Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14753
• Subject: NM_000293.3
• Aligned Length: 1093
• Identities: 1055
• Gaps: 7

Alignment

Query    1  MACSPDAVVSPSSAFL-------RSGSVYEPLKSINLPRPDNETLWDKLDHYYRIVKSTLLLYQSPTTGLFPTK  67
            ||.........|...|       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MAGAAGLTAEVSWKVLERRARTKRSGSVYEPLKSINLPRPDNETLWDKLDHYYRIVKSTLLLYQSPTTGLFPTK  74

Query   68  TCGGDQKAKIQDSLYCAAGAWALALAYRRIDDDKGRTHELEHSAIKCMRGILYCYMRQADKVQQFKQDPRPTTC  141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCGGDQKAKIQDSLYCAAGAWALALAYRRIDDDKGRTHELEHSAIKCMRGILYCYMRQADKVQQFKQDPRPTTC  148

Query  142  LHSVFNVHTGDELLSYEEYGHLQINAVSLYLLYLVEMISSGLQIIYNTDEVSFIQNLVFCVERVYRVPDFGVWE  215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  LHSVFNVHTGDELLSYEEYGHLQINAVSLYLLYLVEMISSGLQIIYNTDEVSFIQNLVFCVERVYRVPDFGVWE  222

Query  216  RGSKYNNGSTELHSSSVGLAKAALEAINGFNLFGNQGCSWSVIFVDLDAHNRNRQTLCSLLPRESRSHNTDDGL  289
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|
Sbjct  223  RGSKYNNGSTELHSSSVGLAKAALEAINGFNLFGNQGCSWSVIFVDLDAHNRNRQTLCSLLPRESRSHNTDAAL  296

Query  290  LTCISYPAFALDDEVLFSQTLDKVVRKLKGKYGFKRFLRDGYRTSLEDPNRCYYKPAEIKLFDGIECEFPIFFL  363
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  LPCISYPAFALDDEVLFSQTLDKVVRKLKGKYGFKRFLRDGYRTSLEDPNRCYYKPAEIKLFDGIECEFPIFFL  370

Query  364  YMMIDGVFRGNPKQVQEYQDLLTPVLHHTTEGYPVVPKYYYVPADFVEYEKNNPGSQKRFPSNCGRDGKLFLWG  437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  YMMIDGVFRGNPKQVQEYQDLLTPVLHHTTEGYPVVPKYYYVPADFVEYEKNNPGSQKRFPSNCGRDGKLFLWG  444

Query  438  QALYIIAKLLADELISPKDIDPVQRYVPLKDQRNVSMRFSNQGPLENDLVVHVALIAESQRLQVFLNTYGIQTQ  511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  QALYIIAKLLADELISPKDIDPVQRYVPLKDQRNVSMRFSNQGPLENDLVVHVALIAESQRLQVFLNTYGIQTQ  518

Query  512  TPQQVEPIQIWPQQELVKAYLQLGINEKLGLSGRPDRPIGCLGTSKIYRILGKTVVCYPIIFDLSDFYMSQDVF  585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TPQQVEPIQIWPQQELVKAYLQLGINEKLGLSGRPDRPIGCLGTSKIYRILGKTVVCYPIIFDLSDFYMSQDVF  592

Query  586  LLIDDIKNALQFIKQYWKMHGRPLFLVLIREDNIRGSRFNPILDMLAALKKGIIGGVKVHVDRLQTLISGAVVE  659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  LLIDDIKNALQFIKQYWKMHGRPLFLVLIREDNIRGSRFNPILDMLAALKKGIIGGVKVHVDRLQTLISGAVVE  666

Query  660  QLDFLRISDTEELPEFKSFEELEPPKHSKVKRQSSTPSAPELGQQPDVNISEWKDKPTHEILQKLNDCSCLASQ  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  QLDFLRISDTEELPEFKSFEELEPPKHSKVKRQSSTPSAPELGQQPDVNISEWKDKPTHEILQKLNDCSCLASQ  740

Query  734  AILLGILLKREGPNFITKEGTVSDHIERVYRRAGSQKLWSVVRRAASLLSKVVDSLAPSITNVLVQGKQVTLGA  807
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||..|....|...|.||.||..||.||||||||
Sbjct  741  AILLGILLKREGPNFITKEGTVSDHIERVYRRAGSQKLWLAVRYGAAFTQKFSSSIAPHITTFLVHGKQVTLGA  814

Query  808  FGHEEEVISNPLSPRVIQNIIYYKCNTHDEREAVIQQELVIHIGWIISNNPELFSGMLKIRIGWIIHAMEYELQ  881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  FGHEEEVISNPLSPRVIQNIIYYKCNTHDEREAVIQQELVIHIGWIISNNPELFSGMLKIRIGWIIHAMEYELQ  888

Query  882  IRGGDKPALDLYQLSPSEVKQLLLDILQPQQNGRCWLNRRQIDGSLNRTPTGFYDRVWQILERTPNGIIVAGKH  955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  IRGGDKPALDLYQLSPSEVKQLLLDILQPQQNGRCWLNRRQIDGSLNRTPTGFYDRVWQILERTPNGIIVAGKH  962

Query  956  LPQQPTLSDMTMYEMNFSLLVEDTLGNIDQPQYRQIVVELLMVVSIVLERNPELEFQDKVDLDRLVKEAFNEFQ  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  LPQQPTLSDMTMYEMNFSLLVEDTLGNIDQPQYRQIVVELLMVVSIVLERNPELEFQDKVDLDRLVKEAFNEFQ  1036

Query 1030  KDQSRLKEIEKQDDMTSFYNTPPLGKRGTCSYLTKAVMNLLLEGEVKPNNDDPCLIS  1086
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Sbjct 1037  KDQSRLKEIEKQDDMTSFYNTPPLGKRGTCSYLTKAVMNLLLEGEVKPNNDDPCLIS  1093