAAGTAGATGTTCGTGATGTAACACATAGCAAAGCAGTTGAAGCGTTGAAAGAAGCAGGGTCTATTGTACGC  811
            ||||||.|||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||||||||.||.
Sbjct  740  ATGAAGCAGACGTTCGTGATGTAACCCACAGCAAAGCAGTGGAGGCATTAAAAGAAGCTGGATCTATTGTGCGA  813

Query  812  TTGTATGTAAAAAGAAGGAAACCAGTGTCAGAAAAAATAATGGAAATAAAGCTCATTAAAGGTCCTAAAGGTCT  885
            ||||||||.|||||..||||.||||..|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  TTGTATGTGAAAAGGCGGAAGCCAGCATCAGAAAAAATCATGGAAATAAAGCTCATTAAAGGTCCTAAAGGTCT  887

Query  886  TGGGTTTAGCATTGCTGGAGGTGTTGGAAATCAGCATATTCCTGGGGATAATAGCATCTATGTAACCAAAATAA  959
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  TGGGTTCAGCATTGCTGGAGGTGTTGGAAATCAGCACATTCCTGGTGATAACAGCATCTATGTAACCAAAATAA  961

Query  960  TTGAAGGAGGTGCAGCACATAAGGATGGCAAACTTCAGATTGGAGATAAACTTTTAGCAGTGAATAACGTATGT  1033
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||.|..||.|||
Sbjct  962  TTGAAGGAGGTGCAGCACACAAGGATGGCAAGCTTCAGATTGGAGATAAGCTTCTAGCAGTGAACAGTGTGTGT  1035

Query 1034  TTAGAAGAAGTTACTCATGAAGAAGCAGTAACTGCCTTAAAGAACACATCTGATTTTGTTTATTTGAAAGTGGC  1107
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  TTAGAAGAAGTTACTCATGAAGAAGCAGTGACTGCCTTAAAGAATACATCTGATTTTGTTTATTTGAAAGTGGC  1109

Query 1108  AAAACCCACAAGTATGTATATGAATGATGGCTATGCACCACCTGATATCACCAACTCTTCTTCTCAGCCTGTTG  1181
            ||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||..||||||
Sbjct 1110  AAAACCAACAAGTATGTATATAAATGATGGCTATGCACCACCTGACATCACTAATTCTTCTTCTCAATCTGTTG  1183

Query 1182  ATAACCATGTTAGCCCATCTTCCTTCTTGGGCCAGACACCAGCATCTCCAGCCAGATACTC-CCCAGTTTCTAA  1254
            |.||||||||.|||||.||.||||.||||||||||||.|||.|.||.||||||||.||||| |||| |||||||
Sbjct 1184  ACAACCATGTCAGCCCGTCCTCCTGCTTGGGCCAGACGCCAACGTCACCAGCCAGGTACTCACCCA-TTTCTAA  1256

Query 1255  AGCAGTACTTGGAGATGATGAAATTACAAGGGAACCTAGAAAAGTTGTTCTTCATCGTGGCTCAACGGGCCTTG  1328
            |||.||.||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1257  AGCTGTGCTCGGAGATGACGAGATCACTAGGGAACCTAGAAAAGTTGTTCTTCATCGTGGCTCAACAGGACTTG  1330

Query 1329  GTTTCAACATTGTAGGAGGAGAAGATGGAGAAGGAATATTTATTTCCTTTATCTTAGCCGGAGGACCTGCTGAT  1402
            ||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||.|.||.||.||||||||||||
Sbjct 1331  GTTTTAACATTGTGGGAGGTGAAGATGGAGAAGGGATTTTTATCTCCTTCATCCTTGCTGGCGGACCTGCTGAT  1404

Query 1403  CTAAGTGGAGAGCTCAGAAAAGGAGATCGTATTATATCGGTAAACAGTGTTGACCTCAGAGCTGCTAGTCATGA  1476
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1405  CTAAGTGGAGAGCTCAGAAAAGGAGATCGCATCATATCGGTGAACAGTGTTGACCTCAGAGCTGCAAGTCACGA  1478

Query 1477  GCAGGCAGCAGCTGCATTGAAAAATGCTGGCCAGGCTGTCACAATTGTTGCACAATATCGACCTGAAGAATACA  1550
            .||.||||||||||||.|.||.||.||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1479  ACAAGCAGCAGCTGCACTAAAGAACGCAGGCCAAGCCGTCACCATCGTTGCGCAATATCGACCCGAAGAGTACA  1552

Query 1551  GTCGTTTTGAAGCTAAAATACATGATTTACGGGAGCAGATGATGAATAGTAGTATTAGTTCAGGGTCAGGTTCT  1624
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||.|||
Sbjct 1553  GTCGTTTTGAAGCTAAAATCCATGACTTACGGGAGCAGATGATGAATAGCAGTGTCAGTTCAGGGTCAGGGTCT  1626

Query 1625  CTTCGAACTAGCCAGAAGCGATCCCTCTATGTCAGAGCCCTTTTTGATTATGACAAGACTAAAGACAGTGGGCT  1698
            ||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1627  CTTCGAACCAGCCAGAAGCGCTCCCTCTATGTCAGAGCCCTCTTTGATTATGACAAGACTAAGGACAGCGGGCT  1700

Query 1699  TCCCAGTCAGGGACTGAACTTCAAATTTGGAGATATCCTCCATGTTATTAATGCTTCTGATGATGAATGGTGGC  1772
            |||||||||.||||||||||||...||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 1701  TCCCAGTCAAGGACTGAACTTCCGCTTTGGAGACATCCTCCATGTCATCAATGCTTCTGACGACGAGTGGTGGC  1774

Query 1773  AAGCCAGGCAGGTTACACCAGATGGTGAGAGCGATGAGGTCGGAGTGATTCCCAGTAAACGCAGAGTTGAGAAG  1846
            |||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1775  AAGCCAGGCAGGTCACCCCAGACGGGGAGAGTGACGAAGTCGGAGTGATTCCTAGTAAACGAAGAGTTGAGAAG  1848

Query 1847  AAAGAACGAGCCCGATTAAAAACAGTGAAATTCAATTCTAAAACGA---GAGATAAAGGGCAGTCATTCAATGA  1917
            ||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|   |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1849  AAGGAACGAGCCCGATTAAAAACGGTCAAATTCAATTCTAAAACAAGAGGAGATAAAGGGCAGTCATTCAATGA  1922

Query 1918  CAAGCGTAAAAAGAACCTCTTTTCCCGAAAATTCCCCTTCTACAAGAACAAGGACCAGAGTGAGCAGGAAACAA  1991
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1923  CAAGCGTAAAAAGAACCTCTTTTCCCGAAAATTTCCCTTCTACAAGAACAAGGACCAGAGTGAACAGGAAACGA  1996

Query 1992  GTGATGCTCACAAGTATGTA-----TA-------------TGAA----------------TGATGGCTATGCAC  2031
            ||||||||.||.||.|.|||     ||             ||||                ||||   ||     
Sbjct 1997  GTGATGCTGACCAGCACGTAACTTCTAATGCCAGCGATAGTGAAAGTAGTTACCTAATCTTGAT---TA-----  2062

Query 2032  CACCTG-ATAT-----CACCAACTGTGGTCAAGAAGAATACGTCTTATCTTATGAACCAGTGAATCAACAAGAA  2099
            ||..|| ||||     |.|.||..||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2063  CAGATGAATATGGCTGCTCAAAAGGTGGTCAAGAAGAATATGTTTTATCTTATGAGCCAGTGAATCAACAAGAA  2136

Query 2100  GTTAATTATACTCGACCAGTGATCATATTGGGACCTATGAAAGACAGGATAAATGATGACTTGATCTCAGAATT  2173
            |||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2137  GTTAATTATACCCGACCAGTCATCATATTAGGACCTATGAAAGACAGAGTAAATGATGACTTAATCTCAGAATT  2210

Query 2174  TCCTGACAAATTTGGATCCTGTGTTCCTCATACAACTAGACCAAAACGAGATTATGAGGTAGATGGAAGAGATT  2247
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||.||||||
Sbjct 2211  TCCTGACAAATTTGGATCCTGTGTCCCTCATACAACTAGACCGAAGCGTGACTATGAGGTGGATGGACGAGATT  2284

Query 2248  ATCATTTTGTGACTTCAAGAGAGCAGATGGAAAAAGATATCCAGGAACATAAATTCATTGAAGCTGGCCAGTAT  2321
            |||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 2285  ATCATTTTGTGACTTCAAGGGAACAGATGGAAAAGGATATTCAGGAGCATAAGTTCATTGAAGCCGGCCAGTAT  2358

Query 2322  AACAATCATCTATATGGAACAAGTGTTCAGTCTGTACGAGAAGTAGCAGAAAAGGGCAAACACTGTATCCTTGA  2395
            |||||.|||||.|||||.||.||.||.|||||.||.||||.|||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2359  AACAACCATCTGTATGGGACGAGCGTGCAGTCCGTGCGAGCAGTGGCAGAGAAGGGCAAACATTGTATCCTTGA  2432

Query 2396  TGTGTCTGGAAATGCCATAAAGAGATTACAGATTGCACAGCTTTACCCTATCTCCATTTTTATTAAACCCAAAT  2469
            ||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2433  TGTGTCTGGAAATGCCATAAAGAGGTTGCAGATTGCACAGCTTTATCCAATATCTATTTTTATTAAACCCAAAT  2506

Query 2470  CCATGGAAAATATCATGGAAATGAATAAGCGTCTAACAGAAGAACAAGCCAGAAAAACATTTGAGAGAGCCATG  2543
            |||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2507  CCATGGAAAATATCATGGAAATGAACAAGCGCCTAACAGAAGAGCAGGCCAGAAAAACATTTGAGAGAGCCATG  2580

Query 2544  AAACTGGAACAGGAGTTTACTGAACATTTCACAGCTATTGTACAGGGGGATACGCTGGAAGACATTTACAACCA  2617
            ||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2581  AAGCTGGAGCAGGAGTTCACTGAGCATTTCACAGCTATTGTCCAGGGAGACACGCTGGAGGACATTTACAACCA  2654

Query 2618  AGTGAAACAGATCATAGAAGAACAATCTGGTTCTTACATCTGGGTTCCGGCAAAAGAAAAGCTA  2681
            |||||||||||||||.||||||||.|||||..|||||||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 2655  AGTGAAACAGATCATCGAAGAACAGTCTGGGCCTTACATCTGGGTCCCAGCGAAAGAAAAGCTA  2718