Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14689
- Subject:
- NM_001305875.1
- Aligned Length:
- 1982
- Identities:
- 1631
- Gaps:
- 109
Alignment
Query 1 ATGAGGTTGACGCTACTTTGTTGCACCTGGAGGGAAGAACGTATGGGAGAGGAAG--GAAGCGAGTTG---CCC 69
|||| ||||| .|.||.|| | |||
Sbjct 1 ------------------------------------------ATGG----GGAAGCTTAGGCCAG--GCCACCC 26
Query 70 GTGTG----TGCA-------AG---CTGCGGCCAGAGGATCT----ATGATG--GCCAGTACCTCCAGGCCCTG 123
.||.| |.|| || ||.|||.||||| || |.|||| ||||| ||| .|||||||
Sbjct 27 ATGGGCTCCTCCAGACCTCCAGAGTCTCCGGACAGAG---CTGCAGAGGATGCAGCCAG--CCT--TGGCCCTG 93
Query 124 AACGCGGACTGGCACGCAGACT-------------GCTTCAGGTGTTGTGACTGCAGTGCCTCCCTGTCGCACC 184
| ||..|.|.|||.|.|| ||| |.|||.||.||.||.||.|.||||||.||.||||
Sbjct 94 A-----GAAGGACCCGCTGCCTCCACCTCCGTGGGGCT--AAGTGCTGCGAGTGTAGCGTCTCCCTTTCACACC 160
Query 185 AGTACTATGAGAAGGATGGGCAGCTCTTCTGCAAGAAGGACTACTGGGCCCGCTATGGCGAGTCCTGCCATGGG 258
|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 161 AGTACTACGAGAAGGATGGACAGCTCTTCTGCAAGAAGGACTACTGGGCCCGCTATGGCGAGTCTTGCCACGGG 234
Query 259 TGCTCTGAGCAAATCACCAAGGGACTGGTTATGGTGGCTGGGGAGCTGAAGTACCACCCCGAGTGTTTCATCTG 332
|||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 235 TGCTCCGAGCACATCACCAAAGGGCTGGTCATGGTGGCTGGGGAGCTGAAGTACCACCCTGAGTGTTTCATCTG 308
Query 333 CCTCACGTGTGGGACCTTTATCGGTGACGGGGACACCTACACGCTGGTGGAGCACTCCAAGCTGTACTGCGGGC 406
||||.|.|||||.|.|||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 309 CCTCGCCTGTGGAAACTTCATTGGCGATGGGGACACCTACACACTGGTGGAGCACTCCAAGCTGTACTGTGGCC 382
Query 407 ACTGCTACTACCAGACTGTGGTGACCCCCGTCATCGAGCAGATCCTGCCTGACTCCCCTGGCTCCCACCTGCCC 480
|.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 383 AGTGCTACTACCAGACCGTGGTAACTCCAGTCATCGAACAGATCCTACCTGACTCACCCGGCTCCCACCTGCCC 456
Query 481 CACACCGTCACCCTGGTGTCCATCCCAGCCTCATCTCATGGCAAGCGTGGACTTTCAGTCTCCATTGACCCCCC 554
|||||.||||||||.|||||.|||||||||||..|.||||||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 457 CACACAGTCACCCTCGTGTCTATCCCAGCCTCTGCCCATGGCAAACGAGGCCTGTCTGTCTCCATCGACCCCCC 530
Query 555 GCACGGCCCACCGGGCTGTGGCACCGAGCACTCACACACCGTCCGCGTCCAGGGAGTGGATCCCGGGCTGCATG 628
.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||| |||.|||||||||
Sbjct 531 TCACGGCCCACCAGGATGTGGCACGGAGCATTCGCACACTGTCCGAGTCCAAGGAGTGGA-CCCAGGCTGCATG 603
Query 629 AGCCCAGATGTGAAGAATTCCATCCACGTCGGAGACCGGATCTTGGAAATCAATGGCACGCCCATCCGAAATGT 702
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 604 AGCCCAGATGTGAAGAATTCCATCCACGTTGGAGACCGGATCTTGGAAATCAATGGCACGCCCATCCGGAATGT 677
Query 703 GCCCCTGGACGAGATTGACCTGCTGATTCAGGAAACCAGCCGCCTGCTCCAGCTGACCCTCGAGCATGACCCTC 776
|||.|||||||||||.|||.|||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 678 GCCGCTGGACGAGATCGACTTGCTGATCCAGGAGACCAGCCGCCTGCTCCAGCTGACCCTCGAGCACGACCCCC 751
Query 777 ACGATACACTGGGCCACGGGCTGGGGCCTGAGACCAGCCCCCTGAGCTCTCCGGCTTATACTCCCAGCGGGGAG 850
|.||..||||||||||.||||..|.|.|.||..||||||||||||||||.||||...|.|||||||||||..||
Sbjct 752 ATGACTCACTGGGCCATGGGCCCGTGTCGGATCCCAGCCCCCTGAGCTCCCCGGTGCACACTCCCAGCGGACAG 825
Query 851 GCGGGCAGCTCTGCCCGGCAGAAACCTGTCTTGAGGAGCTGCAGCATCGACAGGTCTCCGGGCGCTGGCTCACT 924
||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.|||.|||||..|..|||||||
Sbjct 826 GCAGCCAGCTCTGCCCGGCAGAAACCTGTCTTGAGGAGCTGCAGTATTGACACGTCCCCGGGTACCAGCTCACT 899
Query 925 GGGCTCCCCGGCCTCCCAGCGCAAGGACCTGGGTCGCTCTGAGTCCCTCCGCGTAGTCTGCCGGCCACACCGCA 998
.|.|||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 900 AGCCTCTCCAGCCTCCCAGCGCAAGGACCTGGGTCGCTCCGAATCCCTCCGAGTGGTCTGCCGACCACACCGAA 973
Query 999 TCTTCCGGCCGTCGGACCTCATCCACGGGGAGGTGCTGGGCAAGGGCTGCTTCGGCCAGGCTATCAAGGTGACA 1072
||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 974 TCTTCCGGCCATCTGATCTCATCCATGGGGAAGTGCTGGGCAAGGGCTGTTTTGGCCAGGCCATCAAGGTGACA 1047
Query 1073 CACCGTGAGACAGGTGAGGTGATGGTGATGAAGGAGCTGATCCGGTTCGACGAGGAGACCCAGAGGACGTTCCT 1146
|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1048 CACCGAGAAACAGGCGAGGTGATGGTGATGAAGGAACTTATCCGGTTTGATGAGGAGACCCAGAGGACATTCCT 1121
Query 1147 CAAGGAGGTGAAGGTCATGCGATGCCTGGAACACCCCAACGTGCTCAAGTTCATCGGGGTGCTCTAC-AGGACA 1219
|||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||| ||||||
Sbjct 1122 CAAGGAGGTAAAGGTCATGCGCTGCCTGGAGCACCCTAACGTGCTCAAGTTCATCGGAGTGCTCTACAAGGACA 1195
Query 1220 GA---GCTCA--CTCATCACTGAGTACATCAAAGGGCGGCACGCTCCGGGGCATCATCAAGAGCATGGACAGCC 1288
| |||.| .|||||||.||||||||| |||||||||||.||.||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1196 -AGCGGCTAAACTTCATCACAGAGTACATC-AAGGGCGGCACCCTGCGGGGCATCATCAAGAACATGGACAGCC 1267
Query 1289 AGTACCCATGGAGCCAGAGAGTGAGCTTTGCCAAGGACATCGCATCAGGGATGGCCTACCTCCACTCCATGAAC 1362
|||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1268 AGTACCCGTGGAGTCAGAGGGTCAGCTTTGCCAAGGACATTGCATCAGGGATGGCCTACCTCCATTCGATGAAC 1341
Query 1363 ATCATCCACCGAGACCTCAACTCCCACAACTGCCTGGTCCGCGAGAACAAGAATGTGGTGGTGGCTGACTTCGG 1436
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|.|||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 1342 ATCATCCACCGAGACCTCAACTCCCACAACTGTCTGGTCCGTGAGAATAGGAACGTGGTGGTGGCCGACTTTGG 1415
Query 1437 GCTGGCGCGTCTCATGGTGGACGAGAAGACTCAGCCTGAGGGCCTGCGGAGCCTCAAGAAGCCAGACCGCAAGA 1510
||||||.||.||||||.|.||.||.||||.||||.||||.|.|.|.||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1416 GCTGGCTCGACTCATGATCGATGAAAAGAATCAGTCTGAAGACTTACGCAGCCTTAAGAAGCCGGACCGCAAGA 1489
Query 1511 AGCGCTACACCGTGGTGGGCAACCCCTACTGGATGGCACCTGAGATGATCAACGGCCGCAGCTATGATGAGAAG 1584
||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.|||
Sbjct 1490 AGCGGTACACAGTGGTGGGCAACCCCTACTGGATGGCGCCAGAGATGATCAATGGTCGTAGTTATGATGAAAAG 1563
Query 1585 GTGGATGTGTTCTCCTTTGGGATCGTCCTGTGCGAGATCATCGGGCGGGTGAACGCAGACCCTGACTACCTGCC 1658
|||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1564 GTGGACGTGTTTTCCTTTGGAATTGTCCTCTGTGAGATTATCGGGCGTGTGAATGCAGACCCTGACTATCTGCC 1637
Query 1659 CCGCACCATGGACTTTGGCCTCAACGTGCGAGGATTCCTGGACCGCTACTGCCCCCCAAACTGCCCCCCGAGCT 1732
||||||.|||||||||||||||||.||..|.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|
Sbjct 1638 CCGCACTATGGACTTTGGCCTCAATGTAAGGGGTTTCCTGGACCGCTACTGTCCACCAAACTGTCCCCCAAGTT 1711
Query 1733 TCTTCCCCATCACCGTGCGCTGTTGCGATCTGGACCCCGAGAAGAGGCCATCCTTTGTGAAGCTGGAACACTGG 1806
|||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1712 TCTTCCCCATCACTGTGCGCTGCTGTGACCTGGATCCTGAAAAGAGACCCTCTTTTGTAAAGCTGGAACAATGG 1785
Query 1807 CTGGAGACCCTCCGCATGCACCTGGCCGGCCACCTGCCACTGGGCCCACAGCTGGAGCAGCTGGACAGAGGTTT 1880
||.||.||.||.|||||||||.||.|.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||..|.||.||
Sbjct 1786 CTAGAAACACTTCGCATGCACTTGTCTGGTCACCTGCCACTGGGCCCACAACTGGAACAACTGGAGCGGGGCTT 1859
Query 1881 CTGGGAGACCTACCGGCGCGGCGAGAGCGGACTGCCTGCCCACCCTGAGGTCCCCGAC 1938
||||||||||||||||||.|||||||||..|||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1860 CTGGGAGACCTACCGGCGGGGCGAGAGCTCACTGCCTGCCCACCCCGAGGTCCCTGAC 1917