Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14720
• Subject: XM_006501124.2
• Aligned Length: 2392
• Identities: 2028
• Gaps: 35

Alignment

Query    1  ATGCTGCGAGGCGGACGGCGCGGGCAGCTTGGCTGGCACAGCTGGGCTGCGGGGCCGGGCAGCCTGCTGGCTTG  74
            ||||||||||||...||||.|||||||||.||||||||..||..|||.|||||||..|||||.|||.||.|||.
Sbjct    1  ATGCTGCGAGGCCAGCGGCTCGGGCAGCTGGGCTGGCATCGCCCGGCCGCGGGGCTAGGCAGTCTGATGACTTC  74

Query   75  GCTGATACTGGCATCTGCGGGCGCCGCACCCTGCCCCGATGCCTGCTGCCCCCACGGCTCCTCGGGACTGCGAT  148
            |.||||.|||||.|.|||...|||||||.||||.|.|||.|.||||||.|||...|||.|||||||.|||||.|
Sbjct   75  GTTGATGCTGGCCTGTGCCTCCGCCGCATCCTGTCGCGAGGTCTGCTGTCCCGTGGGCCCCTCGGGGCTGCGCT  148

Query  149  GCACCCGGGATGGGGCCCTGGATAGCCTCCACCACCTGCCCGGCGCAGAGAACCTGACTGAGCTCTACATCGAG  222
            |||||.|||..|||.|||||||||.|||||.|..|||||..|||||.|.|||||||||.|||||||||.|.||.
Sbjct  149  GCACCAGGGCAGGGTCCCTGGATACCCTCCGCGGCCTGCGGGGCGCCGGGAACCTGACGGAGCTCTACGTGGAA  222

Query  223  AACCAGCAGCATCTGCAGCATCTGGAGCTCCGTGATCTGAGGGGCCTGGGGGAGCTGAGAAACCTCACCATCGT  296
            |||||||||||.|||||.|...|||||.|....||.|||..|||||||||||||.||||||.|||.||||||||
Sbjct  223  AACCAGCAGCACCTGCAACGCTTGGAGTTTGAGGACCTGCAGGGCCTGGGGGAGTTGAGAAGCCTAACCATCGT  296

Query  297  GAAGAGTGGTCTCCGTTTCGTGGCGCCAGATGCCTTCCATTTCACTCCTCGGCTCAGTCGCCTGAATCTCTCCT  370
            |||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct  297  GAAGAGTGGCCTCCGCTTTGTGGCCCCAGATGCCTTCCGTTTCACCCCTCGGCTCAGTCACCTGAATCTGTCCT  370

Query  371  TCAACGCTCTGGAGTCTCTCTCCTGGAAAACTGTGCAGGGCCTCTCCTTACAGGAACTGGTCCTGTCGGGGAAC  444
            .|||.||..|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||..||||||.||||||
Sbjct  371  CCAATGCGTTGGAGTCCCTCTCCTGGAAAACTGTGCAGGGCCTCTCCCTACAGGACCTGACCCTGTCAGGGAAC  444

Query  445  CCTCTGCACTGTTCTTGTGCCCTGCGCTGGCTACAGCGCTGGGAGGAGGAGGGACTGGGCGGAGTGCCTGAACA  518
            ||.|||||.|||||.|||||||||..||||||.|||||.||||||.||||.||.|||.|.||.||||.|..|||
Sbjct  445  CCACTGCATTGTTCCTGTGCCCTGTTCTGGCTCCAGCGTTGGGAGCAGGAAGGGCTGTGTGGTGTGCATACACA  518

Query  519  GAAGCTGCAGTG--TCATGGGCAAGGGCCCCTGG------------CCCACATG---CCCAATGCCAGCTGTGG  575
            ||.|||.|| ||  || ||||        |||||            ||||| ||   |.|||..||||.|||||
Sbjct  519  GACGCTTCA-TGACTC-TGGG--------CCTGGAGACCAGTTCCTCCCAC-TGGGACACAACACCAGTTGTGG  581

Query  576  TGTGCCCACGCTGAAGGTCCAGGTGCCCAATGCCTCGGTGGATGTGGGGGACGACGTGCTGCTGCGGTGCCAGG  649
            |||.|||||..|||||.|||||.|||||||||.|||.|||||.|||||.||.||||||.|.||||.||||||||
Sbjct  582  TGTACCCACAGTGAAGATCCAGATGCCCAATGACTCTGTGGAAGTGGGCGATGACGTGTTTCTGCAGTGCCAGG  655

Query  650  TGGAGGGGCGGGGCCTGGAGCAGGCCGGCTGGATCCTCACAGAGCTGGAGCAGTCAGCCACGGTGATGAAATCT  723
            |||||||||.||.|||..|||||||.|.|||||||||||||||||||||...|.|||||||.||||.|||||.|
Sbjct  656  TGGAGGGGCTGGCCCTACAGCAGGCTGACTGGATCCTCACAGAGCTGGAAGGGGCAGCCACCGTGAAGAAATTT  729

Query  724  GGGGGTCTGCCATCCCTGGGGCTGACCCTGGCCAATGTCACCAGTGACCTCAACAGGAAGAACGTGACGTGCTG  797
            ||.|.||||||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct  730  GGAGATCTGCCATCCCTGGGGCTGATTCTGGTCAATGTCACCAGTGATCTCAACAAGAAGAATGTGACGTGCTG  803

Query  798  GGCAGAGAACGATGTGGGCCGGGCAGAGGTCTCTGTTCAGGTCAACGTCTCCTTCCCGGCCAGTGTGCAGCTGC  871
            |||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||.||||||||||||.|||||||||||.|||.
Sbjct  804  GGCAGAGAATGATGTGGGCCGGGCCGAGGTCTCTGTCCAAGTCAGCGTCTCCTTCCCAGCCAGTGTGCACCTGG  877

Query  872  ACACGGCGGTGGAGATGCACCACTGGTGCATCCCCTTCTCTGTGGATGGGCAGCCGGCACCGTCTCTGCGCTGG  945
            .|...|||||||||..|||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  878  GCCTAGCGGTGGAGCAGCATCATTGGTGCATCCCCTTCTCGGTGGACGGGCAGCCAGCACCGTCTCTGCGCTGG  951

Query  946  CTCTTCAATGGCTCCGTGCTCAATGAGACCAGCTTCATCTTCACTGAGTTCCTGGAGCCGGCAG----CCAATG  1015
            .|.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||.|||||.|.|| |    |.||||
Sbjct  952  TTGTTCAACGGCTCTGTGCTCAACGAGACCAGTTTCATCTTCACTCAGTTCTTGGAGTCTGC-GCTGACTAATG  1024

Query 1016  AGACCGTGCGGCACGGGTGTCTGCGCCTCAACCAGCCCACCCACGTCAACAACGGCAACTACACGCTGCTGGCT  1089
            |||||.||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.
Sbjct 1025  AGACCATGCGGCACGGCTGCCTGCGCCTCAATCAGCCCACGCATGTCAACAACGGGAACTACACCCTGCTGGCG  1098

Query 1090  GCCAACCCCTTCGGCCAGGCCTCCGCCTCCATCATGGCTGCCTTCATGGACAACCCTTTCGAGTTCAACCCCGA  1163
            ||||||||||.|||||||||..||||||||.||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1099  GCCAACCCCTACGGCCAGGCTGCCGCCTCCGTCATGGCTGCTTTTATGGACAACCCTTTTGAGTTCAACCCTGA  1172

Query 1164  GGACCCCATCCCTGACACTAACAGCACATCTGGAGACCCGGTGGAGAAGAAGGACGAAACACCTTTTGGGGTCT  1237
            ||||||||||||||||..||||||||||||..|||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1173  GGACCCCATCCCTGACGGTAACAGCACATCAAGAGACCCAGTGGAGAAGAAAGATGAAACCCCTTTTGGGGTCT  1246

Query 1238  CGGTGGCTGTGGGCCTGGCCGTCTTTGCCTGCCTCTTCCTTTCTACGCTGCTCCTTGTGCTCAACAAATGTGGA  1311
            |.||||||||||||||.|||||||.||||..|||||||||||||.|.||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1247  CTGTGGCTGTGGGCCTAGCCGTCTCTGCCGCCCTCTTCCTTTCTGCCCTCCTTCTTGTGCTCAACAAATGTGGA  1320

Query 1312  CGGAGAAACAAGTTTGGGATCAACCGCCCGGCTGTGCTGGCTCCAGAGGATGGGCTGGCCATGTCCCTGCATTT  1385
            |.|||.|.|||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1321  CAGAGGAGCAAATTTGGGATCAACCGCCCTGCTGTATTAGCTCCAGAGGATGGGCTGGCCATGTCCCTACACTT  1394

Query 1386  CATGACATTGGGTGGCAGCTCCCTGTCCCCCACCGAGGGCAAAGGCTCTGGGCTCCAAGGCCACATCATCGAGA  1459
            |||||||.||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1395  CATGACACTGGGTGGCAGTTCTCTTTCCCCTACTGAGGGCAAAGGCTCCGGACTCCAGGGCCACATCATGGAGA  1468

Query 1460  ACCCACAATACTTCAGTGATGCCTGTGTTCACCACATCAAGCGCCGGGACATCGTGCTCAAGTGGGAGCTGGGG  1533
            |||||||.||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||||.|||||||.|.||||||||||||||.|||
Sbjct 1469  ACCCACAGTACTTCAGTGATACCTGTGTCCATCACATCAAGCGCCAGGACATCATTCTCAAGTGGGAGCTAGGG  1542

Query 1534  GAGGGCGCCTTTGGGAAGGTCTTCCTTGCTGAGTGCCACAACCTCCTGCCTGAGCAGGACAAGATGCTGGTGGC  1607
            |||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||.|||||||.|||..|||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1543  GAGGGAGCCTTTGGAAAGGTCTTTCTCGCTGAGTGCTACAACCTTCTGAATGATCAGGACAAGATGCTCGTGGC  1616

Query 1608  TGTCAAGGCACTGAAGGAGGCGTCCGAGAGTGCTCGGCAGGACTTCCAGCGTGAGGCTGAGCTGCTCACCATGC  1681
            |||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1617  TGTCAAGGCACTGAAGGAGGCATCCGAGAATGCTCGGCAGGACTTTCAGCGTGAGGCCGAGCTGCTCACCATGC  1690

Query 1682  TGCAGCACCAGCACATCGTGCGCTTCTTCGGCGTCTGCACCGAGGGCCGCCCCCTGCTCATGGTCTTTGAGTAT  1755
            |.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..||||..|||||||||||||||||||.
Sbjct 1691  TACAGCACCAGCACATCGTGCGCTTCTTTGGAGTCTGCACCGAGGGTGGCCCGTTGCTCATGGTCTTTGAGTAC  1764

Query 1756  ATGCGGCACGGGGACCTCAACCGCTTCCTCCGATCCCATGGACCTGATGCCAAGCTGCTGGCTGGTGGGGAGGA  1829
            |||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1765  ATGCGCCACGGGGACCTCAACCGTTTCCTCCGGTCCCACGGACCTGATGCAAAGCTGCTGGCTGGTGGTGAGGA  1838

Query 1830  TGTGGCTCCAGGCCCCCTGGGTCTGGGGCAGCTGCTGGCCGTGGCTAGCCAGGTCGCTGCGGGGATGGTGTACC  1903
            |||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|
Sbjct 1839  TGTGGCTCCTGGTCCTCTGGGCCTTGGGCAGCTTCTGGCTGTGGCTAGCCAGGTGGCTGCTGGTATGGTATATC  1912

Query 1904  TGGCGGGTCTGCATTTTGTGCACCGGGACCTGGCCACACGCAACTGTCTAGTGGGCCAGGGACTGGTGGTCAAG  1977
            |.||..|.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 1913  TAGCCAGCCTGCACTTTGTGCACCGGGATCTGGCCACACGCAACTGTCTGGTGGGTCAGGGACTAGTGGTGAAG  1986

Query 1978  ATTGGTGATTTTGGCATGAGCAGGGATATCTACAGCACCGACTATTACCGTGTGGGAGGCCGCACCATGCTGCC  2051
            |||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1987  ATTGGAGACTTTGGCATGAGCAGAGACATCTATAGCACAGACTATTACCGAGTGGGAGGTCGGACCATGCTGCC  2060

Query 2052  CATTCGCTGGATGCCGCCCGAGAGCATCCTGTACCGTAAGTTCACCACCGAGAGCGACGTGTGGAGCTTCGGCG  2125
            |||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 2061  CATCCGCTGGATGCCACCCGAGAGCATCCTCTACCGCAAGTTCAGCACCGAGAGCGATGTGTGGAGCTTTGGGG  2134

Query 2126  TGGTGCTCTGGGAGATCTTCACCTACGGCAAGCAGCCCTGGTACCAGCTCTCCAACACGGAGGCAATCGACTGC  2199
            |||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.
Sbjct 2135  TGGTGCTCTGGGAGATCTTCACCTATGGAAAGCAGCCCTGGTACCAGCTCTCCAACACTGAGGCGATCGAGTGT  2208

Query 2200  ATCACGCAGGGACGTGAGTTGGAGCGGCCACGTGCCTGCCCACCAGAGGTCTACGCCATCATGCGGGGCTGCTG  2273
            |||||||||||.||.|||.||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2209  ATCACGCAGGGCCGGGAGCTGGAGCGGCCGCGCGCCTGCCCTCCTGATGTCTACGCCATCATGCGAGGCTGCTG  2282

Query 2274  GCAGCGGGAGCCCCAGCAACGCCACAGCATCAAGGATGTGCACGCCCGGCTGCAAGCCCTGGCCCAGGCACC-T  2346
            ||||||.||.||.||||||||||.||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|| .
Sbjct 2283  GCAGCGAGAACCGCAGCAACGCCTCAGCATGAAGGATGTGCACGCGCGTCTGCAGGCCCTGGCACAGGCGCCAC  2356

Query 2347  CCTGTCTACCTGGATGTCCTGGGC  2370
            ||.|| ||||||||.||.||||||
Sbjct 2357  CCAGT-TACCTGGACGTTCTGGGC  2379