Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14633
• Subject: XM_017003582.1
• Aligned Length: 3969
• Identities: 3302
• Gaps: 666

Alignment

Query    1  ATGAAGCCGGCGACAGGACTTTGGGTCTGGGTGAGCCTTCTCGTGGCGGCGGGGACCGTCCAGCCCAGCGATTC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TCAGTCAGTGTGTGCAGGAACGGAGAATAAACTGAGCTCTCTCTCTGACCTGGAACAGCAGTACCGAGCCTTGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GCAAGTACTATGAAAACTGTGAGGTTGTCATGGGCAACCTGGAGATAACCAGCATTGAGCACAACCGGGACCTC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TCCTTCCTGCGGTCTGTTCGAGAAGTCACAGGCTACGTGTTAGTGGCTCTTAATCAGTTTCGTTACCTGCCTCT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GGAGAATTTACGCATTATTCGTGGGACAAAACTTTATGAGGATCGATATGCCTTGGCAATATTTTTAAACTACA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  GAAAAGATGGAAACTTTGGACTTCAAGAACTTGGATTAAAGAACTTGACAGAAATCCTAAATGGTGGAGTCTAT  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  GTAGACCAGAACAAATTCCTTTGTTATGCAGACACCATTCATTGGCAAGATATTGTTCGGAACCCATGGCCTTC  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  CAACTTGACTCTTGTGTCAACAAATGGTAGTTCAGGATGTGGACGTTGCCATAAGTCCTGTACTGGCCGTTGCT  592
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  593  GGGGACCCACAGAAAATCATTGCCAGACTTTGACAAGGACGGTGTGTGCAGAACAATGTGACGGCAGATGCTAC  666
                                         .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------ATGACAAGGACGGTGTGTGCAGAACAATGTGACGGCAGATGCTAC  45

Query  667  GGACCTTACGTCAGTGACTGCTGCCATCGAGAATGTGCTGGAGGCTGCTCAGGACCTAAGGACACAGACTGCTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   46  GGACCTTACGTCAGTGACTGCTGCCATCGAGAATGTGCTGGAGGCTGCTCAGGACCTAAGGACACAGACTGCTT  119

Query  741  TGCCTGCATGAATTTCAATGACAGTGGAGCATGTGTTACTCAGTGTCCCCAAACCTTTGTCTACAATCCAACCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  120  TGCCTGCATGAATTTCAATGACAGTGGAGCATGTGTTACTCAGTGTCCCCAAACCTTTGTCTACAATCCAACCA  193

Query  815  CCTTTCAACTGGAGCACAATTTCAATGCAAAGTACACATATGGAGCATTCTGTGTCAAGAAATGTCCACATAAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  194  CCTTTCAACTGGAGCACAATTTCAATGCAAAGTACACATATGGAGCATTCTGTGTCAAGAAATGTCCACATAAC  267

Query  889  TTTGTGGTAGATTCCAGTTCTTGTGTGCGTGCCTGCCCTAGTTCCAAGATGGAAGTAGAAGAAAATGGGATTAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  268  TTTGTGGTAGATTCCAGTTCTTGTGTGCGTGCCTGCCCTAGTTCCAAGATGGAAGTAGAAGAAAATGGGATTAA  341

Query  963  AATGTGTAAACCTTGCACTGACATTTGCCCAAAAGCTTGTGATGGCATTGGCACAGGATCATTGATGTCAGCTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  342  AATGTGTAAACCTTGCACTGACATTTGCCCAAAAGCTTGTGATGGCATTGGCACAGGATCATTGATGTCAGCTC  415

Query 1037  AGACTGTGGATTCCAGTAACATTGACAAATTCATAAACTGTACCAAGATCAATGGGAATTTGATCTTTCTAGTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  416  AGACTGTGGATTCCAGTAACATTGACAAATTCATAAACTGTACCAAGATCAATGGGAATTTGATCTTTCTAGTC  489

Query 1111  ACTGGTATTCATGGGGACCCTTACAATGCAATTGAAGCCATAGACCCAGAGAAACTGAACGTCTTTCGGACAGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  490  ACTGGTATTCATGGGGACCCTTACAATGCAATTGAAGCCATAGACCCAGAGAAACTGAACGTCTTTCGGACAGT  563

Query 1185  CAGAGAGATAACAGGTTTCCTGAACATACAGTCATGGCCACCAAACATGACTGACTTCAGTGTTTTTTCTAACC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  564  CAGAGAGATAACAGGTTTCCTGAACATACAGTCATGGCCACCAAACATGACTGACTTCAGTGTTTTTTCTAACC  637

Query 1259  TGGTGACCATTGGTGGAAGAGTACTCTATAGTGGCCTGTCCTTGCTTATCCTCAAGCAACAGGGCATCACCTCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  638  TGGTGACCATTGGTGGAAGAGTACTCTATAGTGGCCTGTCCTTGCTTATCCTCAAGCAACAGGGCATCACCTCT  711

Query 1333  CTACAGTTCCAGTCCCTGAAGGAAATCAGCGCAGGAAACATCTATATTACTGACAACAGCAACCTGTGTTATTA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  712  CTACAGTTCCAGTCCCTGAAGGAAATCAGCGCAGGAAACATCTATATTACTGACAACAGCAACCTGTGTTATTA  785

Query 1407  TCATACCATTAACTGGACAACACTCTTCAGCACAATCAACCAGAGAATAGTAATCCGGGACAACAGAAAAGCTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  786  TCATACCATTAACTGGACAACACTCTTCAGCACAATCAACCAGAGAATAGTAATCCGGGACAACAGAAAAGCTG  859

Query 1481  AAAATTGTACTGCTGAAGGAATGGTGTGCAACCATCTGTGTTCCAGTGATGGCTGTTGGGGACCTGGGCCAGAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  860  AAAATTGTACTGCTGAAGGAATGGTGTGCAACCATCTGTGTTCCAGTGATGGCTGTTGGGGACCTGGGCCAGAC  933

Query 1555  CAATGTCTGTCGTGTCGCCGCTTCAGTAGAGGAAGGATCTGCATAGAGTCTTGTAACCTCTATGATGGTGAATT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  934  CAATGTCTGTCGTGTCGCCGCTTCAGTAGAGGAAGGATCTGCATAGAGTCTTGTAACCTCTATGATGGTGAATT  1007

Query 1629  TCGGGAGTTTGAGAATGGCTCCATCTGTGTGGAGTGTGACCCCCAGTGTGAGAAGATGGAAGATGGCCTCCTCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1008  TCGGGAGTTTGAGAATGGCTCCATCTGTGTGGAGTGTGACCCCCAGTGTGAGAAGATGGAAGATGGCCTCCTCA  1081

Query 1703  CATGCCATGGACCGGGTCCTGACAACTGTACAAAGTGCTCTCATTTTAAAGATGGCCCAAACTGTGTGGAAAAA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1082  CATGCCATGGACCGGGTCCTGACAACTGTACAAAGTGCTCTCATTTTAAAGATGGCCCAAACTGTGTGGAAAAA  1155

Query 1777  TGTCCAGATGGCTTACAGGGGGCAAACAGTTTCATTTTCAAGTATGCTGATCCAGATCGGGAGTGCCACCCATG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1156  TGTCCAGATGGCTTACAGGGGGCAAACAGTTTCATTTTCAAGTATGCTGATCCAGATCGGGAGTGCCACCCATG  1229

Query 1851  CCATCCAAACTGCACCCAAG---------------------------------------------GGTGTAACG  1879
            ||||||||||||||||||||                                             |||||||||
Sbjct 1230  CCATCCAAACTGCACCCAAGGGTGCATAGGCTCAAGTATTGAAGACTGCATCGGCCTGATGGATAGGTGTAACG  1303

Query 1880  GTCCCACTAGTCATGACTGCATTTACTACCCATGGACGGGCCATTCCACTTTACCACAACATGCTAGAACTCCC  1953
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1304  GTCCCACTAGTCATGACTGCATTTACTACCCATGGACGGGCCATTCCACTTTACCACAACATGCTAGAACTCCC  1377

Query 1954  CTGATTGCAGCTGGAGTAATTGGTGGGCTCTTCATTCTGGTCATTGTGGGTCTGACATTTGCTGTTTATGTTAG  2027
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1378  CTGATTGCAGCTGGAGTAATTGGTGGGCTCTTCATTCTGGTCATTGTGGGTCTGACATTTGCTGTTTATGTTAG  1451

Query 2028  AAGGAAGAGCATCAAAAAGAAAAGAGCCTTGAGAAGATTCTTGGAAACAGAGTTGGTGGAACCATTAACTCCCA  2101
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1452  AAGGAAGAGCATCAAAAAGAAAAGAGCCTTGAGAAGATTCTTGGAAACAGAGTTGGTGGAACCATTAACTCCCA  1525

Query 2102  GTGGCACAGCACCCAATCAAGCTCAACTTCGTATTTTGAAAGAAACTGAGCTGAAGAGGGTAAAAGTCCTTGGC  2175
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1526  GTGGCACAGCACCCAATCAAGCTCAACTTCGTATTTTGAAAGAAACTGAGCTGAAGAGGGTAAAAGTCCTTGGC  1599

Query 2176  TCAGGTGCTTTTGGAACGGTTTATAAAGGTATTTGGGTACCTGAAGGAGAAACTGTGAAGATTCCTGTGGCTAT  2249
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1600  TCAGGTGCTTTTGGAACGGTTTATAAAGGTATTTGGGTACCTGAAGGAGAAACTGTGAAGATTCCTGTGGCTAT  1673

Query 2250  TAAGATTCTTAATGAGACAACTGGTCCCAAGGCAAATGTGGAGTTCATGGATGAAGCTCTGATCATGGCAAGTA  2323
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1674  TAAGATTCTTAATGAGACAACTGGTCCCAAGGCAAATGTGGAGTTCATGGATGAAGCTCTGATCATGGCAAGTA  1747

Query 2324  TGGATCATCCACACCTAGTCCGGTTGCTGGGTGTGTGTCTGAGCCCAACCATCCAGCTGGTTACTCAACTTATG  2397
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1748  TGGATCATCCACACCTAGTCCGGTTGCTGGGTGTGTGTCTGAGCCCAACCATCCAGCTGGTTACTCAACTTATG  1821

Query 2398  CCCCATGGCTGCCTGTTGGAGTATGTCCACGAGCACAAGGATAACATTGGATCACAACTGCTGCTTAACTGGTG  2471
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1822  CCCCATGGCTGCCTGTTGGAGTATGTCCACGAGCACAAGGATAACATTGGATCACAACTGCTGCTTAACTGGTG  1895

Query 2472  TGTCCAGATAGCTAAGGGAATGATGTACCTGGAAGAAAGACGACTCGTTCATCGGGATTTGGCAGCCCGTAATG  2545
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1896  TGTCCAGATAGCTAAGGGAATGATGTACCTGGAAGAAAGACGACTCGTTCATCGGGATTTGGCAGCCCGTAATG  1969

Query 2546  TCTTAGTGAAATCTCCAAACCATGTGAAAATCACAGATTTTGGGCTAGCCAGACTCTTGGAAGGAGATGAAAAA  2619
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1970  TCTTAGTGAAATCTCCAAACCATGTGAAAATCACAGATTTTGGGCTAGCCAGACTCTTGGAAGGAGATGAAAAA  2043

Query 2620  GAGTACAATGCTGATGGAGGAAAGATGCCAATTAAATGGATGGCTCTGGAGTGTATACATTACAGGAAATTCAC  2693
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2044  GAGTACAATGCTGATGGAGGAAAGATGCCAATTAAATGGATGGCTCTGGAGTGTATACATTACAGGAAATTCAC  2117

Query 2694  CCATCAGAGTGACGTTTGGAGCTATGGAGTTACTATATGGGAACTGATGACCTTTGGAGGAAAACCCTATGATG  2767
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2118  CCATCAGAGTGACGTTTGGAGCTATGGAGTTACTATATGGGAACTGATGACCTTTGGAGGAAAACCCTATGATG  2191

Query 2768  GAATTCCAACGCGAGAAATCCCTGATTTATTAGAGAAAGGAGAACGTTTGCCTCAGCCTCCCATCTGCACTATT  2841
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2192  GAATTCCAACGCGAGAAATCCCTGATTTATTAGAGAAAGGAGAACGTTTGCCTCAGCCTCCCATCTGCACTATT  2265

Query 2842  GACGTTTACATGGTCATGGTCAAATGTTGGATGATTGATGCTGACAGTAGACCTAAATTTAAGGAACTGGCTGC  2915
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2266  GACGTTTACATGGTCATGGTCAAATGTTGGATGATTGATGCTGACAGTAGACCTAAATTTAAGGAACTGGCTGC  2339

Query 2916  TGAGTTTTCAAGGATGGCTCGAGACCCTCAAAGATACCTAGTTATTCAGGGTGATGATCGTATGAAGCTTCCCA  2989
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2340  TGAGTTTTCAAGGATGGCTCGAGACCCTCAAAGATACCTAGTTATTCAGGGTGATGATCGTATGAAGCTTCCCA  2413

Query 2990  GTCCAAATGACAGCAAGTTCTTTCAGAATCTCTTGGATGAAGAGGATTTGGAAGATATGATGGATGCTGAGGAG  3063
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2414  GTCCAAATGACAGCAAGTTCTTTCAGAATCTCTTGGATGAAGAGGATTTGGAAGATATGATGGATGCTGAGGAG  2487

Query 3064  TACTTGGTCCCTCAGGCTTTCAACATCCCACCTCCCATCTATACTTCCAGAGCAAGAATTGACTCGAATAGGAG  3137
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2488  TACTTGGTCCCTCAGGCTTTCAACATCCCACCTCCCATCTATACTTCCAGAGCAAGAATTGACTCGAATAGGAG  2561

Query 3138  TGAAATTGGACACAGCCCTCCTCCTGCCTACACCCCCATGTCAGGAAACCAGTTTGTATACCGAGATGGAGGTT  3211
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2562  TGAAATTGGACACAGCCCTCCTCCTGCCTACACCCCCATGTCAGGAAACCAGTTTGTATACCGAGATGGAGGTT  2635

Query 3212  TTGCTGCTGAACAAGGAGTGTCTGTGCCCTACAGAGCCCCAACTAGCACAATTCCAGAAGCTCCTGTGGCACAG  3285
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2636  TTGCTGCTGAACAAGGAGTGTCTGTGCCCTACAGAGCCCCAACTAGCACAATTCCAGAAGCTCCTGTGGCACAG  2709

Query 3286  GGTGCTACTGCTGAGATTTTTGATGACTCCTGCTGTAATGGCACCCTACGCAAGCCAGTGGCACCCCATGTCCA  3359
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2710  GGTGCTACTGCTGAGATTTTTGATGACTCCTGCTGTAATGGCACCCTACGCAAGCCAGTGGCACCCCATGTCCA  2783

Query 3360  AGAGGACAGTAGCACCCAGAGGTACAGTGCTGACCCCACCGTGTTTGCCCCAGAACGGAGCCCACGAGGAGAGC  3433
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2784  AGAGGACAGTAGCACCCAGAGGTACAGTGCTGACCCCACCGTGTTTGCCCCAGAACGGAGCCCACGAGGAGAGC  2857

Query 3434  TGGATGAGGAAGGTTACATGACTCCTATGCGAGACAAACCCAAACAAGAATACCTGAATCCAGTGGAGGAGAAC  3507
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2858  TGGATGAGGAAGGTTACATGACTCCTATGCGAGACAAACCCAAACAAGAATACCTGAATCCAGTGGAGGAGAAC  2931

Query 3508  CCTTTTGTTTCTCGGAGAAAAAATGGAGACCTTCAAGCATTGGATAATCCCGAATATCACAATGCATCCAATGG  3581
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2932  CCTTTTGTTTCTCGGAGAAAAAATGGAGACCTTCAAGCATTGGATAATCCCGAATATCACAATGCATCCAATGG  3005

Query 3582  TCCACCCAAGGCCGAGGATGAGTATGTGAATGAGCCACTGTACCTCAACACCTTTGCCAACACCTTGGGAAAAG  3655
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3006  TCCACCCAAGGCCGAGGATGAGTATGTGAATGAGCCACTGTACCTCAACACCTTTGCCAACACCTTGGGAAAAG  3079

Query 3656  CTGAGTACCTGAAGAACAACATACTGTCAATGCCAGAGAAGGCCAAGAAAGCGTTTGACAACCCTGACTACTGG  3729
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3080  CTGAGTACCTGAAGAACAACATACTGTCAATGCCAGAGAAGGCCAAGAAAGCGTTTGACAACCCTGACTACTGG  3153

Query 3730  AACCACAGCCTGCCACCTCGGAGCACCCTTCAGCACCCAGACTACCTGCAGGAGTACAGCACAAAATATTTTTA  3803
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3154  AACCACAGCCTGCCACCTCGGAGCACCCTTCAGCACCCAGACTACCTGCAGGAGTACAGCACAAAATATTTTTA  3227

Query 3804  TAAACAGAATGGGCGGATCCGGCCTATTGTGGCAGAGAATCCTGAATACCTCTCTGAGTTCTCCCTGAAGCCAG  3877
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3228  TAAACAGAATGGGCGGATCCGGCCTATTGTGGCAGAGAATCCTGAATACCTCTCTGAGTTCTCCCTGAAGCCAG  3301

Query 3878  GCACTGTGCTGCCGCCTCCACCTTACAGACACCGGAATACTGTGGTG  3924
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3302  GCACTGTGCTGCCGCCTCCACCTTACAGACACCGGAATACTGTGGTG  3348