Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14763
• Subject: NM_181524.2
• Aligned Length: 1364
• Identities: 1265
• Gaps: 94

Alignment

Query    1  ATGTACAATACTGTTTGGAATATGGAAGACCTGGATTTAGAATATGCCAAGACAGATATAAATTGTGGCACAGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTTGATGTTTTAT--ATAGAAATGGACCCACCAGCACTGCCTCCTAAACCACCAAAACCTACTACTGTAGCCAA  146
                       ||  |||       |||..|.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------ATGCATA-------ACCTGCAAACACTGCCTCCTAAACCACCAAAACCTACTACTGTAGCCAA  56

Query  147  CAACGGTATGAATAACAATATGTCCTTACAAGATGCTGAATGGTACTGGGGAGATATCTCGAGGGAAGAAGTGA  220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   57  CAACGGTATGAATAACAATATGTCCTTACAAGATGCTGAATGGTACTGGGGAGATATCTCGAGGGAAGAAGTGA  130

Query  221  ATGAAAAACTTCGAGATACAGCAGACGGGACCTTTTTGGTACGAGATGCGTCTACTAAAATGCATGGTGATTAT  294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  131  ATGAAAAACTTCGAGATACAGCAGACGGGACCTTTTTGGTACGAGATGCGTCTACTAAAATGCATGGTGATTAT  204

Query  295  ACTCTTACACTAAGGAAAGGGGGAAATAACAAATTAATCAAAATATTTCATCGAGATGGGAAATATGGCTTCTC  368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  205  ACTCTTACACTAAGGAAAGGGGGAAATAACAAATTAATCAAAATATTTCATCGAGATGGGAAATATGGCTTCTC  278

Query  369  TGACCCATTAACCTTCAGTTCTGTGGTTGAATTAATAAACCACTACCGGAATGAATCTCTAGCTCAGTATAATC  442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  279  TGACCCATTAACCTTCAGTTCTGTGGTTGAATTAATAAACCACTACCGGAATGAATCTCTAGCTCAGTATAATC  352

Query  443  CCAAATTGGATGTGAAATTACTTTATCCAGTATCCAAATACCAACAGGATCAAGTTGTCAAAGAAGATAATATT  516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  353  CCAAATTGGATGTGAAATTACTTTATCCAGTATCCAAATACCAACAGGATCAAGTTGTCAAAGAAGATAATATT  426

Query  517  GAAGCTGTAGGGAAAAAATTACATAAATATAACACTCAGTTTCAAGAAAAAAGTCGAGAATATGATAGATTATA  590
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  427  GAAGCTGTAGGGAAAAAATTACATGAATATAACACTCAGTTTCAAGAAAAAAGTCGAGAATATGATAGATTATA  500

Query  591  TGAAGAATATACCCGCACATCCCAGGAAATCCAAATGAAAAGGACAGCTATTGAAGCATTTAATGAAACCATAA  664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  501  TGAAGAATATACCCGCACATCCCAGGAAATCCAAATGAAAAGGACAGCTATTGAAGCATTTAATGAAACCATAA  574

Query  665  AAATATTTGAAGAACAGTGCCAGACCCAAGAGCGGTACAGCAAAGAATACATAGAAAAGTTTAAACGTGAAGGC  738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  575  AAATATTTGAAGAACAGTGCCAGACCCAAGAGCGGTACAGCAAAGAATACATAGAAAAGTTTAAACGTGAAGGC  648

Query  739  AATGAGAAAGAAATACAAAGGATTATGCATAATTATGATAAGTTGAAGTCTCGAATCAGTGAAATTATTGACAG  812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  649  AATGAGAAAGAAATACAAAGGATTATGCATAATTATGATAAGTTGAAGTCTCGAATCAGTGAAATTATTGACAG  722

Query  813  TAGAAGAAGATTGGAAGAAGACTTGAAGAAGCAGGCAGCTGAGTATCGAGAAATTGACAAACGTATGAACAGCA  886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  723  TAGAAGAAGATTGGAAGAAGACTTGAAGAAGCAGGCAGCTGAGTATCGAGAAATTGACAAACGTATGAACAGCA  796

Query  887  TTAAACCAGACCTTATCCAGCTGAGAAAGACGAGAGACCAATACTTGATGTGGTTGACTCAAAAAGGTGTTCGG  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  797  TTAAACCAGACCTTATCCAGCTGAGAAAGACGAGAGACCAATACTTGATGTGGTTGACTCAAAAAGGTGTTCGG  870

Query  961  CAAAAGAAGTTGAACGAGTGGTTGGGCAATGAAAACACTGAAGACCAATATTCACTGGTGGAAGATGATGAAGA  1034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  871  CAAAAGAAGTTGAACGAGTGGTTGGGCAATGAAAACACTGAAGACCAATATTCACTGGTGGAAGATGATGAAGA  944

Query 1035  TTTGCCCCATCATGATGAGAAGACATGGAATGTTGGAAGCAGCAACCGAAACAAAGCTGAAAACCTGTTGCGAG  1108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  945  TTTGCCCCATCATGATGAGAAGACATGGAATGTTGGAAGCAGCAACCGAAACAAAGCTGAAAACCTGTTGCGAG  1018

Query 1109  GGAAGCGAGATGGCACTTTTCTTGTCCGGGAGAGCAGTAAACAGGGCTGCTATGCCTGCTCTGTAGTGGTGGAC  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019  GGAAGCGAGATGGCACTTTTCTTGTCCGGGAGAGCAGTAAACAGGGCTGCTATGCCTGCTCTGTAGTGGTGGAC  1092

Query 1183  GGCGAAGTAAAGCATTGTGTCATAAACAAAACAGCAACTGGCTATGGCTTTGCCGAGCCCTATAACTTGTACAG  1256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1093  GGCGAAGTAAAGCATTGTGTCATAAACAAAACAGCAACTGGCTATGGCTTTGCCGAGCCCTATAACTTGTACAG  1166

Query 1257  CTCTCTGAAAGAACTGGTGCTACATTACCAACACACCTCCCTTGTGCAGCACAACGACTCCCTCAATGTCACAC  1330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1167  CTCTCTGAAAGAACTGGTGCTACATTACCAACACACCTCCCTTGTGCAGCACAACGACTCCCTCAATGTCACAC  1240

Query 1331  TAGCCTACCCAGTATATGCACAGCAGAGGCGA  1362
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1241  TAGCCTACCCAGTATATGCACAGCAGAGGCGA  1272