Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14616
• Subject: NM_001177779.1
• Aligned Length: 1546
• Identities: 1415
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ATGGAGAGGGCCCGCAAGTTCTCGGGCTCCGGCTTGGCCATGGGCTTGGGCTCCGCCTCCGCTTCGGCCTGGAG  74
            |||||||.|||.|||||||||||.|||||..||||||||.||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGAGACGGCTCGCAAGTTCTCAGGCTCAAGCTTGGCCCTGGGTTTGGGCTCGGCCTCTGCTTCAGCCTGGAG  74

Query   75  GAGGGCTTCGCAGAGGTGGGCCTGGCCGCTCCGCTCCCTGCGGCCCGGAGGGGATGCCAGAGAGCCTCGCAAGA  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct   75  GAGGGCTTCGCAGAGGTGGGCCTGGCCGCTCCGTTCCCTGCGGCCTGGAGGGGATGCCAGAGAGCCCCGCAAGA  148

Query  149  TCATCCTGCACAAAGGCTCCACAGGCCTGGGCTTCAACATCGTAGGAGGAGAGGATGGAGAAGGCATTTTTGTC  222
            ||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  TCATCCTGCACAAAGGTTCTACAGGCCTGGGCTTCAACATTGTAGGAGGAGAAGATGGAGAAGGCATTTTTGTT  222

Query  223  TCCTTCATCCTGGCAGGAGGCCCAGCTGACCTGAGTGGGGAGCTGCGCAGGGGAGACCGGATCTTATCGGTGAA  296
            ||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  TCCTTCATCCTGGCGGGAGGCCCAGCAGACCTAAGTGGGGAGTTGCGAAGGGGAGACCGGATCTTATCGGTAAA  296

Query  297  TGGAGTGAATCTGAGGAATGCAACTCATGAGCAGGCTGCAGCTGCTCTGAAACGGGCCGGCCAGTCAGTCACCA  370
            ||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGAGTCAACCTGAGGAATGCTACCCACGAGCAAGCAGCGGCTGCTCTGAAACGGGCTGGCCAGTCAGTCACCA  370

Query  371  TTGTGGCCCAATACAGACCTGAAGAATACAGTCGCTTTGAATCGAAGATACATGACTTACGAGAACAAATGATG  444
            ||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  371  TTGTGGCCCAGTATAGACCTGAAGAGTACAGTCGCTTTGAATCCAAGATCCATGACTTGCGGGAACAAATGATG  444

Query  445  AACAGCAGCATGAGCTCTGGGTCTGGGTCCCTCCGAACAAGTGAGAAGAGGTCCTTGTATGTCACGGCCCTGTT  518
            ||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  445  AACAGCAGCATGAGTTCTGGGTCTGGGTCTCTCCGAACCAGTGAGAAGAGGTCCTTGTATGTCAGGGCCCTGTT  518

Query  519  TGATTATGATCGGACTCTGGACAGCTGCCTGCCAAGCCAGGGGCTCAGCTTCTCTTATGGTGACATTCTGCATG  592
            |||||||||||||||||..||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  TGATTATGATCGGACTCGTGACAGCTGTCTACCAAGCCAGGGACTCAGTTTCTCTTATGGTGACATTCTGCACG  592

Query  593  TCATTAATGCCTCTGATGATGAGTGGTGGCAGGCAATGCTGGTGACCCCACACAGAGAAAGTGAGCATATCGGT  666
            |||||||.|||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||.||.||..||||.|||||.||.||||||
Sbjct  593  TCATTAACGCCTCTGATGATGAGTGGTGGCAAGCAAGGCTGGTGACTCCTCATGGAGAGAGTGAACAGATCGGT  666

Query  667  GTGATCCCCAGTAAGAGCAGGGTGGAATAGAAATAACCAGCTTCGAT--ACAAACTGTGAACTTTCATGCCAGG  738
            ||||||||.|||||.|..|||||||||.|||||.|.|.||| |||||  | ||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  667  GTGATCCCTAGTAAAAAGAGGGTGGAAAAGAAAGAGCGAGC-TCGATTGA-AAACTGTGAAGTTCCATGCCAGG  738

Query  739  ACGGGGATGGAGTGAGTCCAATGCAGTTCTGATCAGAATCCCAGACGTAGNAAGAGTTTCGGCCTCTCTCGAAA  812
            ||.||||| ||.||||||.||| |.||  .|||||.||  |.|.|||||..||||||||..|||||||||||||
Sbjct  739  ACAGGGAT-GATTGAGTCTAAT-CGGT--CGATCAAAA--CGAAACGTAAAAAGAGTTTTCGCCTCTCTCGAAA  806

Query  813  GTTTCCATTTTACAAGAGCAAAGAAAACATGGCCCAGGAGAGCAGCATACAGGAACAGGGGAGTGACATCCAAC  886
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  807  GTTTCCATTTTACAAGAGCAAAGAAAACATGGCCCAGGAGAACAGCATACAGGAACA-GGGAGTGACATCCAAC  879

Query  887  ACCCAGTGACAGCGAAAGCAGTTCCAAAGGACAAGAGGATGCTATTTTGTCATATGAGCCAGTGACACGGCAAG  960
            | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  880  A-CCAGTGACAGCGAAAGCAGTTCCAAAGGACAAGAGGATGCTATTTTGTCATATGAGCCAGTGACACGACAAG  952

Query  961  AAATTCACTATGCAAGGCCTGTGATCATCCTGGGCCCAATGAAGGACCGAGTCAATGATGACCTGATCTCCGAA  1034
            |||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.
Sbjct  953  AAATTCACTATGCCAGGCCTGTGATCATCTTGGGCCCAATGAAGGACCGAGTCAACGATGACCTCATCTCTGAG  1026

Query 1035  TTTCCACATAAATTTGGATCCTGTGTGCCACATACTACCCGGCCTCGACGTGATAATGAGGTGGATGGACAAGA  1108
            ||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 1027  TTCCCGCATAAATTTGGATCCTGTGTGCCACATACCACCCGGCCTCGGCGTGATAACGAGGTAGATGGACAGGA  1100

Query 1109  CTACCACTTTGTGGTGTCCCGAGAACAAATGGAGAAAGATATTCAGGACAACAAGTTCATCGAGGCGGGCCAAT  1182
            .||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1101  TTACCACTTTGTGGTTTCCCGGGAACAAATGGAGAAGGATATTCAGGACAACAAGTTCATTGAGGCGGGCCAGT  1174

Query 1183  TTAATGATAACCTCTATGGGACCAGCATCCAGTCAGTGCGGGCAGTTGCAGAGAGGGGCAAGCACTGCATCTTA  1256
            |.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175  TCAATGATAATCTCTATGGGACCAGCATCCAGTCTGTGCGGGCAGTTGCAGAGAGGGGCAAGCACTGCATCTTA  1248

Query 1257  GATGTTTCCGGCAATGCTATCAAGAGACTGCAGCAAGCACAACTTTACCCCATTGCCATTTTCATCAAGCCCAA  1330
            |||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249  GATGTCTCCGGCAACGCCATAAAGAGACTGCAGCAAGCACAACTTTATCCCATTGCCATTTTCATCAAGCCCAA  1322

Query 1331  GTCCATTGAAGCCCTTATGGAAATGAACCGAAGGCAGACATATGAACAAGCAAATAAGATCTATGACAAAGCCA  1404
            ||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||.|||.|||||||
Sbjct 1323  GTCCATTGAAGCACTTATGGAAATGAACCGACGGCAGACATACGAACAAGCAAATAAGATCTTTGATAAAGCCA  1396

Query 1405  TGAAACTGGAGCAGGAATTTGGAGAGTACTTTACAGCCATTGTACAGGGTGACTCACTGGAAGAGATTTATAAC  1478
            |||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397  TGAAACTGGAGCAAGAATTTGGAGAATACTTTACAGCCATTGTACAGGGTGACTCACTGGAAGAGATTTATAAC  1470

Query 1479  AAAATCAAACAAATCATTGAGGACCAGTCTGGGCACTACATTTGGGTCCCATCCCCTGAAAAACTC  1544
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1471  AAAATCAAACAAATCATTGAGGACCAGTCTGGGCACTACATTTGGGTCCCATCCCCTGAAAAACTC  1536