Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14754
• Subject: NM_001364411.1
• Aligned Length: 1086
• Identities: 965
• Gaps: 52

Alignment

Query    1  MACSPDAVVSPSSAFLRSGSVYEPLKSINLPRPDNETLWDKLDHYYRIVKSTLLLYQSPTTGLFPTKTCGGDQK  74
                                                                .|.||||||||||||||||..|
Sbjct    1  ----------------------------------------------------MLMYQSPTTGLFPTKTCGGEEK  22

Query   75  AKIQDSLYCAAGAWALALAYRRIDDDKGRTHELEHSAIKCMRGILYCYMRQADKVQQFKQDPRPTTCLHSVFNV  148
            .|...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   23  SKVHESLYCAAGAWALALAYRRIDDDKGRTHELEHSAIKCMRGILYCYMRQADKVQQFKQDPRPTTCLHSVFSV  96

Query  149  HTGDELLSYEEYGHLQINAVSLYLLYLVEMISSGLQIIYNTDEVSFIQNLVFCVERVYRVPDFGVWERGSKYNN  222
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   97  HTGDELLSYEEYGHLQINAVSLFLLYLVEMISSGLQIIYNTDEVSFIQNLVFCVERVYRVPDFGVWERGSKYNN  170

Query  223  GSTELHSSSVGLAKAALEAINGFNLFGNQGCSWSVIFVDLDAHNRNRQTLCSLLPRESRSHNTDAALLPCISYP  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  171  GSTELHSSSVGLAKAALEAINGFNLFGNQGCSWSVIFVDLDAHNRNRQTLCSLLPRESRSHNTDAALLPCISYP  244

Query  297  AFALDDEVLFSQTLDKVVRKLKGKYGFKRFLRDGYRTSLEDPNRCYYKPAEIKLFDGIECEFPIFFLYMMIDGV  370
            |||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  245  AFALDDEALFSQTLDKVIRKLKGKYGFKRFLRDGYRTPLEDPNRRYYKPAEIKLFDGIECEFPIFFLYMMIDGV  318

Query  371  FRGNPKQVQEYQDLLTPVLHHTTEGYPVVPKYYYVPADFVEYEKNNPGSQKRFPSNCGRDGKLFLWGQALYIIA  444
            ||||..||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  319  FRGNLEQVKEYQDLLTPLLHQTTEGYPVVPKYYYVPADFVECEKRNPGSQKRFPSNCGRDGKLFLWGQALYIIA  392

Query  445  KLLADELISPKDIDPVQRYVPLKDQRNVSMRFSNQGPLENDLVVHVALIAESQRLQVFLNTYGIQTQTPQQVEP  518
            ||||||||||||||||||.|||..|||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  393  KLLADELISPKDIDPVQRFVPLQNQRNVSMRYSNQGPLENDLVVHVALVAESQRLQVFLNTYGIQTQTPQQVEP  466

Query  519  IQIWPQQELVKAYLQLGINEKLGLSGRPDRPIGCLGTSKIYRILGKTVVCYPIIFDLSDFYMSQDVFLLIDDIK  592
            |||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  467  IQIWPQQELVKAYFHLGINEKLGLSGRPDRPIGCLGTSKIYRILGKTVVCYPIIFDLSDFYMSQDVLLLIDDIK  540

Query  593  NALQFIKQYWKMHGRPLFLVLIREDNIRGSRFNPILDMLAALKKGIIGGVKVHVDRLQTLISGAVVEQLDFLRI  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  NALQFIKQYWKMHGRPLFLVLIREDNIRGSRFNPILDMLAAFKKGIIGGVKVHVDRLQTLISGAVVEQLDFLRI  614

Query  667  SDTEELPEFKSFEELEPPKHSKVKRQSSTPSAPELGQQPDVNISEWKDKPTHEILQKLNDCSCLASQAILLGIL  740
            ||||.|||||||||||.||||||||||||..|||....|...|.|||.|.|||||||||||.|||.|.||||||
Sbjct  615  SDTEKLPEFKSFEELEFPKHSKVKRQSSTADAPEAQHEPGITITEWKNKSTHEILQKLNDCGCLAGQTILLGIL  688

Query  741  LKREGPNFITKEGTVSDHIERVYRRAGSQKLWSVVRRAASLLSKVVDSLAPSITNVLVQGKQVTLGAFGHEEEV  814
            ||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  689  LKREGPNFITMEGTVSDHIERVYRRAGSKKLWSVVRRAASLLNKVVDSLAPSITNVLVQGKQVTLGAFGHEEEV  762

Query  815  ISNPLSPRVIQNIIYYKCNTHDEREAVIQQELVIHIGWIISNNPELFSGMLKIRIGWIIHAMEYELQIRGGDKP  888
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  763  ISNPLSPRVIKNIIYYKCNTHDEREAVIQQELVIHIGWIISNSPELFSGMLKIRIGWIIHAMEYELQVRGGDKP  836

Query  889  ALDLYQLSPSEVKQLLLDILQPQQNGRCWLNRRQIDGSLNRTPTGFYDRVWQILERTPNGIIVAGKHLPQQPTL  962
            |.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||..||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  837  AVDLYQLSPSEVKQLLLDILQPQQSGRCWLNRRQIDGSLNRTPPEFYDRVWQILERTPNGIVVAGKHLPQQPTL  910

Query  963  SDMTMYEMNFSLLVEDTLGNIDQPQYRQIVVELLMVVSIVLERNPELEFQDKVDLDRLVKEAFNEFQKDQSRLK  1036
            ||||||||||||||||.|||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct  911  SDMTMYEMNFSLLVEDMLGNIDQPKYRQIIVELLMVVSIVLERNPELEFQDKVDLDRLVKEAFHEFQKDESRLK  984

Query 1037  EIEKQDDMTSFYNTPPLGKRGTCSYLTKAVMNLLLEGEVKPNNDDPCLIS  1086
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.|.|.||.|
Sbjct  985  EIEKQDDMTSFYNTPPLGKRGTCSYLTKVVMNSLLEGEVKPSNEDSCLVS  1034