Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14730
• Subject: NM_033018.4
• Aligned Length: 1506
• Identities: 1487
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  ------------------ATGGATCGGATGAAGAAGATCAAACGGCAGCTGTCAATGACACTCCGAGGTGGCCG  56
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAGTCCGAGATCGCCATGGATCGGATGAAGAAGATCAAACGGCAGCTGTCAATGACACTCCGAGGTGGCCG  74

Query   57  AGGCATAGACAAGACCAATGGTGCCCCTGAGCAGATAGGCCTGGATGAGAGTGGTGGTGGTGGCGGCAGTGACC  130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGGCATAGACAAGACCAATGGTGCCCCTGAGCAGATAGGCCTGGATGAGAGTGGTGGTGGTGGCGGCAGTGACC  148

Query  131  CTGGAGAGGCCCCCACACGTGCTGCTCCTGGGGAACTTCGTTCTGCACGGGGCCCACTCAGCTCTGCACCAGAG  204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGGAGAGGCCCCCACACGTGCTGCTCCTGGGGAACTTCGTTCTGCACGGGGCCCACTCAGCTCTGCACCAGAG  222

Query  205  ATTGTGCACGAGGACTTGAAGATGGGGTCTGATGGGGAGAGTGACCAGGCTTCAGCCACGTCCTCGGATGAGGT  278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTGTGCACGAGGACTTGAAGATGGGGTCTGATGGGGAGAGTGACCAGGCTTCAGCCACGTCCTCGGATGAGGT  296

Query  279  GCAGTCTCCAGTGAGAGTGCGTATGCGCAACCATCCCCCACGCAAGATCTCCACTGAGGACATCAACAAGCGCC  352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAGTCTCCAGTGAGAGTGCGTATGCGCAACCATCCCCCACGCAAGATCTCCACTGAGGACATCAACAAGCGCC  370

Query  353  TATCACTACCAGCTGACATCCGGCTGCCTGAGGGCTACCTGGAGAAGCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGAC  426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TATCACTACCAGCTGACATCCGGCTGCCTGAGGGCTACCTGGAGAAGCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGAC  444

Query  427  AAGCCCCTCAGCCGCCGCCTCCGTCGTGTCAGCCTATCTGAGATTGGCTTTGGGAAACTGGAGACCTACATTAA  500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGCCCCTCAGCCGCCGCCTCCGTCGTGTCAGCCTATCTGAGATTGGCTTTGGGAAACTGGAGACCTACATTAA  518

Query  501  GCTGGACAAACTGGGCGAGGGTACCTATGCCACCGTCTACAAAGGCAAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTGG  574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGGACAAACTGGGCGAGGGTACCTATGCCACCGTCTACAAAGGCAAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTGG  592

Query  575  CACTCAAGGAGATCAGACTGGAACATGAAGAGGGGGCACCCTGCACCGCCATCCGGGAAGTGTCCCTACTCAAG  648
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  593  CACTCAAGGAGATCAGACTGGAACATGAAGAGGGGGCACCCTGCACCGCCATCCGGGAAGTGTCCCTGCTCAAG  666

Query  649  GACCTCAAACACGCCAACATCGTTACGCTACATGACATTATCCACACGGAGAAGTCCCTCACCCTTGTCTTTGA  722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACCTCAAACACGCCAACATCGTTACGCTACATGACATTATCCACACGGAGAAGTCCCTCACCCTTGTCTTTGA  740

Query  723  GTACCTGGACAAGGACCTGAAGCAGTACCTGGATGACTGTGGGAACATCATCAACATGCACAACGTGAAACTGT  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTACCTGGACAAGGACCTGAAGCAGTACCTGGATGACTGTGGGAACATCATCAACATGCACAACGTGAAACTGT  814

Query  797  TCCTGTTCCAGCTGCTCCGTGGCCTGGCCTACTGCCACCGGCAGAAGGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAG  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCCTGTTCCAGCTGCTCCGTGGCCTGGCCTACTGCCACCGGCAGAAGGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAG  888

Query  871  AACCTGCTCATCAACGAGAGGGGAGAGCTCAAGCTGGCTGACTTTGGCCTGGCCCGAGCCAAGTCAATCCCAAC  944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AACCTGCTCATCAACGAGAGGGGAGAGCTCAAGCTGGCTGACTTTGGCCTGGCCCGAGCCAAGTCAATCCCAAC  962

Query  945  AAAGACATACTCCAATGAGGTGGTGACACTGTGGTACCGGCCCCCTGACATCCTGCTTGGGTCCACGGACTACT  1018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAAGACATACTCCAATGAGGTGGTGACACTGTGGTACCGGCCCCCTGACATCCTGCTTGGGTCCACGGACTACT  1036

Query 1019  CCACTCAGATTGACATGTGGGGTGTGGGCTGCATCTTCTATGAGATGGCCACAGGCCGTCCCCTCTTTCCGGGC  1092
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCACTCAGATTGACATGTGGGGTGTGGGCTGCATCTTCTATGAGATGGCCACAGGCCGTCCCCTCTTTCCGGGC  1110

Query 1093  TCCACGGTGGAGGAACAGCTACACTTCATCTTCCGTATCTTAGGAACCCCAACTGAGGAGACGTGGCCAGGCAT  1166
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCCACGGTGGAGGAACAGCTACACTTCATCTTCCGTATCTTAGGAACCCCAACTGAGGAGACGTGGCCAGGCAT  1184

Query 1167  CCTGTCCAACGAGGAGTTCAAGACATACAACTACCCCAAGTACCGAGCCGAGGCCCTTTTGAGCCACGCACCCC  1240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTGTCCAACGAGGAGTTCAAGACATACAACTACCCCAAGTACCGAGCCGAGGCCCTTTTGAGCCACGCACCCC  1258

Query 1241  GACTTGATAGCGACGGGGCCGACCTCCTCACCAAGCTGTTGCAGTTTGAGGGTCGAAATCGGATCTCCGCAGAG  1314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GACTTGATAGCGACGGGGCCGACCTCCTCACCAAGCTGTTGCAGTTTGAGGGTCGAAATCGGATCTCCGCAGAG  1332

Query 1315  GATGCCATGAAACATCCATTCTTCCTCAGTCTGGGGGAGCGGATCCACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATT  1388
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GATGCCATGAAACATCCATTCTTCCTCAGTCTGGGGGAGCGGATCCACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATT  1406

Query 1389  TGCACTAAAGGAGATTCAGCTACAAAAGGAGGCCAGCCTTCGGTCTTCGTCGATGCCTGACTCAGGCAGGCCAG  1462
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCACTAAAGGAGATTCAGCTACAAAAGGAGGCCAGCCTTCGGTCTTCGTCGATGCCTGACTCAGGCAGGCCAG  1480

Query 1463  CTTTCCGCGTGGTGGACACCGAGTTC  1488
            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTTTCCGCGTGGTGGACACCGAGTTC  1506