Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14763
• Subject: XM_006517570.3
• Aligned Length: 1362
• Identities: 1089
• Gaps: 153

Alignment

Query    1  ATGTACAATACTGTTTGGAATATGGAAGACCTGGATTTAGAATATGCCAAGACAGATATAAATTGTGGCACAGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTTGATGTTTTATATAGAAATGGACCCACCAGCACTGCCTCCTAAACCACCAAAACCTACTACTGTAGCCAACA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACGGTATGAATAACAATATGTCCTTACAAGATGCTGAATGGTACTGGGGAGATATCTCGAGGGAAGAAGTGAAT  222
                 |||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct    1  -----ATGAACAACAATATGTCCTTGCAGGATGCTGAATGGTACTGGGGAGACATCTCAAGGGAAGAAGTGAAT  69

Query  223  GAAAAACTTCGAGATACAGCAGACGGGACCTTTTTGGTACGAGATGCGTCTACTAAAATGCATGGTGATTATAC  296
            ||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct   70  GAAAAACTCCGAGACACTGCTGATGGGACCTTTTTGGTACGAGACGCATCTACTAAAATGCACGGCGATTACAC  143

Query  297  TCTTACACTAAGGAAAGGGGGAAATAACAAATTAATCAAAATATTTCATCGAGATGGGAAATATGGCTTCTCTG  370
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  144  TCTTACACTAAGGAAAGGAGGAAATAACAAATTAATCAAAATCTTTCACCGTGATGGAAAATATGGCTTCTCTG  217

Query  371  ACCCATTAACCTTCAGTTCTGTGGTTGAATTAATAAACCACTACCGGAATGAATCTCTAGCTCAGTATAATCCC  444
            |.|||||||||||||..|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||.||.|||
Sbjct  218  ATCCATTAACCTTCAACTCTGTGGTTGAGTTAATAAACCACTACCGGAATGAGTCTTTAGCTCAGTACAACCCC  291

Query  445  AAATTGGATGTGAAATTACTTTATCCAGTATCCAAATACCAACAGGATCAAGTTGTCAAAGAAGATAATATTGA  518
            ||..||||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  292  AAGCTGGATGTGAAGTTGCTCTACCCAGTGTCCAAATACCAGCAGGATCAAGTTGTCAAAGAAGATAATATTGA  365

Query  519  AGCTGTAGGGAAAAAATTACATAAATATAACACTCAGTTTCAAGAAAAAAGTCGAGAATATGATAGATTATATG  592
            ||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  366  AGCTGTAGGGAAAAAATTACATGAATATAATACTCAATTTCAAGAAAAAAGTCGGGAATATGATAGATTATATG  439

Query  593  AAGAATATACCCGCACATCCCAGGAAATCCAAATGAAAAGGACAGCTATTGAAGCATTTAATGAAACCATAAAA  666
            |.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  440  AGGAGTACACCCGTACTTCCCAGGAAATCCAAATGAAAAGAACGGCTATCGAAGCATTTAATGAAACCATAAAA  513

Query  667  ATATTTGAAGAACAGTGCCAGACCCAAGAGCGGTACAGCAAAGAATACATAGAAAAGTTTAAACGTGAAGGCAA  740
            ||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  514  ATATTTGAAGAACAATGCCAAACCCAGGAGCGGTACAGCAAAGAATACATAGAGAAGTTTAAACGCGAAGGCAA  587

Query  741  TGAGAAAGAAATACAAAGGATTATGCATAATTATGATAAGTTGAAGTCTCGAATCAGTGAAATTATTGACAGTA  814
            .|||||||||||.|||||||||||||||||..||||||||.|||||||.||.||||||||.||.||||||||||
Sbjct  588  CGAGAAAGAAATTCAAAGGATTATGCATAACCATGATAAGCTGAAGTCGCGTATCAGTGAGATCATTGACAGTA  661

Query  815  GAAGAAGATTGGAAGAAGACTTGAAGAAGCAGGCAGCTGAGTATCGAGAAATTGACAAACGTATGAACAGCATT  888
            |.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct  662  GGAGGAGGTTGGAAGAAGACTTGAAGAAGCAGGCAGCTGAGTACCGAGAGATCGACAAACGCATGAACAGTATT  735

Query  889  AAACCAGACCTTATCCAGCTGAGAAAGACGAGAGACCAATACTTGATGTGGTTGACTCAAAAAGGTGTTCGGCA  962
            ||.||.|||||.||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.|||||
Sbjct  736  AAGCCGGACCTCATCCAGTTGAGAAAGACAAGAGACCAATACTTGATGTGGCTGACGCAGAAAGGTGTGCGGCA  809

Query  963  AAAGAAGTTGAACGAGTGGTTGGGCAATGAAAACACTGAAGACCAATATTCACTGGTGGAAGATGATGAAGATT  1036
            .||||||.|||||||||||.||||.||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct  810  GAAGAAGCTGAACGAGTGGCTGGGGAATGAAAATACCGAAGATCAATACTCCCTGGTAGAAGATGATGAGGATT  883

Query 1037  TGCCCCATCATGATGAGAAGACATGGAATGTTGGAAGCAGCAACCGAAACAAAGCTGAAAACCTGTTGCGAGGG  1110
            |||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct  884  TGCCCCACCATGACGAGAAGACGTGGAATGTCGGGAGCAGCAACCGAAACAAAGCGGAGAACCTATTGCGAGGG  957

Query 1111  AAGCGAGATGGCACTTTTCTTGTCCGGGAGAGCAGTAAACAGGGCTGCTATGCCTGCTCTGTAGTGGTGGACGG  1184
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  958  AAGCGAGACGGCACTTTCCTTGTCCGGGAGAGCAGTAAGCAGGGCTGCTATGCCTGCTCCGTAGTGGTAGACGG  1031

Query 1185  CGAAGTAAAGCATTGTGTCATAAACAAAACAGCAACTGGCTATGGCTTTGCCGAGCCCTATAACTTGTACAGCT  1258
            ||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||
Sbjct 1032  CGAAGTCAAGCATTGCGTCATTAACAAGACTGCCACCGGCTATGGCTTTGCCGAGCCCTACAACCTGTACAGCT  1105

Query 1259  CTCTGAAAGAACTGGTGCTACATTACCAACACACCTCCCTTGTGCAGCACAACGACTCCCTCAATGTCACACTA  1332
            |.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1106  CCCTGAAGGAGCTGGTGCTACATTATCAACACACCTCCCTCGTGCAGCACAATGACTCCCTCAATGTCACACTA  1179

Query 1333  GCCTACCCAGTATATGCACAGCAGAGGCGA  1362
            ||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1180  GCATACCCAGTATATGCACAACAGAGGCGA  1209