Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14763
• Subject: NM_001024955.2
• Aligned Length: 1362
• Identities: 1225
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTACAATACTGTTTGGAATATGGAAGACCTGGATTTAGAATATGCCAAGACAGATATAAATTGTGGCACAGA  74
            |||||||..||.|||||||.|||||||||||||||.|||||.|.||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGTACACCACGGTTTGGACTATGGAAGACCTGGACTTAGAGTGTGCCAAGACAGATATAAACTGTGGCACAGA  74

Query   75  CTTGATGTTTTATATAGAAATGGACCCACCAGCACTGCCTCCTAAACCACCAAAACCTACTACTGTAGCCAACA  148
            ||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTGGTGTTTTATATAGAAATGGATCCACCAGCACTGCCCCCCAAACCACCCAAGCCCACTACTGTAGCCAACA  148

Query  149  ACGGTATGAATAACAATATGTCCTTACAAGATGCTGAATGGTACTGGGGAGATATCTCGAGGGAAGAAGTGAAT  222
            ||.|.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  ACAGCATGAACAACAATATGTCCTTGCAGGATGCTGAATGGTACTGGGGAGACATCTCAAGGGAAGAAGTGAAT  222

Query  223  GAAAAACTTCGAGATACAGCAGACGGGACCTTTTTGGTACGAGATGCGTCTACTAAAATGCATGGTGATTATAC  296
            ||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct  223  GAAAAACTCCGAGACACTGCTGATGGGACCTTTTTGGTACGAGACGCATCTACTAAAATGCACGGCGATTACAC  296

Query  297  TCTTACACTAAGGAAAGGGGGAAATAACAAATTAATCAAAATATTTCATCGAGATGGGAAATATGGCTTCTCTG  370
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  TCTTACACTAAGGAAAGGAGGAAATAACAAATTAATCAAAATCTTTCACCGTGATGGAAAATATGGCTTCTCTG  370

Query  371  ACCCATTAACCTTCAGTTCTGTGGTTGAATTAATAAACCACTACCGGAATGAATCTCTAGCTCAGTATAATCCC  444
            |.|||||||||||||..|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||.||.|||
Sbjct  371  ATCCATTAACCTTCAACTCTGTGGTTGAGTTAATAAACCACTACCGGAATGAGTCTTTAGCTCAGTACAACCCC  444

Query  445  AAATTGGATGTGAAATTACTTTATCCAGTATCCAAATACCAACAGGATCAAGTTGTCAAAGAAGATAATATTGA  518
            ||..||||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGCTGGATGTGAAGTTGCTCTACCCAGTGTCCAAATACCAGCAGGATCAAGTTGTCAAAGAAGATAATATTGA  518

Query  519  AGCTGTAGGGAAAAAATTACATAAATATAACACTCAGTTTCAAGAAAAAAGTCGAGAATATGATAGATTATATG  592
            ||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCTGTAGGGAAAAAATTACATGAATATAATACTCAATTTCAAGAAAAAAGTCGGGAATATGATAGATTATATG  592

Query  593  AAGAATATACCCGCACATCCCAGGAAATCCAAATGAAAAGGACAGCTATTGAAGCATTTAATGAAACCATAAAA  666
            |.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGAGTACACCCGTACTTCCCAGGAAATCCAAATGAAAAGAACGGCTATCGAAGCATTTAATGAAACCATAAAA  666

Query  667  ATATTTGAAGAACAGTGCCAGACCCAAGAGCGGTACAGCAAAGAATACATAGAAAAGTTTAAACGTGAAGGCAA  740
            ||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  667  ATATTTGAAGAACAATGCCAAACCCAGGAGCGGTACAGCAAAGAATACATAGAGAAGTTTAAACGCGAAGGCAA  740

Query  741  TGAGAAAGAAATACAAAGGATTATGCATAATTATGATAAGTTGAAGTCTCGAATCAGTGAAATTATTGACAGTA  814
            .|||||||||||.|||||||||||||||||..||||||||.|||||||.||.||||||||.||.||||||||||
Sbjct  741  CGAGAAAGAAATTCAAAGGATTATGCATAACCATGATAAGCTGAAGTCGCGTATCAGTGAGATCATTGACAGTA  814

Query  815  GAAGAAGATTGGAAGAAGACTTGAAGAAGCAGGCAGCTGAGTATCGAGAAATTGACAAACGTATGAACAGCATT  888
            |.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct  815  GGAGGAGGTTGGAAGAAGACTTGAAGAAGCAGGCAGCTGAGTACCGAGAGATCGACAAACGCATGAACAGTATT  888

Query  889  AAACCAGACCTTATCCAGCTGAGAAAGACGAGAGACCAATACTTGATGTGGTTGACTCAAAAAGGTGTTCGGCA  962
            ||.||.|||||.||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.|||||
Sbjct  889  AAGCCGGACCTCATCCAGTTGAGAAAGACAAGAGACCAATACTTGATGTGGCTGACGCAGAAAGGTGTGCGGCA  962

Query  963  AAAGAAGTTGAACGAGTGGTTGGGCAATGAAAACACTGAAGACCAATATTCACTGGTGGAAGATGATGAAGATT  1036
            .||||||.|||||||||||.||||.||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct  963  GAAGAAGCTGAACGAGTGGCTGGGGAATGAAAATACCGAAGATCAATACTCCCTGGTAGAAGATGATGAGGATT  1036

Query 1037  TGCCCCATCATGATGAGAAGACATGGAATGTTGGAAGCAGCAACCGAAACAAAGCTGAAAACCTGTTGCGAGGG  1110
            |||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 1037  TGCCCCACCATGACGAGAAGACGTGGAATGTCGGGAGCAGCAACCGAAACAAAGCGGAGAACCTATTGCGAGGG  1110

Query 1111  AAGCGAGATGGCACTTTTCTTGTCCGGGAGAGCAGTAAACAGGGCTGCTATGCCTGCTCTGTAGTGGTGGACGG  1184
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1111  AAGCGAGACGGCACTTTCCTTGTCCGGGAGAGCAGTAAGCAGGGCTGCTATGCCTGCTCCGTAGTGGTAGACGG  1184

Query 1185  CGAAGTAAAGCATTGTGTCATAAACAAAACAGCAACTGGCTATGGCTTTGCCGAGCCCTATAACTTGTACAGCT  1258
            ||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||
Sbjct 1185  CGAAGTCAAGCATTGCGTCATTAACAAGACTGCCACCGGCTATGGCTTTGCCGAGCCCTACAACCTGTACAGCT  1258

Query 1259  CTCTGAAAGAACTGGTGCTACATTACCAACACACCTCCCTTGTGCAGCACAACGACTCCCTCAATGTCACACTA  1332
            |.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCCTGAAGGAGCTGGTGCTACATTATCAACACACCTCCCTCGTGCAGCACAATGACTCCCTCAATGTCACACTA  1332

Query 1333  GCCTACCCAGTATATGCACAGCAGAGGCGA  1362
            ||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1333  GCATACCCAGTATATGCACAACAGAGGCGA  1362