Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14649
• Subject: NM_008054.2
• Aligned Length: 1602
• Identities: 1336
• Gaps: 158

Alignment

Query    1  ATGGGCTGTGTGCAATGTAAGGATAAAGAAGCAACAAAACTGACGGAGGAGAGGGACGGCAGCCTGAACCAGAG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCTGTGTGCAATGTAAGGATAAAGAAGCAGCGAAACTGACAGAGGAGAGGGACGGCAGCCTGAACCAGAG  74

Query   75  CTCTGGGTACCGCTATGGCACAGACCCCACCCCTCAGCACTACCCCAGCTTCGGTGTGACCTCCATCCCCAACT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct   75  CTCTGGGTACCGCTATGGCACAGACCCCACCCCTCAGCACTACCCCAGCTTCGGCGTGACCTCCATCCCGAACT  148

Query  149  ACAACAACTTCCACGCAGCCGGGGGCCAAGGACTCACCGTCTTTGGAGGTGTGAACTCTTCGTCTCATACGGGG  222
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct  149  ACAACAACTTCCACGCAGCTGGGGGCCAGGGACTCACCGTCTTTGGGGGTGTGAACTCCTCCTCTCACACTGGG  222

Query  223  ACCTTGCGTACGAGAGGAGGAACAGGAGTGACACTCTTTGTGGCCCTTTATGACTATGAAGCACGGACAGAAGA  296
            |||.|.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  223  ACCCTACGCACGAGAGGAGGGACAGGAGTGACACTGTTTGTGGCGCTTTATGACTATGAAGCACGGACGGAAGA  296

Query  297  TGACCTGAGTTTTCACAAAGGAGAAAAATTTCAAATATTGAACAGCTCGGAAGGAGATTGGTGGGAAGCCCGCT  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  TGACCTGAGTTTTCACAAAGGAGAAAAATTTCAAATATTGAACAGCTCGGAAGGAGACTGGTGGGAAGCCCGCT  370

Query  371  CCTTGACAACTGGAGAGACAGGTTACATTCCCAGCAATTATGTGGCTCCAGTTGACTCTATCCAGGCAGAAGAG  444
            ||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  CCTTGACAACCGGGGAAACTGGTTACATTCCCAGCAATTACGTGGCTCCAGTTGACTCCATCCAGGCAGAAGAG  444

Query  445  TGGTACTTTGGAAAACTTGGCCGAAAAGATGCTGAGCGACAGCTATTGTCCTTTGGAAACCCAAGAGGTACCTT  518
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||..||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGTACTTTGGAAAACTTGGCCGCAAAGATGCTGAGAGACAGCTCCTGTCCTTTGGAAACCCAAGAGGTACCTT  518

Query  519  TCTTATCCGCGAGAGTGAAACCACCAAAGGTGCCTATTCACTTTCTATCCGTGATTGGGATGATATGAAAGGAG  592
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  TCTTATCCGCGAGAGCGAAACCACCAAAGGTGCCTACTCACTTTCCATCCGTGATTGGGATGATATGAAAGGGG  592

Query  593  ACCATGTCAAACATTATAAAATTCGCAAACTTGACAATGGTGGATACTACATTACCACCCGGGCCCAGTTTGAA  666
            ||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct  593  ACCACGTCAAACATTATAAAATCCGCAAGCTTGACAATGGTGGATACTATATCACAACGCGGGCCCAGTTTGAA  666

Query  667  ACACTTCAGCAGCTTGTACAACATTACTCA--------------------------------------------  696
            |||||||||||.||.|||||.|||||||||                                            
Sbjct  667  ACACTTCAGCAACTGGTACAGCATTACTCAGAGAAAGCTGATGGTTTGTGTTTTAACTTAACTGTGGTTTCATC  740

Query  697  --------------------------------------------------------------------------  696
                                                                                      
Sbjct  741  AAGTTGTACCCCACAAACTTCTGGATTGGCTAAAGATGCTTGGGAAGTTGCACGTGACTCGTTGTTTCTGGAGA  814

Query  697  --------------------------------------GGTACCTGGAATGGAAACACAAAAGTAGCCATAAAG  732
                                                  |||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGAAGCTGGGGCAGGGGTGTTTCGCTGAAGTGTGGCTTGGTACCTGGAATGGAAATACAAAAGTAGCCATAAAG  888

Query  733  ACTCTTAAACCAGGCACAATGTCCCCCGAATCATTCCTTGAGGAAGCGCAGATCATGAAGAAGCTGAAGCACGA  806
            ||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  889  ACCCTTAAGCCAGGCACCATGTCTCCGGAGTCCTTCCTGGAGGAGGCGCAGATCATGAAGAAGCTGAAGCATGA  962

Query  807  CAAGCTGGTCCAGCTCTATGCAGTGGTGTCTGAGGAGCCCATCTACATCGTCACCGAGTATATGAACAAAGGAA  880
            |||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||.||||||||
Sbjct  963  CAAGCTGGTGCAGCTCTACGCGGTCGTGTCTGAGGAGCCCATTTACATCGTCACGGAGTACATGAGCAAAGGAA  1036

Query  881  GTTTACTGGATTTCTTAAAAGATGGAGAAGGAAGAGCTCTGAAATTACCAAATCTTGTGGACATGGCAGCACAG  954
            ||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1037  GTTTGCTTGACTTCTTAAAAGATGGTGAAGGAAGAGCTCTGAAGTTGCCAAACCTTGTGGACATGGCGGCACAG  1110

Query  955  GTGGCTGCAGGAATGGCTTACATCGAGCGCATGAATTATATCCATAGAGATCTGCGATCAGCAAACATTCTAGT  1028
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTTGCTGCAGGAATGGCTTACATCGAGCGCATGAATTATATCCACAGAGATCTGCGATCAGCAAACATTCTAGT  1184

Query 1029  GGGGAATGGACTCATATGCAAGATTGCTGACTTCGGATTGGCCCGATTGATAGAAGACAATGAGTACACAGCAA  1102
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1185  GGGGAATGGACTAATTTGCAAGATTGCTGACTTTGGATTGGCTCGGTTGATTGAAGACAATGAATACACAGCAA  1258

Query 1103  GACAAGGTGCAAAGTTCCCCATCAAGTGGACGGCCCCCGAGGCAGCCCTGTACGGGAGGTTCACAATCAAGTCT  1176
            ||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GACAAGGTGCGAAGTTTCCCATTAAGTGGACAGCCCCCGAAGCGGCCCTGTATGGAAGGTTCACAATCAAGTCT  1332

Query 1177  GACGTGTGGTCTTTTGGAATCTTACTCACAGAGCTGGTCACCAAAGGAAGAGTGCCATACCCAGGCATGAACAA  1250
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GACGTATGGTCTTTTGGAATCTTACTCACAGAGCTGGTCACCAAAGGAAGAGTGCCATACCCAGGCATGAACAA  1406

Query 1251  CCGGGAGGTGCTGGAGCAGGTGGAGCGAGGCTACAGGATGCCCTGCCCGCAGGACTGCCCCATCTCTCTGCATG  1324
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1407  CCGGGAGGTGCTGGAGCAGGTGGAGAGAGGCTATAGGATGCCCTGCCCACAGGACTGCCCGATCTCCCTGCACG  1480

Query 1325  AGCTCATGATCCACTGCTGGAAAAAGGACCCTGAAGAACGCCCCACTTTTGAGTACTTGCAGAGCTTCCTGGAA  1398
            ||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||.||||||||||.
Sbjct 1481  AGCTCATGATCCACTGCTGGAAAAAGGATCCGGAAGAGCGCCCGACCTTCGAGTACTTGCAGGGCTTCCTGGAG  1554

Query 1399  GACTACTTTACCGCGACAGAGCCCCAGTACCAACCTGGTGAAAACC--  1444
            |||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||||  
Sbjct 1555  GACTACTTTACGGCCACAGAGCCCCAGTATCAGCCCGGTGAAAACCTG  1602