Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14673
• Subject: NM_001161724.1
• Aligned Length: 1356
• Identities: 1245
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGACGACATTTTCACTCAGTGCCGGGAGGGCAACGCAGTCGCCGTTCGCCTGTGGCTGGACAACACGGAGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||.||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGACGACATTTTCACTCAGTGCCGGGAGGGCAACGCGGTGGCGGTGCGCTTGTGGCTGGACAACACAGAGAA  74

Query   75  CGACCTCAACCAGGGGGACGATCATGGCTTCTCCCCCTTGCACTGGGCCTGCCGAGAGGGCCGCTCTGCTGTGG  148
            |||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct   75  CGACCTCAATCAGGGGGATGATCATGGCTTCTCCCCCTTGCACTGGGCCTGCCGAGAAGGCCGCTCTGCGGTGG  148

Query  149  TTGAGATGTTGATCATGCGGGGGGCACGGATCAATGTAATGAACCGTGGGGATGACACCCCCCTGCATCTGGCA  222
            ||||.|||.||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  149  TTGAAATGCTGATCATGCGTGGAGCACGGATTAATGTGATGAATCGTGGGGATGATACCCCCCTGCACCTGGCA  222

Query  223  GCCAGTCATGGACACCGTGATATTGTACAGAAGCTATTGCAGTACAAGGCAGACATCAATGCAGTGAATGAACA  296
            ||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  GCTAGTCATGGACACCGTGACATTGTACAGAAGCTGTTGCAATACAAGGCTGACATCAATGCAGTGAATGAGCA  296

Query  297  TGGGAATGTGCCCCTGCACTATGCCTGTTTTTGGGGCCAAGATCAAGTGGCAGAGGACCTGGTGGCAAATGGGG  370
            .||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  297  CGGCAATGTGCCACTTCACTATGCATGTTTCTGGGGCCAAGACCAGGTGGCAGAGGACCTGGTGGCTAACGGGG  370

Query  371  CCCTTGTCAGCATCTGTAACAAGTATGGAGAGATGCCTGTGGACAAAGCCAAGGCACCCCTGAGAGAGCTTCTC  444
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  371  CTCTTGTGAGCATCTGTAACAAGTATGGAGAGATGCCTGTGGACAAAGCCAAGGCACCCCTTAGAGAGCTTCTC  444

Query  445  CGAGAGCGGGCAGAGAAGATGGGCCAGAATCTCAACCGTATTCCATACAAGGACACATTCTGGAAGGGGACCAC  518
            |||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGAGAACGGGCAGAGAAAATGGGCCAGAATCTCAACCGTATTCCATACAAGGACACATTCTGGAAGGGGACCAC  518

Query  519  CCGCACTCGGCCCCGAAATGGAACCCTGAACAAACACTCTGGCATTGACTTCAAACAGCTTAACTTCCTGACGA  592
            .|||||..|||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|.|
Sbjct  519  TCGCACAAGGCCCCGAAATGGGACCCTGAACAAACACTCCGGTATTGACTTCAAACAGCTCAACTTTCTGGCAA  592

Query  593  AGCTCAACGAGAATCACTCTGGAGAGCTATGGAAGGGCCGCTGGCAGGGCAATGACATTGTCGTGAAGGTGCTG  666
            |||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct  593  AGCTCAATGAGAATCATTCTGGAGAGCTTTGGAAAGGCCGCTGGCAGGGCAATGATATTGTTGTGAAGGTGCTG  666

Query  667  AAGGTTCGAGACTGGAGTACAAGGAAGAGCAGGGACTTCAATGAAGAGTGTCCCCGGCTCAGGATTTTCTCGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  667  AAGGTTCGAGACTGGAGTACAAGGAAAAGCAGGGACTTCAATGAGGAATGTCCCCGGCTCAGGATTTTCTCACA  740

Query  741  TCCAAATGTGCTCCCAGTGCTAGGTGCCTGCCAGTCTCCACCTGCTCCTCATCCTACTCTCATCACACACTGGA  814
            .||.||.||||||||||||||||||||.||||||.||||.||.||.||.||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct  741  CCCTAACGTGCTCCCAGTGCTAGGTGCTTGCCAGGCTCCCCCAGCCCCCCACCCAACCCTCATCACACACTGGA  814

Query  815  TGCCATATGGATCCCTCTACAATGTACTACATGAAGGCACCAATTTCGTCGTGGACCAGAGCCAGGCTGTGAAG  888
            |||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  815  TGCCATATGGATCTCTCTACAATGTTCTACATGAAGGCACCAATTTCGTTGTGGACCAGAGCCAAGCTGTAAAG  888

Query  889  TTTGCTTTGGACATGGCAAGGGGCATGGCCTTCCTACACACACTAGAGCCCCTCATCCCACGACATGCACTCAA  962
            ||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||
Sbjct  889  TTTGCTTTGGACATGGCAAGAGGCATGGCTTTTCTTCACACACTAGAGCCTCTCATACCCCGGCATGCACTCAA  962

Query  963  TAGCCGTAGTGTAATGATTGATGAGGACATGACTGCCCGAATTAGCATGGCTGATGTCAAGTTCTCTTTCCAAT  1036
            ||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct  963  TAGCCGCAGTGTAATGATCGATGAAGATATGACTGCCCGAATCAGCATGGCTGATGTTAAGTTTTCTTTCCAGT  1036

Query 1037  GTCCTGGTCGCATGTATGCACCTGCCTGGGTAGCCCCCGAAGCTCTGCAGAAGAAGCCTGAAGACACAAACAGA  1110
            |.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCCCTGGGCGCATGTATGCGCCTGCCTGGGTGGCCCCTGAAGCCCTGCAGAAGAAGCCTGAAGACACAAACAGA  1110

Query 1111  CGCTCAGCAGACATGTGGAGTTTTGCAGTGCTTCTGTGGGAACTGGTGACACGGGAGGTACCCTTTGCTGACCT  1184
            |||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1111  CGCTCAGCAGACATGTGGAGTTTCGCGGTGCTTCTGTGGGAACTGGTGACACGAGAGGTGCCCTTTGCTGACCT  1184

Query 1185  CTCCAATATGGAGATTGGAATGAAGGTGGCATTGGAAGGCCTTCGGCCTACCATCCCACCAGGTATTTCCCCTC  1258
            |||.||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1185  CTCTAATATGGAGATTGGGATGAAGGTGGCACTGGAAGGCCTTCGGCCTACCATCCCACCAGGTATTTCCCCCC  1258

Query 1259  ATGTGTGTAAGCTCATGAAGATCTGCATGAATGAAGACCCTGCAAAGCGACCCAAATTTGACATGATTGTGCCT  1332
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATGTGTGTAAGCTCATGAAGATTTGCATGAATGAAGACCCTGCAAAGCGACCCAAGTTTGACATGATTGTGCCT  1332

Query 1333  ATCCTTGAGAAGATGCAGGACAAG  1356
            |||.|.||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATCTTGGAGAAGATGCAGGACAAG  1356