Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14722
• Subject: NM_001243101.1
• Aligned Length: 839
• Identities: 816
• Gaps: 22

Alignment

Query   1  MDVSLCPAKCSFWRIFLLGSVWLDYVGSVLACPANCVCSKTEINCRRPDDGNLFPLLEGQDSGNSNGNASINIT  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MDVSLCPAKCSFWRIFLLGSVWLDYVGSVLACPANCVCSKTEINCRRPDDGNLFPLLEGQDSGNSNGNASINIT  74

Query  75  DISRNITSIHIENWRSLHTLNAVDMELYTGLQKLTIKNSGLRSIQPRAFAKNPHLRYINLSSNRLTTLSWQLFQ  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  DISRNITSIHIENWRSLHTLNAVDMELYTGLQKLTIKNSGLRSIQPRAFAKNPHLRYINLSSNRLTTLSWQLFQ  148

Query 149  TLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQEQGEAKLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVR  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQEQGEAKLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVR  222

Query 223  EGDNAVITCNGSGSPLPDVDWIVTGLQSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSNAS  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  EGDNAVITCNGSGSPLPDVDWIVTGLQSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSNAS  296

Query 297  VALTVYYPPRVVSLEEPELRLEHCIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYYQEGEISEGCLLFNKPTH  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  VALTVYYPPRVVSLEEPELRLEHCIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYYQEGEISEGCLLFNKPTH  370

Query 371  YNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFPESTDNFILFDEVSPTPPITVTHKPEEDTFGVSIAVGLAAFACV  444
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Sbjct 371  YNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFP--------VDEVSPTPPITVTHKPEEDTFGVSIAVGLAAFACV  436

Query 445  LLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASPLHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFR  518
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Sbjct 437  LLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASPLHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFR  510

Query 519  QGHNCHKPDTYVQHIKRRDIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAARKDFQREAELL  592
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Sbjct 511  QGHNCHKPDTYVQHIKRRDIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAARKDFQREAELL  584

Query 593  TNLQHEHIVKFYGVCGDGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAMILVDGQPRQAKGELGLSQMLHIASQIASG  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 585  TNLQHEHIVKFYGVCGDGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAMILVDGQPRQAKGELGLSQMLHIASQIASG  658

Query 667  MVYLASQHFVHRDLATRNCLVGANLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRLFNPSGNDFCIWCEVGGHTMLPIRWMPPE  740
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Sbjct 659  MVYLASQHFVHRDLATRNCLVGANLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYR--------------VGGHTMLPIRWMPPE  718

Query 741  SIMYRKFTTESDVWSFGVILWEIFTYGKQPWFQLSNTEVIECITQGRVLERPRVCPKEVYDVMLGCWQREPQQR  814
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Sbjct 719  SIMYRKFTTESDVWSFGVILWEIFTYGKQPWFQLSNTEVIECITQGRVLERPRVCPKEVYDVMLGCWQREPQQR  792

Query 815  LNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG  839
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Sbjct 793  LNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG  817