Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14756
• Subject: NM_001172432.1
• Aligned Length: 1222
• Identities: 1107
• Gaps: 104

Alignment

Query    1  ATGACGCTGGACGTGGGGCCGGAGGATGAGCTGCCCGACTGGGCCGCCGCCAAAGAGTTTTACCAGAAGTACGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACGCTGGACGTGGGGCCGGAGGATGAGCTGCCCGACTGGGCCGCCGCCAAAGAGTTTTACCAGAAGTACGA  74

Query   75  CCCTAAGGACGTCATCGGCAGAGGAGTGAGCTCTGTGGTCCGCCGTTGTGTTCATCGAGCTACTGGCCACGAGT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCTAAGGACGTCATCGGCAGAGGAGTGAGCTCTGTGGTCCGCCGTTGTGTTCATCGAGCTACTGGCCACGAGT  148

Query  149  TTGCGGTGAAGATTATGGAAGTGACAGCTGAGCGGCTGAGTCCTGAGCAGCTGGAGGAGGTGCGGGAAGCCACA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTGCGGTGAAGATTATGGAAGTGACAGCTGAGCGGCTGAGTCCTGAGCAGCTGGAGGAGGTGCGGGAAGCCACA  222

Query  223  CGGCGAGAGACACACATCCTTCGCCAGGTCGCCGGCCACCCCCACATCATCACCCTCATCGATTCCTACGAGTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGCGAGAGACACACATCCTTCGCCAGGTCGCCGGCCACCCCCACATCATCACCCTCATCGATTCCTACGAGTC  296

Query  297  TTCTAGCTTCATGTTCCTGGTGTTTGACCTGATGCGGAAGGGAGAGCTGTTTGACTATCTCACAGAGAAGGTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTCTAGCTTCATGTTCCTGGTGTTTGACCTGATGCGGAAGGGAGAGCTGTTTGACTATCTCACAGAGAAGGTGG  370

Query  371  CCCTCTCTGAAAAGGAAACCAGGTCCATCATGCGGTCTCTGCTGGAAGCAGTGAGCTTTCTCCATGCCAACAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCTCTCTGAAAAGGAAACCAGGTCCATCATGCGGTCTCTGCTGGAAGCAGTGAGCTTTCTCCATGCCAACAAC  444

Query  445  ATTGTGCATCGAGATCTGAAGCCCGAGAATATTCTCCTAGATGACAATATGCAGATCCGACTTTCAGATTTCGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTGTGCATCGAGATCTGAAGCCCGAGAATATTCTCCTAGATGACAATATGCAGATCCGACTTTCAGATTTCGG  518

Query  519  GTTCTCCTGCCACTTGGAACCTGGCGAGAAGCTTCGAGAGTTGTGTGGGACCCCAGGGTATCTAGCGCCAGAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTTCTCCTGCCACTTGGAACCTGGCGAGAAGCTTCGAGAGTTGTGTGGGACCCCAGGGTATCTAGCGCCAGAGA  592

Query  593  TCCTTAAATGCTCCATGGATGAAACCCACCCAGGCTATGGCAAGGAGGTCGACCTCTGGGCCTGTGGGGTGATC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCTTAAATGCTCCATGGATGAAACCCACCCAGGCTATGGCAAGGAGGTCGACCTCTGGGCCTGTGGGGTGATC  666

Query  667  TTGTTCACACTCCTGGCTGGCTCGCCACCCTTCTGGCACCGGCGGCAGATCCTGATGTTACGCATGATCATGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTGTTCACACTCCTGGCTGGCTCGCCACCCTTCTGGCACCGGCGGCAGATCCTGATGTTACGCATGATCATGGA  740

Query  741  GGGCCAGTACCAGTTCAGTTCCCCCGAGTGGGATGACCGTTCCAGCACTGTCAAAGACCTGATCTCCAGGCTGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGGCCAGTACCAGTTCAGTTCCCCCGAGTGGGATGACCGTTCCAGCACTGTCAAAGACCTGATCTCCAGGCTGC  814

Query  815  TGCAGGTGGATCCTGAGGCACGCCTGACAGCTGAGCAGGCCCTACAGCACCCCTTCTTTGAGCGTTGTGAAGGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCAGGTGGATCCTGAGGCACGCCTGACAGCTGAGCAGGCCCTACAGCACCCCTTCTTTGAGCGTTGTGAAGGC  888

Query  889  AGCCAACCCTGGAACCTCACCCCCCGCCAGCGGTTCCGGGTGGCAGTGTGGACAGTGCTGGCTGCTGGACGAGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGCCAACCCTGGAACCTCACCCCCCGCCAGCGGTTCCGGGTGGCAGTGTGGACAGTGCTGGCTGCTGGACGAGT  962

Query  963  GGCCCTAAGCACCCATCGTGTACGGCCACTGACCAAGAATGCACTGTTGAGGGACCCTTATGCGCTGCGGTCAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGCCCTAAGCACCCATCGTGTACGGCCACTGACCAAGAATGCACTGTTGAGGGACCCTTATGCGCTGCGGTCAG  1036

Query 1037  TGCGGCACCTCATCGACAACTGTGCCTTCCGGCTCTACGGGCACTGGGTAAAGAA--AGGGGA--GCAGCAGAA  1106
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||  ||.|||  |.|    ||
Sbjct 1037  TGCGGCACCTCATCGACAACTGTGCCTTCCGGCTCTACGGGCACTGGATAAGGAAGCAGTGGATTGGA----AA  1106

Query 1107  CCGGGCGGCTCTCTTTCAGCACCGGCCCCCTGGGCCTTTTCCCATCATGGGCCCTGAAGAGGAGGGAGACTCTG  1180
            .|.|..|||| |.|.|.                                                         
Sbjct 1107  GCTGATGGCT-TGTGTA---------------------------------------------------------  1122

Query 1181  CTGCTATAACTGAGGATGAGGCCGTGCTTGTGCTGGGC  1218
                                                  
Sbjct 1123  --------------------------------------  1122