Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14754
- Subject:
- NM_001363837.1
- Aligned Length:
- 3295
- Identities:
- 3234
- Gaps:
- 53
Alignment
Query 1 ATGGCCTG----------CTCAC------------CTGATGCAGTCGTCT------------CTCCGTCTTC-- 38
|||||..| ||||| ||| |.|| |||| |||.|.| |
Sbjct 1 ATGGCGGGGGCGGCGGGACTCACGGCAGAAGTGAGCTG--GAAG--GTCTTGGAGCGAAGAGCTCGGAC--CAA 68
Query 39 -CGCTTTCTTAAGGTCTGGCTCAGTTTATGAACCTCTTAAAAGCATTAATCTTCCAAGACCTGATAATGAAACT 111
||| ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 69 GCGC----------TCAGGCTCAGTTTATGAACCTCTTAAAAGCATTAATCTTCCAAGACCTGATAATGAAACT 132
Query 112 CTCTGGGATAAGTTGGACCATTATTACAGAATTGTCAAGTCAACATTGCTGCTGTATCAAAGTCCAACTACCGG 185
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 133 CTCTGGGATAAGTTGGACCATTATTACAGAATTGTCAAGTCAACATTGCTGCTGTATCAAAGTCCAACTACCGG 206
Query 186 TCTCTTTCCCACTAAAACATGCGGTGGTGACCAGAAGGCCAAGATCCAGGACAGCCTATACTGCGCTGCTGGGG 259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 207 TCTCTTTCCCACTAAAACATGCGGTGGTGACCAGAAGGCCAAGATCCAGGACAGCCTATACTGCGCTGCTGGGG 280
Query 260 CCTGGGCTTTGGCTCTTGCATACAGGCGAATTGATGACGACAAGGGAAGGACCCATGAGCTGGAGCACTCAGCT 333
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 281 CCTGGGCTTTGGCTCTTGCATACAGGCGAATTGATGATGACAAGGGAAGGACCCATGAGCTGGAGCACTCAGCT 354
Query 334 ATAAAATGCATGAGAGGAATTCTCTACTGCTATATGCGTCAGGCCGATAAGGTCCAGCAGTTTAAGCAGGATCC 407
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 355 ATAAAATGCATGAGAGGAATTCTCTACTGCTATATGCGTCAGGCCGATAAGGTCCAGCAGTTTAAGCAGGATCC 428
Query 408 ACGCCCAACAACATGTCTTCACTCTGTTTTCAATGTGCATACAGGAGATGAGTTGCTTTCCTATGAGGAATATG 481
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 429 ACGCCCAACAACATGTCTTCACTCTGTTTTCAATGTGCATACAGGAGATGAGTTGCTTTCCTATGAGGAATATG 502
Query 482 GTCATCTTCAGATAAATGCAGTGTCACTTTATCTCCTTTACCTTGTGGAAATGATTTCCTCAGGACTCCAGATT 555
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 503 GTCATCTTCAGATAAATGCAGTGTCACTTTATCTCCTTTACCTTGTGGAAATGATTTCCTCAGGACTCCAGATT 576
Query 556 ATCTACAACACTGATGAGGTCTCTTTTATTCAAAACCTTGTATTTTGTGTGGAAAGAGTTTACCGTGTGCCTGA 629
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 577 ATCTACAACACTGATGAGGTCTCTTTTATTCAAAACCTTGTATTTTGTGTGGAAAGAGTTTACCGTGTGCCTGA 650
Query 630 CTTTGGTGTCTGGGAAAGAGGAAGCAAATATAATAATGGCAGCACAGAGCTACATTCGAGCTCGGTTGGTTTAG 703
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 651 CTTTGGTGTCTGGGAAAGAGGAAGCAAATATAATAATGGCAGCACAGAGCTACATTCGAGCTCGGTTGGTTTAG 724
Query 704 CAAAAGCAGCTCTAGAAGCAATTAATGGATTCAACCTTTTTGGCAACCAGGGCTGTTCGTGGTCAGTTATATTT 777
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 725 CAAAAGCAGCTCTAGAAGCAATTAATGGATTCAACCTTTTTGGCAACCAGGGCTGTTCGTGGTCAGTTATATTT 798
Query 778 GTGGATCTCGATGCTCACAATCGCAACAGGCAAACTTTGTGCTCGCTGTTACCCAGAGAATCAAGATCACATAA 851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 799 GTGGATCTCGATGCTCACAATCGCAACAGGCAAACTTTGTGCTCGCTGTTACCCAGAGAATCAAGATCACATAA 872
Query 852 TACAGATGCTGCCCTGCTCCCCTGCATCAGTTATCCTGCATTTGCCCTGGATGATGAAGTTCTTTTTAGCCAGA 925
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 873 TACAGATGCTGCCCTGCTCCCCTGCATCAGTTATCCTGCATTTGCCCTGGATGATGAAGTTCTTTTTAGCCAGA 946
Query 926 CACTTGATAAAGTGGTTAGAAAATTAAAAGGAAAATATGGATTTAAACGTTTCTTGAGAGATGGGTATAGAACA 999
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 947 CACTTGATAAAGTGGTTAGAAAATTAAAAGGAAAATATGGATTTAAACGTTTCTTGAGAGATGGGTATAGAACA 1020
Query 1000 TCATTGGAAGATCCCAACAGATGCTACTACAAGCCAGCTGAAATTAAGCTATTTGATGGCATTGAATGTGAATT 1073
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 TCATTGGAAGATCCCAACAGATGCTACTACAAGCCAGCTGAAATTAAGCTATTTGATGGCATTGAATGTGAATT 1094
Query 1074 TCCCATATTTTTCCTTTATATGATGATTGATGGAGTTTTTAGAGGCAATCCTAAGCAAGTACAGGAATATCAGG 1147
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095 TCCCATATTTTTCCTTTATATGATGATTGATGGAGTTTTTAGAGGCAATCCTAAGCAAGTACAGGAATATCAGG 1168
Query 1148 ATCTTTTGACTCCAGTACTTCATCATACCACAGAAGGATATCCTGTTGTACCAAAGTACTATTATGTGCCAGCT 1221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169 ATCTTTTGACTCCAGTACTTCATCATACCACAGAAGGATATCCTGTTGTACCAAAGTACTATTATGTGCCAGCT 1242
Query 1222 GACTTTGTAGAATATGAAAAAAATAACCCTGGTAGTCAAAAACGATTTCCTAGCAACTGTGGCCGTGATGGAAA 1295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243 GACTTTGTAGAATATGAAAAAAATAACCCTGGTAGTCAAAAACGATTTCCTAGCAACTGTGGCCGTGATGGAAA 1316
Query 1296 ACTGTTTCTTTGGGGACAAGCACTTTATATCATCGCAAAACTCCTGGCTGATGAACTTATTAGTCCTAAAGACA 1369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317 ACTGTTTCTTTGGGGACAAGCACTTTATATCATCGCAAAACTCCTGGCTGATGAACTTATTAGTCCTAAAGACA 1390
Query 1370 TTGATCCTGTCCAGCGCTATGTCCCACTAAAGGATCAACGTAACGTGAGCATGAGGTTTTCCAATCAGGGCCCA 1443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391 TTGATCCTGTCCAGCGCTATGTCCCACTAAAGGATCAACGTAACGTGAGCATGAGGTTTTCCAATCAGGGCCCA 1464
Query 1444 CTGGAAAATGACTTGGTAGTTCATGTGGCACTTATAGCAGAAAGCCAAAGACTTCAAGTTTTTCTGAACACATA 1517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1465 CTGGAAAATGACTTGGTAGTTCATGTGGCACTTATAGCAGAAAGCCAAAGACTTCAAGTTTTTCTGAACACATA 1538
Query 1518 TGGTATTCAAACTCAAACTCCTCAACAAGTAGAACCCATTCAGATATGGCCTCAGCAGGAGCTTGTGAAAGCTT 1591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1539 TGGTATTCAAACTCAAACTCCTCAACAAGTAGAACCCATTCAGATATGGCCTCAGCAGGAGCTTGTGAAAGCTT 1612
Query 1592 ATTTGCAGCTGGGTATCAATGAAAAGTTAGGACTCTCTGGAAGGCCAGACAGGCCCATTGGCTGCCTCGGGACA 1665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1613 ATTTGCAGCTGGGTATCAATGAAAAGTTAGGACTCTCTGGAAGGCCAGACAGGCCCATTGGCTGCCTCGGGACA 1686
Query 1666 TCAAAGATTTATCGCATTCTAGGAAAGACTGTGGTTTGTTACCCGATTATTTTCGACCTAAGTGATTTCTACAT 1739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1687 TCAAAGATTTATCGCATTCTAGGAAAGACTGTGGTTTGTTACCCGATTATTTTCGACCTAAGTGATTTCTACAT 1760
Query 1740 GTCTCAGGATGTTTTCCTGCTGATAGATGACATAAAGAATGCGCTGCAGTTCATTAAACAATATTGGAAAATGC 1813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1761 GTCTCAGGATGTTTTCCTGCTGATAGATGACATAAAGAATGCGCTGCAGTTCATTAAACAATATTGGAAAATGC 1834
Query 1814 ATGGACGTCCACTTTTCCTTGTTCTCATCCGGGAAGACAATATAAGAGGTAGCCGGTTCAACCCCATATTAGAT 1887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1835 ATGGACGTCCACTTTTCCTTGTTCTCATCCGGGAAGACAATATAAGAGGTAGCCGGTTCAACCCCATATTAGAT 1908
Query 1888 ATGCTGGCAGCCCTTAAAAAAGGAATAATTGGAGGAGTCAAAGTTCATGTGGATCGTCTACAGACACTAATATC 1961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1909 ATGCTGGCAGCCCTTAAAAAAGGAATAATTGGAGGAGTCAAAGTTCATGTGGATCGTCTACAGACACTAATATC 1982
Query 1962 TGGAGCTGTGGTAGAACAACTTGATTTCCTACGAATCAGTGACACAGAAGAGCTTCCAGAATTTAAGAGTTTTG 2035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1983 TGGAGCTGTGGTAGAACAACTTGATTTCCTACGAATCAGTGACACAGAAGAGCTTCCAGAATTTAAGAGTTTTG 2056
Query 2036 AGGAACTAGAACCTCCCAAACATTCAAAAGTCAAACGGCAAAGCAGCACCCCTAGTGCTCCTGAACTGGGACAG 2109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2057 AGGAACTAGAACCTCCCAAACATTCAAAAGTCAAACGGCAAAGCAGCACCCCTAGTGCTCCTGAACTGGGACAG 2130
Query 2110 CAGCCGGATGTCAACATTAGTGAATGGAAGGACAAACCCACCCATGAAATTCTTCAAAAACTGAATGATTGCAG 2183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2131 CAGCCGGATGTCAACATTAGTGAATGGAAGGACAAACCCACCCACGAAATTCTTCAAAAACTGAATGATTGCAG 2204
Query 2184 TTGTCTGGCTAGCCAAGCCATCCTGCTGGGTATACTGCTCAAAAGAGAAGGCCCCAACTTCATCACAAAGGAAG 2257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2205 TTGTCTGGCTAGCCAAGCCATCCTGCTGGGTATACTGCTCAAAAGAGAAGGCCCCAACTTCATCACAAAGGAAG 2278
Query 2258 GTACCGTTTCTGATCACATTGAGAGAGTCTATAGAAGAGCTGGCAGCCAAAAACTTTGGTCGGTTGTACGCCGT 2331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2279 GTACCGTTTCTGATCACATTGAGAGAGTCTATAGAAGAGCTGGCAGCCAAAAACTTTGGTCGGTTGTACGCCGT 2352
Query 2332 GCAGCAAGTCTTTTAAGTAAAGTAGTGGACAGCCTGGCCCCATCCATTACTAATGTTTTAGTGCAGGGCAAACA 2405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2353 GCAGCAAGTCTTTTAAGTAAAGTAGTGGACAGCCTGGCCCCATCCATTACTAATGTTTTAGTGCAGGGCAAACA 2426
Query 2406 GGTAACTCTGGGTGCCTTTGGGCATGAAGAAGAAGTTATCTCTAATCCTTTGTCTCCAAGAGTGATTCAAAACA 2479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2427 GGTAACTCTGGGTGCCTTTGGGCATGAAGAAGAAGTTATCTCTAATCCTTTGTCTCCAAGAGTGATTCAAAACA 2500
Query 2480 TCATCTATTATAAGTGTAACACCCATGATGAGAGGGAAGCGGTCATTCAGCAAGAACTGGTCATCCATATTGGC 2553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2501 TCATCTATTATAAGTGTAACACCCATGATGAGAGGGAAGCGGTCATTCAGCAAGAACTGGTCATCCATATTGGC 2574
Query 2554 TGGATCATCTCCAATAACCCTGAGTTATTCAGTGGCATGCTGAAAATACGAATCGGGTGGATCATCCATGCCAT 2627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2575 TGGATCATCTCCAATAACCCTGAGTTATTCAGTGGCATGCTGAAAATACGAATCGGGTGGATCATCCATGCCAT 2648
Query 2628 GGAGTATGAACTTCAGATCCGTGGCGGAGACAAGCCAGCCTTGGACTTGTATCAGCTGTCACCTAGTGAAGTTA 2701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2649 GGAGTATGAACTTCAGATCCGTGGCGGAGACAAGCCAGCCTTGGACTTGTATCAGCTGTCACCTAGTGAAGTTA 2722
Query 2702 AACAGCTTCTGCTGGATATTCTGCAGCCTCAACAGAATGGAAGATGTTGGCTGAACAGGCGTCAGATCGATGGG 2775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2723 AACAGCTTCTGCTGGATATTCTGCAGCCTCAACAGAATGGAAGATGTTGGCTGAACAGGCGTCAGATCGATGGG 2796
Query 2776 TCTTTGAATAGAACTCCCACCGGGTTCTATGACCGAGTGTGGCAGATTCTGGAGCGCACGCCCAATGGGATCAT 2849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2797 TCTTTGAATAGAACTCCCACCGGGTTCTATGACCGAGTGTGGCAGATTCTGGAGCGCACGCCCAATGGGATCAT 2870
Query 2850 TGTTGCTGGGAAGCATTTGCCTCAGCAACCAACCCTGTCAGATATGACCATGTATGAGATGAATTTCTCTCTCC 2923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2871 TGTTGCTGGGAAGCATTTGCCTCAGCAACCAACCCTGTCAGATATGACCATGTATGAGATGAATTTCTCTCTCC 2944
Query 2924 TTGTTGAAGACACGTTGGGAAATATTGACCAGCCACAGTACAGACAGATCGTTGTAGAGTTACTTATGGTTGTA 2997
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2945 TTGTTGAAGACACGTTGGGAAATATTGACCAGCCACAGTACAGACAGATCGTTGTAGAGTTACTTATGGTTGTA 3018
Query 2998 TCCATTGTACTGGAAAGAAACCCCGAGCTAGAATTTCAAGACAAAGTAGATCTAGACAGACTGGTCAAAGAAGC 3071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3019 TCCATTGTACTGGAAAGAAACCCCGAGCTAGAATTTCAAGACAAAGTAGATCTAGACAGACTGGTCAAAGAAGC 3092
Query 3072 ATTTAATGAATTTCAAAAAGATCAGAGTCGGCTAAAGGAAATTGAAAAACAAGATGACATGACTTCCTTTTACA 3145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3093 ATTTAATGAATTTCAAAAAGATCAGAGTCGGCTAAAGGAAATTGAAAAACAAGATGACATGACTTCCTTTTACA 3166
Query 3146 ACACTCCTCCCCTGGGAAAAAGAGGAACATGCAGCTATTTGACAAAGGCGGTGATGAATCTGCTGCTGGAAGGA 3219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3167 ACACTCCTCCCCTGGGAAAAAGAGGAACATGCAGCTATTTGACAAAGGCGGTGATGAATCTGCTGCTGGAAGGA 3240
Query 3220 GAAGTCAAGCCAAACAATGATGACCCGTGTCTGATTAGC 3258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3241 GAAGTCAAGCCAAACAATGATGACCCGTGTCTGATTAGC 3279