Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_14754
Subject:
XM_006530531.4
Aligned Length:
3313
Identities:
2840
Gaps:
89

Alignment

Query    1  ATGGC-----CTG-----CTCA--CCTGATGCAGTCGTCTCTCCG-----TCTT------------CCGCTTTC  45
            |||||     |||     ||||  .||||   |||...||    |     ||||            |||     
Sbjct    1  ATGGCGGGGGCTGAGGGACTCATGGCTGA---AGTAAGCT----GGAAGCTCTTGGAACGAAGAGCCCG-----  62

Query   46  TTAAGG--------TCTGGCTCAGTTTATGAACCTCTTAAAAGCATTAATCTTCCAAGACCTGATAATGAAACT  111
                ||        ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   63  ----GGCCAAGCGCTCAGGCTCAGTTTATGAACCTCTTAAAAGCATTAATCTTCCAAGACCTGATAATGAAACT  132

Query  112  CTCTGGGATAAGTTGGACCATTATTACAGAATTGTCAAGTCAACATTGCTGCTGTATCAAAGTCCAACTACCGG  185
            ||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  133  CTATGGGATAAGTTGGATCATTATTACAGAATTGTCAAGTCAACGATGCTGATGTATCAAAGTCCAACTACCGG  206

Query  186  TCTCTTTCCCACTAAAACATGCGGTGGTGACCAGAAGGCCAAGATCCAGGACAGCCTATACTGCGCTGCTGGGG  259
            |||||||||.|||||||||||.|||||.||..|||||.||||..|.||.||.||.||.|||||.|||||.||.|
Sbjct  207  TCTCTTTCCTACTAAAACATGTGGTGGAGAAGAGAAGTCCAAAGTGCACGAGAGTCTGTACTGTGCTGCGGGTG  280

Query  260  CCTGGGCTTTGGCTCTTGCATACAGGCGAATTGATGACGACAAGGGAAGGACCCATGAGCTGGAGCACTCAGCT  333
            |||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  281  CCTGGGCCTTGGCGCTAGCATACAGGCGCATTGATGATGACAAGGGACGGACCCATGAGCTGGAGCACTCGGCC  354

Query  334  ATAAAATGCATGAGAGGAATTCTCTACTGCTATATGCGTCAGGCCGATAAGGTCCAGCAGTTTAAGCAGGATCC  407
            |||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct  355  ATAAAGTGTATGAGAGGAATTCTCTACTGCTACATGCGGCAGGCTGATAAGGTCCAACAGTTTAAACAAGATCC  428

Query  408  ACGCCCAACAACATGTCTTCACTCTGTTTTCAATGTGCATACAGGAGATGAGTTGCTTTCCTATGAGGAATATG  481
            .||.||.|||||||||||||||||||||||||.||||||.||.||.|||||||||||...||||||.|||||||
Sbjct  429  CCGGCCCACAACATGTCTTCACTCTGTTTTCAGTGTGCACACTGGGGATGAGTTGCTCAGCTATGAAGAATATG  502

Query  482  GTCATCTTCAGATAAATGCAGTGTCACTTTATCTCCTTTACCTTGTGGAAATGATTTCCTCAGGACTCCAGATT  555
            |.||||||||||||||||||||.|||||.|.||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  503  GCCATCTTCAGATAAATGCAGTCTCACTCTTTCTCCTTTACCTGGTAGAAATGATTTCCTCAGGCCTCCAGATA  576

Query  556  ATCTACAACACTGATGAGGTCTCTTTTATTCAAAACCTTGTATTTTGTGTGGAAAGAGTTTACCGTGTGCCTGA  629
            |||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  577  ATCTATAACACGGATGAGGTTTCTTTTATTCAAAACCTTGTATTTTGTGTAGAGAGAGTTTACCGTGTTCCTGA  650

Query  630  CTTTGGTGTCTGGGAAAGAGGAAGCAAATATAATAATGGCAGCACAGAGCTACATTCGAGCTCGGTTGGTTTAG  703
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.||.||.|||||.||||||||||
Sbjct  651  CTTTGGTGTCTGGGAAAGAGGAAGCAAATATAACAATGGTAGTACCGAACTGCACTCAAGCTCTGTTGGTTTAG  724

Query  704  CAAAAGCAGCTCTAGAAGCAATTAATGGATTCAACCTTTTTGGCAACCAGGGCTGTTCGTGGTCAGTTATATTT  777
            ||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  725  CAAAAGCAGCCTTAGAAGCAATTAATGGATTTAACCTCTTTGGAAACCAGGGGTGTTCCTGGTCAGTTATATTT  798

Query  778  GTGGATCTCGATGCTCACAATCGCAACAGGCAAACTTTGTGCTCGCTGTTACCCAGAGAATCAAGATCACATAA  851
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.|.||.|||||
Sbjct  799  GTGGATCTCGATGCTCACAACCGCAACAGGCAGACATTGTGCTCACTGTTACCCAGAGAATCACGCTCTCATAA  872

Query  852  TACAGATGCTGCCCTGCTCCCCTGCATCAGTTATCCTGCATTTGCCCTGGATGATGAAGTTCTTTTTAGCCAGA  925
            .||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||..||.||.|||||||
Sbjct  873  CACAGATGCTGCCCTGCTCCCGTGCATCAGTTACCCTGCGTTTGCCTTGGATGATGAAGCACTGTTCAGCCAGA  946

Query  926  CACTTGATAAAGTGGTTAGAAAATTAAAAGGAAAATATGGATTTAAACGTTTCTTGAGAGATGGGTATAGAACA  999
            ||||||||||||||.|.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||.
Sbjct  947  CACTTGATAAAGTGATAAGAAAATTGAAAGGAAAATATGGATTTAAGCGTTTCTTGCGAGATGGGTACAGAACG  1020

Query 1000  TCATTGGAAGATCCCAACAGATGCTACTACAAGCCAGCTGAAATTAAGCTATTTGATGGCATTGAATGTGAATT  1073
            .||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021  CCATTGGAAGATCCCAACAGACGCTATTACAAACCAGCAGAGATTAAGCTGTTTGATGGCATTGAATGTGAATT  1094

Query 1074  TCCCATATTTTTCCTTTATATGATGATTGATGGAGTTTTTAGAGGCAATCCTAAGCAAGTACAGGAATATCAGG  1147
            |||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||.|.|.|||||..||||||||||||
Sbjct 1095  TCCCATATTCTTCCTTTACATGATGATCGATGGTGTTTTTAGAGGCAATCTTGAACAAGTCAAGGAATATCAGG  1168

Query 1148  ATCTTTTGACTCCAGTACTTCATCATACCACAGAAGGATATCCTGTTGTACCAAAGTACTATTATGTGCCAGCT  1221
            |.||||||||.||..|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169  ACCTTTTGACACCTTTGCTTCATCAGACCACAGAAGGATATCCTGTTGTGCCAAAGTACTATTATGTGCCAGCT  1242

Query 1222  GACTTTGTAGAATATGAAAAAAATAACCCTGGTAGTCAAAAACGATTTCCTAGCAACTGTGGCCGTGATGGAAA  1295
            |||||||||||||.||||||||..||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1243  GACTTTGTAGAATGTGAAAAAAGAAACCCTGGTAGTCAGAAGCGGTTTCCAAGTAACTGTGGCCGTGATGGGAA  1316

Query 1296  ACTGTTTCTTTGGGGACAAGCACTTTATATCATCGCAAAACTCCTGGCTGATGAACTTATTAGTCCTAAAGACA  1369
            ..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||..|.||.||.||||||||||
Sbjct 1317  GTTGTTTCTTTGGGGACAAGCTCTTTATATCATTGCAAAACTCCTAGCTGATGAGTTAATCAGCCCTAAAGACA  1390

Query 1370  TTGATCCTGTCCAGCGCTATGTCCCACTAAAGGATCAACGTAACGTGAGCATGAGGTTTTCCAATCAGGGCCCA  1443
            ||||.|||||||||||||.|||||||||..||.||||||||||||||||||||||.|..|||||||||||||||
Sbjct 1391  TTGACCCTGTCCAGCGCTTTGTCCCACTTCAGAATCAACGTAACGTGAGCATGAGATACTCCAATCAGGGCCCA  1464

Query 1444  CTGGAAAATGACTTGGTAGTTCATGTGGCACTTATAGCAGAAAGCCAAAGACTTCAAGTTTTTCTGAACACATA  1517
            |||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||||||||||.|.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1465  CTGGAAAATGACTTGGTGGTTCATGTAGCACTTGTAGCAGAAAGCCAACGCCTTCAAGTTTTTCTCAATACATA  1538

Query 1518  TGGTATTCAAACTCAAACTCCTCAACAAGTAGAACCCATTCAGATATGGCCTCAGCAGGAGCTTGTGAAAGCTT  1591
            ||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1539  TGGTATTCAAACCCAAACTCCTCAGCAGGTGGAACCCATTCAGATCTGGCCTCAGCAGGAGCTTGTAAAAGCTT  1612

Query 1592  ATTTGCAGCTGGGTATCAATGAAAAGTTAGGACTCTCTGGAAGGCCAGACAGGCCCATTGGCTGCCTCGGGACA  1665
            ||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1613  ATTTCCACCTGGGAATCAATGAAAAGTTGGGTCTGTCTGGAAGGCCAGATAGGCCCATTGGCTGCCTTGGTACA  1686

Query 1666  TCAAAGATTTATCGCATTCTAGGAAAGACTGTGGTTTGTTACCCGATTATTTTCGACCTAAGTGATTTCTACAT  1739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1687  TCAAAGATTTATCGCATTCTAGGAAAGACTGTGGTTTGTTACCCTATCATCTTTGACCTGAGTGATTTCTACAT  1760

Query 1740  GTCTCAGGATGTTTTCCTGCTGATAGATGACATAAAGAATGCGCTGCAGTTCATTAAACAATATTGGAAAATGC  1813
            |||||||||.|||.|.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1761  GTCTCAGGACGTTCTGCTGCTCATAGATGACATAAAGAACGCACTACAGTTCATTAAGCAATATTGGAAAATGC  1834

Query 1814  ATGGACGTCCACTTTTCCTTGTTCTCATCCGGGAAGACAATATAAGAGGTAGCCGGTTCAACCCCATATTAGAT  1887
            |||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|.||||||||.||||||||.
Sbjct 1835  ATGGACGCCCACTTTTTCTTGTTCTCATCCGAGAAGACAACATAAGAGGTAGCAGATTCAACCCAATATTAGAC  1908

Query 1888  ATGCTGGCAGCCCTTAAAAAAGGAATAATTGGAGGAGTCAAAGTTCATGTGGATCGTCTACAGACACTAATATC  1961
            ||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||.|.|||||
Sbjct 1909  ATGCTGGCAGCCTTTAAAAAGGGAATAATTGGAGGAGTCAAAGTTCATGTTGATCGTTTACAGACATTGATATC  1982

Query 1962  TGGAGCTGTGGTAGAACAACTTGATTTCCTACGAATCAGTGACACAGAAGAGCTTCCAGAATTTAAGAGTTTTG  2035
            .||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1983  CGGAGCTGTAGTAGAGCAGCTTGACTTTCTACGAATTAGTGACACAGAAAAGCTTCCAGAATTTAAGAGCTTTG  2056

Query 2036  AGGAACTAGAACCTCCCAAACATTCAAAAGTCAAACGGCAAAGCAGCACCCCTAG-TGCTCCTGAACTGGG---  2105
            |.|||||||||..|||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||.| || |||||||||    ||   
Sbjct 2057  AAGAACTAGAATTTCCTAAGCATTCAAAAGTCAAACGGCAGAGCAGTACCGC-AGATGCTCCTGA----GGCGC  2125

Query 2106  -ACAGCAGCCGGATGTCAACATTAGTGAATGGAAGGACAAACCCACCCATGAAATTCTTCAAAAACTGAATGAT  2178
             |||..||||.|...|||.|||||..||.|||||..|||||.|||||||.|||||.|||||.||.||||||||.
Sbjct 2126  AACACGAGCCAGGCATCACCATTACCGAGTGGAAAAACAAATCCACCCACGAAATCCTTCAGAAGCTGAATGAC  2199

Query 2179  TGCAGTTGTCTGGCTAGCCAAGCCATCCTGCTGGGTATACTGCTCAAAAGAGAAGGCCCCAACTTCATCACAAA  2252
            |||.|||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||.
Sbjct 2200  TGCGGTTGTCTGGCTGGTCAAACCATCCTGCTGGGTATACTGCTCAAAAGAGAGGGCCCTAACTTTATCACAAT  2273

Query 2253  GGAAGGTACCGTTTCTGATCACATTGAGAGAGTCTATAGAAGAGCTGGCAGCCAAAAACTTTGGTCGGTTGTAC  2326
            ||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||||||..||.|||.|
Sbjct 2274  GGAAGGAACTGTGTCTGATCACATTGAGAGAGTGTATAGAAGAGCTGGCAGCAAAAAGCTTTGGCTGGCTGTGC  2347

Query 2327  G---CCGTGCAGCAAGTCTTTTA---AGTAAA-----GTAGTGGACAGCCTGGCCCCATCCATTACTAATGTTT  2389
            |   |.|.||.|||     ||||   || |||     .|..|..|.||||   ||.||  ||||||.|...||.
Sbjct 2348  GGTACGGGGCTGCA-----TTTACCCAG-AAATTTTCCTCCTCTATAGCC---CCGCA--CATTACCACCTTTC  2410

Query 2390  TAGTGCAGGGCAAACAGGTAACTCTGGGTGCCTTTGGGCATGAAGAAGAAGTTATCTCTAATCCTTTGTCTCCA  2463
            |.||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||..||||||||
Sbjct 2411  TGGTACATGGGAAACAGGTAACTCTAGGTGCCTTTGGACATGAAGAGGAGGTCATCTCTAACCCACTGTCTCCA  2484

Query 2464  AGAGTGATTCAAAACATCATCTATTATAAGTGTAACACCCATGATGAGAGGGAAGCGGTCATTCAGCAAGAACT  2537
            |||||||||.|.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 2485  AGAGTGATTAAGAACATAATCTATTATAAGTGCAATACCCACGATGAGAGGGAGGCAGTCATTCAGCAAGAACT  2558

Query 2538  GGTCATCCATATTGGCTGGATCATCTCCAATAACCCTGAGTTATTCAGTGGCATGCTGAAAATACGAATCGGGT  2611
            |||||||||.||.|||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 2559  GGTCATCCACATCGGCTGGATCATCTCCAACAGCCCTGAGTTGTTCAGCGGCATGCTGAAAATACGCATTGGGT  2632

Query 2612  GGATCATCCATGCCATGGAGTATGAACTTCAGATCCGTGGCGGAGACAAGCCAGCCTTGGACTTGTATCAGCTG  2685
            ||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||||.||.||||||||..||||||||||.|||||.
Sbjct 2633  GGATCATCCACGCCATGGAGTATGAACTGCAGGTCCGGGGCGGGGATAAGCCAGCTGTGGACTTGTACCAGCTC  2706

Query 2686  TCACCTAGTGAAGTTAAACAGCTTCTGCTGGATATTCTGCAGCCTCAACAGAATGGAAGATGTTGGCTGAACAG  2759
            ||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||.|||||||||||||.||||.||
Sbjct 2707  TCGCCCAGTGAAGTGAAGCAGCTGCTGCTAGACATTCTCCAGCCTCAACAGAGTGGAAGATGTTGGTTGAATAG  2780

Query 2760  GCGTCAGATCGATGGGTCTTTGAATAGAACTCCCACCGG-GTTCTATGACCGAGTGTGGCAGATTCTGGAGCGC  2832
            .||||||||.||||||||.|||||||||||.||| |||| .|||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 2781  ACGTCAGATTGATGGGTCATTGAATAGAACACCC-CCGGAATTCTATGACCGAGTGTGGCAGATCCTGGAACGC  2853

Query 2833  ACGCCCAATGGGATCATTGTTGCTGGGAAGCATTTGCCTCAGCAACCAACCCTGTCAGATATGACCATGTATGA  2906
            ||.||.|||||.|||.||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||..||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2854  ACACCTAATGGTATCGTTGTAGCTGGAAAGCATTTGCCACAGCAACCAACTTTGTCGGATATGACCATGTATGA  2927

Query 2907  GATGAATTTCTCTCTCCTTGTTGAAGACACGTTGGGAAATATTGACCAGCCACAGTACAGACAGATCGTTGTAG  2980
            |||||||||.|||||||||||||||||.|.|.|||||||.||||||||||||.||||.|||||||||.|.||.|
Sbjct 2928  GATGAATTTTTCTCTCCTTGTTGAAGATATGCTGGGAAACATTGACCAGCCAAAGTATAGACAGATCATAGTTG  3001

Query 2981  AGTTACTTATGGTTGTATCCATTGTACTGGAAAGAAACCCCGAGCTAGAATTTCAAGACAAAGTAGATCTAGAC  3054
            |||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 3002  AGTTACTAATGGTCGTATCCATTGTGCTGGAAAGAAACCCTGAACTGGAGTTTCAAGACAAAGTGGATCTGGAC  3075

Query 3055  AGACTGGTCAAAGAAGCATTTAATGAATTTCAAAAAGATCAGAGTCGGCTAAAGGAAATTGAAAAACAAGATGA  3128
            ||||||||.||||||||.|||.||||.||||||||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 3076  AGACTGGTTAAAGAAGCGTTTCATGAGTTTCAAAAAGATGAGAGTCGGCTAAAAGAAATCGAAAAACAAGATGA  3149

Query 3129  CATGACTTCCTTTTACAACACTCCTCCCCTGGGAAAAAGAGGAACATGCAGCTATTTGACAAAGGCGGTGATGA  3202
            .||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||..|||||||
Sbjct 3150  TATGACTTCCTTTTACAACACGCCCCCACTGGGAAAAAGAGGAACCTGCAGCTACTTGACGAAGGTTGTGATGA  3223

Query 3203  ATCT-GCTGCTGGAAGGAGAAGTCAAGCCAAACAATGATGACCCGTGTCTGATTAGC  3258
            | || .|||||.||.||||||||||||||.|.||||||.|||.|.||.|||.|||||
Sbjct 3224  A-CTCACTGCTCGAGGGAGAAGTCAAGCCCAGCAATGAGGACTCCTGCCTGGTTAGC  3279