Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14719
• Subject: NM_001204375.2
• Aligned Length: 1625
• Identities: 1620
• Gaps: 2

Alignment

Query    1  ATGCCGTCTCTGCTGGTGGCGCACATTCTCCCCGTGCGTACTACTCGGCTGGGCGTTGCTGGCCGGCGGCACCG  74
            ||||||||||||||||| ||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCGTCTCTGCTGGT-GCTCACTTTCTCCCCGTGCGTACTACTCGGCTGGGCGTTGCTGGCCGGCGGCACCG  73

Query   75  GTGGCGGTGGCGTTGGCGGCGGCGGCGGTGGCGCGGGCATAGGCGGCGGACGCCAGGAGAGAGAGGCGCTGCCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   74  GTGGCGGTGGCGTTGGCGGCGGCGGCGGTGGCGCGGGCATAGGCGGCGGACGCCAGGAGAGAGAGGCGCTGCCG  147

Query  149  CCACAGAAGATCGAGGTGCTGGTGTTACTGCCCCAGGATGACTCGTACTTGTTTTCACTCACCCGGGTGCGGCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  CCACAGAAGATCGAGGTGCTGGTGTTACTGCCCCAGGATGACTCGTACTTGTTTTCACTCACCCGGGTGCGGCC  221

Query  223  GGCCATCGAGTATGCTCTGCGCAGCGTGGAGGGCAACGGGACTGGGAGGCGGCTTCTGCCGCCGGGCACTCGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  GGCCATCGAGTATGCTCTGCGCAGCGTGGAGGGCAACGGGACTGGGAGGCGGCTTCTGCCGCCGGGCACTCGCT  295

Query  297  TCCAGGTGGCTTACGAGGATTCAGACTGTGGGAACCGTGCGCTCTTCAGCTTGGTGGACCGCGTGGCGGCGGCG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  TCCAGGTGGCTTACGAGGATTCAGACTGTGGGAACCGTGCGCTCTTCAGCTTGGTGGACCGCGTGGCGGCGGCG  369

Query  371  CGGGGCGCCAAGCCAGACCTTATCCTGGGGCCAGTGTGCGAGTATGCAGCAGCGCCAGTGGCCCGGCTTGCATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  CGGGGCGCCAAGCCAGACCTTATCCTGGGGCCAGTGTGCGAGTATGCAGCAGCGCCAGTGGCCCGGCTTGCATC  443

Query  445  GCACTGGGACCTGCCCATGCTGTCGGCTGGGGCGCTGGCCGCTGGCTTCCAGCACAAGGACTCTGAGTACTCGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  GCACTGGGACCTGCCCATGCTGTCGGCTGGGGCGCTGGCCGCTGGCTTCCAGCACAAGGACTCTGAGTACTCGC  517

Query  519  ACCTCACGCGCGTGGCGCCCGCCTACGCCAAGATGGGCGAGATGATGCTCGCCCTGTTCCGCCACCACCACTGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  ACCTCACGCGCGTGGCGCCCGCCTACGCCAAGATGGGCGAGATGATGCTCGCCCTGTTCCGCCACCACCACTGG  591

Query  593  AGCCGCGCTGCACTGGTCTACAGCGACGACAAGCTGGAGCGGAACTGCTACTTCACCCTCGAGGGGGTCCACGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  AGCCGCGCTGCACTGGTCTACAGCGACGACAAGCTGGAGCGGAACTGCTACTTCACCCTCGAGGGGGTCCACGA  665

Query  667  GGTCTTCCAGGAGGAGGGTTTGCACACGTCCATCTACAGTTTCGACGAGACCAAAGACTTGGATCTGGAAGACA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  GGTCTTCCAGGAGGAGGGTTTGCACACGTCCATCTACAGTTTCGACGAGACCAAAGACTTGGATCTGGAAGACA  739

Query  741  TCGTGCGCAATATCCAGGCCAGTGAGAGAGTGGTGATCATGTGTGCGAGCAGTGACACCATCCGGAGCATCTCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| .|
Sbjct  740  TCGTGCGCAATATCCAGGCCAGTGAGAGAGTGGTGATCATGTGTGCGAGCAGTGACACCATCCGGAGCATC-AT  812

Query  815  GCTGGTGGCGCACAGGCATGGCATGACCAGTGGAGACTACGCCTTCTTCAACATTGAGCTCTTCAACAGCTCTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  GCTGGTGGCGCACAGGCATGGCATGACCAGTGGAGACTACGCCTTCTTCAACATTGAGCTCTTCAACAGCTCTT  886

Query  889  CCTATGGAGATGGCTCATGGAAGAGAGGAGACAAACACGACTTTGAAGCTAAGCAAGCATACTCGTCCCTCCAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  CCTATGGAGATGGCTCATGGAAGAGAGGAGACAAACACGACTTTGAAGCTAAGCAAGCATACTCGTCCCTCCAG  960

Query  963  ACAGTCACTCTACTGAGGACAGTGAAACCTGAGTTTGAGAAGTTTTCCATGGAGGTGAAAAGTTCAGTTGAGAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  ACAGTCACTCTACTGAGGACAGTGAAACCTGAGTTTGAGAAGTTTTCCATGGAGGTGAAAAGTTCAGTTGAGAA  1034

Query 1037  ACAAGGGCTCAATATGGAGGATTACGTTAACATGTTTGTTGAAGGATTCCACGATGCCATCCTCCTCTACGTCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  ACAAGGGCTCAATATGGAGGATTACGTTAACATGTTTGTTGAAGGATTCCACGATGCCATCCTCCTCTACGTCT  1108

Query 1111  TGGCTCTACATGAAGTACTCAGAGCTGGTTACAGCAAAAAGGATGGAGGGAAAATTATACAGCAGACTTGGAAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  TGGCTCTACATGAAGTACTCAGAGCTGGTTACAGCAAAAAGGATGGAGGGAAAATTATACAGCAGACTTGGAAC  1182

Query 1185  AGAACATTTGAAGGTATCGCCGGGCAGGTGTCCATAGATGCCAACGGAGACCGATATGGGGATTTCTCTGTGAT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183  AGAACATTTGAAGGTATCGCCGGGCAGGTGTCCATAGATGCCAACGGAGACCGATATGGGGATTTCTCTGTGAT  1256

Query 1259  TGCCATGACTGATGTGGAGGCGGGCACCCAGGAGGTTATTGGTGATTATTTTGGAAAAGAAGGTCGTTTTGAAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257  TGCCATGACTGATGTGGAGGCGGGCACCCAGGAGGTTATTGGTGATTATTTTGGAAAAGAAGGTCGTTTTGAAA  1330

Query 1333  TGCGGCCGAATGTCAAATATCCTTGGGGCCCTTTAAAACTGAGAATAGATGAAAACCGAATTGTAGAGCATACA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331  TGCGGCCGAATGTCAAATATCCTTGGGGCCCTTTAAAACTGAGAATAGATGAAAACCGAATTGTAGAGCATACA  1404

Query 1407  AACAGCTCTCCCTGCAAATCATCAGGTGGCCTAGAAGAATCGGCAGTGACAGGAATTGTCGTGGGGGCTTTACT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405  AACAGCTCTCCCTGCAAATCATCAGGTGGCCTAGAAGAATCGGCAGTGACAGGAATTGTCGTGGGGGCTTTACT  1478

Query 1481  AGGAGCTGGCTTGCTAATGGCCTTCTACTTTTTCAGGAAGAAATACAGAATAACCATTGAGAGGCGAACCCAGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1479  AGGAGCTGGCTTGCTAATGGCCTTCTACTTTTTCAGGAAGAAATACAGAATAACCATTGAGAGGCGAACCCAGC  1552

Query 1555  AAGAAGAAAGTAACCTTGGAAAACATCGGGAATTACGGGAAGATTCCATCAGATCCCATTTTTCAGTAGCT  1625
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553  AAGAAGAAAGTAACCTTGGAAAACATCGGGAATTACGGGAAGATTCCATCAGATCCCATTTTTCAGTAGCT  1623