Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14689
- Subject:
- NM_001204426.2
- Aligned Length:
- 1946
- Identities:
- 1819
- Gaps:
- 115
Alignment
Query 1 ATGAGGTTGACGCTACTTTGTTGCACCTGGAGGGAAGAACGTATGGGAGAGGAAGGAAGCGAGTTGCCCGTGTG 74
.||| |||
Sbjct 1 ---------------------------------------------------------------ATGC---TGT- 7
Query 75 TGCAAGCTGCGGCC---AGAGGATCTATGATGGCCAGTACCTCCAGGCCCTGAACGCGGACTGGCACGCAGACT 145
|| |||.|.||| |||.|| .|||..|.|||||| |.||.||
Sbjct 8 TG---GCTTCAGCCCCAAGAAGA--------CGCCGCTTCCTCCA----------GAGGGCT------------ 48
Query 146 GCTTCAGGTGTTGTGACTGCAGTGCCTCCCTGTCGCACCAGTACTATGAGAAGGATGGGCAGCTCTTCTGCAAG 219
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 49 -----AAGTGTTGTGACTGCAGTGCCTCCCTGTCGCACCAGTACTATGAGAAGGATGGGCAGCTCTTCTGCAAG 117
Query 220 AAGGACTACTGGGCCCGCTATGGCGAGTCCTGCCATGGGTGCTCTGAGCAAATCACCAAGGGACTGGTTATGGT 293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 118 AAGGACTACTGGGCCCGCTATGGCGAGTCCTGCCATGGGTGCTCTGAGCAAATCACCAAGGGACTGGTTATGGT 191
Query 294 GGCTGGGGAGCTGAAGTACCACCCCGAGTGTTTCATCTGCCTCACGTGTGGGACCTTTATCGGTGACGGGGACA 367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 192 GGCTGGGGAGCTGAAGTACCACCCCGAGTGTTTCATCTGCCTCACGTGTGGGACCTTTATCGGTGACGGGGACA 265
Query 368 CCTACACGCTGGTGGAGCACTCCAAGCTGTACTGCGGGCACTGCTACTACCAGACTGTGGTGACCCCCGTCATC 441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 266 CCTACACGCTGGTGGAGCACTCCAAGCTGTACTGCGGGCACTGCTACTACCAGACTGTGGTGACCCCCGTCATC 339
Query 442 GAGCAGATCCTGCCTGACTCCCCTGGCTCCCACCTGCCCCACACCGTCACCCTGGTGTCCATCCCAGCCTCATC 515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 340 GAGCAGATCCTGCCTGACTCCCCTGGCTCCCACCTGCCCCACACCGTCACCCTGGTGTCCATCCCAGCCTCATC 413
Query 516 TCATGGCAAGCGTGGACTTTCAGTCTCCATTGACCCCCCGCACGGCCCACCGGGCTGTGGCACCGAGCACTCAC 589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 414 TCATGGCAAGCGTGGACTTTCAGTCTCCATTGACCCCCCGCACGGCCCACCGGGCTGTGGCACCGAGCACTCAC 487
Query 590 ACACCGTCCGCGTCCAGGGAGTGGATCCCGGGCTGCATGAGCCCAGATGTGAAGAATTCCATCCACGTCGGAGA 663
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 488 ACACCGTCCGCGTCCAGGGAGTGGAT-CCGGGCTGCATGAGCCCAGATGTGAAGAATTCCATCCACGTCGGAGA 560
Query 664 CCGGATCTTGGAAATCAATGGCACGCCCATCCGAAATGTGCCCCTGGACGAGATTGACCTGCTGATTCAGGAAA 737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 561 CCGGATCTTGGAAATCAATGGCACGCCCATCCGAAATGTGCCCCTGGACGAGATTGACCTGCTGATTCAGGAAA 634
Query 738 CCAGCCGCCTGCTCCAGCTGACCCTCGAGCATGACCCTCACGATACACTGGGCCACGGGCTGGGGCCTGAGACC 811
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 635 CCAGCCGCCTGCTCCAGCTGACCCTCGAGCATGACCCTCACGATACACTGGGCCACGGGCTGGGGCCTGAGACC 708
Query 812 AGCCCCCTGAGCTCTCCGGCTTATACTCCCAGCGGGGAGGCGGGCAGCTCTGCCCGGCAGAAACCTGTCTTGAG 885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 709 AGCCCCCTGAGCTCTCCGGCTTATACTCCCAGCGGGGAGGCGGGCAGCTCTGCCCGGCAGAAACCTGTCTTGAG 782
Query 886 GAGCTGCAGCATCGACAGGTCTCCGGGCGCTGGCTCACTGGGCTCCCCGGCCTCCCAGCGCAAGGACCTGGGTC 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 783 GAGCTGCAGCATCGACAGGTCTCCGGGCGCTGGCTCACTGGGCTCCCCGGCCTCCCAGCGCAAGGACCTGGGTC 856
Query 960 GCTCTGAGTCCCTCCGCGTAGTCTGCCGGCCACACCGCATCTTCCGGCCGTCGGACCTCATCCACGGGGAGGTG 1033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 857 GCTCTGAGTCCCTCCGCGTAGTCTGCCGGCCACACCGCATCTTCCGGCCGTCGGACCTCATCCACGGGGAGGTG 930
Query 1034 CTGGGCAAGGGCTGCTTCGGCCAGGCTATCAAGGTGACACACCGTGAGACAGGTGAGGTGATGGTGATGAAGGA 1107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 931 CTGGGCAAGGGCTGCTTCGGCCAGGCTATCAAGGTGACACACCGTGAGACAGGTGAGGTGATGGTGATGAAGGA 1004
Query 1108 GCTGATCCGGTTCGACGAGGAGACCCAGAGGACGTTCCTCAAGGAGGTGAAGGTCATGCGATGCCTGGAACACC 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1005 GCTGATCCGGTTCGACGAGGAGACCCAGAGGACGTTCCTCAAGGAGGTGAAGGTCATGCGATGCCTGGAACACC 1078
Query 1182 CCAACGTGCTCAAGTTCATCGGGGTGCTCTAC-AGGAC-AGA-GCTCA--CTCATCACTGAGTACATCAAAGGG 1250
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| .||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1079 CCAACGTGCTCAAGTTCATCGGGGTGCTCTACAAGGACAAGAGGCTCAACTTCATCACTGAGTACATC-AAGGG 1151
Query 1251 CGGCACGCTCCGGGGCATCATCAAGAGCATGGACAGCCAGTACCCATGGAGCCAGAGAGTGAGCTTTGCCAAGG 1324
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1152 CGGCACGCTCCGGGGCATCATCAAGAGCATGGACAGCCAGTACCCATGGAGCCAGAGAGTGAGCTTTGCCAAGG 1225
Query 1325 ACATCGCATCAGGGATGGCCTACCTCCACTCCATGAACATCATCCACCGAGACCTCAACTCCCACAACTGCCTG 1398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1226 ACATCGCATCAGGGATGGCCTACCTCCACTCCATGAACATCATCCACCGAGACCTCAACTCCCACAACTGCCTG 1299
Query 1399 GTCCGCGAGAACAAGAATGTGGTGGTGGCTGACTTCGGGCTGGCGCGTCTCATGGTGGACGAGAAGACTCAGCC 1472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1300 GTCCGCGAGAACAAGAATGTGGTGGTGGCTGACTTCGGGCTGGCGCGTCTCATGGTGGACGAGAAGACTCAGCC 1373
Query 1473 TGAGGGCCTGCGGAGCCTCAAGAAGCCAGACCGCAAGAAGCGCTACACCGTGGTGGGCAACCCCTACTGGATGG 1546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1374 TGAGGGCCTGCGGAGCCTCAAGAAGCCAGACCGCAAGAAGCGCTACACCGTGGTGGGCAACCCCTACTGGATGG 1447
Query 1547 CACCTGAGATGATCAACGGCCGCAGCTATGATGAGAAGGTGGATGTGTTCTCCTTTGGGATCGTCCTGTGCGAG 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1448 CACCTGAGATGATCAACGGCCGCAGCTATGATGAGAAGGTGGATGTGTTCTCCTTTGGGATCGTCCTGTGCGAG 1521
Query 1621 ATCATCGGGCGGGTGAACGCAGACCCTGACTACCTGCCCCGCACCATGGACTTTGGCCTCAACGTGCGAGGATT 1694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1522 ATCATCGGGCGGGTGAACGCAGACCCTGACTACCTGCCCCGCACCATGGACTTTGGCCTCAACGTGCGAGGATT 1595
Query 1695 CCTGGACCGCTACTGCCCCCCAAACTGCCCCCCGAGCTTCTTCCCCATCACCGTGCGCTGTTGCGATCTGGACC 1768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1596 CCTGGACCGCTACTGCCCCCCAAACTGCCCCCCGAGCTTCTTCCCCATCACCGTGCGCTGTTGCGATCTGGACC 1669
Query 1769 CCGAGAAGAGGCCATCCTTTGTGAAGCTGGAACACTGGCTGGAGACCCTCCGCATGCACCTGGCCGGCCACCTG 1842
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1670 CCGAGAAGAGGCCATCCTTTGTGAAGCTGGAACACTGGCTGGAGACCCTCCGCATGCACCTGGCCGGCCACCTG 1743
Query 1843 CCACTGGGCCCACAGCTGGAGCAGCTGGACAGAGGTTTCTGGGAGACCTACCGGCGCGGCGAGAGCGGACTGCC 1916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1744 CCACTGGGCCCACAGCTGGAGCAGCTGGACAGAGGTTTCTGGGAGACCTACCGGCGCGGCGAGAGCGGACTGCC 1817
Query 1917 TGCCCACCCTGAGGTCCCCGAC 1938
||||||||||||||||||||||
Sbjct 1818 TGCCCACCCTGAGGTCCCCGAC 1839