Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14615
- Subject:
- XM_006521769.2
- Aligned Length:
- 2785
- Identities:
- 2176
- Gaps:
- 321
Alignment
Query 1 ATG-----CCGGTCCGGAAGCAAGA--------TACCCAGAGAGCATTGCACC--TTTTGGAGGAATATCGTTC 59
||| |...|.|||||.|||.| |||.| |.||.|| |...||||| |
Sbjct 1 ATGAATTACATTTTCGGAAACAACACACTTCTGTACTC--------TCGCGCCAGTCGAGGAGG---------C 57
Query 60 AAAACTA-----AGCCAAACTGAAGACAGACAGCTCAGAAGTTCCATAGAACGGGTTATTAACATATTTCAGAG 128
||..||| ||||| || ||||||.||..||..|| ||||
Sbjct 58 AATGCTAGCTCTAGCCA---TG----------GCTCAGTAGGCCCTAAG--------------------CAGA- 97
Query 129 CAACCTCTTTCAGGCTTTAATAGATATTCAAGAATTTTATGAAGTGACCTTACTGGATAATCCAAAATGTATAG 202
||| |||||..|| ||||.| |
Sbjct 98 -AAC-----------------------------------------------ACTGGGCAA---AAAAGG----G 116
Query 203 ATCGTTCAAAGCCGTCTGAACCAATTCAA-CCTGTGAATACTTGGGAGATTTCC--AGCCTTCCAAGCTCTACT 273
.||| |||.| ||||| |.||| || ||| || |||||||| |.
Sbjct 117 CTCG-TCAGA------TGAAC---TGCAAGCC-------------GAG----CCAGAGCCTTCC--------CG 155
Query 274 GTGACTTCAGAGA-----------CACTGCCAAG---CAGCCTTAGCCCTAGTGTAGAGAAATACA----GGTA 329
.||.|..||||.| |||| |.||| ||||.||| |.| |.|.|| ||||
Sbjct 156 CTGGCAGCAGATAGTTGCATTCTTCACT-CGAAGACACAGCTTTA----TTG--------ACTGCATCTCGGTA 216
Query 330 TCAGGATGAAGATACACCTCCTCAAGAGCATATTTCCCCACAAATCACAAATGAAG-TGATAGGTCCAGAATTG 402
.| |||| ||| |||.|.||...|||| |||| ||.|....||
Sbjct 217 GC------------CACC--------AGC-----TCCACCCAGCCCACA---GAAGCTGTTCCTCCC------- 255
Query 403 GTTCATGTCTCAGAGAAGAACTTATCAGAGATTGA----------GAATGTCCATG----GATTTGTTTC-TCA 461
||.|.||.|| ||.||...| ||| |...||||.|| ||.|..|.|| ||.
Sbjct 256 --TCCTCTCCCA---------TTGTCCCTG--TGACCCCTGCCCTGCCAGTCCCTGCTGAGAGTACTGTCGTCC 316
Query 462 TTCTCATATTTCACCAATAAAGGCAAATCCTCCCCCAGTACTGGTCAACACAGATAGCTTGAAAACACCAACTT 535
|.|.| ||..||..|.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||..|.||||||||||
Sbjct 317 TGCCC-----TCCGCACCACAGGCAAATCCTCCTCCAGTGCTGGTCAACACAGACAGCTTAGAGACACCAACTT 385
Query 536 ACGTTAATGGCACAGATGCAGATTATGAATATGAAGAAATCACACTTGAAAGGGGAAATTCAGGGCTTGGTTTC 609
|.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 386 ATGTTAATGGCACTGATGCAGATTATGAATATGAGGAAATCACACTTGAAAGGGGAAATTCGGGTCTTGGTTTC 459
Query 610 AGCATTGCAG--AGTACGGACAACCCACACATTGGAGATGACTCAAGTATTTTCATTACCAAAATTATCACAGG 681
|||||||||| .||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 460 AGCATTGCAGGAGGTACAGACAACCCACACATTGGAGATGACTCAAGTATTTTCATCACCAAAATTATCACAGG 533
Query 682 -GGAGCAGCCGCCCAAGATGGGAAGATTGCGGGTCAATGACTGTATATTACAAGTAAATGAAGTAGATGTTCGT 754
|||||.||.|||||.||| ||||||||||||||.||||||||||||.|...|||||||||||.|||.||||||
Sbjct 534 CGGAGCGGCTGCCCAGGAT-GGAAGATTGCGGGTAAATGACTGTATACTGAGAGTAAATGAAGCAGACGTTCGT 606
Query 755 GATGTAACACATAGCAAAGCAGTTGAAGCGTTGAAAGAAGCAGGGTCTATTGTACGCTTGTATGTAAAAAGAAG 828
||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||..|
Sbjct 607 GATGTAACCCACAGCAAAGCAGTGGAGGCATTAAAAGAAGCTGGATCTATTGTGCGATTGTATGTGAAAAGGCG 680
Query 829 GAAACCAGTGTCAGAAAAAATAATGGAAATAAAGCTCATTAAAGGTCCTAAAGGTCTTGGGTTTAGCATTGCTG 902
|||.||||..|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 681 GAAGCCAGCATCAGAAAAAATCATGGAAATAAAGCTCATTAAAGGTCCTAAAGGTCTTGGGTTCAGCATTGCTG 754
Query 903 GAGGTGTTGGAAATCAGCATATTCCTGGGGATAATAGCATCTATGTAACCAAAATAATTGAAGGAGGTGCAGCA 976
|||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 755 GAGGTGTTGGAAATCAGCACATTCCTGGTGATAACAGCATCTATGTAACCAAAATAATTGAAGGAGGTGCAGCA 828
Query 977 CATAAGGATGGCAAACTTCAGATTGGAGATAAACTTTTAGCAGTGAATAACGTATGTTTAGAAGAAGTTACTCA 1050
||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||.|..||.||||||||||||||||||||
Sbjct 829 CACAAGGATGGCAAGCTTCAGATTGGAGATAAGCTTCTAGCAGTGAACAGTGTGTGTTTAGAAGAAGTTACTCA 902
Query 1051 TGAAGAAGCAGTAACTGCCTTAAAGAACACATCTGATTTTGTTTATTTGAAAGTGGCAAAACCCACAAGTATGT 1124
||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 903 TGAAGAAGCAGTGACTGCCTTAAAGAATACATCTGATTTTGTTTATTTGAAAGTGGCAAAACCAACAAGTATGT 976
Query 1125 ATATGAATGATGGCTATGCACCACCTGATATCACCAACTCTTCTTCTCAGCCTGTTGATAACCATGTTAGCCCA 1198
||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||..|||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 977 ATATAAATGATGGCTATGCACCACCTGACATCACTAATTCTTCTTCTCAATCTGTTGACAACCATGTCAGCCCG 1050
Query 1199 TCTTCCTTCTTGGGCCAGACACCAGCATCTCCAGCCAGATACTC-CCCAGTTTCTAAAGCAGTACTTGGAGATG 1271
||.||||.||||||||||||.|||.|.||.||||||||.||||| |||| ||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 1051 TCCTCCTGCTTGGGCCAGACGCCAACGTCACCAGCCAGGTACTCACCCA-TTTCTAAAGCTGTGCTCGGAGATG 1123
Query 1272 ATGAAATTACAAGGGAACCTAGAAAAGTTGTTCTTCATCGTGGCTCAACGGGCCTTGGTTTCAACATTGTAGGA 1345
|.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1124 ACGAGATCACTAGGGAACCTAGAAAAGTTGTTCTTCATCGTGGCTCAACAGGACTTGGTTTTAACATTGTGGGA 1197
Query 1346 GGAGAAGATGGAGAAGGAATATTTATTTCCTTTATCTTAGCCGGAGGACCTGCTGATCTAAGTGGAGAGCTCAG 1419
||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||.|.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 GGTGAAGATGGAGAAGGGATTTTTATCTCCTTCATCCTTGCTGGCGGACCTGCTGATCTAAGTGGAGAGCTCAG 1271
Query 1420 AAAAGGAGATCGTATTATATCGGTAAACAGTGTTGACCTCAGAGCTGCTAGTCATGAGCAGGCAGCAGCTGCAT 1493
||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||.
Sbjct 1272 AAAAGGAGATCGCATCATATCGGTGAACAGTGTTGACCTCAGAGCTGCAAGTCACGAACAAGCAGCAGCTGCAC 1345
Query 1494 TGAAAAATGCTGGCCAGGCTGTCACAATTGTTGCACAATATCGACCTGAAGAATACAGTCGTTTTGAAGCTAAA 1567
|.||.||.||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1346 TAAAGAACGCAGGCCAAGCCGTCACCATCGTTGCGCAATATCGACCCGAAGAGTACAGTCGTTTTGAAGCTAAA 1419
Query 1568 ATACATGATTTACGGGAGCAGATGATGAATAGTAGTATTAGTTCAGGGTCAGGTTCTCTTCGAACTAGCCAGAA 1641
||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1420 ATCCATGACTTACGGGAGCAGATGATGAATAGCAGTGTCAGTTCAGGGTCAGGGTCTCTTCGAACCAGCCAGAA 1493
Query 1642 GCGATCCCTCTATGTCAGAGCCCTTTTTGATTATGACAAGACTAAAGACAGTGGGCTTCCCAGTCAGGGACTGA 1715
|||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1494 GCGCTCCCTCTATGTCAGAGCCCTCTTTGATTATGACAAGACTAAGGACAGCGGGCTTCCCAGTCAAGGACTGA 1567
Query 1716 ACTTCAAATTTGGAGATATCCTCCATGTTATTAATGCTTCTGATGATGAATGGTGGCAAGCCAGGCAGGTTACA 1789
|||||...||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1568 ACTTCCGCTTTGGAGACATCCTCCATGTCATCAATGCTTCTGACGACGAGTGGTGGCAAGCCAGGCAGGTCACC 1641
Query 1790 CCAGATGGTGAGAGCGATGAGGTCGGAGTGATTCCCAGTAAACGCAGAGTTGAGAAGAAAGAACGAGCCCGATT 1863
|||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1642 CCAGACGGGGAGAGTGACGAAGTCGGAGTGATTCCTAGTAAACGAAGAGTTGAGAAGAAGGAACGAGCCCGATT 1715
Query 1864 AAAAACAGTGAAATTCAATTCTAAAACGA---GAGATAAAGGGCAGTCATTCAATGACAAGCGTAAAAAGAACC 1934
||||||.||.|||||||||||||||||.| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1716 AAAAACGGTCAAATTCAATTCTAAAACAAGAGGAGATAAAGGGCAGTCATTCAATGACAAGCGTAAAAAGAACC 1789
Query 1935 TCTTTTCCCGAAAATTCCCCTTCTACAAGAACAAGGACCAGAGTGAGCAGGAAACAAGTGATGCTCACAAGTAT 2008
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.||.||.|.
Sbjct 1790 TCTTTTCCCGAAAATTTCCCTTCTACAAGAACAAGGACCAGAGTGAACAGGAAACGAGTGATGCTGACCAGCAC 1863
Query 2009 GTA-----TA-------------TGAA----------------TGATGGCTATGCACCACCTG-ATAT-----C 2042
||| || |||| |||| || ||..|| |||| |
Sbjct 1864 GTAACTTCTAATGCCAGCGATAGTGAAAGTAGTTACCTAATCTTGAT---TA-----CAGATGAATATGGCTGC 1929
Query 2043 ACCAACTGTGGTCAAGAAGAATACGTCTTATCTTATGAACCAGTGAATCAACAAGAAGTTAATTATACTCGACC 2116
.|.||..||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1930 TCAAAAGGTGGTCAAGAAGAATATGTTTTATCTTATGAGCCAGTGAATCAACAAGAAGTTAATTATACCCGACC 2003
Query 2117 AGTGATCATATTGGGACCTATGAAAGACAGGATAAATGATGACTTGATCTCAGAATTTCCTGACAAATTTGGAT 2190
|||.||||||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2004 AGTCATCATATTAGGACCTATGAAAGACAGAGTAAATGATGACTTAATCTCAGAATTTCCTGACAAATTTGGAT 2077
Query 2191 CCTGTGTTCCTCATACAACTAGACCAAAACGAGATTATGAGGTAGATGGAAGAGATTATCATTTTGTGACTTCA 2264
|||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2078 CCTGTGTCCCTCATACAACTAGACCGAAGCGTGACTATGAGGTGGATGGACGAGATTATCATTTTGTGACTTCA 2151
Query 2265 AGAGAGCAGATGGAAAAAGATATCCAGGAACATAAATTCATTGAAGCTGGCCAGTATAACAATCATCTATATGG 2338
||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 2152 AGGGAACAGATGGAAAAGGATATTCAGGAGCATAAGTTCATTGAAGCCGGCCAGTATAACAACCATCTGTATGG 2225
Query 2339 AACAAGTGTTCAGTCTGTACGAGAAGTAGCAGAAAAGGGCAAACACTGTATCCTTGATGTGTCTGGAAATGCCA 2412
.||.||.||.|||||.||.||||.|||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2226 GACGAGCGTGCAGTCCGTGCGAGCAGTGGCAGAGAAGGGCAAACATTGTATCCTTGATGTGTCTGGAAATGCCA 2299
Query 2413 TAAAGAGATTACAGATTGCACAGCTTTACCCTATCTCCATTTTTATTAAACCCAAATCCATGGAAAATATCATG 2486
|||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2300 TAAAGAGGTTGCAGATTGCACAGCTTTATCCAATATCTATTTTTATTAAACCCAAATCCATGGAAAATATCATG 2373
Query 2487 GAAATGAATAAGCGTCTAACAGAAGAACAAGCCAGAAAAACATTTGAGAGAGCCATGAAACTGGAACAGGAGTT 2560
||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 2374 GAAATGAACAAGCGCCTAACAGAAGAGCAGGCCAGAAAAACATTTGAGAGAGCCATGAAGCTGGAGCAGGAGTT 2447
Query 2561 TACTGAACATTTCACAGCTATTGTACAGGGGGATACGCTGGAAGACATTTACAACCAAGTGAAACAGATCATAG 2634
.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2448 CACTGAGCATTTCACAGCTATTGTCCAGGGAGACACGCTGGAGGACATTTACAACCAAGTGAAACAGATCATCG 2521
Query 2635 AAGAACAATCTGGTTCTTACATCTGGGTTCCGGCAAAAGAAAAGCTA 2681
|||||||.|||||..|||||||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 2522 AAGAACAGTCTGGGCCTTACATCTGGGTCCCAGCGAAAGAAAAGCTA 2568