Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14633
- Subject:
- XM_006712364.3
- Aligned Length:
- 3969
- Identities:
- 3924
- Gaps:
- 45
Alignment
Query 1 ATGAAGCCGGCGACAGGACTTTGGGTCTGGGTGAGCCTTCTCGTGGCGGCGGGGACCGTCCAGCCCAGCGATTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGCCGGCGACAGGACTTTGGGTCTGGGTGAGCCTTCTCGTGGCGGCGGGGACCGTCCAGCCCAGCGATTC 74
Query 75 TCAGTCAGTGTGTGCAGGAACGGAGAATAAACTGAGCTCTCTCTCTGACCTGGAACAGCAGTACCGAGCCTTGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCAGTCAGTGTGTGCAGGAACGGAGAATAAACTGAGCTCTCTCTCTGACCTGGAACAGCAGTACCGAGCCTTGC 148
Query 149 GCAAGTACTATGAAAACTGTGAGGTTGTCATGGGCAACCTGGAGATAACCAGCATTGAGCACAACCGGGACCTC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCAAGTACTATGAAAACTGTGAGGTTGTCATGGGCAACCTGGAGATAACCAGCATTGAGCACAACCGGGACCTC 222
Query 223 TCCTTCCTGCGGTCTGTTCGAGAAGTCACAGGCTACGTGTTAGTGGCTCTTAATCAGTTTCGTTACCTGCCTCT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCCTTCCTGCGGTCTGTTCGAGAAGTCACAGGCTACGTGTTAGTGGCTCTTAATCAGTTTCGTTACCTGCCTCT 296
Query 297 GGAGAATTTACGCATTATTCGTGGGACAAAACTTTATGAGGATCGATATGCCTTGGCAATATTTTTAAACTACA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAGAATTTACGCATTATTCGTGGGACAAAACTTTATGAGGATCGATATGCCTTGGCAATATTTTTAAACTACA 370
Query 371 GAAAAGATGGAAACTTTGGACTTCAAGAACTTGGATTAAAGAACTTGACAGAAATCCTAAATGGTGGAGTCTAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GAAAAGATGGAAACTTTGGACTTCAAGAACTTGGATTAAAGAACTTGACAGAAATCCTAAATGGTGGAGTCTAT 444
Query 445 GTAGACCAGAACAAATTCCTTTGTTATGCAGACACCATTCATTGGCAAGATATTGTTCGGAACCCATGGCCTTC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTAGACCAGAACAAATTCCTTTGTTATGCAGACACCATTCATTGGCAAGATATTGTTCGGAACCCATGGCCTTC 518
Query 519 CAACTTGACTCTTGTGTCAACAAATGGTAGTTCAGGATGTGGACGTTGCCATAAGTCCTGTACTGGCCGTTGCT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAACTTGACTCTTGTGTCAACAAATGGTAGTTCAGGATGTGGACGTTGCCATAAGTCCTGTACTGGCCGTTGCT 592
Query 593 GGGGACCCACAGAAAATCATTGCCAGACTTTGACAAGGACGGTGTGTGCAGAACAATGTGACGGCAGATGCTAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GGGGACCCACAGAAAATCATTGCCAGACTTTGACAAGGACGGTGTGTGCAGAACAATGTGACGGCAGATGCTAC 666
Query 667 GGACCTTACGTCAGTGACTGCTGCCATCGAGAATGTGCTGGAGGCTGCTCAGGACCTAAGGACACAGACTGCTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGACCTTACGTCAGTGACTGCTGCCATCGAGAATGTGCTGGAGGCTGCTCAGGACCTAAGGACACAGACTGCTT 740
Query 741 TGCCTGCATGAATTTCAATGACAGTGGAGCATGTGTTACTCAGTGTCCCCAAACCTTTGTCTACAATCCAACCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGCCTGCATGAATTTCAATGACAGTGGAGCATGTGTTACTCAGTGTCCCCAAACCTTTGTCTACAATCCAACCA 814
Query 815 CCTTTCAACTGGAGCACAATTTCAATGCAAAGTACACATATGGAGCATTCTGTGTCAAGAAATGTCCACATAAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCTTTCAACTGGAGCACAATTTCAATGCAAAGTACACATATGGAGCATTCTGTGTCAAGAAATGTCCACATAAC 888
Query 889 TTTGTGGTAGATTCCAGTTCTTGTGTGCGTGCCTGCCCTAGTTCCAAGATGGAAGTAGAAGAAAATGGGATTAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTTGTGGTAGATTCCAGTTCTTGTGTGCGTGCCTGCCCTAGTTCCAAGATGGAAGTAGAAGAAAATGGGATTAA 962
Query 963 AATGTGTAAACCTTGCACTGACATTTGCCCAAAAGCTTGTGATGGCATTGGCACAGGATCATTGATGTCAGCTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AATGTGTAAACCTTGCACTGACATTTGCCCAAAAGCTTGTGATGGCATTGGCACAGGATCATTGATGTCAGCTC 1036
Query 1037 AGACTGTGGATTCCAGTAACATTGACAAATTCATAAACTGTACCAAGATCAATGGGAATTTGATCTTTCTAGTC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGACTGTGGATTCCAGTAACATTGACAAATTCATAAACTGTACCAAGATCAATGGGAATTTGATCTTTCTAGTC 1110
Query 1111 ACTGGTATTCATGGGGACCCTTACAATGCAATTGAAGCCATAGACCCAGAGAAACTGAACGTCTTTCGGACAGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACTGGTATTCATGGGGACCCTTACAATGCAATTGAAGCCATAGACCCAGAGAAACTGAACGTCTTTCGGACAGT 1184
Query 1185 CAGAGAGATAACAGGTTTCCTGAACATACAGTCATGGCCACCAAACATGACTGACTTCAGTGTTTTTTCTAACC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAGAGAGATAACAGGTTTCCTGAACATACAGTCATGGCCACCAAACATGACTGACTTCAGTGTTTTTTCTAACC 1258
Query 1259 TGGTGACCATTGGTGGAAGAGTACTCTATAGTGGCCTGTCCTTGCTTATCCTCAAGCAACAGGGCATCACCTCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGGTGACCATTGGTGGAAGAGTACTCTATAGTGGCCTGTCCTTGCTTATCCTCAAGCAACAGGGCATCACCTCT 1332
Query 1333 CTACAGTTCCAGTCCCTGAAGGAAATCAGCGCAGGAAACATCTATATTACTGACAACAGCAACCTGTGTTATTA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTACAGTTCCAGTCCCTGAAGGAAATCAGCGCAGGAAACATCTATATTACTGACAACAGCAACCTGTGTTATTA 1406
Query 1407 TCATACCATTAACTGGACAACACTCTTCAGCACAATCAACCAGAGAATAGTAATCCGGGACAACAGAAAAGCTG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TCATACCATTAACTGGACAACACTCTTCAGCACAATCAACCAGAGAATAGTAATCCGGGACAACAGAAAAGCTG 1480
Query 1481 AAAATTGTACTGCTGAAGGAATGGTGTGCAACCATCTGTGTTCCAGTGATGGCTGTTGGGGACCTGGGCCAGAC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AAAATTGTACTGCTGAAGGAATGGTGTGCAACCATCTGTGTTCCAGTGATGGCTGTTGGGGACCTGGGCCAGAC 1554
Query 1555 CAATGTCTGTCGTGTCGCCGCTTCAGTAGAGGAAGGATCTGCATAGAGTCTTGTAACCTCTATGATGGTGAATT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CAATGTCTGTCGTGTCGCCGCTTCAGTAGAGGAAGGATCTGCATAGAGTCTTGTAACCTCTATGATGGTGAATT 1628
Query 1629 TCGGGAGTTTGAGAATGGCTCCATCTGTGTGGAGTGTGACCCCCAGTGTGAGAAGATGGAAGATGGCCTCCTCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TCGGGAGTTTGAGAATGGCTCCATCTGTGTGGAGTGTGACCCCCAGTGTGAGAAGATGGAAGATGGCCTCCTCA 1702
Query 1703 CATGCCATGGACCGGGTCCTGACAACTGTACAAAGTGCTCTCATTTTAAAGATGGCCCAAACTGTGTGGAAAAA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CATGCCATGGACCGGGTCCTGACAACTGTACAAAGTGCTCTCATTTTAAAGATGGCCCAAACTGTGTGGAAAAA 1776
Query 1777 TGTCCAGATGGCTTACAGGGGGCAAACAGTTTCATTTTCAAGTATGCTGATCCAGATCGGGAGTGCCACCCATG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TGTCCAGATGGCTTACAGGGGGCAAACAGTTTCATTTTCAAGTATGCTGATCCAGATCGGGAGTGCCACCCATG 1850
Query 1851 CCATCCAAACTGCACCCAAG---------------------------------------------GGTGTAACG 1879
|||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1851 CCATCCAAACTGCACCCAAGGGTGCATAGGCTCAAGTATTGAAGACTGCATCGGCCTGATGGATAGGTGTAACG 1924
Query 1880 GTCCCACTAGTCATGACTGCATTTACTACCCATGGACGGGCCATTCCACTTTACCACAACATGCTAGAACTCCC 1953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GTCCCACTAGTCATGACTGCATTTACTACCCATGGACGGGCCATTCCACTTTACCACAACATGCTAGAACTCCC 1998
Query 1954 CTGATTGCAGCTGGAGTAATTGGTGGGCTCTTCATTCTGGTCATTGTGGGTCTGACATTTGCTGTTTATGTTAG 2027
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CTGATTGCAGCTGGAGTAATTGGTGGGCTCTTCATTCTGGTCATTGTGGGTCTGACATTTGCTGTTTATGTTAG 2072
Query 2028 AAGGAAGAGCATCAAAAAGAAAAGAGCCTTGAGAAGATTCTTGGAAACAGAGTTGGTGGAACCATTAACTCCCA 2101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AAGGAAGAGCATCAAAAAGAAAAGAGCCTTGAGAAGATTCTTGGAAACAGAGTTGGTGGAACCATTAACTCCCA 2146
Query 2102 GTGGCACAGCACCCAATCAAGCTCAACTTCGTATTTTGAAAGAAACTGAGCTGAAGAGGGTAAAAGTCCTTGGC 2175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GTGGCACAGCACCCAATCAAGCTCAACTTCGTATTTTGAAAGAAACTGAGCTGAAGAGGGTAAAAGTCCTTGGC 2220
Query 2176 TCAGGTGCTTTTGGAACGGTTTATAAAGGTATTTGGGTACCTGAAGGAGAAACTGTGAAGATTCCTGTGGCTAT 2249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TCAGGTGCTTTTGGAACGGTTTATAAAGGTATTTGGGTACCTGAAGGAGAAACTGTGAAGATTCCTGTGGCTAT 2294
Query 2250 TAAGATTCTTAATGAGACAACTGGTCCCAAGGCAAATGTGGAGTTCATGGATGAAGCTCTGATCATGGCAAGTA 2323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TAAGATTCTTAATGAGACAACTGGTCCCAAGGCAAATGTGGAGTTCATGGATGAAGCTCTGATCATGGCAAGTA 2368
Query 2324 TGGATCATCCACACCTAGTCCGGTTGCTGGGTGTGTGTCTGAGCCCAACCATCCAGCTGGTTACTCAACTTATG 2397
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TGGATCATCCACACCTAGTCCGGTTGCTGGGTGTGTGTCTGAGCCCAACCATCCAGCTGGTTACTCAACTTATG 2442
Query 2398 CCCCATGGCTGCCTGTTGGAGTATGTCCACGAGCACAAGGATAACATTGGATCACAACTGCTGCTTAACTGGTG 2471
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CCCCATGGCTGCCTGTTGGAGTATGTCCACGAGCACAAGGATAACATTGGATCACAACTGCTGCTTAACTGGTG 2516
Query 2472 TGTCCAGATAGCTAAGGGAATGATGTACCTGGAAGAAAGACGACTCGTTCATCGGGATTTGGCAGCCCGTAATG 2545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TGTCCAGATAGCTAAGGGAATGATGTACCTGGAAGAAAGACGACTCGTTCATCGGGATTTGGCAGCCCGTAATG 2590
Query 2546 TCTTAGTGAAATCTCCAAACCATGTGAAAATCACAGATTTTGGGCTAGCCAGACTCTTGGAAGGAGATGAAAAA 2619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TCTTAGTGAAATCTCCAAACCATGTGAAAATCACAGATTTTGGGCTAGCCAGACTCTTGGAAGGAGATGAAAAA 2664
Query 2620 GAGTACAATGCTGATGGAGGAAAGATGCCAATTAAATGGATGGCTCTGGAGTGTATACATTACAGGAAATTCAC 2693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 GAGTACAATGCTGATGGAGGAAAGATGCCAATTAAATGGATGGCTCTGGAGTGTATACATTACAGGAAATTCAC 2738
Query 2694 CCATCAGAGTGACGTTTGGAGCTATGGAGTTACTATATGGGAACTGATGACCTTTGGAGGAAAACCCTATGATG 2767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 CCATCAGAGTGACGTTTGGAGCTATGGAGTTACTATATGGGAACTGATGACCTTTGGAGGAAAACCCTATGATG 2812
Query 2768 GAATTCCAACGCGAGAAATCCCTGATTTATTAGAGAAAGGAGAACGTTTGCCTCAGCCTCCCATCTGCACTATT 2841
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 GAATTCCAACGCGAGAAATCCCTGATTTATTAGAGAAAGGAGAACGTTTGCCTCAGCCTCCCATCTGCACTATT 2886
Query 2842 GACGTTTACATGGTCATGGTCAAATGTTGGATGATTGATGCTGACAGTAGACCTAAATTTAAGGAACTGGCTGC 2915
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 GACGTTTACATGGTCATGGTCAAATGTTGGATGATTGATGCTGACAGTAGACCTAAATTTAAGGAACTGGCTGC 2960
Query 2916 TGAGTTTTCAAGGATGGCTCGAGACCCTCAAAGATACCTAGTTATTCAGGGTGATGATCGTATGAAGCTTCCCA 2989
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 TGAGTTTTCAAGGATGGCTCGAGACCCTCAAAGATACCTAGTTATTCAGGGTGATGATCGTATGAAGCTTCCCA 3034
Query 2990 GTCCAAATGACAGCAAGTTCTTTCAGAATCTCTTGGATGAAGAGGATTTGGAAGATATGATGGATGCTGAGGAG 3063
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 GTCCAAATGACAGCAAGTTCTTTCAGAATCTCTTGGATGAAGAGGATTTGGAAGATATGATGGATGCTGAGGAG 3108
Query 3064 TACTTGGTCCCTCAGGCTTTCAACATCCCACCTCCCATCTATACTTCCAGAGCAAGAATTGACTCGAATAGGAG 3137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 TACTTGGTCCCTCAGGCTTTCAACATCCCACCTCCCATCTATACTTCCAGAGCAAGAATTGACTCGAATAGGAG 3182
Query 3138 TGAAATTGGACACAGCCCTCCTCCTGCCTACACCCCCATGTCAGGAAACCAGTTTGTATACCGAGATGGAGGTT 3211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 TGAAATTGGACACAGCCCTCCTCCTGCCTACACCCCCATGTCAGGAAACCAGTTTGTATACCGAGATGGAGGTT 3256
Query 3212 TTGCTGCTGAACAAGGAGTGTCTGTGCCCTACAGAGCCCCAACTAGCACAATTCCAGAAGCTCCTGTGGCACAG 3285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 TTGCTGCTGAACAAGGAGTGTCTGTGCCCTACAGAGCCCCAACTAGCACAATTCCAGAAGCTCCTGTGGCACAG 3330
Query 3286 GGTGCTACTGCTGAGATTTTTGATGACTCCTGCTGTAATGGCACCCTACGCAAGCCAGTGGCACCCCATGTCCA 3359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 GGTGCTACTGCTGAGATTTTTGATGACTCCTGCTGTAATGGCACCCTACGCAAGCCAGTGGCACCCCATGTCCA 3404
Query 3360 AGAGGACAGTAGCACCCAGAGGTACAGTGCTGACCCCACCGTGTTTGCCCCAGAACGGAGCCCACGAGGAGAGC 3433
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 AGAGGACAGTAGCACCCAGAGGTACAGTGCTGACCCCACCGTGTTTGCCCCAGAACGGAGCCCACGAGGAGAGC 3478
Query 3434 TGGATGAGGAAGGTTACATGACTCCTATGCGAGACAAACCCAAACAAGAATACCTGAATCCAGTGGAGGAGAAC 3507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 TGGATGAGGAAGGTTACATGACTCCTATGCGAGACAAACCCAAACAAGAATACCTGAATCCAGTGGAGGAGAAC 3552
Query 3508 CCTTTTGTTTCTCGGAGAAAAAATGGAGACCTTCAAGCATTGGATAATCCCGAATATCACAATGCATCCAATGG 3581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553 CCTTTTGTTTCTCGGAGAAAAAATGGAGACCTTCAAGCATTGGATAATCCCGAATATCACAATGCATCCAATGG 3626
Query 3582 TCCACCCAAGGCCGAGGATGAGTATGTGAATGAGCCACTGTACCTCAACACCTTTGCCAACACCTTGGGAAAAG 3655
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627 TCCACCCAAGGCCGAGGATGAGTATGTGAATGAGCCACTGTACCTCAACACCTTTGCCAACACCTTGGGAAAAG 3700
Query 3656 CTGAGTACCTGAAGAACAACATACTGTCAATGCCAGAGAAGGCCAAGAAAGCGTTTGACAACCCTGACTACTGG 3729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701 CTGAGTACCTGAAGAACAACATACTGTCAATGCCAGAGAAGGCCAAGAAAGCGTTTGACAACCCTGACTACTGG 3774
Query 3730 AACCACAGCCTGCCACCTCGGAGCACCCTTCAGCACCCAGACTACCTGCAGGAGTACAGCACAAAATATTTTTA 3803
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3775 AACCACAGCCTGCCACCTCGGAGCACCCTTCAGCACCCAGACTACCTGCAGGAGTACAGCACAAAATATTTTTA 3848
Query 3804 TAAACAGAATGGGCGGATCCGGCCTATTGTGGCAGAGAATCCTGAATACCTCTCTGAGTTCTCCCTGAAGCCAG 3877
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3849 TAAACAGAATGGGCGGATCCGGCCTATTGTGGCAGAGAATCCTGAATACCTCTCTGAGTTCTCCCTGAAGCCAG 3922
Query 3878 GCACTGTGCTGCCGCCTCCACCTTACAGACACCGGAATACTGTGGTG 3924
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3923 GCACTGTGCTGCCGCCTCCACCTTACAGACACCGGAATACTGTGGTG 3969