Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14615
- Subject:
- XM_011512502.3
- Aligned Length:
- 2796
- Identities:
- 2581
- Gaps:
- 199
Alignment
Query 1 ATGCCGGTCCGGAAGCAAGATACCCAGAGAGCATTGCACCTTTTGGAGGAATATCGTTCAAAACTAAGCCAAAC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCGGTCCGGAAGCAAGATACCCAGAGAGCATTGCACCTTTTGGAGGAATATCGTTCAAAACTAAGCCAAAC 74
Query 75 TGAAGACAGACAGCTCAGAAGTTCCATAGAACGGGTTATTAACATATTTCAGAGCAACCTCTTTCAGGCTTTAA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGAAGACAGACAGCTCAGAAGTTCCATAGAACGGGTTATTAACATATTTCAGAGCAACCTCTTTCAGGCTTTAA 148
Query 149 TAGATATTCAAGAATTTTATGAAGTGACCTTACTGGATAATCCAAAATGTATAGATCGTTCAAAGCCGTCTGAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TAGATATTCAAGAATTTTATGAAGTGACCTTACTGGATAATCCAAAATGTATAGATCGTTCAAAGCCGTCTGAA 222
Query 223 CCAATTCAACCTGTGAATACTTGGGAGATTTCCAGCCTTCCAAGCTCTACTGTGACTTCAGAGACACTGCCAAG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCAATTCAACCTGTGAATACTTGGGAGATTTCCAGCCTTCCAAGCTCTACTGTGACTTCAGAGACACTGCCAAG 296
Query 297 CAGCCTTAGCCCTAGTGTAGAGAAATACAGGTATCAGGATGAAGATACACCTCCTCAAGAGCATATTTCCCCAC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAGCCTTAGCCCTAGTGTAGAGAAATACAGGTATCAGGATGAAGATACACCTCCTCAAGAGCATATTTCCCCAC 370
Query 371 AAATCACAAATGAAGTGATAGGTCCAGAATTGGTTCATGTCTCAGAGAAGAACTTATCAGAGATTGAGAATGTC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAATCACAAATGAAGTGATAGGTCCAGAATTGGTTCATGTCTCAGAGAAGAACTTATCAGAGATTGAGAATGTC 444
Query 445 CATGGATTTGTTTCTCATTCTCATATTTCACCAATAA------------------------------------- 481
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CATGGATTTGTTTCTCATTCTCATATTTCACCAATAAAGCCAACAGAAGCTGTTCTTCCCTCTCCTCCCACTGT 518
Query 482 --------------------------------------------------------------AGGCAAATCCTC 493
||||||||||||
Sbjct 519 CCCTGTGATCCCTGTCCTGCCAGTCCCTGCTGAGAATACTGTCATCCTACCCACCATACCACAGGCAAATCCTC 592
Query 494 CCCCAGTACTGGTCAACACAGATAGCTTGAAAACACCAACTTACGTTAATGGCACAGATGCAGATTATGAATAT 567
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCCCAGTACTGGTCAACACAGATAGCTTGGAAACACCAACTTACGTTAATGGCACAGATGCAGATTATGAATAT 666
Query 568 GAAGAAATCACACTTGAAAGGGGAAATTCAGGGCTTGGTTTCAGCATTGCAG--AGTACGGACAACCCACACAT 639
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| .|||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAAGAAATCACACTTGAAAGGGGAAATTCAGGGCTTGGTTTCAGCATTGCAGGAGGTACGGACAACCCACACAT 740
Query 640 TGGAGATGACTCAAGTATTTTCATTACCAAAATTATCACA-GGGGAGCAGCCGCCCAAGATGGGAAGATTGCGG 712
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 741 TGGAGATGACTCAAGTATTTTCATTACCAAAATTATCACAGGGGGAGCAGCCGCCCAAGAT-GGAAGATTGCGG 813
Query 713 GTCAATGACTGTATATTACAAGTAAATGAAGTAGATGTTCGTGATGTAACACATAGCAAAGCAGTTGAAGCGTT 786
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 GTCAATGACTGTATATTACGAGTAAATGAAGTAGATGTTCGTGATGTAACACATAGCAAAGCAGTTGAAGCGTT 887
Query 787 GAAAGAAGCAGGGTCTATTGTACGCTTGTATGTAAAAAGAAGGAAACCAGTGTCAGAAAAAATAATGGAAATAA 860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 GAAAGAAGCAGGGTCTATTGTACGCTTGTATGTAAAAAGAAGGAAACCAGTGTCAGAAAAAATAATGGAAATAA 961
Query 861 AGCTCATTAAAGGTCCTAAAGGTCTTGGGTTTAGCATTGCTGGAGGTGTTGGAAATCAGCATATTCCTGGGGAT 934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 AGCTCATTAAAGGTCCTAAAGGTCTTGGGTTTAGCATTGCTGGAGGTGTTGGAAATCAGCATATTCCTGGGGAT 1035
Query 935 AATAGCATCTATGTAACCAAAATAATTGAAGGAGGTGCAGCACATAAGGATGGCAAACTTCAGATTGGAGATAA 1008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 AATAGCATCTATGTAACCAAAATAATTGAAGGAGGTGCAGCACATAAGGATGGCAAACTTCAGATTGGAGATAA 1109
Query 1009 ACTTTTAGCAGTGAATAACGTATGTTTAGAAGAAGTTACTCATGAAGAAGCAGTAACTGCCTTAAAGAACACAT 1082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 ACTTTTAGCAGTGAATAACGTATGTTTAGAAGAAGTTACTCATGAAGAAGCAGTAACTGCCTTAAAGAACACAT 1183
Query 1083 CTGATTTTGTTTATTTGAAAGTGGCAAAACCCACAAGTATGTATATGAATGATGGCTATGCACCACCTGATATC 1156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 CTGATTTTGTTTATTTGAAAGTGGCAAAACCCACAAGTATGTATATGAATGATGGCTATGCACCACCTGATATC 1257
Query 1157 ACCAACTCTTCTTCTCAGCCTGTTGATAACCATGTTAGCCCATCTTCCTTCTTGGGCCAGACACCAGCATCTCC 1230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 ACCAACTCTTCTTCTCAGCCTGTTGATAACCATGTTAGCCCATCTTCCTTCTTGGGCCAGACACCAGCATCTCC 1331
Query 1231 AGCCAGATACTCCCCAGTTTCTAAAGCAGTACTTGGAGATGATGAAATTACAAGGGAACCTAGAAAAGTTGTTC 1304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 AGCCAGATACTCCCCAGTTTCTAAAGCAGTACTTGGAGATGATGAAATTACAAGGGAACCTAGAAAAGTTGTTC 1405
Query 1305 TTCATCGTGGCTCAACGGGCCTTGGTTTCAACATTGTAGGAGGAGAAGATGGAGAAGGAATATTTATTTCCTTT 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 TTCATCGTGGCTCAACGGGCCTTGGTTTCAACATTGTAGGAGGAGAAGATGGAGAAGGAATATTTATTTCCTTT 1479
Query 1379 ATCTTAGCCGGAGGACCTGCTGATCTAAGTGGAGAGCTCAGAAAAGGAGATCGTATTATATCGGTAAACAGTGT 1452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 ATCTTAGCCGGAGGACCTGCTGATCTAAGTGGAGAGCTCAGAAAAGGAGATCGTATTATATCGGTAAACAGTGT 1553
Query 1453 TGACCTCAGAGCTGCTAGTCATGAGCAGGCAGCAGCTGCATTGAAAAATGCTGGCCAGGCTGTCACAATTGTTG 1526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 TGACCTCAGAGCTGCTAGTCATGAGCAGGCAGCAGCTGCATTGAAAAATGCTGGCCAGGCTGTCACAATTGTTG 1627
Query 1527 CACAATATCGACCTGAAGAATACAGTCGTTTTGAAGCTAAAATACATGATTTACGGGAGCAGATGATGAATAGT 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 CACAATATCGACCTGAAGAATACAGTCGTTTTGAAGCTAAAATACATGATTTACGGGAGCAGATGATGAATAGT 1701
Query 1601 AGTATTAGTTCAGGGTCAGGTTCTCTTCGAACTAGCCAGAAGCGATCCCTCTATGTCAGAGCCCTTTTTGATTA 1674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702 AGTATTAGTTCAGGGTCAGGTTCTCTTCGAACTAGCCAGAAGCGATCCCTCTATGTCAGAGCCCTTTTTGATTA 1775
Query 1675 TGACAAGACTAAAGACAGTGGGCTTCCCAGTCAGGGACTGAACTTCAAATTTGGAGATATCCTCCATGTTATTA 1748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776 TGACAAGACTAAAGACAGTGGGCTTCCCAGTCAGGGACTGAACTTCAAATTTGGAGATATCCTCCATGTTATTA 1849
Query 1749 ATGCTTCTGATGATGAATGGTGGCAAGCCAGGCAGGTTACACCAGATGGTGAGAGCGATGAGGTCGGAGTGATT 1822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850 ATGCTTCTGATGATGAATGGTGGCAAGCCAGGCAGGTTACACCAGATGGTGAGAGCGATGAGGTCGGAGTGATT 1923
Query 1823 CCCAGTAAACGCAGAGTTGAGAAGAAAGAACGAGCCCGATTAAAAACAGTGAAATTCAATTCTAAAACGAGAGA 1896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924 CCCAGTAAACGCAGAGTTGAGAAGAAAGAACGAGCCCGATTAAAAACAGTGAAATTCAATTCTAAAACGAGAGA 1997
Query 1897 TAAAGGGCAGTCATTC--AATGACAAGCG-TAAAAAGAACCTCTTTTCCCGAA------AATTCCCCTTCTACA 1961
|||||||.|| ||.| .|.||||.|.| |.||||| .||.||| || |||||| |
Sbjct 1998 TAAAGGGGAG--ATCCCTGACGACATGGGATCAAAAG---------GCCTGAAGCATGTAA-----CTTCTA-A 2054
Query 1962 AGAACAAGGACCAG----AGTGAGCAGGAAACAAGTGATGCTCACAAGTATGTATATGAATGATGGCTATGCAC 2031
.| |||| ||||| |||||..|
Sbjct 2055 TG--------CCAGCGATAGTGA----------------------AAGTAGTT--------------------- 2077
Query 2032 CACCTGATATCACCAACTGTGGTCAAGAAGAATACGTCTTATCTTATGAACCAGTGAATCAACAAGAAGTTAAT 2105
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2078 ---------------ACCGTGGTCAAGAAGAATACGTCTTATCTTATGAACCAGTGAATCAACAAGAAGTTAAT 2136
Query 2106 TATACTCGACCAGTGATCATATTGGGACCTATGAAAGACAGGATAAATGATGACTTGATCTCAGAATTTCCTGA 2179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2137 TATACTCGACCAGTGATCATATTGGGACCTATGAAAGACAGGATAAATGATGACTTGATCTCAGAATTTCCTGA 2210
Query 2180 CAAATTTGGATCCTGTGTTCCTCATACAACTAGACCAAAACGAGATTATGAGGTAGATGGAAGAGATTATCATT 2253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2211 CAAATTTGGATCCTGTGTTCCTCATACAACTAGACCAAAACGAGATTATGAGGTAGATGGAAGAGATTATCATT 2284
Query 2254 TTGTGACTTCAAGAGAGCAGATGGAAAAAGATATCCAGGAACATAAATTCATTGAAGCTGGCCAGTATAACAAT 2327
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2285 TTGTGACTTCAAGAGAGCAGATGGAAAAAGATATCCAGGAACATAAATTCATTGAAGCTGGCCAGTATAACAAT 2358
Query 2328 CATCTATATGGAACAAGTGTTCAGTCTGTACGAGAAGTAGCAGAAAAGGGCAAACACTGTATCCTTGATGTGTC 2401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2359 CATCTATATGGAACAAGTGTTCAGTCTGTACGAGAAGTAGCAGAAAAGGGCAAACACTGTATCCTTGATGTGTC 2432
Query 2402 TGGAAATGCCATAAAGAGATTACAGATTGCACAGCTTTACCCTATCTCCATTTTTATTAAACCCAAATCCATGG 2475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2433 TGGAAATGCCATAAAGAGATTACAGATTGCACAGCTTTACCCTATCTCCATTTTTATTAAACCCAAATCCATGG 2506
Query 2476 AAAATATCATGGAAATGAATAAGCGTCTAACAGAAGAACAAGCCAGAAAAACATTTGAGAGAGCCATGAAACTG 2549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2507 AAAATATCATGGAAATGAATAAGCGTCTAACAGAAGAACAAGCCAGAAAAACATTTGAGAGAGCCATGAAACTG 2580
Query 2550 GAACAGGAGTTTACTGAACATTTCACAGCTATTGTACAGGGGGATACGCTGGAAGACATTTACAACCAAGTGAA 2623
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2581 GAACAGGAGTTTACTGAACATTTCACAGCTATTGTACAGGGGGATACGCTGGAAGACATTTACAACCAAGTGAA 2654
Query 2624 ACAGATCATAGAAGAACAATCTGGTTCTTACATCTGGGTTCCGGCAAAAGAAAAGCTA 2681
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2655 ACAGATCATAGAAGAACAATCTGGTTCTTACATCTGGGTTCCGGCAAAAGAAAAGCTA 2712