Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14754
- Subject:
- XM_006530531.4
- Aligned Length:
- 3313
- Identities:
- 2840
- Gaps:
- 89
Alignment
Query 1 ATGGC-----CTG-----CTCA--CCTGATGCAGTCGTCTCTCCG-----TCTT------------CCGCTTTC 45
||||| ||| |||| .|||| |||...|| | |||| |||
Sbjct 1 ATGGCGGGGGCTGAGGGACTCATGGCTGA---AGTAAGCT----GGAAGCTCTTGGAACGAAGAGCCCG----- 62
Query 46 TTAAGG--------TCTGGCTCAGTTTATGAACCTCTTAAAAGCATTAATCTTCCAAGACCTGATAATGAAACT 111
|| ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 63 ----GGCCAAGCGCTCAGGCTCAGTTTATGAACCTCTTAAAAGCATTAATCTTCCAAGACCTGATAATGAAACT 132
Query 112 CTCTGGGATAAGTTGGACCATTATTACAGAATTGTCAAGTCAACATTGCTGCTGTATCAAAGTCCAACTACCGG 185
||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 133 CTATGGGATAAGTTGGATCATTATTACAGAATTGTCAAGTCAACGATGCTGATGTATCAAAGTCCAACTACCGG 206
Query 186 TCTCTTTCCCACTAAAACATGCGGTGGTGACCAGAAGGCCAAGATCCAGGACAGCCTATACTGCGCTGCTGGGG 259
|||||||||.|||||||||||.|||||.||..|||||.||||..|.||.||.||.||.|||||.|||||.||.|
Sbjct 207 TCTCTTTCCTACTAAAACATGTGGTGGAGAAGAGAAGTCCAAAGTGCACGAGAGTCTGTACTGTGCTGCGGGTG 280
Query 260 CCTGGGCTTTGGCTCTTGCATACAGGCGAATTGATGACGACAAGGGAAGGACCCATGAGCTGGAGCACTCAGCT 333
|||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 281 CCTGGGCCTTGGCGCTAGCATACAGGCGCATTGATGATGACAAGGGACGGACCCATGAGCTGGAGCACTCGGCC 354
Query 334 ATAAAATGCATGAGAGGAATTCTCTACTGCTATATGCGTCAGGCCGATAAGGTCCAGCAGTTTAAGCAGGATCC 407
|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 355 ATAAAGTGTATGAGAGGAATTCTCTACTGCTACATGCGGCAGGCTGATAAGGTCCAACAGTTTAAACAAGATCC 428
Query 408 ACGCCCAACAACATGTCTTCACTCTGTTTTCAATGTGCATACAGGAGATGAGTTGCTTTCCTATGAGGAATATG 481
.||.||.|||||||||||||||||||||||||.||||||.||.||.|||||||||||...||||||.|||||||
Sbjct 429 CCGGCCCACAACATGTCTTCACTCTGTTTTCAGTGTGCACACTGGGGATGAGTTGCTCAGCTATGAAGAATATG 502
Query 482 GTCATCTTCAGATAAATGCAGTGTCACTTTATCTCCTTTACCTTGTGGAAATGATTTCCTCAGGACTCCAGATT 555
|.||||||||||||||||||||.|||||.|.||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 503 GCCATCTTCAGATAAATGCAGTCTCACTCTTTCTCCTTTACCTGGTAGAAATGATTTCCTCAGGCCTCCAGATA 576
Query 556 ATCTACAACACTGATGAGGTCTCTTTTATTCAAAACCTTGTATTTTGTGTGGAAAGAGTTTACCGTGTGCCTGA 629
|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 577 ATCTATAACACGGATGAGGTTTCTTTTATTCAAAACCTTGTATTTTGTGTAGAGAGAGTTTACCGTGTTCCTGA 650
Query 630 CTTTGGTGTCTGGGAAAGAGGAAGCAAATATAATAATGGCAGCACAGAGCTACATTCGAGCTCGGTTGGTTTAG 703
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.||.||.|||||.||||||||||
Sbjct 651 CTTTGGTGTCTGGGAAAGAGGAAGCAAATATAACAATGGTAGTACCGAACTGCACTCAAGCTCTGTTGGTTTAG 724
Query 704 CAAAAGCAGCTCTAGAAGCAATTAATGGATTCAACCTTTTTGGCAACCAGGGCTGTTCGTGGTCAGTTATATTT 777
||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 725 CAAAAGCAGCCTTAGAAGCAATTAATGGATTTAACCTCTTTGGAAACCAGGGGTGTTCCTGGTCAGTTATATTT 798
Query 778 GTGGATCTCGATGCTCACAATCGCAACAGGCAAACTTTGTGCTCGCTGTTACCCAGAGAATCAAGATCACATAA 851
||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.|.||.|||||
Sbjct 799 GTGGATCTCGATGCTCACAACCGCAACAGGCAGACATTGTGCTCACTGTTACCCAGAGAATCACGCTCTCATAA 872
Query 852 TACAGATGCTGCCCTGCTCCCCTGCATCAGTTATCCTGCATTTGCCCTGGATGATGAAGTTCTTTTTAGCCAGA 925
.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||..||.||.|||||||
Sbjct 873 CACAGATGCTGCCCTGCTCCCGTGCATCAGTTACCCTGCGTTTGCCTTGGATGATGAAGCACTGTTCAGCCAGA 946
Query 926 CACTTGATAAAGTGGTTAGAAAATTAAAAGGAAAATATGGATTTAAACGTTTCTTGAGAGATGGGTATAGAACA 999
||||||||||||||.|.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||.
Sbjct 947 CACTTGATAAAGTGATAAGAAAATTGAAAGGAAAATATGGATTTAAGCGTTTCTTGCGAGATGGGTACAGAACG 1020
Query 1000 TCATTGGAAGATCCCAACAGATGCTACTACAAGCCAGCTGAAATTAAGCTATTTGATGGCATTGAATGTGAATT 1073
.||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 CCATTGGAAGATCCCAACAGACGCTATTACAAACCAGCAGAGATTAAGCTGTTTGATGGCATTGAATGTGAATT 1094
Query 1074 TCCCATATTTTTCCTTTATATGATGATTGATGGAGTTTTTAGAGGCAATCCTAAGCAAGTACAGGAATATCAGG 1147
|||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||.|.|.|||||..||||||||||||
Sbjct 1095 TCCCATATTCTTCCTTTACATGATGATCGATGGTGTTTTTAGAGGCAATCTTGAACAAGTCAAGGAATATCAGG 1168
Query 1148 ATCTTTTGACTCCAGTACTTCATCATACCACAGAAGGATATCCTGTTGTACCAAAGTACTATTATGTGCCAGCT 1221
|.||||||||.||..|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169 ACCTTTTGACACCTTTGCTTCATCAGACCACAGAAGGATATCCTGTTGTGCCAAAGTACTATTATGTGCCAGCT 1242
Query 1222 GACTTTGTAGAATATGAAAAAAATAACCCTGGTAGTCAAAAACGATTTCCTAGCAACTGTGGCCGTGATGGAAA 1295
|||||||||||||.||||||||..||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1243 GACTTTGTAGAATGTGAAAAAAGAAACCCTGGTAGTCAGAAGCGGTTTCCAAGTAACTGTGGCCGTGATGGGAA 1316
Query 1296 ACTGTTTCTTTGGGGACAAGCACTTTATATCATCGCAAAACTCCTGGCTGATGAACTTATTAGTCCTAAAGACA 1369
..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||..|.||.||.||||||||||
Sbjct 1317 GTTGTTTCTTTGGGGACAAGCTCTTTATATCATTGCAAAACTCCTAGCTGATGAGTTAATCAGCCCTAAAGACA 1390
Query 1370 TTGATCCTGTCCAGCGCTATGTCCCACTAAAGGATCAACGTAACGTGAGCATGAGGTTTTCCAATCAGGGCCCA 1443
||||.|||||||||||||.|||||||||..||.||||||||||||||||||||||.|..|||||||||||||||
Sbjct 1391 TTGACCCTGTCCAGCGCTTTGTCCCACTTCAGAATCAACGTAACGTGAGCATGAGATACTCCAATCAGGGCCCA 1464
Query 1444 CTGGAAAATGACTTGGTAGTTCATGTGGCACTTATAGCAGAAAGCCAAAGACTTCAAGTTTTTCTGAACACATA 1517
|||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||||||||||.|.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1465 CTGGAAAATGACTTGGTGGTTCATGTAGCACTTGTAGCAGAAAGCCAACGCCTTCAAGTTTTTCTCAATACATA 1538
Query 1518 TGGTATTCAAACTCAAACTCCTCAACAAGTAGAACCCATTCAGATATGGCCTCAGCAGGAGCTTGTGAAAGCTT 1591
||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1539 TGGTATTCAAACCCAAACTCCTCAGCAGGTGGAACCCATTCAGATCTGGCCTCAGCAGGAGCTTGTAAAAGCTT 1612
Query 1592 ATTTGCAGCTGGGTATCAATGAAAAGTTAGGACTCTCTGGAAGGCCAGACAGGCCCATTGGCTGCCTCGGGACA 1665
||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1613 ATTTCCACCTGGGAATCAATGAAAAGTTGGGTCTGTCTGGAAGGCCAGATAGGCCCATTGGCTGCCTTGGTACA 1686
Query 1666 TCAAAGATTTATCGCATTCTAGGAAAGACTGTGGTTTGTTACCCGATTATTTTCGACCTAAGTGATTTCTACAT 1739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1687 TCAAAGATTTATCGCATTCTAGGAAAGACTGTGGTTTGTTACCCTATCATCTTTGACCTGAGTGATTTCTACAT 1760
Query 1740 GTCTCAGGATGTTTTCCTGCTGATAGATGACATAAAGAATGCGCTGCAGTTCATTAAACAATATTGGAAAATGC 1813
|||||||||.|||.|.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1761 GTCTCAGGACGTTCTGCTGCTCATAGATGACATAAAGAACGCACTACAGTTCATTAAGCAATATTGGAAAATGC 1834
Query 1814 ATGGACGTCCACTTTTCCTTGTTCTCATCCGGGAAGACAATATAAGAGGTAGCCGGTTCAACCCCATATTAGAT 1887
|||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|.||||||||.||||||||.
Sbjct 1835 ATGGACGCCCACTTTTTCTTGTTCTCATCCGAGAAGACAACATAAGAGGTAGCAGATTCAACCCAATATTAGAC 1908
Query 1888 ATGCTGGCAGCCCTTAAAAAAGGAATAATTGGAGGAGTCAAAGTTCATGTGGATCGTCTACAGACACTAATATC 1961
||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||.|.|||||
Sbjct 1909 ATGCTGGCAGCCTTTAAAAAGGGAATAATTGGAGGAGTCAAAGTTCATGTTGATCGTTTACAGACATTGATATC 1982
Query 1962 TGGAGCTGTGGTAGAACAACTTGATTTCCTACGAATCAGTGACACAGAAGAGCTTCCAGAATTTAAGAGTTTTG 2035
.||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1983 CGGAGCTGTAGTAGAGCAGCTTGACTTTCTACGAATTAGTGACACAGAAAAGCTTCCAGAATTTAAGAGCTTTG 2056
Query 2036 AGGAACTAGAACCTCCCAAACATTCAAAAGTCAAACGGCAAAGCAGCACCCCTAG-TGCTCCTGAACTGGG--- 2105
|.|||||||||..|||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||.| || ||||||||| ||
Sbjct 2057 AAGAACTAGAATTTCCTAAGCATTCAAAAGTCAAACGGCAGAGCAGTACCGC-AGATGCTCCTGA----GGCGC 2125
Query 2106 -ACAGCAGCCGGATGTCAACATTAGTGAATGGAAGGACAAACCCACCCATGAAATTCTTCAAAAACTGAATGAT 2178
|||..||||.|...|||.|||||..||.|||||..|||||.|||||||.|||||.|||||.||.||||||||.
Sbjct 2126 AACACGAGCCAGGCATCACCATTACCGAGTGGAAAAACAAATCCACCCACGAAATCCTTCAGAAGCTGAATGAC 2199
Query 2179 TGCAGTTGTCTGGCTAGCCAAGCCATCCTGCTGGGTATACTGCTCAAAAGAGAAGGCCCCAACTTCATCACAAA 2252
|||.|||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||.
Sbjct 2200 TGCGGTTGTCTGGCTGGTCAAACCATCCTGCTGGGTATACTGCTCAAAAGAGAGGGCCCTAACTTTATCACAAT 2273
Query 2253 GGAAGGTACCGTTTCTGATCACATTGAGAGAGTCTATAGAAGAGCTGGCAGCCAAAAACTTTGGTCGGTTGTAC 2326
||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||||||..||.|||.|
Sbjct 2274 GGAAGGAACTGTGTCTGATCACATTGAGAGAGTGTATAGAAGAGCTGGCAGCAAAAAGCTTTGGCTGGCTGTGC 2347
Query 2327 G---CCGTGCAGCAAGTCTTTTA---AGTAAA-----GTAGTGGACAGCCTGGCCCCATCCATTACTAATGTTT 2389
| |.|.||.||| |||| || ||| .|..|..|.|||| ||.|| ||||||.|...||.
Sbjct 2348 GGTACGGGGCTGCA-----TTTACCCAG-AAATTTTCCTCCTCTATAGCC---CCGCA--CATTACCACCTTTC 2410
Query 2390 TAGTGCAGGGCAAACAGGTAACTCTGGGTGCCTTTGGGCATGAAGAAGAAGTTATCTCTAATCCTTTGTCTCCA 2463
|.||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||..||||||||
Sbjct 2411 TGGTACATGGGAAACAGGTAACTCTAGGTGCCTTTGGACATGAAGAGGAGGTCATCTCTAACCCACTGTCTCCA 2484
Query 2464 AGAGTGATTCAAAACATCATCTATTATAAGTGTAACACCCATGATGAGAGGGAAGCGGTCATTCAGCAAGAACT 2537
|||||||||.|.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 2485 AGAGTGATTAAGAACATAATCTATTATAAGTGCAATACCCACGATGAGAGGGAGGCAGTCATTCAGCAAGAACT 2558
Query 2538 GGTCATCCATATTGGCTGGATCATCTCCAATAACCCTGAGTTATTCAGTGGCATGCTGAAAATACGAATCGGGT 2611
|||||||||.||.|||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 2559 GGTCATCCACATCGGCTGGATCATCTCCAACAGCCCTGAGTTGTTCAGCGGCATGCTGAAAATACGCATTGGGT 2632
Query 2612 GGATCATCCATGCCATGGAGTATGAACTTCAGATCCGTGGCGGAGACAAGCCAGCCTTGGACTTGTATCAGCTG 2685
||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||||.||.||||||||..||||||||||.|||||.
Sbjct 2633 GGATCATCCACGCCATGGAGTATGAACTGCAGGTCCGGGGCGGGGATAAGCCAGCTGTGGACTTGTACCAGCTC 2706
Query 2686 TCACCTAGTGAAGTTAAACAGCTTCTGCTGGATATTCTGCAGCCTCAACAGAATGGAAGATGTTGGCTGAACAG 2759
||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||.|||||||||||||.||||.||
Sbjct 2707 TCGCCCAGTGAAGTGAAGCAGCTGCTGCTAGACATTCTCCAGCCTCAACAGAGTGGAAGATGTTGGTTGAATAG 2780
Query 2760 GCGTCAGATCGATGGGTCTTTGAATAGAACTCCCACCGG-GTTCTATGACCGAGTGTGGCAGATTCTGGAGCGC 2832
.||||||||.||||||||.|||||||||||.||| |||| .|||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 2781 ACGTCAGATTGATGGGTCATTGAATAGAACACCC-CCGGAATTCTATGACCGAGTGTGGCAGATCCTGGAACGC 2853
Query 2833 ACGCCCAATGGGATCATTGTTGCTGGGAAGCATTTGCCTCAGCAACCAACCCTGTCAGATATGACCATGTATGA 2906
||.||.|||||.|||.||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||..||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2854 ACACCTAATGGTATCGTTGTAGCTGGAAAGCATTTGCCACAGCAACCAACTTTGTCGGATATGACCATGTATGA 2927
Query 2907 GATGAATTTCTCTCTCCTTGTTGAAGACACGTTGGGAAATATTGACCAGCCACAGTACAGACAGATCGTTGTAG 2980
|||||||||.|||||||||||||||||.|.|.|||||||.||||||||||||.||||.|||||||||.|.||.|
Sbjct 2928 GATGAATTTTTCTCTCCTTGTTGAAGATATGCTGGGAAACATTGACCAGCCAAAGTATAGACAGATCATAGTTG 3001
Query 2981 AGTTACTTATGGTTGTATCCATTGTACTGGAAAGAAACCCCGAGCTAGAATTTCAAGACAAAGTAGATCTAGAC 3054
|||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 3002 AGTTACTAATGGTCGTATCCATTGTGCTGGAAAGAAACCCTGAACTGGAGTTTCAAGACAAAGTGGATCTGGAC 3075
Query 3055 AGACTGGTCAAAGAAGCATTTAATGAATTTCAAAAAGATCAGAGTCGGCTAAAGGAAATTGAAAAACAAGATGA 3128
||||||||.||||||||.|||.||||.||||||||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 3076 AGACTGGTTAAAGAAGCGTTTCATGAGTTTCAAAAAGATGAGAGTCGGCTAAAAGAAATCGAAAAACAAGATGA 3149
Query 3129 CATGACTTCCTTTTACAACACTCCTCCCCTGGGAAAAAGAGGAACATGCAGCTATTTGACAAAGGCGGTGATGA 3202
.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||..|||||||
Sbjct 3150 TATGACTTCCTTTTACAACACGCCCCCACTGGGAAAAAGAGGAACCTGCAGCTACTTGACGAAGGTTGTGATGA 3223
Query 3203 ATCT-GCTGCTGGAAGGAGAAGTCAAGCCAAACAATGATGACCCGTGTCTGATTAGC 3258
| || .|||||.||.||||||||||||||.|.||||||.|||.|.||.|||.|||||
Sbjct 3224 A-CTCACTGCTCGAGGGAGAAGTCAAGCCCAGCAATGAGGACTCCTGCCTGGTTAGC 3279