Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14732
- Subject:
- XM_011247940.2
- Aligned Length:
- 1416
- Identities:
- 1013
- Gaps:
- 294
Alignment
Query 1 ATGAACAAGATGAAGAACTTTAAGCGCCGTTTCTCCCTGTCAGTGCCCCGCACTGAGACCATTGAAGAATCCTT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGCTGAATTCACGGAGCAATTCAACCAGCTCCACAACCGGCGGAATGAGAACTTGCAGCTCGGTCCTCTTGGCA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GAGACCCCCCGCAGGAGTGCAGCACCTTCTCCCCAACAGACAGCGGGGAGGAGCCGGGGCAGCTCTCCCCTGGC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GTGCAGTTCCAGCGGCGGCAGAACCAGCGCCGCTTCTCCATGGAGGACGTCAGCAAGAGGCTCTCTCTGCCCAT 296
||
Sbjct 1 ------------------------------------------------------------------------AT 2
Query 297 GGATATCCGCCTGCCCCAGGAATTCCTACAGAAGCTACAGATGGAGAGCCCAGATCTGCCCAAGCCGCTCAGCC 370
|||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.||||||.|||||..|||||||||||.||||.||
Sbjct 3 GGACATCCGCCTACCCCAGGAATTCCTGCAGAAGCTACAGCTGGAGAACCCAGGGCTGCCCAAGCCTCTCACCC 76
Query 371 GCATGTCCCGCCGGGCCTCCCTGTCAGACATTGGCTTTGGGAAACTGGAAACATACGTGAAACTGGACAAACTG 444
|||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 77 GCATGTCCCGCCGTGCCTCCCTGTCAGATATCGGCTTTGGGAAACTGGAAACATATGTGAAACTGGACAAACTG 150
Query 445 GGAGAGGGCACCTATGCCACAGTCTTCAAAGGGCGCAGCAAACTGATGGAGAACCTTGTGGCCCTGAAAGAGAT 518
||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||..||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 151 GGGGAGGGTACCTATGCCACCGTCTTCAAGGGACGCAGCAAGCTGACAGAGAACCTCGTGGCCCTGAAGGAGAT 224
Query 519 CCGGCTGGAGCACGAGGAGGGAGCGCCCTGCACTGCCATCCGAGAGGTGTCTCTGCTGAAGAACCTGAAGCACG 592
||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||||
Sbjct 225 CCGGCTGGAGCATGAGGAAGGGGCGCCCTGCACTGCTATTCGAGAGGTGTCTCTGCTGAAGGACCTGAAACACG 298
Query 593 CCAATATTGTGACCCTGCATGACCTCATCCACACAGATCGGTCCCTCACCCTGGTGTTTGAGTACCTGGACAGT 666
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 CCAATATTGTGACCCTGCATGACCTCATTCACACAGATCGGTCCCTCACCCTGGTGTTTGAGTACCTGGACAGT 372
Query 667 GACCTGAAGCAGTATCTGGACCACTGTGGGAACCTCATGAGCATGCACAACGTCAAGATTTTCATGTTCCAGCT 740
||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 373 GACCTGAAACAGTACCTAGACCACTGTGGGAACCTCATGAACATGCACAATGTCAAGATATTCATGTTCCAGCT 446
Query 741 GCTCCGGGGCCTCGCCTACTGTCACCACCGCAAGATCCTGCACCGGGACCTGAAGCCCCAGAACCTGCTCATCA 814
|||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 447 GCTCCGGGGTCTGGCCTACTGCCACCACCGCAAGATCCTGCACCGGGACCTGAAGCCCCAGAACCTACTCATCA 520
Query 815 ACGAGAGGGGGGAGCTGAAGCTGGCCGACTTTGGACTGGCCAGGGCCAAGTCAGTGCCCACAAAGACTTACTCC 888
|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||.||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct 521 ATGAGAGGGGCGAGCTGAAGCTGGCCGACTTTGGCCTGGCCCGGGCCAAATCAGTGCCTACAAAGACCTATTCC 594
Query 889 AATGAGGTGGTGACCCTGTGGTACAGGCCCCCCGATGTGCTGCTGGGATCCACAGAGTACTCCACCCCCATTGA 962
|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 595 AATGAGGTGGTGACCCTCTGGTACAGGCCCCCAGATGTGCTGCTGGGATCCACAGAGTACTCCACCCCCATTGA 668
Query 963 TATGTGGGGCGTGGGCTGCATCCACTACGAGATGGCCACAGGGAGGCCCCTCTTCCCGGGCTCCACAGTCAAGG 1036
.||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||.||.|.||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 669 CATGTGGGGCGTGGGCTGCATCCTCTATGAGATGGCCACCGGCAAGCCCCTCTTCCCGGGCTCTACTGTCAAGG 742
Query 1037 AGGAGCTGCACCTCATCTTTCGCCTCCTCGGGACCCCCACAGAAGAGACGTGGCCCGGCGTGACCGCCTTCTCT 1110
|||||.|||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||.|||||||.||.|||||..||.|||||
Sbjct 743 AGGAGTTGCACCTCATCTTCCGTCTCCTAGGGACACCTACAGAAGAGTCGTGGCCGGGTGTGACGTCCATCTCT 816
Query 1111 GAGTTCCGCACCTACAGCTTCCCCTGCTACCTCCCGCAGCCGCTCATCAACCACGCGCCCAGGTTGGATACGGA 1184
|||||.||..||||||.|||||||.|.|||||.||.|||||.||..|||.||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 817 GAGTTTCGAGCCTACAACTTCCCCCGATACCTACCACAGCCACTGCTCAGCCACGCCCCCAGGTTGGATACTGA 890
Query 1185 TGGCATCCACCTCCTGAGCAGCCTGCTCCTGTATGAATCCAAGAGTCGCATGTCAGCAGAGGCTGCCCTGAGTC 1258
.||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.||
Sbjct 891 AGGCATCAACCTCCTGAGCAGCCTCCTCCTGTATGAATCCAAGAGTCGCATGTCAGCAGAGGCAGCCCTCAATC 964
Query 1259 ACTCCTACTTCCGGTCTCTGGGAGAGCGTGTGCACCAGCTTGAAGACACTGCCTCCATCTTCTCCCTGAAGGAG 1332
||.|||||||||.||||||.|||||.||.||.||.|||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 965 ACCCCTACTTCCAGTCTCTCGGAGACCGAGTTCATCAGCTCCATGACACTGCCTCCATCTTCTCCCTGAAGGAG 1038
Query 1333 ATCCAGCTCCAGAAGGACCCAGGCTACCGAGGCTTGGCCTTCCAGCAGCCAGGACGAGGGAAGAACAGGCGGCA 1406
|||||||||||.||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.|||||.||||||||||.|.|||||||
Sbjct 1039 ATCCAGCTCCAAAAGGACCCAGGCTATCGTGGCCTGGCCTTCCAGCACCCAGGGCGAGGGAAGAGCCGGCGGCA 1112
Query 1407 GAGCATCTTC 1416
||||||||||
Sbjct 1113 GAGCATCTTC 1122