Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14633
- Subject:
- XM_017003581.2
- Aligned Length:
- 4002
- Identities:
- 3876
- Gaps:
- 126
Alignment
Query 1 ATGAAGCCGGCGACAGGACTTTGGGTCTGGGTGAGCCTTCTCGTGGCGGCGGGGACCGTCCAGCCCAGCGATTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGCCGGCGACAGGACTTTGGGTCTGGGTGAGCCTTCTCGTGGCGGCGGGGACCGTCCAGCCCAGCGATTC 74
Query 75 TCAGTCAGTGTGTGCAGGAACGGAGAATAAACTGAGCTCTCTCTCTGACCTGGAACAGCAGTACCGAGCCTTGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCAGTCAGTGTGTGCAGGAACGGAGAATAAACTGAGCTCTCTCTCTGACCTGGAACAGCAGTACCGAGCCTTGC 148
Query 149 GCAAGTACTATGAAAACTGTGAGGTTGTCATGGGCAACCTGGAGATAACCAGCATTGAGCACAACCGGGACCTC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCAAGTACTATGAAAACTGTGAGGTTGTCATGGGCAACCTGGAGATAACCAGCATTGAGCACAACCGGGACCTC 222
Query 223 TCCTTCCTGCGGTCTGTTCGAGAAGTCACAGGCTACGTGTTAGTGGCTCTTAATCAGTTTCGTTACCTGCCTCT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCCTTCCTGCGGTCTGTTCGAGAAGTCACAGGCTACGTGTTAGTGGCTCTTAATCAGTTTCGTTACCTGCCTCT 296
Query 297 GGAGAATTTACGCATTATTCGTGGGACAAAACTTTATGAGGATCGATATGCCTTGGCAATATTTTTAAACTACA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAGAATTTACGCATTATTCGTGGGACAAAACTTTATGAGGATCGATATGCCTTGGCAATATTTTTAAACTACA 370
Query 371 GAAAAGATGGAAACTTTGGACTTCAAGAACTTGGATTAAAGAACTTGACAGAAATCCTAAATGGTGGAGTCTAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GAAAAGATGGAAACTTTGGACTTCAAGAACTTGGATTAAAGAACTTGACAGAAATCCTAAATGGTGGAGTCTAT 444
Query 445 GTAGACCAGAACAAATTCCTTTGTTATGCAGACACCATTCATTGGCAAGATATTGTTCGGAACCCATGGCCTTC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTAGACCAGAACAAATTCCTTTGTTATGCAGACACCATTCATTGGCAAGATATTGTTCGGAACCCATGGCCTTC 518
Query 519 CAACTTGACTCTTGTGTCAACAAATGGTAGTTCAGGAT------------------------------------ 556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAACTTGACTCTTGTGTCAACAAATGGTAGTTCAGGATGTTTAGCTCATCAAGACACTGAGAAGAACAATCCTC 592
Query 557 ------------------------------------------GTGGACGTTGCCATAAGTCCTGTACTGGCCGT 588
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGCTGCTCCAGTCCCTACAACCTTTTTCTTTGATTACGCCAGGTGGACGTTGCCATAAGTCCTGTACTGGCCGT 666
Query 589 TGCTGGGGACCCACAGAAAATCATTGCCAGACTTTGACAAGGACGGTGTGTGCAGAACAATGTGACGGCAGATG 662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TGCTGGGGACCCACAGAAAATCATTGCCAGACTTTGACAAGGACGGTGTGTGCAGAACAATGTGACGGCAGATG 740
Query 663 CTACGGACCTTACGTCAGTGACTGCTGCCATCGAGAATGTGCTGGAGGCTGCTCAGGACCTAAGGACACAGACT 736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTACGGACCTTACGTCAGTGACTGCTGCCATCGAGAATGTGCTGGAGGCTGCTCAGGACCTAAGGACACAGACT 814
Query 737 GCTTTGCCTGCATGAATTTCAATGACAGTGGAGCATGTGTTACTCAGTGTCCCCAAACCTTTGTCTACAATCCA 810
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCTTTGCCTGCATGAATTTCAATGACAGTGGAGCATGTGTTACTCAGTGTCCCCAAACCTTTGTCTACAATCCA 888
Query 811 ACCACCTTTCAACTGGAGCACAATTTCAATGCAAAGTACACATATGGAGCATTCTGTGTCAAGAAATGTCCACA 884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACCACCTTTCAACTGGAGCACAATTTCAATGCAAAGTACACATATGGAGCATTCTGTGTCAAGAAATGTCCACA 962
Query 885 TAACTTTGTGGTAGATTCCAGTTCTTGTGTGCGTGCCTGCCCTAGTTCCAAGATGGAAGTAGAAGAAAATGGGA 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TAACTTTGTGGTAGATTCCAGTTCTTGTGTGCGTGCCTGCCCTAGTTCCAAGATGGAAGTAGAAGAAAATGGGA 1036
Query 959 TTAAAATGTGTAAACCTTGCACTGACATTTGCCCAAAAGCTTGTGATGGCATTGGCACAGGATCATTGATGTCA 1032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TTAAAATGTGTAAACCTTGCACTGACATTTGCCCAAAAGCTTGTGATGGCATTGGCACAGGATCATTGATGTCA 1110
Query 1033 GCTCAGACTGTGGATTCCAGTAACATTGACAAATTCATAAACTGTACCAAGATCAATGGGAATTTGATCTTTCT 1106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCTCAGACTGTGGATTCCAGTAACATTGACAAATTCATAAACTGTACCAAGATCAATGGGAATTTGATCTTTCT 1184
Query 1107 AGTCACTGGTATTCATGGGGACCCTTACAATGCAATTGAAGCCATAGACCCAGAGAAACTGAACGTCTTTCGGA 1180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGTCACTGGTATTCATGGGGACCCTTACAATGCAATTGAAGCCATAGACCCAGAGAAACTGAACGTCTTTCGGA 1258
Query 1181 CAGTCAGAGAGATAACAGGTTTCCTGAACATACAGTCATGGCCACCAAACATGACTGACTTCAGTGTTTTTTCT 1254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CAGTCAGAGAGATAACAGGTTTCCTGAACATACAGTCATGGCCACCAAACATGACTGACTTCAGTGTTTTTTCT 1332
Query 1255 AACCTGGTGACCATTGGTGGAAGAGTACTCTATAGTGGCCTGTCCTTGCTTATCCTCAAGCAACAGGGCATCAC 1328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AACCTGGTGACCATTGGTGGAAGAGTACTCTATAGTGGCCTGTCCTTGCTTATCCTCAAGCAACAGGGCATCAC 1406
Query 1329 CTCTCTACAGTTCCAGTCCCTGAAGGAAATCAGCGCAGGAAACATCTATATTACTGACAACAGCAACCTGTGTT 1402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CTCTCTACAGTTCCAGTCCCTGAAGGAAATCAGCGCAGGAAACATCTATATTACTGACAACAGCAACCTGTGTT 1480
Query 1403 ATTATCATACCATTAACTGGACAACACTCTTCAGCACAATCAACCAGAGAATAGTAATCCGGGACAACAGAAAA 1476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ATTATCATACCATTAACTGGACAACACTCTTCAGCACAATCAACCAGAGAATAGTAATCCGGGACAACAGAAAA 1554
Query 1477 GCTGAAAATTGTACTGCTGAAGGAATGGTGTGCAACCATCTGTGTTCCAGTGATGGCTGTTGGGGACCTGGGCC 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GCTGAAAATTGTACTGCTGAAGGAATGGTGTGCAACCATCTGTGTTCCAGTGATGGCTGTTGGGGACCTGGGCC 1628
Query 1551 AGACCAATGTCTGTCGTGTCGCCGCTTCAGTAGAGGAAGGATCTGCATAGAGTCTTGTAACCTCTATGATGGTG 1624
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGACCAATGTCTGTCGTGTCGCCGCTTCAGTAGAGGAAGGATCTGCATAGAGTCTTGTAACCTCTATGATGGTG 1702
Query 1625 AATTTCGGGAGTTTGAGAATGGCTCCATCTGTGTGGAGTGTGACCCCCAGTGTGAGAAGATGGAAGATGGCCTC 1698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AATTTCGGGAGTTTGAGAATGGCTCCATCTGTGTGGAGTGTGACCCCCAGTGTGAGAAGATGGAAGATGGCCTC 1776
Query 1699 CTCACATGCCATGGACCGGGTCCTGACAACTGTACAAAGTGCTCTCATTTTAAAGATGGCCCAAACTGTGTGGA 1772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CTCACATGCCATGGACCGGGTCCTGACAACTGTACAAAGTGCTCTCATTTTAAAGATGGCCCAAACTGTGTGGA 1850
Query 1773 AAAATGTCCAGATGGCTTACAGGGGGCAAACAGTTTCATTTTCAAGTATGCTGATCCAGATCGGGAGTGCCACC 1846
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AAAATGTCCAGATGGCTTACAGGGGGCAAACAGTTTCATTTTCAAGTATGCTGATCCAGATCGGGAGTGCCACC 1924
Query 1847 CATGCCATCCAAACTGCACCCAAGGGTGTAACGGTCCCACTAGTCATGACTGCATTTACTACCCATGGACGGGC 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CATGCCATCCAAACTGCACCCAAGGGTGTAACGGTCCCACTAGTCATGACTGCATTTACTACCCATGGACGGGC 1998
Query 1921 CATTCCACTTTACCACAACATGCTAGAACTCCCCTGATTGCAGCTGGAGTAATTGGTGGGCTCTTCATTCTGGT 1994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CATTCCACTTTACCACAACATGCTAGAACTCCCCTGATTGCAGCTGGAGTAATTGGTGGGCTCTTCATTCTGGT 2072
Query 1995 CATTGTGGGTCTGACATTTGCTGTTTATGTTAGAAGGAAGAGCATCAAAAAGAAAAGAGCCTTGAGAAGATTCT 2068
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CATTGTGGGTCTGACATTTGCTGTTTATGTTAGAAGGAAGAGCATCAAAAAGAAAAGAGCCTTGAGAAGATTCT 2146
Query 2069 TGGAAACAGAGTTGGTGGAACCATTAACTCCCAGTGGCACAGCACCCAATCAAGCTCAACTTCGTATTTTGAAA 2142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TGGAAACAGAGTTGGTGGAACCATTAACTCCCAGTGGCACAGCACCCAATCAAGCTCAACTTCGTATTTTGAAA 2220
Query 2143 GAAACTGAGCTGAAGAGGGTAAAAGTCCTTGGCTCAGGTGCTTTTGGAACGGTTTATAAAGGTATTTGGGTACC 2216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GAAACTGAGCTGAAGAGGGTAAAAGTCCTTGGCTCAGGTGCTTTTGGAACGGTTTATAAAGGTATTTGGGTACC 2294
Query 2217 TGAAGGAGAAACTGTGAAGATTCCTGTGGCTATTAAGATTCTTAATGAGACAACTGGTCCCAAGGCAAATGTGG 2290
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TGAAGGAGAAACTGTGAAGATTCCTGTGGCTATTAAGATTCTTAATGAGACAACTGGTCCCAAGGCAAATGTGG 2368
Query 2291 AGTTCATGGATGAAGCTCTGATCATGGCAAGTATGGATCATCCACACCTAGTCCGGTTGCTGGGTGTGTGTCTG 2364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 AGTTCATGGATGAAGCTCTGATCATGGCAAGTATGGATCATCCACACCTAGTCCGGTTGCTGGGTGTGTGTCTG 2442
Query 2365 AGCCCAACCATCCAGCTGGTTACTCAACTTATGCCCCATGGCTGCCTGTTGGAGTATGTCCACGAGCACAAGGA 2438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 AGCCCAACCATCCAGCTGGTTACTCAACTTATGCCCCATGGCTGCCTGTTGGAGTATGTCCACGAGCACAAGGA 2516
Query 2439 TAACATTGGATCACAACTGCTGCTTAACTGGTGTGTCCAGATAGCTAAGGGAATGATGTACCTGGAAGAAAGAC 2512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TAACATTGGATCACAACTGCTGCTTAACTGGTGTGTCCAGATAGCTAAGGGAATGATGTACCTGGAAGAAAGAC 2590
Query 2513 GACTCGTTCATCGGGATTTGGCAGCCCGTAATGTCTTAGTGAAATCTCCAAACCATGTGAAAATCACAGATTTT 2586
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 GACTCGTTCATCGGGATTTGGCAGCCCGTAATGTCTTAGTGAAATCTCCAAACCATGTGAAAATCACAGATTTT 2664
Query 2587 GGGCTAGCCAGACTCTTGGAAGGAGATGAAAAAGAGTACAATGCTGATGGAGGAAAGATGCCAATTAAATGGAT 2660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 GGGCTAGCCAGACTCTTGGAAGGAGATGAAAAAGAGTACAATGCTGATGGAGGAAAGATGCCAATTAAATGGAT 2738
Query 2661 GGCTCTGGAGTGTATACATTACAGGAAATTCACCCATCAGAGTGACGTTTGGAGCTATGGAGTTACTATATGGG 2734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 GGCTCTGGAGTGTATACATTACAGGAAATTCACCCATCAGAGTGACGTTTGGAGCTATGGAGTTACTATATGGG 2812
Query 2735 AACTGATGACCTTTGGAGGAAAACCCTATGATGGAATTCCAACGCGAGAAATCCCTGATTTATTAGAGAAAGGA 2808
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 AACTGATGACCTTTGGAGGAAAACCCTATGATGGAATTCCAACGCGAGAAATCCCTGATTTATTAGAGAAAGGA 2886
Query 2809 GAACGTTTGCCTCAGCCTCCCATCTGCACTATTGACGTTTACATGGTCATGGTCAAATGTTGGATGATTGATGC 2882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 GAACGTTTGCCTCAGCCTCCCATCTGCACTATTGACGTTTACATGGTCATGGTCAAATGTTGGATGATTGATGC 2960
Query 2883 TGACAGTAGACCTAAATTTAAGGAACTGGCTGCTGAGTTTTCAAGGATGGCTCGAGACCCTCAAAGATACCTAG 2956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 TGACAGTAGACCTAAATTTAAGGAACTGGCTGCTGAGTTTTCAAGGATGGCTCGAGACCCTCAAAGATACCTAG 3034
Query 2957 TTATTCAGGGTGATGATCGTATGAAGCTTCCCAGTCCAAATGACAGCAAGTTCTTTCAGAATCTCTTGGATGAA 3030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 TTATTCAGGGTGATGATCGTATGAAGCTTCCCAGTCCAAATGACAGCAAGTTCTTTCAGAATCTCTTGGATGAA 3108
Query 3031 GAGGATTTGGAAGATATGATGGATGCTGAGGAGTACTTGGTCCCTCAGGCTTTCAACATCCCACCTCCCATCTA 3104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 GAGGATTTGGAAGATATGATGGATGCTGAGGAGTACTTGGTCCCTCAGGCTTTCAACATCCCACCTCCCATCTA 3182
Query 3105 TACTTCCAGAGCAAGAATTGACTCGAATAGGAGTGAAATTGGACACAGCCCTCCTCCTGCCTACACCCCCATGT 3178
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 TACTTCCAGAGCAAGAATTGACTCGAATAGG------------------------------------------- 3213
Query 3179 CAGGAAACCAGTTTGTATACCGAGATGGAGGTTTTGCTGCTGAACAAGGAGTGTCTGTGCCCTACAGAGCCCCA 3252
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3214 -----AACCAGTTTGTATACCGAGATGGAGGTTTTGCTGCTGAACAAGGAGTGTCTGTGCCCTACAGAGCCCCA 3282
Query 3253 ACTAGCACAATTCCAGAAGCTCCTGTGGCACAGGGTGCTACTGCTGAGATTTTTGATGACTCCTGCTGTAATGG 3326
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3283 ACTAGCACAATTCCAGAAGCTCCTGTGGCACAGGGTGCTACTGCTGAGATTTTTGATGACTCCTGCTGTAATGG 3356
Query 3327 CACCCTACGCAAGCCAGTGGCACCCCATGTCCAAGAGGACAGTAGCACCCAGAGGTACAGTGCTGACCCCACCG 3400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3357 CACCCTACGCAAGCCAGTGGCACCCCATGTCCAAGAGGACAGTAGCACCCAGAGGTACAGTGCTGACCCCACCG 3430
Query 3401 TGTTTGCCCCAGAACGGAGCCCACGAGGAGAGCTGGATGAGGAAGGTTACATGACTCCTATGCGAGACAAACCC 3474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3431 TGTTTGCCCCAGAACGGAGCCCACGAGGAGAGCTGGATGAGGAAGGTTACATGACTCCTATGCGAGACAAACCC 3504
Query 3475 AAACAAGAATACCTGAATCCAGTGGAGGAGAACCCTTTTGTTTCTCGGAGAAAAAATGGAGACCTTCAAGCATT 3548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3505 AAACAAGAATACCTGAATCCAGTGGAGGAGAACCCTTTTGTTTCTCGGAGAAAAAATGGAGACCTTCAAGCATT 3578
Query 3549 GGATAATCCCGAATATCACAATGCATCCAATGGTCCACCCAAGGCCGAGGATGAGTATGTGAATGAGCCACTGT 3622
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3579 GGATAATCCCGAATATCACAATGCATCCAATGGTCCACCCAAGGCCGAGGATGAGTATGTGAATGAGCCACTGT 3652
Query 3623 ACCTCAACACCTTTGCCAACACCTTGGGAAAAGCTGAGTACCTGAAGAACAACATACTGTCAATGCCAGAGAAG 3696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3653 ACCTCAACACCTTTGCCAACACCTTGGGAAAAGCTGAGTACCTGAAGAACAACATACTGTCAATGCCAGAGAAG 3726
Query 3697 GCCAAGAAAGCGTTTGACAACCCTGACTACTGGAACCACAGCCTGCCACCTCGGAGCACCCTTCAGCACCCAGA 3770
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3727 GCCAAGAAAGCGTTTGACAACCCTGACTACTGGAACCACAGCCTGCCACCTCGGAGCACCCTTCAGCACCCAGA 3800
Query 3771 CTACCTGCAGGAGTACAGCACAAAATATTTTTATAAACAGAATGGGCGGATCCGGCCTATTGTGGCAGAGAATC 3844
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3801 CTACCTGCAGGAGTACAGCACAAAATATTTTTATAAACAGAATGGGCGGATCCGGCCTATTGTGGCAGAGAATC 3874
Query 3845 CTGAATACCTCTCTGAGTTCTCCCTGAAGCCAGGCACTGTGCTGCCGCCTCCACCTTACAGACACCGGAATACT 3918
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3875 CTGAATACCTCTCTGAGTTCTCCCTGAAGCCAGGCACTGTGCTGCCGCCTCCACCTTACAGACACCGGAATACT 3948
Query 3919 GTGGTG 3924
||||||
Sbjct 3949 GTGGTG 3954